单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Spatial determinants of CD8+ T cell differentiation in cancer
2022-08, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2022.04.003
PMID:35527216
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研究论文 | 本文探讨了癌症中CD8+ T细胞分化的空间决定因素 | 利用新的空间转录组学和成像技术揭示了CD8 T细胞功能调控的机制 | 现有的流式细胞术和单细胞转录组学技术未能捕捉到重要的空间信息 | 揭示调控CD8 T细胞功能的空间决定因素 | CD8+ T细胞在癌症中的分化 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学和成像技术 | NA | 细胞状态数据 | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
Macrophage functional diversity in NAFLD - more than inflammation
2022-08, Nature reviews. Endocrinology
DOI:10.1038/s41574-022-00675-6
PMID:35534573
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的多样性和功能，特别是肝内常驻巨噬细胞（Kupffer细胞）和单核细胞来源的肝巨噬细胞在稳态及NAFLD状态下的变化 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，深入研究了巨噬细胞在肝脏中的异质性，揭示了其在NAFLD和NASH发病机制中超越传统炎症角色的功能 | NA | 探讨巨噬细胞在NAFLD中的多样性和功能，特别是NASH中的作用 | 肝内常驻巨噬细胞（Kupffer细胞）和单核细胞来源的肝巨噬细胞 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 223 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies premature aging features of TERC-deficient mouse brain and bone marrow
2022-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00578-4
PMID:35545739
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了TERC缺陷小鼠的脑和骨髓在早衰特征上的差异表达基因，揭示了早衰相关的炎症反应和神经发育抑制现象 | 首次通过单细胞转录组测序技术研究了TERC缺陷小鼠脑和骨髓的早衰特征，并发现了早衰相关的炎症反应和神经发育抑制现象 | NA | 探究TERC缺陷小鼠脑和骨髓的早衰特征及其相关机制 | TERC缺陷小鼠的脑和骨髓 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 年轻小鼠、自然衰老小鼠和TERC缺陷（TERC-KO）小鼠的脑和骨髓样本 |
| 224 | 2024-08-08 |
Airway Macrophages Encompass Transcriptionally and Functionally Distinct Subsets Altered by Smoking
2022-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0563OC
PMID:35522264
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研究论文 | 本研究探讨了吸烟和慢性阻塞性肺病（COPD）对人类肺泡巨噬细胞（AMs）异质性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了吸烟相关肺泡巨噬细胞的转录特征，包括解毒、氧化应激和促炎反应 | 研究样本仅包括健康非吸烟者、无COPD的吸烟者和有COPD的吸烟者，可能未能涵盖所有相关人群 | 探索吸烟和COPD对肺泡巨噬细胞异质性的影响 | 人类肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 健康非吸烟者、无COPD的吸烟者和有COPD的吸烟者的肺泡巨噬细胞 |
| 225 | 2024-08-08 |
Dynamical Systems Model of RNA Velocity Improves Inference of Single-cell Trajectory, Pseudo-time and Gene Regulation
2022-08-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167606
PMID:35489382
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研究论文 | 本文开发了RNA-ODE框架，通过普通微分方程（ODE）模型量化系统级动态，改进单细胞数据分析 | 提出RNA-ODE框架，能够通过解决动态方程预测和外推每个细胞的表达轨迹，相比现有方法更准确地估计细胞状态谱系和伪时间 | NA | 改进单细胞RNA-seq数据的分析，提高对细胞发育谱系和动态的推断 | 单细胞RNA-seq数据，特别是RNA速度的推断 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ODE | 基因表达数据 | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
Reduced adhesion of aged intestinal stem cells contributes to an accelerated clonal drift
2022-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201408
PMID:35487692
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研究论文 | 本文研究了衰老过程中肠道干细胞的粘附性降低如何加速克隆漂移 | 首次揭示了衰老肠道干细胞粘附性降低对克隆动态的影响 | NA | 探讨衰老对肠道干细胞克隆动态的影响 | 年轻和老年小鼠的肠道干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,920个高Lgr5肠道干细胞 |
| 227 | 2024-08-08 |
A common epigenetic mechanism across different cellular origins underlies systemic immune dysregulation in an idiopathic autism mouse model
2022-08, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01566-y
PMID:35491410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，追踪了自闭症小鼠模型中免疫失调的发展起源，发现HDAC1介导的表观遗传机制在不同细胞前体中改变，影响胚胎期的造血作用和微胶质细胞发育，导致免疫系统失调。 | 揭示了从大脑到肠道免疫失调的共同机制，并为针对免疫失调型自闭症亚型的治疗提供了新视角。 | NA | 探究自闭症中免疫失调的内在机制及其发展起源。 | 自闭症小鼠模型中的免疫失调现象。 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 228 | 2024-08-08 |
Improved T-cell Immunity Following Neoadjuvant Chemotherapy in Ovarian Cancer
2022-08-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2834
PMID:35443043
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研究论文 | 本文评估了接受新辅助化疗的晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的演变 | 发现新辅助化疗可能通过减少肿瘤负担和增强抗原处理与呈递来缓解肿瘤相关免疫抑制 | 研究样本量较小，仅包括10名患者 | 研究新辅助化疗对晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的影响 | 晚期高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 10名患者 |
| 229 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals circadian rhythm disruption associated with poor prognosis and drug-resistance in lung adenocarcinoma
2022-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12803
PMID:35436363
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研究论文 | 本研究开发了一种计算算法，用于定义肺腺癌中单细胞RNA测序数据集中的肿瘤内昼夜节律紊乱状态，并探讨其与临床预后和药物抵抗的关系 | 首次使用单细胞转录组数据分析昼夜节律紊乱与肺腺癌预后和药物抵抗的关系，并开发了开源R包CRDscore进行分析 | NA | 探讨昼夜节律紊乱在肺腺癌临床预测中的作用 | 肺腺癌中的昼夜节律紊乱状态及其对预后和药物抵抗的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算算法 | 转录组数据 | 三个代表性的单细胞RNA测序数据集及涉及22种癌症类型的公共批量转录组数据集 |
| 230 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in hiPSC-derived muscle progenitors and E2F family as a key regulator of proliferation
2022-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101312
PMID:35459735
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了hiPSC衍生的肌肉前体细胞图谱，揭示了其异质性并发现了E2F转录因子家族在细胞增殖中的关键作用 | 首次揭示了hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性，并识别了E2F转录因子家族作为其增殖的关键调节因子 | NA | 研究hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性及其对再生潜力的影响 | hiPSC衍生的肌肉前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个hiPSC衍生的肌肉前体细胞样本 |
| 231 | 2024-08-08 |
Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease
2022-08, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708
PMID:35428651
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研究论文 | 本文研究了一例由NLRC4体细胞突变引起的晚发性自身炎症性疾病的遗传基础，并通过多种技术手段揭示了其发病机制。 | 首次报道了低比例的NLRC4体细胞突变导致晚发性自身炎症性疾病，并提出了针对gasdermin D的新治疗策略。 | NA | 探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础和发病机制。 | 一例表现为关节炎、反复发热和皮肤疹的晚发性自身炎症性疾病。 | 遗传学 | 自身炎症性疾病 | 全外显子/基因组测序、数字滴液PCR (ddPCR)、单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、细胞内细胞因子染色、定量PCR、免疫组织化学和西方墨点法 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 单个病例 |
| 232 | 2024-08-08 |
Decoding the annulus fibrosus cell atlas by scRNA-seq to develop an inducible composite hydrogel: A novel strategy for disc reconstruction
2022-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.01.040
PMID:35386822
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解码小鼠纤维环细胞图谱，并基于此开发了一种可诱导的复合水凝胶，用于纤维环重建 | 首次鉴定出一种新的纤维环细胞群体——类成纤维软骨细胞，这种细胞能合成I型和II型胶原蛋白，是纤维环重建的潜在功能细胞。此外，还开发了一种基于甲基丙烯酸化丝素蛋白和甲基丙烯酸化透明质酸的复合水凝胶，用于纤维环缺陷的重建 | NA | 研究纤维环细胞图谱，并开发一种新的纤维环重建策略 | 小鼠纤维环细胞及纤维环重建 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠纤维环细胞 |
| 233 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomic profiles of mouse uterine microenvironments at pregnancy day 7.5†
2022-08-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac061
PMID:35357464
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了怀孕第7.5天小鼠子宫内膜植入部位的局部基因表达谱 | 首次详细描述了怀孕第7.5天小鼠子宫内膜植入部位的11个不同基因特征域和12种细胞类型，并揭示了区域特异性的内分泌和旁分泌信号调控的细胞行为和代谢偏好 | NA | 旨在揭示正常妊娠进展的分子机制 | 小鼠怀孕第7.5天的子宫内膜微环境 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠子宫内膜植入部位的多个样本 |
| 234 | 2024-08-08 |
Nicotinic acetylcholine receptors in a songbird brain
2022-08, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25314
PMID:35344610
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研究论文 | 研究了斑胸草雀大脑中15种烟碱型乙酰胆碱受体（nAChRs）亚基的克隆及其在鸟鸣学习和产生过程中的mRNA表达模式 | 首次全面研究了斑胸草雀大脑中15种nAChR亚基的表达模式及其对鸟鸣学习和产生的可能贡献 | 未检测到ChrnA1、A6、A9和A10的杂交信号 | 探讨烟碱型乙酰胆碱受体亚基在斑胸草雀鸟鸣学习和产生中的作用 | 斑胸草雀大脑中的15种nAChR亚基及其在鸟鸣学习和产生过程中的表达模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达 | 15种nAChR亚基 |
| 235 | 2024-08-08 |
Integrative spatial analysis of cell morphologies and transcriptional states with MUSE
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01251-z
PMID:35347329
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSE的多模态结构化嵌入方法，用于整合细胞形态学和空间解析的转录组数据，以表征细胞和组织区域 | MUSE能够发现单一模态可能遗漏的组织亚群，并补偿模态特定的噪声 | NA | 开发一种方法来整合细胞形态学和空间解析的转录组数据，以深入理解细胞状态、功能和复杂生物组织中的组织结构 | 细胞和组织区域 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | MUSE | 图像和转录组数据 | 多种数据集，包括健康和疾病的大脑皮质及肠道组织 |
| 236 | 2024-08-08 |
Endothelial OCT4 is atheroprotective by preventing metabolic and phenotypic dysfunction
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac036
PMID:35325071
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研究论文 | 本文探讨了OCT4在血管内皮细胞中的保护作用及其机制 | 首次证明了OCT4在血管内皮细胞中具有保护性的代谢功能，并揭示了OCT4/ABCG2轴在维持内皮细胞代谢稳态中的作用 | NA | 研究OCT4在血管内皮细胞中的功能及其对动脉粥样硬化的影响 | 血管内皮细胞中的OCT4 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 237 | 2024-08-08 |
Spatial charting of single-cell transcriptomes in tissues
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01233-1
PMID:35314812
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellTrek的计算方法，结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，实现单细胞的空间映射 | CellTrek通过共同嵌入和度量学习方法，将单细胞转录组数据与空间信息相结合，实现了单细胞的空间映射 | NA | 开发一种能够结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的方法，以实现单细胞的空间映射 | 小鼠大脑和肾脏组织，以及两个原位导管癌组织 | 生物信息学 | 原位导管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 共同嵌入和度量学习 | 转录组数据 | 两个原位导管癌组织 |
| 238 | 2024-08-08 |
A mouse model of the LEAP study reveals a role for CTLA-4 in preventing peanut allergy induced by environmental peanut exposure
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.02.024
PMID:35288169
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研究论文 | 本文通过建立模拟LEAP研究的小鼠模型，研究了环境花生暴露引发的花生过敏中CTLA-4的作用 | 首次在小鼠模型中验证了CTLA-4在预防由环境花生暴露引起的花生过敏中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 开发小鼠模型以模拟LEAP研究并探究其观察结果的潜在机制 | BALB/c小鼠及其对花生产品的免疫反应 | NA | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 成年BALB/c小鼠 |
| 239 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profile of mouse skin undergoing antigen-driven allergic inflammation recapitulates findings in atopic dermatitis skin lesions
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.002
PMID:35300986
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了经抗原驱动的过敏性炎症的小鼠皮肤，并与特应性皮炎皮肤病变中的发现进行了比较 | 揭示了小鼠皮肤中与特应性皮炎皮肤病变相似的基因表达特征，并发现了可能参与过敏性皮肤炎症的新通路 | NA | 研究小鼠皮肤在抗原驱动过敏性炎症中的单细胞基因表达特征，并与人类特应性皮炎皮肤病变进行比较 | 小鼠皮肤细胞在抗原驱动过敏性炎症中的基因表达 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠皮肤细胞样本 |
| 240 | 2024-08-08 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了轻度缺血性中风患者外周血单个核细胞（PBMCs）的转录组变化 | 首次基于转录组分析展示了轻度缺血性中风患者NK细胞数量增加和新单核细胞亚群的存在 | NA | 研究轻度缺血性中风后外周免疫反应的动态变化，以辅助诊断和潜在治疗开发 | 轻度缺血性中风患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性缺血性中风患者和9名种族、年龄、性别匹配的控制组 |