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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Cellular responses in the FGF10-mediated improvement of hindlimb regenerative capacity in Xenopus laevis revealed by single-cell transcriptomics
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12795
PMID:35642106
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序探索了FGF10处理后非洲爪蟾后肢芽的细胞反应,以改善其再生能力 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析FGF10处理后的非洲爪蟾后肢芽细胞,发现了新的steap4表达细胞簇和其他细胞类型的基因表达差异 | NA | 研究FGF10如何通过细胞反应改善非洲爪蟾后肢的再生能力 | 非洲爪蟾后肢芽的细胞反应 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
Mogroside V ameliorates the oxidative stress-induced meiotic defects in porcine oocytes in vitro
2022-08, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2022.05.008
PMID:35597324
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研究论文 | 研究探讨了Mogroside V(MV)如何改善由氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷 | 首次揭示了MV通过恢复线粒体完整性来减轻氧化应激引起的减数分裂缺陷的机制 | NA | 探索MV改善氧化应激引起的猪卵母细胞减数分裂缺陷的机制 | 猪卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-08 |
Reprogramming of Hepatic Metabolism and Microenvironment in Nonalcoholic Steatohepatitis
2022-08-22, Annual review of nutrition
IF:12.6Q1
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的最新研究进展,特别是遗传、表观遗传和饮食因素以及代谢功能障碍在其他组织中的作用,以及单细胞RNA测序揭示的肝脏细胞异质性和微环境重编程的分子细节。 | 单细胞RNA测序技术揭示了肝脏细胞异质性和微环境的分子细节,为理解NASH的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探讨NAFLD/NASH的病理生理机制及潜在的治疗机会。 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)及其严重形式非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-08 |
Distinct disease-specific Tfh cell populations in 2 different fibrotic diseases: IgG4-related disease and Kimura disease
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.034
PMID:35568079
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研究论文 | 本文研究了两种不同纤维化疾病中特定Tfh细胞亚群的特征,包括IgG4相关疾病和Kimura病。 | 发现了IgG4相关疾病患者受累器官中浸润的IL-10+LAG3+ Tfh细胞的新亚群,以及Kimura病患者中IL-13+ Tfh细胞和类型2免疫细胞的浸润。 | NA | 旨在识别次级和三级淋巴器官中表达IL-10或IL-13的疾病特异性Tfh细胞亚群,以识别两种不同类型纤维化疾病的不同细胞驱动因子。 | B细胞、Tfh细胞和浸润的类型2细胞在Kimura病或IgG4相关疾病患者病变组织中的特征。 | 免疫学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、原位测序和多色免疫荧光分析 | NA | 组织样本 | Kimura病和IgG4相关疾病患者的病变组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-08 |
Reconstructing physical cell interaction networks from single-cell data using Neighbor-seq
2022-08-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac333
PMID:35536255
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research paper | 本文开发了一种名为Neighbor-seq的方法,用于从大规模并行单细胞测序数据中识别和注释直接细胞间相互作用的结构及其相关的配体-受体信号传导 | Neighbor-seq方法能够准确识别多种组织类型(如小肠上皮、终末呼吸道和脾白髓)的微解剖特征,并捕捉胰腺和皮肤肿瘤中癌症-免疫-基质细胞通信的不同拓扑结构 | NA | 研究细胞间相互作用在健康和疾病中的器官级细胞互作组 | 细胞间相互作用及其相关的配体-受体信号传导 | digital pathology | NA | Neighbor-seq | NA | single-cell sequencing data | 多种组织类型(如小肠上皮、终末呼吸道和脾白髓)及胰腺和皮肤肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
Cell type identification in spatial transcriptomics data can be improved by leveraging cell-type-informative paired tissue images using a Bayesian probabilistic model
2022-08-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac320
PMID:35536287
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研究论文 | 本文介绍了一种新的计算方法,通过整合空间转录组数据与细胞类型信息丰富的配对组织图像,来提高组织细胞类型组成的推断 | 提出了一种贝叶斯概率模型,能够结合空间转录组数据和配对组织图像,显著提高细胞类型识别的准确性 | 该方法依赖于能够获取信息丰富的配对组织图像的空间转录组技术 | 提高空间转录组数据中细胞类型识别的准确性 | 空间转录组数据和配对组织图像 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | 贝叶斯概率模型 | 图像和基因表达数据 | 涉及小鼠脑组织和乳腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-08 |
Sequential Single-Cell Transcriptional and Protein Marker Profiling Reveals TIGIT as a Marker of CD19 CAR-T Cell Dysfunction in Patients with Non-Hodgkin Lymphoma
2022-08-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-1586
PMID:35554512
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和蛋白质表面标记分析,揭示了CD19 CAR-T细胞在非霍奇金淋巴瘤患者中的功能障碍,并发现TIGIT表达是一个重要的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质表面标记分析,揭示了CD19 CAR-T细胞在患者体内的变化,并验证了TIGIT阻断对CAR-T细胞抗肿瘤功能的改善作用。 | NA | 揭示CD19 CAR-T细胞在非霍奇金淋巴瘤患者中的功能障碍及其生物标志物。 | CD19 CAR-T细胞在非霍奇金淋巴瘤患者中的功能状态和生物标志物。 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个非霍奇金淋巴瘤患者的CAR-T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-08 |
Spatial determinants of CD8+ T cell differentiation in cancer
2022-08, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2022.04.003
PMID:35527216
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研究论文 | 本文探讨了癌症中CD8+ T细胞分化的空间决定因素 | 利用新的空间转录组学和成像技术揭示了CD8 T细胞功能调控的机制 | 现有的流式细胞术和单细胞转录组学技术未能捕捉到重要的空间信息 | 揭示调控CD8 T细胞功能的空间决定因素 | CD8+ T细胞在癌症中的分化 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学和成像技术 | NA | 细胞状态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
Macrophage functional diversity in NAFLD - more than inflammation
2022-08, Nature reviews. Endocrinology
DOI:10.1038/s41574-022-00675-6
PMID:35534573
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的多样性和功能,特别是肝内常驻巨噬细胞(Kupffer细胞)和单核细胞来源的肝巨噬细胞在稳态及NAFLD状态下的变化 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,深入研究了巨噬细胞在肝脏中的异质性,揭示了其在NAFLD和NASH发病机制中超越传统炎症角色的功能 | NA | 探讨巨噬细胞在NAFLD中的多样性和功能,特别是NASH中的作用 | 肝内常驻巨噬细胞(Kupffer细胞)和单核细胞来源的肝巨噬细胞 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies premature aging features of TERC-deficient mouse brain and bone marrow
2022-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00578-4
PMID:35545739
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,分析了TERC缺陷小鼠的脑和骨髓在早衰特征上的差异表达基因,揭示了早衰相关的炎症反应和神经发育抑制现象 | 首次通过单细胞转录组测序技术研究了TERC缺陷小鼠脑和骨髓的早衰特征,并发现了早衰相关的炎症反应和神经发育抑制现象 | NA | 探究TERC缺陷小鼠脑和骨髓的早衰特征及其相关机制 | TERC缺陷小鼠的脑和骨髓 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 年轻小鼠、自然衰老小鼠和TERC缺陷(TERC-KO)小鼠的脑和骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-08 |
Airway Macrophages Encompass Transcriptionally and Functionally Distinct Subsets Altered by Smoking
2022-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0563OC
PMID:35522264
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研究论文 | 本研究探讨了吸烟和慢性阻塞性肺病(COPD)对人类肺泡巨噬细胞(AMs)异质性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析,揭示了吸烟相关肺泡巨噬细胞的转录特征,包括解毒、氧化应激和促炎反应 | 研究样本仅包括健康非吸烟者、无COPD的吸烟者和有COPD的吸烟者,可能未能涵盖所有相关人群 | 探索吸烟和COPD对肺泡巨噬细胞异质性的影响 | 人类肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 健康非吸烟者、无COPD的吸烟者和有COPD的吸烟者的肺泡巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Dynamical Systems Model of RNA Velocity Improves Inference of Single-cell Trajectory, Pseudo-time and Gene Regulation
2022-08-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167606
PMID:35489382
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研究论文 | 本文开发了RNA-ODE框架,通过普通微分方程(ODE)模型量化系统级动态,改进单细胞数据分析 | 提出RNA-ODE框架,能够通过解决动态方程预测和外推每个细胞的表达轨迹,相比现有方法更准确地估计细胞状态谱系和伪时间 | NA | 改进单细胞RNA-seq数据的分析,提高对细胞发育谱系和动态的推断 | 单细胞RNA-seq数据,特别是RNA速度的推断 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ODE | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-08 |
Reduced adhesion of aged intestinal stem cells contributes to an accelerated clonal drift
2022-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201408
PMID:35487692
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研究论文 | 本文研究了衰老过程中肠道干细胞的粘附性降低如何加速克隆漂移 | 首次揭示了衰老肠道干细胞粘附性降低对克隆动态的影响 | NA | 探讨衰老对肠道干细胞克隆动态的影响 | 年轻和老年小鼠的肠道干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,920个高Lgr5肠道干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-08 |
A common epigenetic mechanism across different cellular origins underlies systemic immune dysregulation in an idiopathic autism mouse model
2022-08, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01566-y
PMID:35491410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,追踪了自闭症小鼠模型中免疫失调的发展起源,发现HDAC1介导的表观遗传机制在不同细胞前体中改变,影响胚胎期的造血作用和微胶质细胞发育,导致免疫系统失调。 | 揭示了从大脑到肠道免疫失调的共同机制,并为针对免疫失调型自闭症亚型的治疗提供了新视角。 | NA | 探究自闭症中免疫失调的内在机制及其发展起源。 | 自闭症小鼠模型中的免疫失调现象。 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-08 |
Improved T-cell Immunity Following Neoadjuvant Chemotherapy in Ovarian Cancer
2022-08-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2834
PMID:35443043
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研究论文 | 本文评估了接受新辅助化疗的晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的演变 | 发现新辅助化疗可能通过减少肿瘤负担和增强抗原处理与呈递来缓解肿瘤相关免疫抑制 | 研究样本量较小,仅包括10名患者 | 研究新辅助化疗对晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的影响 | 晚期高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 10名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals circadian rhythm disruption associated with poor prognosis and drug-resistance in lung adenocarcinoma
2022-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12803
PMID:35436363
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研究论文 | 本研究开发了一种计算算法,用于定义肺腺癌中单细胞RNA测序数据集中的肿瘤内昼夜节律紊乱状态,并探讨其与临床预后和药物抵抗的关系 | 首次使用单细胞转录组数据分析昼夜节律紊乱与肺腺癌预后和药物抵抗的关系,并开发了开源R包CRDscore进行分析 | NA | 探讨昼夜节律紊乱在肺腺癌临床预测中的作用 | 肺腺癌中的昼夜节律紊乱状态及其对预后和药物抵抗的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算算法 | 转录组数据 | 三个代表性的单细胞RNA测序数据集及涉及22种癌症类型的公共批量转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in hiPSC-derived muscle progenitors and E2F family as a key regulator of proliferation
2022-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101312
PMID:35459735
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了hiPSC衍生的肌肉前体细胞图谱,揭示了其异质性并发现了E2F转录因子家族在细胞增殖中的关键作用 | 首次揭示了hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性,并识别了E2F转录因子家族作为其增殖的关键调节因子 | NA | 研究hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性及其对再生潜力的影响 | hiPSC衍生的肌肉前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个hiPSC衍生的肌肉前体细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-08 |
Decoding the annulus fibrosus cell atlas by scRNA-seq to develop an inducible composite hydrogel: A novel strategy for disc reconstruction
2022-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.01.040
PMID:35386822
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解码小鼠纤维环细胞图谱,并基于此开发了一种可诱导的复合水凝胶,用于纤维环重建 | 首次鉴定出一种新的纤维环细胞群体——类成纤维软骨细胞,这种细胞能合成I型和II型胶原蛋白,是纤维环重建的潜在功能细胞。此外,还开发了一种基于甲基丙烯酸化丝素蛋白和甲基丙烯酸化透明质酸的复合水凝胶,用于纤维环缺陷的重建 | NA | 研究纤维环细胞图谱,并开发一种新的纤维环重建策略 | 小鼠纤维环细胞及纤维环重建 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠纤维环细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomic profiles of mouse uterine microenvironments at pregnancy day 7.5†
2022-08-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac061
PMID:35357464
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,分析了怀孕第7.5天小鼠子宫内膜植入部位的局部基因表达谱 | 首次详细描述了怀孕第7.5天小鼠子宫内膜植入部位的11个不同基因特征域和12种细胞类型,并揭示了区域特异性的内分泌和旁分泌信号调控的细胞行为和代谢偏好 | NA | 旨在揭示正常妊娠进展的分子机制 | 小鼠怀孕第7.5天的子宫内膜微环境 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠子宫内膜植入部位的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-08 |
Nicotinic acetylcholine receptors in a songbird brain
2022-08, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25314
PMID:35344610
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研究论文 | 研究了斑胸草雀大脑中15种烟碱型乙酰胆碱受体(nAChRs)亚基的克隆及其在鸟鸣学习和产生过程中的mRNA表达模式 | 首次全面研究了斑胸草雀大脑中15种nAChR亚基的表达模式及其对鸟鸣学习和产生的可能贡献 | 未检测到ChrnA1、A6、A9和A10的杂交信号 | 探讨烟碱型乙酰胆碱受体亚基在斑胸草雀鸟鸣学习和产生中的作用 | 斑胸草雀大脑中的15种nAChR亚基及其在鸟鸣学习和产生过程中的表达模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达 | 15种nAChR亚基 | NA | NA | NA | NA |