单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-08 |
Directed evolution of adeno-associated virus for efficient gene delivery to microglia
2022-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01547-7
PMID:35879607
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研究论文 | 本文报道了通过定向进化腺相关病毒（AAV）衣壳蛋白，发现能够高效介导体外和体内小胶质细胞转导的AAV变体 | 通过定向进化AAV衣壳蛋白，成功开发出能够高效向小胶质细胞传递遗传物质的新型AAV变体 | NA | 开发有效且安全的转基因传递载体，以促进小胶质细胞生物学及其相关疾病机制的研究 | 小胶质细胞 | 基因传递 | 中枢神经系统疾病 | 定向进化 | NA | RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics reveal cellular-specific responses and microenvironment remodeling in aristolochic acid nephropathy
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157360
PMID:35852860
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组学、批量转录组学和基于质谱的蛋白质组学分析，揭示了马兜铃酸肾病中细胞特异性反应和微环境重塑的机制。 | 首次综合运用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学技术，详细阐明了马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制。 | 研究仅限于小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 旨在阐明马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制，并探索潜在的治疗干预途径。 | 研究对象为急性暴露于马兜铃酸I的小鼠肾脏。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-08 |
Effective enrichment of stem cells in regenerating Xenopus laevis tadpole tails using the side population method
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12797
PMID:35839785
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研究论文 | 本文研究了使用侧群方法在再生非洲爪蟾蝌蚪尾巴中有效富集干细胞的方法 | 首次评估了侧群方法在非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中富集干细胞的有效性，并结合单细胞RNA测序进行分析 | 由于组织干细胞的稀有性，揭示其在尾巴再生过程中的行为动态较为困难 | 研究并分析在尾巴再生过程中稀有组织干细胞的行为动态 | 非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中的组织干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从再生芽中提取的侧群细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-08 |
Ets21C sustains a pro-regenerative transcriptional program in blastema cells of Drosophila imaginal discs
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.06.040
PMID:35820420
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研究论文 | 研究探讨了果蝇成虫盘细胞在损伤后通过局部增殖再生缺失部分的过程中，Ets21C转录因子如何维持再生特异性的转录程序 | 发现Ets21C转录因子在再生过程中调控特定基因表达网络，且这种机制可能被肿瘤利用以促进异常生长 | NA | 探究再生过程中基因调控网络的再激活与再生特异性转录程序的激活程度 | 果蝇成虫盘细胞及其再生过程中的基因表达 | 再生生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及再生翅盘中的两种特定细胞群Blastema1和Blastema2 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-08 |
Cell plasticity in regeneration in the stomach and beyond
2022-08, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101948
PMID:35809361
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research paper | 本文探讨了胃及其他器官在稳态和损伤后利用细胞可塑性程序招募祖细胞进行组织再生的机制 | 揭示了细胞可塑性在组织再生中的普遍性和重要性，以及其在病理过程中的潜在作用 | NA | 研究正常干细胞分化与可塑性在稳态和损伤后的相互作用，以及再生程序的共同特征 | 胃上皮细胞及其他器官的细胞可塑性和再生机制 | NA | NA | 细胞系追踪技术、类器官培养、单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-08 |
Heterogeneity analysis of astrocytes following spinal cord injury at single-cell resolution
2022-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200463R
PMID:35816276
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同时间点的星形胶质细胞转录组特征 | 揭示了六种转录上不同的星形胶质细胞状态，并分析了这些亚型在脊髓损伤后的动态演变过程 | NA | 旨在阐明星形胶质细胞在脊髓损伤后的异质性及其动态变化 | 星形胶质细胞在脊髓损伤后的亚型及其转录组特征 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后不同时间点的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-08 |
Characterization of Aldosterone-producing Cell Cluster (APCC) at Single-cell Resolution
2022-08-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgac394
PMID:35796577
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞分辨率分析醛固酮产生细胞簇（APCC）的转录组，并推断其发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下揭示了APCC的基因表达特征，并展示了部分ZG细胞重塑为APCC的过程 | NA | 分析APCC的转录组特征并推断其发育轨迹 | 成人肾上腺中的醛固酮产生细胞簇（APCC） | NA | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 2个成人肾上腺中的2928个肾上腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-08 |
ResPAN: a powerful batch correction model for scRNA-seq data through residual adversarial networks
2022-08-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac427
PMID:35771600
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研究论文 | 本文提出了一种名为ResPAN的轻量级深度学习框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的整合，通过残差对抗网络减少批次效应 | ResPAN结合了Wasserstein生成对抗网络（WGAN）、随机游走互最近邻配对和完全跳跃连接的自编码器，以减少批次间的差异 | NA | 解决多个scRNA-seq数据集整合分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 残差对抗网络（WGAN） | 基因组数据 | 超过五十万细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a senescence-associated IL-6/CCR6 axis driving radiodermatitis
2022-08-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202115653
PMID:35785521
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序分析受照射的皮肤细胞与基因敲除和分子抑制研究，揭示了衰老相关IL-6和IL-1信号以及IL-17上调和CCR6介导的免疫细胞迁移是放射性皮炎的关键驱动因素 | 首次揭示了衰老相关IL-6/CCR6轴在放射性皮炎中的作用，并证明了靶向治疗策略的有效性 | NA | 探究放射治疗引起的脱发和皮炎的分子和细胞基础 | 放射治疗引起的脱发和皮炎 | 数字病理学 | 放射性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及受照射的皮肤细胞、IL-6或IL-1R小鼠、CCR6小鼠等样本 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Circle of Willis in a Mouse Cerebral Aneurysm Model
2022-08, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.122.038776
PMID:35770669
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研究论文 | 本文首次对健康和动脉瘤小鼠Willis环的血管细胞进行了单细胞RNA测序分析，揭示了细胞谱系异质性和转录组特征的变化 | 首次全面分析了健康和动脉瘤小鼠Willis环血管细胞的谱系异质性和转录组变化 | NA | 研究Willis环在健康和动脉瘤状态下的细胞异质性和转录组特征 | 小鼠Willis环的血管细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过3900个Willis环细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-08 |
Zedoarondiol inhibits atherosclerosis by regulating monocyte migration and adhesion via CXCL12/CXCR4 pathway
2022-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106328
PMID:35772647
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研究论文 | 本研究探讨了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的效果 | 首次揭示了zedoarondiol通过调节CXCL12/CXCR4通路抑制单核细胞迁移和粘附，从而减轻动脉粥样硬化的机制 | NA | 探究zedoarondiol在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | zedoarondiol对动脉粥样硬化斑块的影响及对单核细胞迁移和粘附的调节作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq） | NA | NA | apoE基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the antifibrotic effects of YAP/TAZ in systemic sclerosis
2022-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2022.106257
PMID:35772663
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术探讨了YAP/TAZ在系统性硬化症中的抗纤维化作用及其机制 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了YAP/TAZ信号通路在系统性硬化症患者纤维细胞中的表达差异，并验证了YAP/TAZ敲低对系统性硬化症小鼠模型的抗纤维化效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人体中验证YAP/TAZ的治疗潜力 | 探究YAP/TAZ在系统性硬化症中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 | 系统性硬化症患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括系统性硬化症患者和健康志愿者的样本，以及系统性硬化症小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals CD133+CD44--originating evolution and novel stemness related variants in human colorectal cancer
2022-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104125
PMID:35785618
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研究论文 | 本文通过单细胞全外显子测序和批量细胞目标外显子测序，研究了人类结直肠癌起始细胞中的干细胞特异性体细胞变异或克隆进化 | 揭示了CD133+CD44-结直肠癌起始细胞可能是结直肠癌的原始来源，并发现了与干细胞特性相关的新变异基因 | NA | 高分辨率检测结直肠癌起始细胞的异质性 | 结直肠癌起始细胞、结直肠癌细胞和对照细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全外显子测序（scWES）、目标外显子测序（TES） | NA | 基因组数据 | 从一名结直肠癌患者的组织中分离出单细胞，并对96个样本（20名患者）进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-08 |
Shared Differential Expression-Based Distance Reflects Global Cell Type Relationships in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0652
PMID:35793527
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研究论文 | 本文修改了一种生物学驱动的距离度量SIDEseq，用于大规模单细胞RNA测序（scRNA seq）数据中细胞类型的聚合比较，并展示了该修改后的距离度量SIDEREF在模拟和真实数据中能更一致地保留细胞类型的全局关系 | 提出了修改后的距离度量SIDEREF，该度量在保留单细胞RNA测序数据的全局细胞类型关系方面优于常用的距离度量 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的距离度量，以更好地反映细胞类型的全局关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及12种组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-08 |
Consensus draft of the native mouse podocyte-ome
2022-08-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00058.2022
PMID:35796460
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研究论文 | 本文通过整合批量RNA测序、批量蛋白质组学和单细胞转录组学数据，建立了一个关于小鼠足细胞组（podocyte-ome）的共识草图，并开发了一个名为“PodIdent”的网络应用程序，用于探索性分析和查询足细胞特征。 | 本文首次整合了多种组学技术（包括批量RNA测序、批量蛋白质组学和单细胞转录组学）的数据，为足细胞的分子特征提供了一个统一的定义，并开发了一个新的知识库应用程序“PodIdent”。 | 目前，不同组学技术和研究之间的数据整合还不够完善。 | 旨在建立一个关于小鼠足细胞组（podocyte-ome）的共识草图，并开发一个网络应用程序，以便于探索性分析和查询足细胞特征。 | 小鼠足细胞（podocyte）及其分子特征。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 批量RNA测序、批量蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | RNA、蛋白质 | 三个公开可用的每种组学技术数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-08 |
Dissecting the process of human neutrophil lineage determination by using alpha-lipoic acid inducing neutrophil deficiency model
2022-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102392
PMID:35797799
|
研究论文 | 本研究利用α-硫辛酸诱导的中性粒细胞缺乏模型，探讨了人类中性粒细胞谱系决定的过程及其调控机制 | 发现了α-硫辛酸在调控中性粒细胞谱系特化中的新功能，并揭示了SF3B1-ELK轴在中性粒细胞前体细胞从CD371 CD115 GMPs向中性粒细胞前体细胞承诺过程中的作用 | NA | 阐明人类GMPs如何承诺为中性粒细胞前体细胞及其命运决定的调控机制 | 人类中性粒细胞谱系决定及其调控机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-08 |
Machine-learning-optimized Cas12a barcoding enables the recovery of single-cell lineages and transcriptional profiles
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.001
PMID:35752172
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISY的高容量Cas12a条形码系统，结合高通量筛选和机器学习优化条形码序列，用于恢复单细胞谱系和转录组信息 | DAISY条形码系统具有高容量和可靠性，能够在小尺寸下实现高效条形码生成，并成功应用于单细胞RNA测序 | NA | 开发一种高效的CRISPR-based条形码方法，以理解细胞谱系和转录组信息 | 人类黑色素瘤细胞的单细胞谱系和基因表达谱 | 机器学习 | NA | CRISPR-based条形码技术 | 机器学习模型 | 文本 | 约47,000个人类黑色素瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102176
PMID:35753346
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了脑干中斜方体内侧核（MNTB）细胞类型的转录组特征，并探讨了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在星形胶质细胞成熟和突触细化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了MNTB中主要细胞类型的转录组特征，并阐明了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路的功能 | NA | 研究神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号通路在脑干发育中的作用 | 脑干中斜方体内侧核（MNTB）的细胞类型及其转录组特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Col1a1 and Col1a2 as hub genes in obesity-induced cardiac fibrosis
2022-08-27, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.018
PMID:35714568
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，筛选肥胖诱导的心脏纤维化的关键标志物 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出Col1a1和Col1a2作为肥胖诱导心脏纤维化的枢纽基因 | 研究仅在肥胖小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 旨在早期检测和治疗肥胖相关的心脏疾病，以限制其进展 | 肥胖诱导的心脏纤维化及其关键标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及15种不同细胞类型，包括纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞，共33个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-08 |
Accounting for Errors in Data Improves Divergence Time Estimates in Single-cell Cancer Evolution
2022-08-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msac143
PMID:35733333
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研究论文 | 本文提出了一种在单细胞癌症进化分析中考虑数据误差的方法，通过在成熟的贝叶斯框架BEAST2中引入错误和突变模型，提高了相对分歧时间和替代参数的准确性。 | 本文的创新点在于开发了一种能够在单细胞数据进化推断中考虑误差的贝叶斯框架，并展示了这种模型在提高分歧时间估计准确性方面的效果。 | NA | 研究目的是改进单细胞癌症进化分析中分歧时间的估计，通过考虑数据误差来提高分析的准确性。 | 研究对象包括单细胞DNA测序数据，特别是结直肠癌患者和健康患者的细胞进化历史。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 贝叶斯框架 | DNA序列数据 | 包括结直肠癌患者和健康患者的单细胞DNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |