单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells
2022-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00931-x
PMID:35725769
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人骨髓造血干细胞（HSCs）的休眠状态，并揭示了透明质酸-GPRC5C信号轴在维持HSC休眠中的作用 | 首次揭示了透明质酸通过GPRC5C受体在人造血干细胞中维持休眠状态的作用机制 | NA | 探讨人造血干细胞的休眠状态及其调控机制 | 人骨髓造血干细胞及其休眠状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 162 | 2024-08-08 |
Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01097-3
PMID:35726057
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术，分析了多发性硬化症（MS）患者脑组织样本，揭示了MS进展中的多细胞机制及其与神经退行性变的空间分布关系 | 通过解析局部微环境中的配体-受体相互作用，发现了早期神经元衰退区域内的失效营养和抗炎细胞间通讯，为MS治疗药物开发提供了新的框架 | NA | 旨在揭示多发性硬化症进展中的复杂发病机制，并为药物开发提供新的策略 | 多发性硬化症患者的脑组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 163 | 2024-08-08 |
Deciphering the Spatial Modular Patterns of Tissues by Integrating Spatial and Single-Cell Transcriptomic Data
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0617
PMID:35727094
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研究论文 | 本文通过结合空间转录组学和单细胞转录组学数据，采用基于偏最小二乘法的方法（SpaMOD）来解析组织的空间模块模式 | 提出了一种新的方法SpaMOD，能够同时整合两种数据模式以及相关的细胞和斑点网络，以识别细胞-斑点共模块 | 新兴的空间转录组技术在单细胞分辨率和读取充分性方面仍存在不足 | 解析组织中细胞的空间组织结构 | 小鼠大脑、肉芽肿和胰腺导管腺癌的组织 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 偏最小二乘法（PLS） | 转录组数据 | 三组配对的scRNA-seq和ST数据集 |
| 164 | 2024-08-08 |
The metastatic spread of breast cancer accelerates during sleep
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04875-y
PMID:35732738
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌转移扩散在睡眠期间加速的现象 | 发现大多数自发性循环肿瘤细胞（CTCs）进入血管的事件发生在睡眠期间，且休息阶段的CTCs更易转移 | NA | 探讨乳腺癌转移的时间动态特性 | 乳腺癌患者和鼠模型的循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及乳腺癌患者和鼠模型 |
| 165 | 2024-08-08 |
Corrigendum to "Muscle-Derived Beige Adipose Precursors Secrete Promyogenic Exosomes That Treat Rotator Cuff Muscle Degeneration in Mice and Are Identified in Humans by Single-Cell RNA Sequencing"
2022-Jul, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465221111167
PMID:35736510
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and surface epitope detection in human brain epileptic lesions identifies pro-inflammatory signaling
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01095-5
PMID:35739273
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和表面表位检测技术，揭示了人脑癫痫病变中的促炎信号传导机制 | 首次使用单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq）技术，揭示了癫痫病变组织中的免疫转录组特征 | NA | 探究不适当的促炎机制是否在难治性癫痫的发病机制中起作用 | 人脑癫痫病变组织中的免疫微环境 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞细胞索引转录组和表位测序（CITE-seq） | NA | 转录组数据 | 手术切除的癫痫病变组织样本 |
| 167 | 2024-08-08 |
Entropy-based inference of transition states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac225
PMID:35696651
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研究论文 | 本文提出了一种基于过渡熵的单细胞轨迹推断方法scTite，用于从scRNA-seq数据中识别过渡状态并重建细胞轨迹 | 引入了一种新的度量标准——过渡熵，用于测量细胞属于不同细胞集群的不确定性，并据此识别细胞状态和过渡细胞 | NA | 开发一种新的单细胞轨迹推断方法，以更准确地重建细胞轨迹 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型、状态和过渡 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 四组真实scRNA-seq数据和一个综合数据集 |
| 168 | 2024-08-08 |
DURIAN: an integrative deconvolution and imputation method for robust signaling analysis of single-cell transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac223
PMID:35709795
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研究论文 | 介绍了一种名为DURIAN的集成去卷积和插补方法，用于恢复单细胞转录组数据中的基因表达 | DURIAN方法通过多任务回归基础的插补技术，提高了单细胞数据的聚类、低维嵌入和细胞间信号网络的恢复 | NA | 开发一种新的方法来恢复单细胞转录组数据中的基因表达信息 | 单细胞转录组数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多任务回归 | 转录组数据 | 使用合成数据集和已发表的数据集进行系统基准测试 |
| 169 | 2024-08-08 |
Analysis of Gene Expression and TCR/B Cell Receptor Profiling of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome by Single-Cell Sequencing
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100803
PMID:35705251
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术全面分析了原发性干燥综合征（pSS）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的基因表达变化及TCR/BCR谱系特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序技术，全面揭示了pSS患者免疫细胞亚群的变化及其TCR/BCR谱系的改变 | 研究仅限于pSS患者的外周血单个核细胞，未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 旨在全面表征pSS患者PBMCs的转录变化，以更好地理解pSS的发病机制、诊断和治疗 | 原发性干燥综合征（pSS）患者的免疫细胞及其TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 170 | 2024-08-08 |
Mapping the single-cell transcriptomic response of murine diabetic kidney disease to therapies
2022-07-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.05.010
PMID:35709763
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠糖尿病肾病模型对五种治疗方案的反应 | 首次揭示了糖尿病肾病及其治疗对所有肾脏细胞类型的异质性反应，并探讨了SGLT2i类药物可能的作用机制 | NA | 研究糖尿病肾病对小鼠肾脏细胞的影响及不同治疗方案的效果 | 小鼠糖尿病肾病模型及其对五种治疗方案的反应 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约100万个细胞 |
| 171 | 2024-08-08 |
A multifunctional locus controls motor neuron differentiation through short and long noncoding RNAs
2022-07-04, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108918
PMID:35698802
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研究论文 | 本文研究了一个多功能位点通过短链和长链非编码RNA调控运动神经元分化的机制 | 首次揭示了一个特定转录单元MN2中的长链非编码RNA lncMN2-203和两个miRNAs通过吸附miR-466i-5p并上调其靶点，以及抑制与增殖相关因子，来影响运动神经元分化的功能 | NA | 探究运动神经元分化过程中转录后调控的机制 | 运动神经元分化过程中的非编码RNA的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR/Cas9 | RNA | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
BET bromodomain inhibitor JQ1 regulates spermatid development by changing chromatin conformation in mouse spermatogenesis
2022-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.12.012
PMID:35685458
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq技术，探讨了BET溴结构域抑制剂JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | 首次揭示了JQ1通过改变染色质构象调控基因转录，影响精子发生的过程 | NA | 探究JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | JQ1对小鼠精子发生的影响及其分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），ATAC-seq | NA | 基因表达数据，染色质开放性数据 | 小鼠睾丸样本 |
| 173 | 2024-08-08 |
Application and prospect of single-cell sequencing in cancer metastasis
2022-Jul, Future oncology (London, England)
DOI:10.2217/fon-2022-0156
PMID:35686493
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在癌症转移研究中的应用及其未来前景 | 单细胞测序技术揭示了肿瘤进化遗传谱系、肿瘤内异质性和肿瘤微环境，促进了临床医学与分子生物学的结合 | NA | 探索单细胞测序在癌症转移中的应用，寻找更多临床治疗靶点 | 癌症转移过程中的遗传变异和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing sheds light on cell-type specific gene expression in immune cells
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00802-7
PMID:35689032
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential expression of EGFL7 and VEGF in giant-cell tumor of bone and osteosarcoma
2022-07, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221088238
PMID:35695550
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了巨细胞瘤骨和骨肉瘤中EGFL7和VEGF的基因表达谱 | 首次揭示了EGFL7和VEGF在巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 探究巨细胞瘤骨和骨肉瘤中促血管生成基因的表达及其作为潜在预后生物标志物和细胞类型靶向治疗的可能性 | 巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的EGFL7和VEGF基因表达 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的多种细胞类型 |
| 176 | 2024-08-08 |
Evaluating the performance of dropout imputation and clustering methods for single-cell RNA sequencing data
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105697
PMID:35697529
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研究论文 | 评估了九种流行的dropout插补方法与八种聚类方法在10个不同样本大小的单细胞RNA测序数据集上的组合效果 | 展示了插补算法通常能提高聚类方法的性能，并且特定插补与聚类方法组合的性能随数据集大小而变化 | NA | 探讨如何通过插补方法改善单细胞RNA测序数据的聚类质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个不同样本大小的数据集 |
| 177 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals microglia induced angiogenesis by specific subsets of endothelial cells following spinal cord injury
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200337R
PMID:35699080
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后特定内皮细胞亚群介导的微胶质细胞诱导的血管生成过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了脊髓损伤后血管生成的细胞和分子图谱 | 研究仅限于大鼠模型，未来需在更多物种中验证结果 | 探究脊髓损伤后血管生成的细胞机制 | 脊髓损伤后的血管内皮细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同时间点的脊髓组织样本 |
| 178 | 2024-08-08 |
Mechanisms of joint destruction in rheumatoid arthritis - immune cell-fibroblast-bone interactions
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00793-5
PMID:35705856
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研究论文 | 本文探讨了类风湿性关节炎中关节破坏的机制，特别是免疫细胞、成纤维细胞和骨细胞之间的相互作用。 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了滑膜成纤维细胞和免疫细胞的异质性，并探讨了免疫系统如何促进滑膜成纤维细胞的组织破坏特性。 | NA | 旨在深入理解类风湿性关节炎中关节破坏的免疫机制，以及免疫系统、滑膜成纤维细胞和骨之间的相互作用。 | 类风湿性关节炎中的免疫细胞、成纤维细胞和骨细胞。 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
A PDX1 cistrome and single-cell transcriptome resource of the developing pancreas
2022-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200432
PMID:35708349
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研究论文 | 本研究通过PDX1 ChIP-seq和单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿胰腺中PDX1结合的动态变化及其在胰腺发育中的作用 | 首次系统地研究了PDX1在人类和鼠类胰腺发育中的动态结合变化，并揭示了其在不同发育阶段的多方面作用 | NA | 探讨PDX1在胰腺发育中的作用及其结合基因的动态变化 | PDX1在人类和鼠类胰腺发育中的结合动态及其相关基因 | NA | NA | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 人类胎儿胰腺样本 |
| 180 | 2024-08-08 |
Comparative analysis of the testes from wild-type and Alkbh5-knockout mice using single-cell RNA sequencing
2022-07-29, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkac130
PMID:35652742
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对比分析了野生型和Alkbh5敲除小鼠的睾丸样本，揭示了ALKBH5在精子发生和生殖细胞发育中的重要作用 | 本研究首次提供了ALKBH5缺陷小鼠睾丸的单细胞RNA测序图谱，为理解ALKBH5在生殖细胞发育和精子发生中的分子机制提供了新的见解 | NA | 探究ALKBH5缺陷如何影响小鼠的精子发生和生殖细胞发育 | 野生型和Alkbh5敲除小鼠的睾丸细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 5,596个野生型小鼠睾丸细胞和6,816个敲除小鼠睾丸细胞 |