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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Clonal structure, stability and dynamics of human memory B cells and circulating plasmablasts
2022-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01230-1
PMID:35761085
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合特定抗体的分离,探讨了人类记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆结构、稳定性和动态变化 | 首次系统描述了人类记忆B细胞池的结构、稳定性和动态变化,并提出记忆B细胞可能在任何时间点参与浆母细胞的生成 | NA | 研究记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆关系及其进化 | 人类记忆B细胞和循环浆母细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 两名健康捐赠者的多年样本 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-08 |
Dicer deficiency impairs proliferation but potentiates anti-tumoral effect of macrophages in glioblastoma
2022-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02393-9
PMID:35764885
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研究论文 | 本文研究了Dicer酶在巨噬细胞中的遗传缺失对胶质母细胞瘤的影响,发现这种缺失抑制了肿瘤生长并延长了携带肿瘤小鼠的生存期 | 首次报道了Dicer酶在巨噬细胞中的缺失能够减少免疫抑制性胶质母细胞瘤相关巨噬细胞的比例,并将其重编程为促炎激活状态,增强其吞噬活性和IFN产生能力 | NA | 探讨Dicer酶在巨噬细胞中的缺失对胶质母细胞瘤的免疫治疗潜力 | Dicer酶在巨噬细胞中的作用及其对胶质母细胞瘤的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GL261小鼠胶质母细胞瘤异种移植模型和携带肿瘤的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
Very-low-density lipoprotein receptor-enhanced lipid metabolism in pancreatic stellate cells promotes pancreatic fibrosis
2022-07-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.06.001
PMID:35738281
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白受体增强的脂质代谢在胰腺星状细胞中促进胰腺纤维化的发生和机制 | 首次揭示了低密度脂蛋白受体在胰腺星状细胞中的脂质代谢增强与胰腺纤维化的关系,并强调了IL-33在此过程中的主导作用 | NA | 研究脂蛋白代谢紊乱与胰腺纤维化环境之间的关系 | 胰腺星状细胞的激活机制及其在慢性胰腺炎中纤维化加剧的作用 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-08 |
Lymphatics act as a signaling hub to regulate intestinal stem cell activity
2022-07-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.05.007
PMID:35728595
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研究论文 | 本文报道了小肠和大肠的隐窝基部存在一个淋巴网络,该网络与肠道干细胞(ISCs)紧密相关,并通过体内功能丧失和淋巴器官共培养实验,揭示了淋巴系统维持ISCs并抑制其过早分化的作用。 | 首次揭示了淋巴系统在小肠和大肠隐窝中作为信号中枢,直接影响ISCs的再生能力,并通过单细胞和空间转录组学技术,使用BayesPrism和SpaceFold工具,高分辨率地绘制了隐窝微环境的信号图谱。 | NA | 研究淋巴系统在肠道干细胞微环境中的作用及其对干细胞行为的调控机制。 | 肠道干细胞(ISCs)及其微环境中的淋巴系统。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
A probabilistic Boolean model on hair follicle cell fate regulation by TGF-β
2022-07-05, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2022.05.035
PMID:35714600
|
研究论文 | 本文开发了一种新的概率布尔网络(pBN)模型,用于理解头发 follicle(HF)细胞命运调控的机制,特别是TGF-β在HF细胞命运调控中的双重作用 | 首次采用概率布尔网络模型来模拟HF上皮细胞基因调控动力学,并结合单细胞RNA测序数据进行模型优化 | 模型主要基于文献和单细胞RNA测序数据,可能需要进一步的实验验证 | 理解HF细胞命运调控的机制,特别是TGF-β的双重作用 | 头发 follicle(HF)细胞命运调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络(pBN) | 基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Maternal DDB1 regulates apoptosis and lineage differentiation in porcine preimplantation embryos
2022-Jul, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD22028
PMID:35724990
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研究论文 | 研究探讨了母源性基因DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 首次详细研究了DDB1在猪早期胚胎发育中的作用,发现DDB1缺乏会导致胚胎细胞数量减少、细胞凋亡增加及细胞分化异常 | NA | 探索DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 猪早期胚胎 | NA | NA | RNA干扰、显微注射、RT-qPCR、免疫荧光染色和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GV和MII卵母细胞及早期胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-08 |
Deciphering the Spatial Modular Patterns of Tissues by Integrating Spatial and Single-Cell Transcriptomic Data
2022-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0617
PMID:35727094
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研究论文 | 本文通过结合空间转录组学和单细胞转录组学数据,采用基于偏最小二乘法的方法(SpaMOD)来解析组织的空间模块模式 | 提出了一种新的方法SpaMOD,能够同时整合两种数据模式以及相关的细胞和斑点网络,以识别细胞-斑点共模块 | 新兴的空间转录组技术在单细胞分辨率和读取充分性方面仍存在不足 | 解析组织中细胞的空间组织结构 | 小鼠大脑、肉芽肿和胰腺导管腺癌的组织 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 偏最小二乘法(PLS) | 转录组数据 | 三组配对的scRNA-seq和ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
The metastatic spread of breast cancer accelerates during sleep
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04875-y
PMID:35732738
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌转移扩散在睡眠期间加速的现象 | 发现大多数自发性循环肿瘤细胞(CTCs)进入血管的事件发生在睡眠期间,且休息阶段的CTCs更易转移 | NA | 探讨乳腺癌转移的时间动态特性 | 乳腺癌患者和鼠模型的循环肿瘤细胞(CTCs) | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及乳腺癌患者和鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Corrigendum to "Muscle-Derived Beige Adipose Precursors Secrete Promyogenic Exosomes That Treat Rotator Cuff Muscle Degeneration in Mice and Are Identified in Humans by Single-Cell RNA Sequencing"
2022-Jul, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465221111167
PMID:35736510
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and surface epitope detection in human brain epileptic lesions identifies pro-inflammatory signaling
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01095-5
PMID:35739273
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和表面表位检测技术,揭示了人脑癫痫病变中的促炎信号传导机制 | 首次使用单细胞细胞索引转录组和表位测序(CITE-seq)技术,揭示了癫痫病变组织中的免疫转录组特征 | NA | 探究不适当的促炎机制是否在难治性癫痫的发病机制中起作用 | 人脑癫痫病变组织中的免疫微环境 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞细胞索引转录组和表位测序(CITE-seq) | NA | 转录组数据 | 手术切除的癫痫病变组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
Entropy-based inference of transition states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac225
PMID:35696651
|
研究论文 | 本文提出了一种基于过渡熵的单细胞轨迹推断方法scTite,用于从scRNA-seq数据中识别过渡状态并重建细胞轨迹 | 引入了一种新的度量标准——过渡熵,用于测量细胞属于不同细胞集群的不确定性,并据此识别细胞状态和过渡细胞 | NA | 开发一种新的单细胞轨迹推断方法,以更准确地重建细胞轨迹 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型、状态和过渡 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 四组真实scRNA-seq数据和一个综合数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
DURIAN: an integrative deconvolution and imputation method for robust signaling analysis of single-cell transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac223
PMID:35709795
|
研究论文 | 介绍了一种名为DURIAN的集成去卷积和插补方法,用于恢复单细胞转录组数据中的基因表达 | DURIAN方法通过多任务回归基础的插补技术,提高了单细胞数据的聚类、低维嵌入和细胞间信号网络的恢复 | NA | 开发一种新的方法来恢复单细胞转录组数据中的基因表达信息 | 单细胞转录组数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多任务回归 | 转录组数据 | 使用合成数据集和已发表的数据集进行系统基准测试 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-08 |
Analysis of Gene Expression and TCR/B Cell Receptor Profiling of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome by Single-Cell Sequencing
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100803
PMID:35705251
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术全面分析了原发性干燥综合征(pSS)患者外周血单个核细胞(PBMCs)的基因表达变化及TCR/BCR谱系特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序技术,全面揭示了pSS患者免疫细胞亚群的变化及其TCR/BCR谱系的改变 | 研究仅限于pSS患者的外周血单个核细胞,未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 旨在全面表征pSS患者PBMCs的转录变化,以更好地理解pSS的发病机制、诊断和治疗 | 原发性干燥综合征(pSS)患者的免疫细胞及其TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Mapping the single-cell transcriptomic response of murine diabetic kidney disease to therapies
2022-07-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.05.010
PMID:35709763
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠糖尿病肾病模型对五种治疗方案的反应 | 首次揭示了糖尿病肾病及其治疗对所有肾脏细胞类型的异质性反应,并探讨了SGLT2i类药物可能的作用机制 | NA | 研究糖尿病肾病对小鼠肾脏细胞的影响及不同治疗方案的效果 | 小鼠糖尿病肾病模型及其对五种治疗方案的反应 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
A multifunctional locus controls motor neuron differentiation through short and long noncoding RNAs
2022-07-04, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108918
PMID:35698802
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研究论文 | 本文研究了一个多功能位点通过短链和长链非编码RNA调控运动神经元分化的机制 | 首次揭示了一个特定转录单元MN2中的长链非编码RNA lncMN2-203和两个miRNAs通过吸附miR-466i-5p并上调其靶点,以及抑制与增殖相关因子,来影响运动神经元分化的功能 | NA | 探究运动神经元分化过程中转录后调控的机制 | 运动神经元分化过程中的非编码RNA的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR/Cas9 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
BET bromodomain inhibitor JQ1 regulates spermatid development by changing chromatin conformation in mouse spermatogenesis
2022-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.12.012
PMID:35685458
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC-seq技术,探讨了BET溴结构域抑制剂JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | 首次揭示了JQ1通过改变染色质构象调控基因转录,影响精子发生的过程 | NA | 探究JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | JQ1对小鼠精子发生的影响及其分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),ATAC-seq | NA | 基因表达数据,染色质开放性数据 | 小鼠睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Application and prospect of single-cell sequencing in cancer metastasis
2022-Jul, Future oncology (London, England)
DOI:10.2217/fon-2022-0156
PMID:35686493
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在癌症转移研究中的应用及其未来前景 | 单细胞测序技术揭示了肿瘤进化遗传谱系、肿瘤内异质性和肿瘤微环境,促进了临床医学与分子生物学的结合 | NA | 探索单细胞测序在癌症转移中的应用,寻找更多临床治疗靶点 | 癌症转移过程中的遗传变异和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing sheds light on cell-type specific gene expression in immune cells
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00802-7
PMID:35689032
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential expression of EGFL7 and VEGF in giant-cell tumor of bone and osteosarcoma
2022-07, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221088238
PMID:35695550
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了巨细胞瘤骨和骨肉瘤中EGFL7和VEGF的基因表达谱 | 首次揭示了EGFL7和VEGF在巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 探究巨细胞瘤骨和骨肉瘤中促血管生成基因的表达及其作为潜在预后生物标志物和细胞类型靶向治疗的可能性 | 巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的EGFL7和VEGF基因表达 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Evaluating the performance of dropout imputation and clustering methods for single-cell RNA sequencing data
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105697
PMID:35697529
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研究论文 | 评估了九种流行的dropout插补方法与八种聚类方法在10个不同样本大小的单细胞RNA测序数据集上的组合效果 | 展示了插补算法通常能提高聚类方法的性能,并且特定插补与聚类方法组合的性能随数据集大小而变化 | NA | 探讨如何通过插补方法改善单细胞RNA测序数据的聚类质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个不同样本大小的数据集 | NA | NA | NA | NA |