单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
In vivo transcriptional analysis of mice infected with Leishmania major unveils cellular heterogeneity and altered transcriptomic profiling at single-cell resolution
2022-07, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010518
PMID:35789215
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研究论文 | 本文通过结合批量RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq），对感染利什曼原虫L. major的小鼠进行体内转录组分析，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | 首次进行了L. major感染小鼠的体内全局转录组分析，结合了批量和单细胞RNA测序技术，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | NA | 研究L. major感染小鼠后的体内转录组变化，特别是免疫反应和细胞异质性。 | 感染利什曼原虫L. major的小鼠及其免疫细胞。 | 数字病理学 | 皮肤利什曼病 | RNA测序（RNA-Seq），单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 感染L. major的小鼠样本 |
| 142 | 2024-08-08 |
Natural high-avidity T-cell receptor efficiently mediates regression of cancer/testis antigen 83 positive common solid cancers
2022-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004713
PMID:35798537
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研究论文 | 本文研究了从年轻健康捐赠者中分离出的高亲和力T细胞受体（TCR）对CT83阳性常见实体癌的疗效 | 本文首次从年轻健康捐赠者中分离出针对常见实体癌中频繁表达的CTA的高亲和力TCR，并展示了其在体外和体内的抗肿瘤活性 | NA | 研究高亲和力TCR对CT83阳性常见实体癌的疗效 | CT83蛋白和其特异性TCR | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 来自年轻健康捐赠者的T细胞 |
| 143 | 2024-08-08 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2,3,7,8-四氯二苯并-对二恶英（TCDD）对斑马鱼精子发生的影响 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析了TCDD暴露后斑马鱼睾丸中不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 探讨TCDD暴露对斑马鱼精子发生的影响及其分子机制 | 斑马鱼精子发生过程中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼睾丸中的多种细胞类型 |
| 144 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: expansion, integration and translation
2022-07-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac011
PMID:35753690
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术的发展及其在多组学研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术已扩展到基因组学、蛋白质组学和代谢组学等领域，并与其他技术如空间数据和CRISPR筛选技术集成，以增强对复杂细胞行为的理解 | NA | 旨在全面理解复杂的细胞行为，并通过集成多组学数据和其他技术层信息来获得新的知识或功能 | 单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Identification of Pathogenic Immune Cell Subsets Associated With Checkpoint Inhibitor-Induced Myocarditis
2022-07-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过时间飞行质谱技术和多组学单细胞技术，识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 发现了一种在免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者中显著增加的克隆性细胞毒性Temra CD8+细胞，并揭示了其独特的转录变化 | NA | 识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者的外周血单个核细胞和Pdcd1-/-小鼠 | 免疫学 | 心肌炎 | 时间飞行质谱技术，单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，细胞转录组和表位索引测序 | NA | 细胞 | 52名个体（29名患者和23名健康对照），30名患者/对照，Pdcd1-/-小鼠 |
| 146 | 2024-08-08 |
Mapping developmental paths of monkey primordial germ-like cells differentiation from pluripotent stem cells by single cell ribonucleic acid sequencing analysis†
2022-07-25, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac133
PMID:35766401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴多能干细胞向原始生殖样细胞的分化路径 | 首次在猕猴中利用胚胎体分化系统诱导原始生殖样细胞的形成，并揭示了关键生长因子在分化过程中的作用 | 研究仅限于猕猴，尚未扩展到其他非人类灵长类动物 | 探讨多能干细胞向原始生殖样细胞分化的细胞和分子机制 | 猕猴的多能干细胞及其分化形成的原始生殖样细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约40,000个多能干细胞及胚胎体内的细胞 |
| 147 | 2024-08-08 |
Cell-cell communication inference and analysis in the tumour microenvironments from single-cell transcriptomics: data resources and computational strategies
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac234
PMID:35753695
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研究论文 | 本文介绍了从单细胞转录组数据中推断和分析肿瘤微环境中细胞间通讯的流程，并列举了相关的数据库和可视化工具 | 本文提出了七种经典的细胞间通讯评分策略，并强调了四种代表性的细胞间通讯推断方法，包括基于网络的方法、基于机器学习的方法、基于空间信息的方法和其他方法 | 本文分析了上述四种细胞间通讯方法的优势和局限性，并指出了在肿瘤微环境中进行细胞间通讯分析时面临的主要挑战 | 旨在改进癌症治疗，通过量化肿瘤微环境中不同细胞类型之间的交叉对话 | 肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison on cell-type composition inference for spatial transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac245
PMID:35753702
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学数据中细胞类型组成推断的先进方法，并比较了它们的优缺点 | 构建了来自单细胞水平的空间转录组数据点，评估了10种方法的性能，并比较了它们在不同组织和技术平台上的表现 | 空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 评估和比较空间转录组学数据中细胞类型组成推断方法的性能 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 10种方法在不同组织和技术平台上的表现被评估 |
| 149 | 2024-08-08 |
Fast and accurate matching of cellular barcodes across short-reads and long-reads of single-cell RNA-seq experiments
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104530
PMID:35747387
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTagger的计算方法，用于匹配单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | scTagger在准确性和时间效率上显著优于现有先进工具 | NA | 克服利用长读和短读技术进行单细胞测序时匹配细胞条码的挑战 | 单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 使用了真实和模拟数据集进行测试 |
| 150 | 2024-08-08 |
ICOS-Deficient Regulatory T Cells Can Prevent Spontaneous Autoimmunity but Are Impaired in Controlling Acute Inflammation
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100897
PMID:35760518
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研究论文 | 研究探讨了ICOS缺陷的调节性T细胞在预防自发性自身免疫和控制急性炎症中的作用 | 通过条件性敲除系统，选择性地在表达Foxp3的细胞中消除ICOS表达，揭示了ICOS在调节性T细胞中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究ICOS在调节性T细胞中的功能及其在自身免疫和炎症控制中的作用 | ICOS缺陷的调节性T细胞及其在自身免疫和炎症中的作用 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 条件性敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用ICOS FC小鼠和Foxp3-Cre控制小鼠进行比较研究 |
| 151 | 2024-08-08 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 研究通过构建一种类器官的气液界面模型，探讨结膜上皮细胞对SARS-CoV-2感染的抵抗性 | 首次使用单细胞RNA测序结合成像和病毒学检测方法，揭示了结膜上皮细胞对SARS-CoV-2的早期固有免疫反应 | NA | 探讨结膜上皮细胞对SARS-CoV-2感染的抵抗性及其免疫反应机制 | 结膜上皮细胞及其对SARS-CoV-2的感染反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 结膜上皮细胞包括基底层、超基底层和表层上皮细胞及成纤维细胞 |
| 152 | 2024-08-08 |
Nephrin expression in human epidermal keratinocytes and its implication in poor wound closure
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100455RR
PMID:35747929
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研究论文 | 本研究首次证实了nephrin在人类表皮角质形成细胞中的表达，并探讨了其在伤口愈合中的作用 | 首次报道了nephrin在人类皮肤中的表达及其在细胞粘附、增殖和迁移中的功能 | NA | 探讨nephrin在人类皮肤中的表达及其在伤口愈合中的作用 | 人类表皮角质形成细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫组织化学和免疫电子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
CDSImpute: An ensemble similarity imputation method for single-cell RNA sequence dropouts
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105658
PMID:35751187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CDSImpute的新型单细胞RNA测序数据填补方法，用于恢复因技术限制导致的基因表达缺失 | CDSImpute通过考虑细胞间的相关性和负距离，创建相似细胞列表，并从相似细胞中借用基因表达来检测和纠正缺失事件 | NA | 开发一种高效准确的方法来恢复单细胞RNA测序中的真实基因表达 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Kolod、Pollen和Usoskin等多个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 154 | 2024-08-08 |
A shared disease-associated oligodendrocyte signature among multiple CNS pathologies
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01104-7
PMID:35760863
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在野生型和阿尔茨海默病模型（5xFAD）小鼠脑中绘制了所有非免疫、非神经元细胞群体，并识别出一种与脑病理相关的寡突胶质细胞状态，称为疾病相关寡突胶质细胞（DOLs） | 本研究揭示了在中枢神经系统病理中共享的寡突胶质细胞特征，并发现DOLs在多种神经退行性和自身免疫炎症条件下均可被识别 | NA | 探索阿尔茨海默病及其他中枢神经系统病理中寡突胶质细胞的共同反应 | 野生型和阿尔茨海默病模型小鼠的脑组织，以及人类死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多种小鼠模型和人类死后脑组织样本 |
| 155 | 2024-08-08 |
Clonal structure, stability and dynamics of human memory B cells and circulating plasmablasts
2022-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01230-1
PMID:35761085
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合特定抗体的分离，探讨了人类记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆结构、稳定性和动态变化 | 首次系统描述了人类记忆B细胞池的结构、稳定性和动态变化，并提出记忆B细胞可能在任何时间点参与浆母细胞的生成 | NA | 研究记忆B细胞和循环浆母细胞的克隆关系及其进化 | 人类记忆B细胞和循环浆母细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 两名健康捐赠者的多年样本 |
| 156 | 2024-08-08 |
Dicer deficiency impairs proliferation but potentiates anti-tumoral effect of macrophages in glioblastoma
2022-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02393-9
PMID:35764885
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研究论文 | 本文研究了Dicer酶在巨噬细胞中的遗传缺失对胶质母细胞瘤的影响，发现这种缺失抑制了肿瘤生长并延长了携带肿瘤小鼠的生存期 | 首次报道了Dicer酶在巨噬细胞中的缺失能够减少免疫抑制性胶质母细胞瘤相关巨噬细胞的比例，并将其重编程为促炎激活状态，增强其吞噬活性和IFN产生能力 | NA | 探讨Dicer酶在巨噬细胞中的缺失对胶质母细胞瘤的免疫治疗潜力 | Dicer酶在巨噬细胞中的作用及其对胶质母细胞瘤的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GL261小鼠胶质母细胞瘤异种移植模型和携带肿瘤的小鼠 |
| 157 | 2024-08-08 |
Very-low-density lipoprotein receptor-enhanced lipid metabolism in pancreatic stellate cells promotes pancreatic fibrosis
2022-07-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.06.001
PMID:35738281
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白受体增强的脂质代谢在胰腺星状细胞中促进胰腺纤维化的发生和机制 | 首次揭示了低密度脂蛋白受体在胰腺星状细胞中的脂质代谢增强与胰腺纤维化的关系，并强调了IL-33在此过程中的主导作用 | NA | 研究脂蛋白代谢紊乱与胰腺纤维化环境之间的关系 | 胰腺星状细胞的激活机制及其在慢性胰腺炎中纤维化加剧的作用 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Lymphatics act as a signaling hub to regulate intestinal stem cell activity
2022-07-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.05.007
PMID:35728595
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研究论文 | 本文报道了小肠和大肠的隐窝基部存在一个淋巴网络，该网络与肠道干细胞（ISCs）紧密相关，并通过体内功能丧失和淋巴器官共培养实验，揭示了淋巴系统维持ISCs并抑制其过早分化的作用。 | 首次揭示了淋巴系统在小肠和大肠隐窝中作为信号中枢，直接影响ISCs的再生能力，并通过单细胞和空间转录组学技术，使用BayesPrism和SpaceFold工具，高分辨率地绘制了隐窝微环境的信号图谱。 | NA | 研究淋巴系统在肠道干细胞微环境中的作用及其对干细胞行为的调控机制。 | 肠道干细胞（ISCs）及其微环境中的淋巴系统。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 159 | 2024-08-08 |
A probabilistic Boolean model on hair follicle cell fate regulation by TGF-β
2022-07-05, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2022.05.035
PMID:35714600
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研究论文 | 本文开发了一种新的概率布尔网络（pBN）模型，用于理解头发 follicle（HF）细胞命运调控的机制，特别是TGF-β在HF细胞命运调控中的双重作用 | 首次采用概率布尔网络模型来模拟HF上皮细胞基因调控动力学，并结合单细胞RNA测序数据进行模型优化 | 模型主要基于文献和单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证 | 理解HF细胞命运调控的机制，特别是TGF-β的双重作用 | 头发 follicle（HF）细胞命运调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（pBN） | 基因调控网络 | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
Maternal DDB1 regulates apoptosis and lineage differentiation in porcine preimplantation embryos
2022-Jul, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD22028
PMID:35724990
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研究论文 | 研究探讨了母源性基因DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 首次详细研究了DDB1在猪早期胚胎发育中的作用，发现DDB1缺乏会导致胚胎细胞数量减少、细胞凋亡增加及细胞分化异常 | NA | 探索DDB1在猪早期胚胎发育中的表达模式、基因组遗产及其潜在分子机制 | 猪早期胚胎 | NA | NA | RNA干扰、显微注射、RT-qPCR、免疫荧光染色和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及GV和MII卵母细胞及早期胚胎 |