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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 141 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics atlas reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment components in colorectal cancer
2022-07-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03510-8
PMID:35794563
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和批量RNA测序数据，探讨了结直肠癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 本研究首次鉴定了两种不同类型的癌症相关成纤维细胞，并揭示了它们在肿瘤微环境中的功能意义 | NA | 探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用，为精准治疗提供依据 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学（ST） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Multi-omics molecular biomarkers and database of osteoarthritis
2022-07-05, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baac052
PMID:35788653
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research paper | 本文构建了一个名为OAomics和分子生物标志物（OAOB）的在线数据库，整合了来自159篇出版物的多组学实验结果和2405个分类的OA相关基因标记，以及基于最近单细胞RNA测序数据的5459个关节细胞类型基因标记。 | 这是首个针对骨关节炎的分子生物标志物数据库。 | NA | 构建一个综合的在线数据库，用于存储和提供骨关节炎相关的分子生物标志物信息。 | 骨关节炎（OA）相关的基因标记和多组学特征。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 2405个分类的OA相关基因标记和5459个关节细胞类型基因标记 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Integrated analysis reveals the dysfunction of signaling pathways in uveal melanoma
2022-Jul-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09822-8
PMID:35790930
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研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了葡萄膜黑色素瘤中信号通路的失调 | 本研究通过单细胞测序数据和细胞间通信分析，揭示了葡萄膜黑色素瘤中主要和转移阶段之间信号通路的异常状态 | NA | 探索葡萄膜黑色素瘤中信号通路的失调，并为潜在的临床应用提供理论基础 | 葡萄膜黑色素瘤中的信号通路 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 健康数据集和三个葡萄膜黑色素瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Renal organoid modeling of tuberous sclerosis complex reveals lesion features arise from diverse developmental processes
2022-07-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111048
PMID:35793620
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研究论文 | 研究通过遗传工程构建的人类肾脏类器官模型，模拟了TSC肾脏疾病的多种特征，并通过单细胞RNA测序揭示了TSC1或TSC2缺失对肾脏上皮、基质和胶质细胞发育过程的影响 | 首次报道了TSC肾脏疾病的遗传工程人类肾脏类器官模型，并通过单细胞RNA测序详细分析了TSC1或TSC2缺失对肾脏不同细胞类型的发育影响 | NA | 探究TSC肾脏疾病的发病机制 | TSC1或TSC2缺失对肾脏上皮、基质和胶质细胞发育的影响 | 数字病理学 | TSC综合症 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
The effects of sequencing depth on the assembly of coding and noncoding transcripts in the human genome
2022-Jul-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08717-z
PMID:35787153
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研究论文 | 研究了测序深度对人类基因组中编码和非编码转录本组装准确性的影响 | 首次系统地探讨了测序深度对转录本组装的影响，并发现非编码转录本在不同测序深度下未出现饱和现象 | 研究结果受限于细胞或组织类型、读取类型以及转录本的性质和表达水平 | 探讨测序深度对转录本组装准确性的影响 | 人类基因组中的编码和非编码转录本 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 序列数据 | 671个人类短读数据集和4个长读数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Peyer's patch TH17 cells are dispensable for gut IgA responses to oral immunization
2022-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abc5500
PMID:35776804
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研究论文 | 本研究探讨了Peyer's patch中的TH17细胞在口服免疫后肠道IgA反应中的作用 | 使用IL-17A命运报告鼠和MHC-II四聚体分析抗原特异性CD4 T细胞亚群，并通过单细胞RNA测序分离这些细胞，发现PP中抗原特异性T17细胞比例极低，且T17细胞的克隆型与T细胞不共享，表明T17细胞的可塑性不是T细胞分化的主要贡献者 | NA | 验证TH17细胞在口服免疫后肠道IgA反应中的必要性 | Peyer's patch中的TH17细胞及肠道免疫系统 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用两种T17缺陷小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing data analysis suggests the cell-cell interaction patterns of the pituitary-kidney axis
2022-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14680-2
PMID:35778423
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据分析了垂体-肾脏轴的细胞间相互作用模式 | 首次详细描述了垂体和肾脏细胞类型间的配体-受体对相互作用模式 | NA | 深入了解垂体-肾脏轴的连接机制 | 垂体和肾脏的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的小鼠垂体和肾脏的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
[Heterogeneity and function of uterine NK cells: A review]
2022-Jul, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:35786459
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综述 | 本文综述了子宫自然杀伤（NK）细胞的异质性和功能 | 通过单细胞测序技术，研究人员在人类子宫中发现了三种具有不同表型和功能的子宫NK细胞 | NA | 探讨子宫NK细胞在妊娠早期的异质性和功能 | 子宫NK细胞及其在妊娠中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
In vivo transcriptional analysis of mice infected with Leishmania major unveils cellular heterogeneity and altered transcriptomic profiling at single-cell resolution
2022-07, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010518
PMID:35789215
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研究论文 | 本文通过结合批量RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq），对感染利什曼原虫L. major的小鼠进行体内转录组分析，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | 首次进行了L. major感染小鼠的体内全局转录组分析，结合了批量和单细胞RNA测序技术，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | NA | 研究L. major感染小鼠后的体内转录组变化，特别是免疫反应和细胞异质性。 | 感染利什曼原虫L. major的小鼠及其免疫细胞。 | 数字病理学 | 皮肤利什曼病 | RNA测序（RNA-Seq），单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 感染L. major的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Natural high-avidity T-cell receptor efficiently mediates regression of cancer/testis antigen 83 positive common solid cancers
2022-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004713
PMID:35798537
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研究论文 | 本文研究了从年轻健康捐赠者中分离出的高亲和力T细胞受体（TCR）对CT83阳性常见实体癌的疗效 | 本文首次从年轻健康捐赠者中分离出针对常见实体癌中频繁表达的CTA的高亲和力TCR，并展示了其在体外和体内的抗肿瘤活性 | NA | 研究高亲和力TCR对CT83阳性常见实体癌的疗效 | CT83蛋白和其特异性TCR | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 来自年轻健康捐赠者的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: expansion, integration and translation
2022-07-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac011
PMID:35753690
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术的发展及其在多组学研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术已扩展到基因组学、蛋白质组学和代谢组学等领域，并与其他技术如空间数据和CRISPR筛选技术集成，以增强对复杂细胞行为的理解 | NA | 旨在全面理解复杂的细胞行为，并通过集成多组学数据和其他技术层信息来获得新的知识或功能 | 单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Identification of Pathogenic Immune Cell Subsets Associated With Checkpoint Inhibitor-Induced Myocarditis
2022-07-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过时间飞行质谱技术和多组学单细胞技术，识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 发现了一种在免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者中显著增加的克隆性细胞毒性Temra CD8+细胞，并揭示了其独特的转录变化 | NA | 识别与免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎相关的病理性免疫细胞亚群 | 免疫检查点抑制剂诱导的心肌炎患者的外周血单个核细胞和Pdcd1-/-小鼠 | 免疫学 | 心肌炎 | 时间飞行质谱技术，单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，细胞转录组和表位索引测序 | NA | 细胞 | 52名个体（29名患者和23名健康对照），30名患者/对照，Pdcd1-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Mapping developmental paths of monkey primordial germ-like cells differentiation from pluripotent stem cells by single cell ribonucleic acid sequencing analysis†
2022-07-25, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac133
PMID:35766401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴多能干细胞向原始生殖样细胞的分化路径 | 首次在猕猴中利用胚胎体分化系统诱导原始生殖样细胞的形成，并揭示了关键生长因子在分化过程中的作用 | 研究仅限于猕猴，尚未扩展到其他非人类灵长类动物 | 探讨多能干细胞向原始生殖样细胞分化的细胞和分子机制 | 猕猴的多能干细胞及其分化形成的原始生殖样细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约40,000个多能干细胞及胚胎体内的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Cell-cell communication inference and analysis in the tumour microenvironments from single-cell transcriptomics: data resources and computational strategies
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac234
PMID:35753695
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研究论文 | 本文介绍了从单细胞转录组数据中推断和分析肿瘤微环境中细胞间通讯的流程，并列举了相关的数据库和可视化工具 | 本文提出了七种经典的细胞间通讯评分策略，并强调了四种代表性的细胞间通讯推断方法，包括基于网络的方法、基于机器学习的方法、基于空间信息的方法和其他方法 | 本文分析了上述四种细胞间通讯方法的优势和局限性，并指出了在肿瘤微环境中进行细胞间通讯分析时面临的主要挑战 | 旨在改进癌症治疗，通过量化肿瘤微环境中不同细胞类型之间的交叉对话 | 肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison on cell-type composition inference for spatial transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac245
PMID:35753702
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学数据中细胞类型组成推断的先进方法，并比较了它们的优缺点 | 构建了来自单细胞水平的空间转录组数据点，评估了10种方法的性能，并比较了它们在不同组织和技术平台上的表现 | 空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 评估和比较空间转录组学数据中细胞类型组成推断方法的性能 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 10种方法在不同组织和技术平台上的表现被评估 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Fast and accurate matching of cellular barcodes across short-reads and long-reads of single-cell RNA-seq experiments
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104530
PMID:35747387
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTagger的计算方法，用于匹配单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | scTagger在准确性和时间效率上显著优于现有先进工具 | NA | 克服利用长读和短读技术进行单细胞测序时匹配细胞条码的挑战 | 单细胞RNA测序实验中的长读和短读细胞条码数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 使用了真实和模拟数据集进行测试 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
ICOS-Deficient Regulatory T Cells Can Prevent Spontaneous Autoimmunity but Are Impaired in Controlling Acute Inflammation
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100897
PMID:35760518
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研究论文 | 研究探讨了ICOS缺陷的调节性T细胞在预防自发性自身免疫和控制急性炎症中的作用 | 通过条件性敲除系统，选择性地在表达Foxp3的细胞中消除ICOS表达，揭示了ICOS在调节性T细胞中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究ICOS在调节性T细胞中的功能及其在自身免疫和炎症控制中的作用 | ICOS缺陷的调节性T细胞及其在自身免疫和炎症中的作用 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 条件性敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用ICOS FC小鼠和Foxp3-Cre控制小鼠进行比较研究 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Nephrin expression in human epidermal keratinocytes and its implication in poor wound closure
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100455RR
PMID:35747929
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研究论文 | 本研究首次证实了nephrin在人类表皮角质形成细胞中的表达，并探讨了其在伤口愈合中的作用 | 首次报道了nephrin在人类皮肤中的表达及其在细胞粘附、增殖和迁移中的功能 | NA | 探讨nephrin在人类皮肤中的表达及其在伤口愈合中的作用 | 人类表皮角质形成细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫组织化学和免疫电子显微镜 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
CDSImpute: An ensemble similarity imputation method for single-cell RNA sequence dropouts
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105658
PMID:35751187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CDSImpute的新型单细胞RNA测序数据填补方法，用于恢复因技术限制导致的基因表达缺失 | CDSImpute通过考虑细胞间的相关性和负距离，创建相似细胞列表，并从相似细胞中借用基因表达来检测和纠正缺失事件 | NA | 开发一种高效准确的方法来恢复单细胞RNA测序中的真实基因表达 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Kolod、Pollen和Usoskin等多个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
A shared disease-associated oligodendrocyte signature among multiple CNS pathologies
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01104-7
PMID:35760863
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在野生型和阿尔茨海默病模型（5xFAD）小鼠脑中绘制了所有非免疫、非神经元细胞群体，并识别出一种与脑病理相关的寡突胶质细胞状态，称为疾病相关寡突胶质细胞（DOLs） | 本研究揭示了在中枢神经系统病理中共享的寡突胶质细胞特征，并发现DOLs在多种神经退行性和自身免疫炎症条件下均可被识别 | NA | 探索阿尔茨海默病及其他中枢神经系统病理中寡突胶质细胞的共同反应 | 野生型和阿尔茨海默病模型小鼠的脑组织，以及人类死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多种小鼠模型和人类死后脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |