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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 121 | 2024-08-08 |
Ductal keratin 15+ luminal progenitors in normal breast exhibit a basal-like breast cancer transcriptomic signature
2022-Jul-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-022-00444-8
PMID:35821504
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研究论文 | 本文通过结合显微镜下采集的乳房缩小手术中的类器官和单细胞mRNA测序（scRNA-seq），研究了正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌之间的转录组特征关系 | 首次通过空间映射和基因表达谱比较，揭示了正常乳腺管腔祖细胞与基底样乳腺癌之间的强相关性 | NA | 探讨正常乳腺管腔上皮祖细胞与基底样乳腺癌的细胞起源和转录组特征 | 正常乳腺管腔上皮祖细胞和基底样乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自乳房缩小手术的类器官和通过FACS排序的管腔上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Mesenchymal-epithelial interaction regulates gastrointestinal tract development in mouse embryos
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111053
PMID:35830795
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，构建了小鼠胚胎期E9.5至E15.5胃和肠的时空转录组图谱 | 识别了多个亚群，包括Lox胃间质、Aldh1a3小肠间质和Adamdec1大肠间质，并揭示了上皮和间质细胞的区域化和异质性 | NA | 探究胚胎期小鼠胃和肠发育的细胞和分子变化机制 | 小鼠胚胎期胃和肠的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎期E9.5至E15.5的胃和肠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111059
PMID:35830805
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞RNA测序，揭示了拟南芥生物钟在细胞分化中的指导作用 | 利用高细胞命运可塑性的植物细胞进行单细胞RNA测序，开发了PeakMatch方法分析细胞分化过程，发现时钟基因表达变化先于细胞分化 | NA | 探究生物钟是否调控细胞分化 | 拟南芥的细胞分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
A human adipose tissue cell-type transcriptome atlas
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111046
PMID:35830816
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研究论文 | 本研究通过未分选的人体脂肪组织RNA-seq数据，解析了细胞类型特异性转录组图谱 | 本研究提供了一种利用批量RNA-seq数据来分析细胞类型特异性转录组的可访问方法 | NA | 定义细胞类型特异性基因并解析其在人体脂肪组织中的表达 | 人体脂肪组织的细胞类型特异性转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 527个内脏脂肪组织样本和646个皮下脂肪组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Lymphocyte subsets in Atlantic cod (Gadus morhua) interrogated by single-cell sequencing
2022-07-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03645-w
PMID:35821077
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了大西洋鳕鱼（Gadus morhua）脾脏中的淋巴细胞异质性 | 首次描述了大西洋鳕鱼中的五种T细胞亚群和八种B细胞亚群，并提出了B细胞的分化轨迹 | NA | 进一步阐明因缺乏CD4阳性T淋巴细胞而引发的免疫适应性 | 大西洋鳕鱼（Gadus morhua）的淋巴细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Increased H3K27 trimethylation contributes to cone survival in a mouse model of cone dystrophy
2022-Jul-10, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04436-6
PMID:35810394
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研究论文 | 本研究使用Pde6c小鼠模型，探讨了组蛋白去甲基化酶抑制剂GSK-J4对锥细胞生存的潜在治疗益处 | 首次研究了GSK-J4对锥细胞生存的影响，并发现其通过调节甲基化和乙酰化之间的相互作用，对受遗传性视网膜疾病影响的锥细胞有积极响应 | NA | 探讨GSK-J4对锥细胞生存的影响及其在遗传性视网膜疾病治疗中的潜在应用 | Pde6c小鼠模型中的锥细胞 | 遗传性视网膜疾病 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Innate immune regulation in HIV latency models
2022-07-08, Retrovirology
IF:2.7Q3
DOI:10.1186/s12977-022-00599-z
PMID:35804422
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研究论文 | 本文评估了在多种T细胞模型中，HIV潜伏期内的先天免疫和IFN反应 | 发现了潜伏感染的T细胞系在先天免疫激活或类型1 IFN治疗下未能诱导特定的干扰素刺激基因（ISGs） | NA | 研究HIV潜伏期内的先天免疫调控机制 | HIV潜伏模型中的T细胞 | NA | HIV感染 | RNA测序 | NA | RNA | 包括已建立的潜伏细胞系、Jurkat细胞以及ART抑制的初级CD4+ T细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
The Desmoplastic Stroma of Pancreatic Cancer: Multilayered Levels of Heterogeneity, Clinical Significance, and Therapeutic Opportunities
2022-Jul-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133293
PMID:35805064
|
综述 | 本文综述了胰腺癌中促结缔组织增生基质的多层次异质性及其临床意义和治疗机会 | 利用单细胞转录组学和多重组织成像技术，深入了解胰腺癌患者和遗传工程小鼠模型中CAF的异质性 | NA | 探讨胰腺癌促结缔组织增生基质的分子病理基础及其在临床治疗中的潜在应用 | 胰腺癌中的促结缔组织增生基质及其相关纤维母细胞（CAFs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、多重组织成像技术 | NA | 组织 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Patient-derived renal cell carcinoma organoids for personalized cancer therapy
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.970
PMID:35802820
|
研究论文 | 本文建立了一种有效的三维培养系统，用于从临床肾细胞癌样本中生成肾癌类器官，并评估其在个性化癌症治疗中的应用 | 开发了一种新的三维培养系统，用于生成肾癌类器官，这些类器官保留了原始肿瘤组织的组织学结构、突变景观和转录组特征 | NA | 推进人类肾癌研究和治疗 | 肾细胞癌类器官 | 数字病理学 | 肾癌 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 33种不同亚型的肾癌类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals localized tumour ablation and intratumoural immunostimulant delivery potentiate T cell mediated tumour killing
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.937
PMID:35808806
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了局部肿瘤消融和肿瘤内免疫刺激剂递送对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | 首次揭示了局部消融免疫疗法（LAIT）通过诱导广泛的促炎反应和抑制抑制性信号来促进T细胞的免疫重塑，从而驱动抗肿瘤免疫。 | NA | 探讨局部消融免疫疗法（LAIT）对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | CD8+和CD4+ T细胞在局部消融免疫疗法（LAIT）治疗后的反应。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
The accuracy of absolute differential abundance analysis from relative count data
2022-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010284
PMID:35816553
|
研究论文 | 本文探讨了从相对计数数据进行绝对差异丰度分析的准确性 | 使用模拟数据和真实数据集验证了重规范化相对丰度与绝对丰度在差异丰度检测中的一致性，并评估了相对丰度数据特征的预测效用 | 在特征丰度广泛变化的条件下，一致性可能显著降低 | 研究相对丰度数据在差异丰度分析中的准确性和适用性 | 相对丰度数据的重规范化策略及其在差异丰度分析中的表现 | 生物信息学 | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 涉及大量真实数据集，包括16S metabarcoding、表达阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq实验 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
TCF7 is highly expressed in immune cells on the atherosclerotic plaques, and regulating inflammatory signaling via NFκB/AKT/STAT1 signaling
2022-07-29, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212064
PMID:35792753
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，探讨了动脉粥样硬化斑块中T细胞和巨噬细胞的活化状态及其相关基因表达 | 发现了TCF7和XCL1在动脉粥样硬化中的调控机制，并通过蛋白-蛋白网络分析揭示了潜在的基因和新的机制 | NA | 旨在阐明和发现与动脉粥样硬化相关的潜在基因和新机制，为药物开发提供依据 | 动脉粥样硬化斑块中的T细胞、巨噬细胞及其他免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 动脉粥样硬化小鼠及患者斑块样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Hedgehog signaling reprograms hair follicle niche fibroblasts to a hyper-activated state
2022-07-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.06.005
PMID:35777353
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研究论文 | 本文研究了Hedgehog信号通路在毛囊微环境中对成纤维细胞的调控作用，以及这种调控如何影响毛发生长和毛囊增殖。 | 首次揭示了Hedgehog信号通路通过调节SCUBE3/TGF-β机制，影响毛囊微环境中成纤维细胞的状态，从而促进毛发生长和毛囊增殖。 | NA | 探讨Hedgehog信号通路在毛囊微环境中对成纤维细胞的调控作用及其对毛发生长和毛囊增殖的影响。 | 毛囊干细胞、真皮乳头成纤维细胞、Hedgehog信号通路、SCUBE3/TGF-β机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类头皮毛囊样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional regulation and genetic evolution of neuroendocrine prostate cancer
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104576
PMID:35789834
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了7名前列腺肿瘤患者的ADPC和NEPC，揭示了NEPC的基因表达特征、分化路径及转录因子网络 | 首次识别出两种NEPC基因表达特征，并揭示了NEPC从ADPC分化的不同路径及转录因子网络 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性 | 探究神经内分泌前列腺癌（NEPC）的起源及其发生机制 | 前列腺肿瘤中的ADPC和NEPC | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7名患者的前列腺肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Impaired interferon-γ signaling promotes the development of silicosis
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104647
PMID:35800765
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞，发现髓系细胞中干扰素（IFN）-γ信号受损与矽肺的发生密切相关 | 首次揭示了髓系细胞中IFN-γ信号受损与矽肺发生之间的关联，并阐明了IFN-γ预处理巨噬细胞通过形成空间较大的吞噬体来抑制晶体二氧化硅诱导的NLRP3炎症小体激活的机制 | NA | 探究矽肺发生过程中内在因素的作用机制 | 矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞 | NA | 职业病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 矿工和未发展为矽肺的同事的支气管肺泡灌洗液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Genetic association and single-cell transcriptome analyses reveal distinct features connecting autoimmunity with cancers
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104631
PMID:35800769
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研究论文 | 本研究通过分析GWAS目录数据库和Medline，收集了五种常见自身免疫疾病的易感基因，并与癌症驱动基因进行重叠分析。同时，通过单细胞转录组分析比较了系统性红斑狼疮（SLE）及相关癌症的特征。 | 本研究首次识别了45个致癌性自身免疫疾病风险（CAD）基因，并发现这些基因主要富集在T细胞和B细胞信号通路中。此外，通过综合单细胞分析揭示了肾癌与SLE在免疫细胞信号和干细胞特征上的显著差异。 | NA | 探讨自身免疫疾病与癌症之间的关联机制，并寻找新的治疗靶点。 | 五种常见自身免疫疾病（系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、干燥综合征、系统性硬化症和特发性炎症性肌病）及其相关癌症。 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因数据 | 涉及五种自身免疫疾病的易感基因和癌症驱动基因 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Using the Kriging Correlation for unsupervised feature selection problems
2022-07-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15529-4
PMID:35798813
|
研究论文 | 本文提出了一种KC Score来衡量高维数据聚类分析中的特征重要性 | 基于原始特征与低维潜在空间中重建特征之间的相关性，开发了一种基于KC Score的特征选择策略 | NA | 研究高维数据聚类分析中的特征选择问题 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 四个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Gasdermin-D activation by SARS-CoV-2 triggers NET and mediate COVID-19 immunopathology
2022-07-07, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-022-04062-5
PMID:35799268
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研究论文 | 本文研究了Gasdermin-D（GSDMD）途径在COVID-19中中性粒细胞外陷阱（NETs）释放和器官损伤发展中的作用 | 发现SARS-CoV-2病毒直接激活孔形成蛋白GSDMD，触发NET产生和COVID-19中的器官损伤 | NA | 探究GSDMD途径在COVID-19中NETs释放和器官损伤发展中的作用 | COVID-19患者的血液和肺组织样本，以及SARS-CoV-2感染的小鼠模型 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 63名中度和重度COVID-19住院患者，以及SARS-CoV-2感染的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Reshaping the systemic tumor immune environment (STIE) and tumor immune microenvironment (TIME) to enhance immunotherapy efficacy in solid tumors
2022-07-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01307-2
PMID:35799264
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学和空间转录组学在研究系统性肿瘤免疫环境（STIE）和肿瘤免疫微环境（TIME）及其相互作用中的最新进展，旨在提高免疫治疗在实体瘤中的疗效。 | 本文深入探讨了系统性肿瘤免疫环境（STIE）的重要性，这是以往研究中较少涉及的领域。 | NA | 旨在通过综述相关研究，揭示STIE和TIME的异质性及其对免疫治疗反应的影响，从而提高免疫治疗的疗效。 | 研究对象包括系统性肿瘤免疫环境（STIE）、肿瘤免疫微环境（TIME）及其相互作用，以及这些因素在肺癌、肝细胞癌和鼻咽癌中的作用。 | 免疫学 | 肺癌, 肝细胞癌, 鼻咽癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
scSTEM: clustering pseudotime ordered single-cell data
2022-07-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02716-9
PMID:35799304
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研究论文 | 开发了scSTEM方法，用于对从单细胞RNA测序数据中推断出的轨迹进行基因动态表达模式的聚类分析 | scSTEM通过使用多种度量方法总结基因表达并分配p值给聚类，从而识别显著的表达模式并比较不同路径上的模式 | NA | 开发一种新的方法来聚类分析单细胞RNA测序数据中的基因动态表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的基因动态表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |