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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Mapping the single-cell landscape of acral melanoma and analysis of the molecular regulatory network of the tumor microenvironments
2022-07-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78616
PMID:35894206
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研究论文 | 本研究收集了中国黑色素瘤患者的临床样本,并进行了单细胞RNA测序,以分析其肿瘤微环境的异质性和分子调控网络 | 揭示了驱动肿瘤微环境成分失调的基因,并探讨了肿瘤微环境细胞间的分子相互作用关系,为开发新型免疫治疗药物提供了潜在靶点 | NA | 研究肢端黑色素瘤的单细胞景观及其肿瘤微环境的分子调控网络 | 肢端黑色素瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自中国患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-08 |
Vasculature atrophy causes a stiffened microenvironment that augments epidermal stem cell differentiation in aged skin
2022-07, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-022-00244-6
PMID:37117774
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研究论文 | 本文研究了皮肤血管退化导致的真皮硬化如何增强老年小鼠皮肤中表皮干细胞的分化 | 首次报道了皮肤血管退化引起的真皮硬化会增强表皮干细胞的分化和半桥粒脆性,并揭示了这一过程与Piezo1离子通道和pentraxin 3分子的关系 | NA | 探讨衰老过程中外部微环境因素如何影响干细胞功能 | 老年小鼠皮肤中的表皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-08 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用,并探讨了其潜在的临床应用 | scRNA-seq技术提供了比传统RNA测序方法更深入的分子机制理解,揭示了肿瘤演化过程中体细胞突变和功能的变化,以及免疫细胞的浸润和激活 | NA | 理解单细胞基因表达模式,追踪异质细胞中的基因表达或突变,评估癌细胞的克隆起源,并确定不同癌细胞亚群的选择性进化 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用和通信,以及肿瘤内遗传异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-08 |
Mixed Response to Cancer Immunotherapy is Driven by Intratumor Heterogeneity and Differential Interlesion Immune Infiltration
2022-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0050
PMID:36923281
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和单细胞测序分析同一患者淋巴结转移瘤样本,揭示了肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异导致免疫治疗混合反应的机制 | 首次通过临床前模型和临床队列研究,证实肿瘤内异质性改变同一患者中肿瘤浸润淋巴细胞的特征,导致免疫治疗混合反应 | 研究样本量有限,且仅基于PD-1阻断疗法的队列研究,可能限制了结果的普适性 | 探讨肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异如何影响免疫治疗反应 | 淋巴结转移瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 全外显子测序,单细胞测序 | NA | 基因组数据,细胞数据 | 503名接受PD-1阻断单药治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-08 |
Identifying Transient Cells During Reprogramming via Persistent Homology
2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871358
PMID:36085927
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研究论文 | 本研究开发了一种基于持久同调的方法,用于识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞 | 利用持久同调技术,能够识别位于不同细胞亚群边界上的过渡状态细胞 | 仅分析了代表重编程早期阶段的数据 | 开发一种方法来识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞 | 人类成纤维细胞向诱导多能干细胞的重编程过程中的过渡状态细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 持久同调 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-08 |
Gene Expression Markers of Prognostic Importance for Prostate Cancer Risk in Patients with Benign Prostate Hyperplasia
2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871422
PMID:36086411
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研究论文 | 本研究通过重新分析两个公开的单细胞RNA测序数据集,揭示了前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型之间的基因表达差异 | 发现了791个在前列腺癌上皮细胞中上调的基因,并确定了六个在前列腺癌细胞中显著上调的标记基因 | NA | 旨在阐明前列腺癌的发展过程中细胞类型的转变,并识别出具有预后重要性的基因标记 | 前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,505个上皮细胞样本,涉及18,638个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-08 |
Paracrine Factors of Stressed Peripheral Blood Mononuclear Cells Activate Proangiogenic and Anti-Proteolytic Processes in Whole Blood Cells and Protect the Endothelial Barrier
2022-Jul-30, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics14081600
PMID:36015226
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研究论文 | 研究了应激外周血单个核细胞(PBMCsec)的旁分泌因子对全血细胞和内皮屏障的保护作用 | 首次展示了PBMCsec在体外对白细胞和内皮细胞的转录组变化,并发现其具有显著的组织再生和促血管生成能力 | 研究主要集中在体外实验,需要进一步的临床试验来验证其治疗效果 | 探讨PBMCsec在治疗受损器官中的潜在应用 | 外周血单个核细胞的旁分泌因子及其对白细胞和内皮细胞的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自健康个体的全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-08 |
SAREV: A review on statistical analytics of single-cell RNA sequencing data
2022 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics
DOI:10.1002/wics.1558
PMID:36034329
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据统计分析方法的发展 | 介绍了针对单细胞RNA测序数据的高分辨率特性而开发的新的统计分析方法 | 由于篇幅限制,本综述未能涵盖所有相关方法 | 旨在为从事单细胞RNA测序统计和计算研究以及相关方法和工具的科学研究的研究人员提供参考 | 单细胞RNA测序数据的统计分析方法 | 基因组学 | NA | NGS | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-08 |
The Rabep1-Mediated Endocytosis and Activation of Trypsinogen to Promote Pancreatic Stellate Cell Activation
2022-07-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12081063
PMID:36008957
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研究论文 | 本研究探讨了Rabep1介导的内吞作用如何激活胰蛋白酶原,从而促进胰腺星状细胞的激活 | 发现了胰蛋白酶原通过胰腺腺泡细胞与胰腺星状细胞之间的交流,被胰腺星状细胞内吞并由Rabep1基因激活的新机制 | NA | 阐明慢性胰腺炎的发病机制,特别是胰蛋白酶原激活在其中的作用 | 胰蛋白酶原在慢性胰腺炎和正常组织中的定位与表达,以及其在胰腺星状细胞中的作用 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 免疫荧光,微阵列,单细胞RNA测序(scRNA-seq),Western blotting,流式细胞术 | NA | 组织样本,细胞 | 慢性胰腺炎和正常组织的临床样本,胰腺星状细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-08 |
scGENA: A Single-Cell Gene Coexpression Network Analysis Framework for Clustering Cell Types and Revealing Biological Mechanisms
2022-Jul-30, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9080353
PMID:36004879
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGENA的新框架,用于基于单细胞RNA测序数据的基因共表达网络分析,以聚类细胞类型并揭示生物学机制 | scGENA提供了一个集成的流程,涵盖了数据探索、质量控制、归一化、插补和降维等预处理步骤,以及基因共表达网络分析的下游处理 | NA | 构建一个综合的分析流程,用于单细胞RNA测序数据的基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和生物学机制 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因共表达网络 | 基因表达数据 | 1600个细胞和39,851个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
ACUTE AND SUSTAINED ALTERATIONS TO THE BONE MARROW IMMUNE MICROENVIRONMENT FOLLOWING POLYMICROBIAL INFECTION
2022-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001951
PMID:35984760
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 | 首次全面分析了脓毒症引起的免疫细胞景观内的转录变化 | 研究仅限于Friend白血病病毒B小鼠模型,可能限制了结果的普遍性 | 探讨多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 | 骨髓中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3402个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
Transcriptomes of Injured Lamprey Axon Tips: Single-Cell RNA-Seq Suggests Differential Involvement of MAPK Signaling Pathways in Axon Retraction and Regeneration after Spinal Cord Injury
2022-07-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11152320
PMID:35954164
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了脊椎损伤后七鳃鳗轴突尖端的转录组,探讨了MAPK信号通路在轴突回缩和再生中的差异性作用。 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析脊椎损伤后七鳃鳗轴突尖端的转录组,揭示了MAPK信号通路在轴突再生和回缩中的差异性作用。 | 研究仅限于七鳃鳗的轴突尖端,且样本量相对较小,可能限制了结果的普遍性和广泛应用。 | 探讨脊椎损伤后轴突再生和回缩过程中MAPK信号通路的差异性作用。 | 七鳃鳗脊椎损伤后的轴突尖端。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共采集了24个轴突尖端样本,包括10个生长中的、9个静止的和5个回缩的轴突尖端。 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
The impact of neoadjuvant chemotherapy on the tumor microenvironment in advanced high-grade serous carcinoma
2022-Jul-30, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-022-00419-1
PMID:35907904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了新辅助化疗(NACT)前后高级浆液性输卵管癌的肿瘤微环境变化 | 首次展示了NACT前后肿瘤微环境中恶性上皮细胞的高度异质性,并揭示了主要耐药克隆的存在及其与不良临床预后的关联 | 仅基于单一病例的样本,可能限制了研究结果的普遍性 | 探讨新辅助化疗对高级浆液性癌肿瘤微环境的影响及耐药机制 | 高级浆液性卵巢、输卵管或腹膜癌 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 共分析了32,079个单细胞,其中17,249个来自NACT前的肿瘤组织样本,14,830个来自NACT后的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptome sequencing of inspiratory neurons of the preBötzinger complex in neonatal mice
2022-07-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01569-y
PMID:35907922
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研究论文 | 本研究对新生小鼠脑干preBötzinger复合体中的吸气神经元进行了单细胞转录组测序 | 首次对preBötzinger复合体中的吸气神经元进行单细胞RNA测序,提供了这些神经元转录组的详细信息 | NA | 研究脑干preBötzinger复合体中吸气神经元的转录组 | 新生小鼠脑干preBötzinger复合体中的吸气神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 多个神经元的细胞内容物 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
CXCR4high megakaryocytes regulate host-defense immunity against bacterial pathogens
2022-07-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78662
PMID:35904250
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术发现了一群高表达CXCR4的巨核细胞亚群,这些细胞在细菌感染中调节宿主防御免疫反应 | 首次揭示了高表达CXCR4的巨核细胞在细菌感染中的免疫调节作用及其机制 | NA | 研究巨核细胞在细菌感染中的免疫调节作用 | 巨核细胞及其在细菌感染中的免疫功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 使用造血干细胞系追踪的小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of vascular endothelial cells in zebrafish embryos
2022-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-17127-w
PMID:35906287
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼胚胎中血管内皮细胞的转录组特征 | 首次揭示了斑马鱼胚胎发育早期血管内皮细胞的单细胞转录组图谱,并识别出六种不同的血管内皮细胞亚型 | NA | 探索斑马鱼胚胎中血管内皮细胞多样性的分子机制 | 斑马鱼胚胎中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 从斑马鱼胚胎中分离的血管内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Polarization disorder of decidual NK cells in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jul-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-022-00980-9
PMID:35897028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量转录组测序分析,探讨了不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的特征分布 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的分化过程和极化紊乱 | 样本量较小,仅包括正常孕妇和不明原因反复自然流产患者的各3例样本 | 探究不明原因反复自然流产患者中基质自然杀伤细胞的特征分布及其在免疫耐受微环境中的作用 | 不明原因反复自然流产患者的基质自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 正常孕妇3例,不明原因反复自然流产患者3例 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
A Differentiation-Related Gene Prognostic Index Contributes to Prognosis and Immunotherapy Evaluation in Patients with Hepatocellular Carcinoma
2022-07-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11152302
PMID:35892599
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研究论文 | 本研究构建了一个基于肝细胞癌(HCC)分化相关基因的DRGPI,用于评估免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的预后和效益 | 首次探讨了细胞分化相关分子在预测ICI治疗效益和预后中的潜在价值 | NA | 研究HCC细胞的分化轨迹及其临床意义 | 肝细胞癌患者及其免疫治疗评估 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 四个HCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Radiation Pneumonitis Mice
2022-Jul-26, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox11081457
PMID:35892659
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研究论文 | 本研究通过无偏差的单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了辐射性肺炎(RP)小鼠模型的单细胞病理景观 | 首次揭示了RP小鼠肺组织中不同细胞亚型的具体贡献,并发现了特定亚群的巨噬细胞和线粒体基因表达的变化 | NA | 探讨辐射性肺炎小鼠模型中不同细胞亚型对肺损伤的具体贡献 | 辐射性肺炎(RP)小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Immunomodulatory Responses of Subcapsular Sinus Floor Lymphatic Endothelial Cells in Tumor-Draining Lymph Nodes
2022-Jul-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14153602
PMID:35892863
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞的免疫调节反应 | 发现了肿瘤衍生因子诱导的淋巴内皮细胞转录变化,并揭示了podoplanin在介导巨噬细胞粘附和正确定位中的新功能 | NA | 探讨肿瘤引流淋巴结中淋巴内皮细胞的免疫调节作用 | 肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | B16F10黑色素瘤引流淋巴结与非肿瘤引流淋巴结中的淋巴内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |