单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-05	BAP1 Loss Promotes Suppressive Tumor Immune Microenvironment via Upregulation of PROS1 in Class 2 Uveal Melanomas 2022-Jul-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers14153678 PMID:35954340	研究论文	本文研究了BAP1缺失如何通过上调PROS1促进二类葡萄膜黑色素瘤的免疫抑制微环境	提出了BAP1缺失与肿瘤免疫微环境抑制之间的机制联系，揭示了PROS1-MERTK通路作为潜在免疫治疗靶点	尚未明确其他可能的调控因子，且结果的通用性需进一步验证	探讨BAP1缺失与二类葡萄膜黑色素瘤免疫抑制之间的潜在机制	二类葡萄膜黑色素瘤样本、基因工程UM细胞系及葡萄膜黑色素细胞	数字病理	葡萄膜黑色素瘤	RNA测序 (RNA-seq) 和ChIP-seq	NA	基因组数据	包括UM样本和基因工程细胞系的多个样本
42	2024-08-05	Dysfunctional ERG signaling drives pulmonary vascular aging and persistent fibrosis 2022-07-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-31890-4 PMID:35879310	研究论文	本文探讨了老年小鼠肺内皮细胞在肺纤维化恢复或进展过程中的表观遗传和转录分析	识别了转录因子ETS相关基因(ERG)作为肺毛细血管稳态和修复的潜在调节因子，并揭示了其在衰老中的功能失调	研究主要基于小鼠模型，结果可能无法完全转化到人类	探究血管在肺部修复和纤维化中的作用及其衰老的影响	年轻和老年小鼠的肺内皮细胞	数字病理学	肺纤维化	scRNA-seq	NA	基因表达数据	年轻和老年小鼠，具体样本数量未提及
43	2024-08-05	A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours 2022-07-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-31408-y PMID:35853870	研究论文	本研究揭示了人类脑肿瘤中细胞类型与神经发育各个阶段的相似性	该研究首次建立了小鼠大脑发展过程的单细胞转录组图谱，并与人类脑肿瘤中的单细胞数据进行对比，发现肿瘤细胞表现出与胚胎放射神经前体细胞的表达特征重叠	本研究主要基于小鼠模型与人类细胞数据的比较，可能无法完全反映人类脑肿瘤的所有特征	本研究旨在阐明人类脑胶质瘤的起源及其细胞类型特征	研究对象为鼠类大脑发育过程中的细胞及人类胚胎和儿童胶质肿瘤的细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	细胞转录组数据	超过100,000个细胞，以及超过100个成人和儿童脑肿瘤样本
44	2024-08-05	Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal 2022-07-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-31591-y PMID:35851580	研究论文	本研究展示了orexin神经元通过间接抑制促进睡眠的神经元来维持觉醒	发现了一个新的前馈电路，通过这个电路，orexin和共同释放的谷氨酸作用于并抑制促睡眠的神经元	未明确提及	探讨orexin神经元在维持觉醒中的作用机制	orexin神经元及其在觉醒和睡眠之间的调节作用	神经科学	睡眠障碍	体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学	NA	光学数据、转录组数据	涉及了多个动物样本，但具体样本数量未提及
45	2024-08-05	Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence 2022-Jul-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.104660 PMID:35845169	研究论文	该文章探讨了3型天生淋巴细胞在膀胱防御中的17型免疫中的独特贡献	发现组3天生淋巴细胞(ILC3s)在膀胱感染后释放IL17，并探讨了ILC3和髓系细胞之间的相互作用	对人类膀胱的具体机制分析还不完全	旨在深入理解膀胱免疫，特别是17型免疫的调控机制	研究对象为小鼠和人类的膀胱样本	NA	膀胱感染	单细胞RNA测序	NA	NA	研究涉及小鼠和人类样本
46	2024-08-05	Interspecies Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals the Novel Trajectory of Osteoclast Differentiation and Therapeutic Targets 2022-Jul, JBMR plus IF:3.4Q2 DOI:10.1002/jbm4.10631 PMID:35866155	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了破骨细胞分化的新轨迹及治疗靶点	首次建立了人类和小鼠破骨细胞发生的综合命运图谱，并识别了RAB38作为关键分子	样本数量和数据范围的限制可能影响结果的普遍适用性	探索破骨细胞分化的机制并识别骨疾病的治疗靶点	人类和小鼠的破骨细胞谱系细胞	数字病理学	骨疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类和小鼠的破骨细胞样本，具体数量未知
47	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing distinguishes dendritic cell subsets in the rat, allowing advanced characterization of the effects of FMS-like tyrosine kinase 3 ligand 2022-Jul, Scandinavian journal of immunology IF:4.1Q2 DOI:10.1111/sji.13159 PMID:35285040	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序结合多色光谱流式细胞术，对大鼠模型中的组织驻留树突状细胞进行鉴定和表征，并研究了FMS样酪氨酸激酶3配体（FLT3L）对其的影响。	首次将单细胞RNA测序与多色光谱流式细胞术结合，用于鉴定和表征大鼠模型中的组织驻留树突状细胞，并详细研究了FLT3L对其数量和表型的影响。	研究主要集中在肝脏、脾脏和肠系膜淋巴结中的树突状细胞，未涉及其他组织或器官。	探讨FLT3L对大鼠组织驻留树突状细胞数量和表型的影响。	大鼠模型中的组织驻留树突状细胞及其亚型。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用了Lewis大鼠进行体内实验。
48	2024-08-07	Dynamic Changes in the Gene Expression Patterns and Lipid Profiles in the Developing and Maturing Meibomian Glands 2022-Jul-17, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms23147884 PMID:35887230	研究论文	研究了从小鼠新生到成年阶段睑板腺的脂质组和转录组变化	揭示了睑板腺发育和成熟过程中基因表达模式和脂质谱的动态变化	NA	阐明睑板腺发育和成熟过程中的生理变化	睑板腺的脂质组和转录组	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从小鼠新生到成年的睑板腺样本
49	2024-08-07	[Investigation on the growth factor regulatory network of dermal fibroblasts in mouse full-thickness skin defect wounds based on single-cell RNA sequencing] 2022-Jul-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi DOI:10.3760/cma.j.cn501225-20220215-00029 PMID:35899330	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠全层皮肤缺损伤口中成纤维细胞的异质性及其生长因子调控网络	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠全层皮肤缺损伤口中成纤维细胞的异质性和生长因子调控网络	研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能影响结果的普遍性	探索小鼠全层皮肤缺损伤口中成纤维细胞的异质性和生长因子调控网络	小鼠全层皮肤缺损伤口中的成纤维细胞	数字病理学	皮肤损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达矩阵	10只8周龄雄性C57BL/6小鼠
50	2024-08-07	'Youthful' phenotype of c-Kit+ cardiac fibroblasts 2022-Jul-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04449-1 PMID:35841449	研究论文	本文研究了c-Kit阳性心脏成纤维细胞的'年轻'表型，探讨了c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其与DDR2标记的关系。	首次评估了c-Kit在DDR2阳性心脏成纤维细胞中的生物学特性，并揭示了其与'年轻'细胞表型的关联。	NA	探讨c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其对心肌生物学、病理损伤反应和生理衰老的影响。	c-Kit阳性心脏成纤维细胞及其与DDR2标记的关系。	NA	NA	流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序	NA	细胞	涉及约8%的总心脏间质细胞
51	2024-08-07	IL-13-programmed airway tuft cells produce PGE2, which promotes CFTR-dependent mucociliary function 2022-07-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.159832 PMID:35608904	研究论文	本文研究了IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响，发现IL-13能扩展和编程气道簇细胞向前列腺素E2代谢，进而促进囊性纤维化跨膜传导调节因子依赖的纤毛功能。	首次揭示了气道簇细胞在过敏性气道中调节上皮纤毛功能的作用。	NA	探讨IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响及其对纤毛功能的作用。	气道簇细胞及其在2型炎症中的作用。	NA	呼吸道疾病	RNA测序	NA	RNA	使用大量和单细胞RNA测序分析气道上皮和鼠模型。
52	2024-08-07	Mapping the single-cell landscape of acral melanoma and analysis of the molecular regulatory network of the tumor microenvironments 2022-07-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.78616 PMID:35894206	研究论文	本研究收集了中国黑色素瘤患者的临床样本，并进行了单细胞RNA测序，以分析其肿瘤微环境的异质性和分子调控网络	揭示了驱动肿瘤微环境成分失调的基因，并探讨了肿瘤微环境细胞间的分子相互作用关系，为开发新型免疫治疗药物提供了潜在靶点	NA	研究肢端黑色素瘤的单细胞景观及其肿瘤微环境的分子调控网络	肢端黑色素瘤及其肿瘤微环境	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自中国患者的临床样本
53	2024-08-08	Vasculature atrophy causes a stiffened microenvironment that augments epidermal stem cell differentiation in aged skin 2022-07, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-022-00244-6 PMID:37117774	研究论文	本文研究了皮肤血管退化导致的真皮硬化如何增强老年小鼠皮肤中表皮干细胞的分化	首次报道了皮肤血管退化引起的真皮硬化会增强表皮干细胞的分化和半桥粒脆性，并揭示了这一过程与Piezo1离子通道和pentraxin 3分子的关系	NA	探讨衰老过程中外部微环境因素如何影响干细胞功能	老年小鼠皮肤中的表皮干细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	老年小鼠皮肤样本
54	2024-08-08	Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing 2022 Jul-Dec, Bioengineered IF:4.2Q2 DOI:10.1080/21655979.2023.2185434 PMID:37105769	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用，并探讨了其潜在的临床应用	scRNA-seq技术提供了比传统RNA测序方法更深入的分子机制理解，揭示了肿瘤演化过程中体细胞突变和功能的变化，以及免疫细胞的浸润和激活	NA	理解单细胞基因表达模式，追踪异质细胞中的基因表达或突变，评估癌细胞的克隆起源，并确定不同癌细胞亚群的选择性进化	肿瘤微环境中的细胞间相互作用和通信，以及肿瘤内遗传异质性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
55	2024-08-08	Mixed Response to Cancer Immunotherapy is Driven by Intratumor Heterogeneity and Differential Interlesion Immune Infiltration 2022-07, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0050 PMID:36923281	研究论文	本研究通过全外显子测序和单细胞测序分析同一患者淋巴结转移瘤样本，揭示了肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异导致免疫治疗混合反应的机制	首次通过临床前模型和临床队列研究，证实肿瘤内异质性改变同一患者中肿瘤浸润淋巴细胞的特征，导致免疫治疗混合反应	研究样本量有限，且仅基于PD-1阻断疗法的队列研究，可能限制了结果的普适性	探讨肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异如何影响免疫治疗反应	淋巴结转移瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞	数字病理学	癌症	全外显子测序，单细胞测序	NA	基因组数据，细胞数据	503名接受PD-1阻断单药治疗的患者
56	2024-08-08	Identifying Transient Cells During Reprogramming via Persistent Homology 2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871358 PMID:36085927	研究论文	本研究开发了一种基于持久同调的方法，用于识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞	利用持久同调技术，能够识别位于不同细胞亚群边界上的过渡状态细胞	仅分析了代表重编程早期阶段的数据	开发一种方法来识别在不同细胞表型之间起桥梁作用的过渡状态细胞	人类成纤维细胞向诱导多能干细胞的重编程过程中的过渡状态细胞	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	持久同调	时间序列数据	未具体说明样本数量
57	2024-08-08	Gene Expression Markers of Prognostic Importance for Prostate Cancer Risk in Patients with Benign Prostate Hyperplasia 2022-07, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference DOI:10.1109/EMBC48229.2022.9871422 PMID:36086411	研究论文	本研究通过重新分析两个公开的单细胞RNA测序数据集，揭示了前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型之间的基因表达差异	发现了791个在前列腺癌上皮细胞中上调的基因，并确定了六个在前列腺癌细胞中显著上调的标记基因	NA	旨在阐明前列腺癌的发展过程中细胞类型的转变，并识别出具有预后重要性的基因标记	前列腺癌和良性前列腺增生细胞类型	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	15,505个上皮细胞样本，涉及18,638个基因
58	2024-08-08	Paracrine Factors of Stressed Peripheral Blood Mononuclear Cells Activate Proangiogenic and Anti-Proteolytic Processes in Whole Blood Cells and Protect the Endothelial Barrier 2022-Jul-30, Pharmaceutics IF:4.9Q1 DOI:10.3390/pharmaceutics14081600 PMID:36015226	研究论文	研究了应激外周血单个核细胞（PBMCsec）的旁分泌因子对全血细胞和内皮屏障的保护作用	首次展示了PBMCsec在体外对白细胞和内皮细胞的转录组变化，并发现其具有显著的组织再生和促血管生成能力	研究主要集中在体外实验，需要进一步的临床试验来验证其治疗效果	探讨PBMCsec在治疗受损器官中的潜在应用	外周血单个核细胞的旁分泌因子及其对白细胞和内皮细胞的影响	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自健康个体的全血样本
59	2024-08-08	SAREV: A review on statistical analytics of single-cell RNA sequencing data 2022 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics DOI:10.1002/wics.1558 PMID:36034329	综述	本文综述了单细胞RNA测序数据统计分析方法的发展	介绍了针对单细胞RNA测序数据的高分辨率特性而开发的新的统计分析方法	由于篇幅限制，本综述未能涵盖所有相关方法	旨在为从事单细胞RNA测序统计和计算研究以及相关方法和工具的科学研究的研究人员提供参考	单细胞RNA测序数据的统计分析方法	基因组学	NA	NGS	NA	RNA测序数据	NA
60	2024-08-08	The Rabep1-Mediated Endocytosis and Activation of Trypsinogen to Promote Pancreatic Stellate Cell Activation 2022-07-31, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom12081063 PMID:36008957	研究论文	本研究探讨了Rabep1介导的内吞作用如何激活胰蛋白酶原，从而促进胰腺星状细胞的激活	发现了胰蛋白酶原通过胰腺腺泡细胞与胰腺星状细胞之间的交流，被胰腺星状细胞内吞并由Rabep1基因激活的新机制	NA	阐明慢性胰腺炎的发病机制，特别是胰蛋白酶原激活在其中的作用	胰蛋白酶原在慢性胰腺炎和正常组织中的定位与表达，以及其在胰腺星状细胞中的作用	数字病理学	慢性胰腺炎	免疫荧光，微阵列，单细胞RNA测序（scRNA-seq），Western blotting，流式细胞术	NA	组织样本，细胞	慢性胰腺炎和正常组织的临床样本，胰腺星状细胞