单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-01 |
Single-cell transcriptome analysis of embryonic and adult endothelial cells allows to rank the hemogenic potential of post-natal endothelium
2022-07-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16127-0
PMID:35842474
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了胚胎和成年内皮细胞，探讨了成年血管内皮细胞转化为造血干细胞的潜力 | 发现了成年内皮细胞与胚胎内皮细胞在转录因子表达上的关键差异，并确定了胰腺、大脑、肾脏和肝脏内皮细胞作为细胞重编程为造血干细胞的最合适目标 | 缺乏合适的供体是造血干细胞移植的主要限制 | 探讨成年血管内皮细胞转化为造血干细胞的潜力，为造血干细胞的生成提供重编程策略 | 胚胎和成年内皮细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-09-01 |
R-SPONDIN2+ mesenchymal cells form the bud tip progenitor niche during human lung development
2022-07-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.05.010
PMID:35679862
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研究论文 | 研究探讨了人类肺发育过程中R-SPONDIN2+间充质细胞在芽尖前体细胞微环境中的作用 | 首次鉴定出在人类肺发育期间表达WNT激动剂RSPO2的间充质细胞群，并发现其与芽尖前体细胞中的RSPO2受体LGR5的表达富集相关 | NA | 揭示人类肺发育过程中间充质细胞的异质性和功能 | 人类肺发育中的间充质细胞和芽尖前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个人类肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-09-01 |
Joint dimension reduction and clustering analysis of single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics data
2022-07-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac219
PMID:35349708
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研究论文 | 本文开发了一种名为DR-SC的计算方法，能够在统一框架内同时进行降维和（空间）聚类分析 | DR-SC方法通过联合分析，产生准确的空间聚类结果并有效提取生物学上有意义的低维特征 | NA | 开发一种新的计算方法，以同时进行单细胞RNA-seq和空间转录组数据的空间聚类和降维分析 | 单细胞RNA-seq和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场模型 | 转录组数据 | 适用于大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-09-01 |
PU.1 and MYC transcriptional network defines synergistic drug responses to KIT and LSD1 inhibition in acute myeloid leukemia
2022-07, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01594-1
PMID:35590033
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研究论文 | 本文研究了急性髓系白血病（AML）中KIT和LSD1抑制剂联合治疗的协同效应 | 首次报道了KIT和LSD1联合抑制在KIT突变AML细胞系和患者样本中产生协同细胞死亡的效果 | 需要临床试验来评估KIT和LSD1抑制在患者中的实际疗效 | 探讨KIT和LSD1联合抑制在急性髓系白血病治疗中的协同作用 | KIT突变的急性髓系白血病细胞系和患者样本 | NA | 急性髓系白血病 | scRNA-seq, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 细胞 | KIT突变的AML细胞系和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-09-01 |
Lymph node fibroblastic reticular cells preserve a tolerogenic niche in allograft transplantation through laminin α4
2022-07-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156994
PMID:35775481
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研究论文 | 研究探讨了淋巴结（LN）成纤维网状细胞（FRCs）通过产生层粘连蛋白α4（Lama4）在同种异体移植中维持耐受性微环境的作用 | 首次揭示了FRC-Lama4在维持淋巴结耐受性微环境中的关键作用，并提出其作为免疫工程治疗的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，未来需要进一步在人类中验证其效果 | 探究FRC-Lama4在同种异体移植中维持耐受性微环境的作用 | 淋巴结成纤维网状细胞（FRCs）和层粘连蛋白α4（Lama4） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 使用FRC-Lama4条件性敲除Pdgfrb-Cre-/- × Lama4fl/fl小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-09-01 |
How genetic risk contributes to autoimmune liver disease
2022-07, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00950-8
PMID:35650446
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研究论文 | 本文通过全基因组关联研究（GWAS）和全基因组元分析（GWMA）探讨了自身免疫性肝病（AILDs）的遗传风险，并分析了遗传风险变异对肝脏细胞及其免疫微环境的影响 | 本文利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验和基因组范围内的比较分析，为理解遗传风险变异在肝脏驻留免疫细胞和肝脏细胞亚群中的作用提供了新的视角 | 基于当前全基因组数据的多元遗传风险评分（PRSs）在预测个体疾病风险方面的潜力有限 | 探讨遗传风险如何影响自身免疫性肝病的发病机制 | 自身免疫性肝炎（AIH）、原发性胆汁性胆管炎（PBC）和原发性硬化性胆管炎（PSC） | 遗传学 | 自身免疫性疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、全基因组元分析（GWMA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 约100个易感位点 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-31 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，比较了斑马鱼和人类肝脏中的细胞类型和纤维化表型，揭示了两者之间的高度保守性。 | 首次建立了成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并发现了斑马鱼肝星状细胞的新型保守标记物colec11。 | NA | 旨在通过单细胞转录组测序技术，评估成年斑马鱼肝脏作为研究肝纤维化模型的有效性。 | 成年斑马鱼和人类肝脏的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-29 |
The power of single-cell transcriptomics in cardiovascular disease
2022-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00109-6
PMID:39196239
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-05 |
Construction of Prediction Model for Atrial Fibrillation with Valvular Heart Disease Based on Machine Learning
2022-Jul, Reviews in cardiovascular medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.31083/j.rcm2307247
PMID:39076905
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研究论文 | 本研究探讨了瓣膜性心脏病进展的分子机制并提供了房颤-瓣膜性心脏病的候选治疗靶点 | 使用机器学习方法筛选了与AF-VHD相关的核心基因，为房颤的生物标志物和治疗靶点提供了新的见解 | 未提及具体的样本特征和临床数据的多样性 | 探讨瓣膜性心脏病进展的分子机制 | 重点分析与房颤-瓣膜性心脏病相关的核心基因 | 机器学习 | 房颤 | RNA微阵列分析、机器学习、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 819个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-05 |
Identifying cell state-associated alternative splicing events and their coregulation
2022-Jul-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276109.121
PMID:35858747
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的方法Psix，以识别单细胞中的替代剪接事件及其共调控 | Psix方法利用稳健的概率模型，能够在数据限制下自信地识别替代剪接，从而揭示细胞类型依赖的剪接模式和调控网络 | 该方法依赖于单细胞RNA测序的质量和数据，可能受到样本质量的限制 | 揭示替代剪接如何影响单细胞转录组和细胞身份 | 使用小鼠大脑发育过程中的数据来研究替代剪接模式 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 概率模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-05 |
Degradation-resistant implanted biomaterials establish an immunosuppressive microenvironment that induces T cell exhaustion by recruiting myeloid cells
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.10.007
PMID:38933993
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研究论文 | 研究表明，耐降解的钛基植入材料通过招募髓系细胞建立免疫抑制微环境，从而诱导T细胞耗竭 | 首次揭示了钛基植入物如何通过招募髓系细胞形成免疫抑制微环境 | 对植入物周围免疫环境的影响机制尚需进一步探索 | 探索植入生物材料对局部免疫环境的影响 | 耐降解的钛基植入材料及其对周围免疫环境的影响 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-05 |
Multi-tissue scRNA-seq reveals immune cell landscape of turbot (Scophthalmus maximus)
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.12.015
PMID:38933994
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研究论文 | 本文开发了一个鲽鱼的动态细菌感染模型，并创建了鱼类免疫细胞景观。 | 首次系统性解析了鲽鱼中的免疫细胞亚群及其在细菌感染中的双重功能 | 主要集中于鲽鱼，结果可能不适用于其他鱼类 | 阐明骨鱼类免疫细胞的细致分布和功能 | 鲽鱼（Scophthalmus maximus） | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 表达谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-05 |
Cell-by-Cell: Unlocking Lung Cancer Pathogenesis
2022-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14143424
PMID:35884485
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review | 本综述文章总结了单细胞分析在非小细胞肺癌研究中的应用，尤其是肺腺癌亚型。 | 利用单细胞测序技术，文章揭示了肿瘤起源细胞和肿瘤免疫动态的新知识，重写了谱系可塑性和肿瘤内部异质性的机制细节。 | 该综述主要集中于肺腺癌亚型，可能未涵盖其他类型的肺癌及其相应的病理机制。 | 旨在总结肺腺癌发病机制及其肿瘤微环境的互动。 | 研究对象为不同阶段的肺腺癌肿瘤组织及相关动物模型。 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括不同阶段的肺腺癌样本及相关动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-05 |
Deconstructing cold-induced brown adipocyte neogenesis in mice
2022-07-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80167
PMID:35848799
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研究论文 | 研究表明寒冷暴露会诱导小鼠经典肩胛间褐色脂肪组织中的新生现象 | 发现瘦素细胞不仅受β1-肾上腺素受体的调控，还受到成熟褐色脂肪细胞的信号的间接触发 | 目前尚不清楚招募免疫细胞的具体表型 | 探究寒冷诱导的褐色脂肪细胞新生机制 | 小鼠的褐色脂肪细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 生物组织 | 小鼠，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-05 |
Interleukin-17 governs hypoxic adaptation of injured epithelium
2022-07-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abg9302
PMID:35709248
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研究论文 | 本文研究了IL-17A如何调控受损上皮的缺氧适应 | 揭示了IL-17A通过激活HIF1α来驱动受损上皮的缺氧适应，并且说明了其在上皮愈合过程中的重要性 | 未说明样本大小和具体实验条件 | 探讨IL-17A在受损上皮的缺氧适应中的作用 | 受损的上皮细胞及其周围的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-05 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
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研究论文 | 该文章系统性地识别了在急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者接受地西他滨治疗后诱导的全球基因组和转录组改变。 | 本研究揭示了地西他滨诱导的全球可逆性低甲基化及其对干扰素诱导的通路的影响，为理解其在体内的作用提供了新的视角。 | 临床反应与表观遗传或转录特征之间没有关联，样本大小和患者间的变异限制了捕捉较小效应所需的统计能力。 | 研究地西他滨对急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的反应及其分子机制。 | 急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的主要骨髓样本。 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 全基因组亚硫酸盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 在患者治疗过程中收集的主要骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-05 |
What are housekeeping genes?
2022-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010295
PMID:35830477
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研究论文 | 本文探讨了家务基因的定义及其生物学和进化特征 | 提出了一个定量和实验支持的家务基因定义，并比较了不同物种间的基因稳定性和必要性 | 目前的实验支持有限，需更多研究验证基因的稳定表达与必要性之间的关系 | 旨在优化家务基因的定义并探讨其在不同生物体中的功能 | 分析人类和其他10种动物物种的家务基因数据集 | NA | NA | 基因组规模功能基因组筛选、批量及单细胞测序技术 | NA | 基因数据 | 来自多个数据集的人类基因及10种动物的基因列表 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-05 |
BAP1 Loss Promotes Suppressive Tumor Immune Microenvironment via Upregulation of PROS1 in Class 2 Uveal Melanomas
2022-Jul-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14153678
PMID:35954340
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研究论文 | 本文研究了BAP1缺失如何通过上调PROS1促进二类葡萄膜黑色素瘤的免疫抑制微环境 | 提出了BAP1缺失与肿瘤免疫微环境抑制之间的机制联系，揭示了PROS1-MERTK通路作为潜在免疫治疗靶点 | 尚未明确其他可能的调控因子，且结果的通用性需进一步验证 | 探讨BAP1缺失与二类葡萄膜黑色素瘤免疫抑制之间的潜在机制 | 二类葡萄膜黑色素瘤样本、基因工程UM细胞系及葡萄膜黑色素细胞 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和ChIP-seq | NA | 基因组数据 | 包括UM样本和基因工程细胞系的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-05 |
Dysfunctional ERG signaling drives pulmonary vascular aging and persistent fibrosis
2022-07-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31890-4
PMID:35879310
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研究论文 | 本文探讨了老年小鼠肺内皮细胞在肺纤维化恢复或进展过程中的表观遗传和转录分析 | 识别了转录因子ETS相关基因(ERG)作为肺毛细血管稳态和修复的潜在调节因子，并揭示了其在衰老中的功能失调 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能无法完全转化到人类 | 探究血管在肺部修复和纤维化中的作用及其衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-05 |
Interspecies Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals the Novel Trajectory of Osteoclast Differentiation and Therapeutic Targets
2022-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10631
PMID:35866155
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了破骨细胞分化的新轨迹及治疗靶点 | 首次建立了人类和小鼠破骨细胞发生的综合命运图谱，并识别了RAB38作为关键分子 | 样本数量和数据范围的限制可能影响结果的普遍适用性 | 探索破骨细胞分化的机制并识别骨疾病的治疗靶点 | 人类和小鼠的破骨细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的破骨细胞样本，具体数量未知 | NA | NA | NA | NA |