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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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241 | 2024-08-08 |
Parallel Single-Cell Multiomics Analysis of Neonatal Skin Reveals the Transitional Fibroblast States that Restrict Differentiation into Distinct Fates
2022-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.11.032
PMID:34922949
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研究论文 | 本文通过并行多组学分析新生小鼠皮肤中的单细胞转座酶可及染色质测序和单细胞RNA测序,揭示了纤维母细胞群可以根据转录组特征分为乳头状和网状谱系,并探讨了染色质可及性与基因表达之间的关系。 | 本文首次通过单细胞转座酶可及染色质测序分析了新生纤维母细胞谱系标记,发现尽管纤维母细胞群具有谱系特异性的转录组特征,但所有纤维母细胞群中均存在可及染色质,这表明染色质可及性并不总是转化为基因表达。 | NA | 研究新生纤维母细胞的异质性及其在皮肤再生中的作用,特别是分子机制调控细胞状态和命运。 | 新生小鼠皮肤中的纤维母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,染色质可及性数据 | 新生小鼠皮肤样本 |
242 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing predicts motility networks in purified human gastric interstitial cells of Cajal
2022-07, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14303
PMID:34913225
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类胃间质Cajal细胞的运动网络 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了人类胃间质Cajal细胞的分子网络,为胃肠动力障碍的治疗提供了新的分子见解和假设 | NA | 探索控制人类胃间质Cajal细胞生物学的分子网络,为胃肠动力障碍的靶向治疗提供新的框架 | 人类胃间质Cajal细胞 | 数字病理学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用KIT+ CD45- CD11B- 初级人类胃间质Cajal细胞进行了一系列表征实验 |
243 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals that BMPR2 mutation regulates right ventricular function via ID genes
2022-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00327-2021
PMID:34857612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BMPR2突变通过ID基因调控右心室功能 | 首次揭示了BMPR2信号通过ID和USP9X调控心脏分化,并发现ID1和ID3表达缺失导致CHD-PAH患者心肌细胞功能障碍 | NA | 旨在阐明BMPR2信号是否通过下游效应器ID蛋白在心脏发育过程中作用,从而促进CHD-PAH患者的PAH进展 | BMPR2突变对右心室功能的影响及ID基因的作用 | 数字病理学 | 先天性心脏病相关肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25只心脏特异性Id 1/3敲除小鼠,12只发展出轻度PAH;ID1和ID3双敲除人类胚胎干细胞 |
244 | 2024-08-08 |
Epigenetic promoter alterations in GI tumour immune-editing and resistance to immune checkpoint inhibition
2022-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324420
PMID:34433583
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研究论文 | 研究通过表观遗传学改变的替代启动子使用,探讨其在胃癌及其他胃肠道肿瘤中对肿瘤免疫微环境的影响及其与免疫检查点抑制剂治疗反应的关系 | 使用了一种新的生物信息学算法(proActiv)来量化替代启动子负担(APB),并通过单细胞RNA测序分析肿瘤内免疫微环境 | NA | 研究表观遗传学改变在胃癌及其他胃肠道肿瘤中的作用,以及其对肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应的影响 | 胃癌及其他胃肠道肿瘤 | 数字病理学 | 胃肠道肿瘤 | 短读RNA测序 | NA | RNA | 多个胃肠道肿瘤治疗队列 |
245 | 2024-08-08 |
Cancer stem cells in TNBC
2022-07, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2021.06.015
PMID:34147641
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌(TNBC)中癌症干细胞(CSCs)的作用及其在治疗中的潜在意义 | 利用单细胞分析技术,如单细胞RNA测序(scRNA-seq)和蛋白质组学,来揭示患者水平肿瘤内异质性,识别CSCs群体和CSC生物标志物 | TNBC在细胞系组成和分子特性上高度异质性,缺乏有效的治疗靶点 | 探讨CSCs在驱动TNBC发生中的作用及通过操纵分子信号对抗这一罕见细胞群体以控制这种致命疾病的疗法 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞及其在肿瘤生长和转移中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
246 | 2024-08-09 |
TiC2D: Trajectory Inference From Single-Cell RNA-Seq Data Using Consensus Clustering
2022 Jul-Aug, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3061720
PMID:33630737
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TiC2D的新算法,用于从单细胞RNA测序数据中进行细胞轨迹推断,采用共识聚类策略精确聚类细胞 | TiC2D算法采用共识聚类策略,能够准确推断单细胞转录组的发展轨迹,并识别细胞命运决定中的关键基因 | NA | 开发一种新的算法用于从单细胞RNA测序数据中推断细胞轨迹,以揭示正常发育和疾病的机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 转录组数据 | 四个独立的单细胞RNA测序数据集 |