单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Peripheral B-cell dysregulation is associated with relapse after long-term quiescence in patients with multiple sclerosis
2022-07, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12552
PMID:35416319
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）患者在阿仑单抗治疗前后及复发期间的B细胞变化 | 首次详细描述了IgA和IgG B细胞在RRMS患者中的异常变化及其在疾病复发中的作用，并展示了阿仑单抗治疗后这些细胞的恢复情况 | 研究仅限于RRMS患者，且样本量未在摘要中明确提及，可能影响结果的普遍性 | 探讨B细胞在多发性硬化症复发中的作用及阿仑单抗治疗的影响 | 复发缓解型多发性硬化症患者的B细胞 | NA | 多发性硬化症 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
Rare and Common Variants in KIF15 Contribute to Genetic Risk of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202110-2439OC
PMID:35417304
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研究论文 | 本文通过基因负担分析、单核苷酸变异关联测试、KIF15功能研究及人类肺单细胞RNA测序数据分析，探讨了KIF15基因中的罕见和常见变异在特发性肺纤维化（IPF）遗传风险中的作用。 | 首次揭示了KIF15基因中的罕见有害变异和常见变异与IPF风险的相关性，并关联了细胞增殖的非端粒酶途径。 | NA | 旨在识别特发性肺纤维化及相关家族性肺纤维化中富集罕见有害变异的基因。 | KIF15基因及其在特发性肺纤维化中的作用。 | 遗传学 | 特发性肺纤维化 | 全外显子数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据、RNA序列数据 | 1,725例病例和23,509例对照组 |
| 223 | 2024-08-08 |
NFkB-signaling promotes glial reactivity and suppresses Müller glia-mediated neuron regeneration in the mammalian retina
2022-07, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24181
PMID:35388544
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研究论文 | 研究NFkB信号通路如何影响啮齿动物视网膜中胶质细胞对损伤的反应以及Müller胶质细胞向神经元的重编程 | 发现NFkB信号通路在损伤后在Müller胶质细胞中被激活，介导免疫细胞的积累，并抑制Müller胶质细胞的神经发生潜力 | NA | 识别调控Müller胶质细胞介导再生的细胞信号通路和基因调控网络 | Müller胶质细胞在哺乳动物视网膜中的神经元再生能力 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 224 | 2024-08-08 |
Differential effects on natural killer cell production by membrane-bound cytokine stimulations
2022-07, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28086
PMID:35297033
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研究论文 | 本研究通过开发表达膜结合细胞因子的重组K562饲养细胞系，比较了不同细胞因子对NK细胞扩增的影响 | 发现41BBL在促进NK细胞扩增方面起主导作用，且不引起细胞耗竭；通过单细胞测序识别了由不同细胞因子诱导的NK细胞的不同亚群 | 41BBL刺激降低了NK细胞的总体细胞毒性活性 | 探讨细胞因子信号通路在NK细胞扩增和分化中的不同作用，以改进NK细胞处理设计，提高生产效率和产品质量 | NK细胞的扩增和分化 | 细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及不同细胞因子刺激的NK细胞 |
| 225 | 2024-08-08 |
Kidney Development: Recent Insights from Technological Advances
2022-07-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00041.2021
PMID:35253460
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研究论文 | 本文探讨了新技术如单细胞转录组学和增强成像模式在理解胚胎肾脏发育复杂过程中的应用 | 引入单细胞转录组学和增强成像技术以深入研究肾脏发育 | NA | 探索肾脏发育的复杂过程 | 肾脏及其发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
Identification of immunosuppressive factors in retinoblastoma cell secretomes and aqueous humor from patients
2022-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5893
PMID:35254670
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研究论文 | 研究视网膜母细胞瘤微环境中的免疫抑制因子，分析肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用 | 首次在视网膜母细胞瘤中鉴定出高水平的免疫抑制因子EMMPRIN和MIF，并证实这些因子在肿瘤微环境中的作用 | 研究主要集中在细胞和分子水平，临床应用的直接证据有限 | 探讨视网膜母细胞瘤中的免疫抑制机制及其临床意义 | 视网膜母细胞瘤细胞的分泌物和患者房水中免疫抑制因子的鉴定 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 免疫组化分析，单细胞转录组分析，免疫测定 | NA | 组织样本，细胞培养，房水 | 23名患者样本，11种视网膜母细胞瘤细胞模型，超过20名视网膜母细胞瘤患者的房水样本 |
| 227 | 2024-08-08 |
Update on preclinical and clinical efforts on ex-vivo expansion of hematopoietic stem and progenitor cells
2022-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000714
PMID:35220322
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研究论文 | 本文讨论了体外扩增造血干细胞（HSCs）和祖细胞（HPCs）的临床前和临床研究进展 | 单细胞RNA测序发现ADGRG1是体外扩增诱导线粒体氧化应激下功能性HSCs的可靠标记物 | 体外扩增可能克服HSCs稀有性的限制，但不损害干细胞特性 | 增强基于造血细胞移植疗法的临床效果 | 体外扩增的人类HSCs和HPCs | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个临床试验中的患者 |
| 228 | 2024-08-08 |
Transcriptomic Mapping of Human Parotid Gland at Single-Cell Resolution
2022-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221076069
PMID:35220796
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研究论文 | 本研究利用10× Genomics平台构建了人类腮腺的单细胞分辨率转录组图谱 | 首次报道了人类腮腺在单细胞分辨率的转录组特征，并通过比较分析揭示了腮腺与其他消化腺的特异性和相似性 | NA | 探索人类腮腺的细胞异质性和多样性，并揭示其在消化和免疫功能中的作用 | 人类腮腺的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
Gnas Loss Causes Chondrocyte Fate Conversion in Cranial Suture Formation
2022-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221075215
PMID:35220829
|
研究论文 | 研究探讨了Gα基因在维持小鼠新生颅骨发育中颅缝软骨细胞身份的作用，以及减少Hh信号传导作为非手术干预措施减少因Gα基因缺失导致的颅缝早闭症的可能性。 | 首次揭示了Gα基因缺失导致颅缝软骨细胞向成骨细胞命运转换，并引发了颅缝和囟门内的异位骨化，为颅缝早闭症的非手术治疗提供了新思路。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证。 | 探讨Gα基因在颅缝形成中的作用及如何通过减少Hh信号传导来干预颅缝早闭症。 | 小鼠新生颅缝软骨细胞及颅骨发育。 | NA | 颅缝早闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠新生颅缝软骨细胞样本 |
| 230 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers in the fibrosis progression of nonalcoholic steatohepatitis (NASH)
2022-Jul, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-022-01773-y
PMID:35226336
|
研究论文 | 本研究旨在探索与非酒精性脂肪性肝炎（NASH）纤维化进展相关的新基因 | 首次从单细胞角度探讨了与NASH纤维化相关的新基因，并分析了其在不同细胞群中的表达及其对纤维化的影响 | NA | 探索与NASH纤维化进展相关的新基因 | NASH纤维化进展相关基因 | 数字病理学 | 肝病 | RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA测序数据 | 涉及两个人类RNA测序数据集、两个小鼠单细胞RNA测序数据集和一个人类微阵列数据集 |
| 231 | 2024-08-08 |
Functional, metabolic and transcriptional maturation of human pancreatic islets derived from stem cells
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01219-z
PMID:35241836
|
研究论文 | 本文研究了从干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的功能、代谢和转录成熟过程 | 首次详细描述了干细胞衍生的胰岛细胞（SC-islets）的功能特性，并全面比较了它们与成人胰岛细胞的差异 | NA | 探讨干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病治疗中的应用潜力 | 干细胞衍生的胰腺胰岛细胞（SC-islets）及其功能、代谢和转录成熟过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | SC-islets在体外和植入小鼠体内6个月的样本 |
| 232 | 2024-08-08 |
Role for Granulocyte Colony-Stimulating Factor in Neutrophilic Extramedullary Myelopoiesis in a Murine Model of Systemic Juvenile Idiopathic Arthritis
2022-07, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42104
PMID:35243819
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研究论文 | 本研究探讨了粒细胞集落刺激因子（G-CSF）在系统性幼年特发性关节炎（JIA）小鼠模型中的作用及其对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的影响 | 首次展示了G-CSF在系统性JIA小鼠模型中对中性粒细胞增多和髓外髓系生成的作用，并评估了G-CSF受体阻断对这些过程的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要在人类患者中进一步验证 | 研究G-CSF在系统性JIA病理过程中的作用 | 系统性JIA小鼠模型中的中性粒细胞增多和髓外髓系生成 | NA | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和IFNγ-KO小鼠，以及系统性JIA患者 |
| 233 | 2024-08-08 |
CoSpar identifies early cell fate biases from single-cell transcriptomic and lineage information
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01209-1
PMID:35190690
|
研究论文 | 本文开发了一种名为CoSpar的计算方法，用于从单细胞转录组学和谱系追踪信息中推断细胞动态 | CoSpar基于过渡图的连贯性和稀疏性假设，对严重降采样和分散的谱系数据具有鲁棒性，能够识别早期命运偏倚 | NA | 旨在从单细胞基因组广泛分析中重建细胞分化、疾病发生和药物反应的动态过渡 | 单细胞转录组学和谱系追踪信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | CoSpar | 转录组数据 | 涉及造血、重编程和定向分化的数据集 |
| 234 | 2024-08-08 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学和线粒体DNA变异检测，通过增加线粒体转录组富集的覆盖率，提高了复杂组织中线粒体变异的检测能力 | 本文采用3'单细胞RNA测序协议与线粒体转录组富集相结合的方法，使覆盖率提高了50倍以上，实现了高置信度的突变检测 | NA | 研究如何在复杂组织中建立人类细胞的谱系关系 | 人类细胞的线粒体变异和谱系关系 | 数字病理学 | 克隆性造血 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 235 | 2024-08-08 |
Single-cell atlases: shared and tissue-specific cell types across human organs
2022-07, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-022-00449-w
PMID:35217821
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在构建人类细胞图谱中的应用，并探讨了不同器官中细胞类型的共性和特异性 | 介绍了单细胞基因表达数据在人类和鼠类中的应用，对比了两者在细胞类型上的差异 | NA | 旨在生成一个整合的人类细胞图谱，涵盖人体所有细胞 | 研究了人类器官中的上皮细胞、成纤维细胞、血管细胞和免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 236 | 2024-08-08 |
QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability
2022-07, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-022-00743-5
PMID:35169222
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研究论文 | 本文介绍了一种名为QuantISH的开源RNA原位杂交图像分析框架，用于量化特定细胞类型中的目标RNA表达及其变异性。 | QuantISH框架是模块化的，可适应多种图像和样本类型及染色协议，提高了RNA-ISH图像分析的自动化程度。 | NA | 开发一种自动化分析方法，用于处理大量RNA原位杂交实验数据，并量化特定细胞类型中的RNA表达及其变异性。 | 高级别浆液性癌（HGSC）中的癌细胞分类和信号表达量化。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA原位杂交（RNA-ISH） | NA | 图像 | NA |
| 237 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-T cell interactions in vascular adventitia of hyperhomocysteinemia-accelerated atherosclerosis
2022-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-021-00904-0
PMID:35175542
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-08 |
SLRRSC: Single-Cell Type Recognition Method Based on Similarity and Graph Regularization Constraints
2022-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2022.3148286
PMID:35120014
|
研究论文 | 本文提出了一种基于相似性和图正则化约束的单细胞类型识别方法SLRRSC，用于解决scRNA-seq数据中细胞类型识别的挑战 | 引入基于流形的图正则化和相似性约束到低秩表示方法中，以保留数据的局部几何结构并提高全局结构的学习能力 | NA | 开发一种新的子空间聚类算法，以更有效地从大量细胞混合物中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的单细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 低秩表示模型 | SLRRSC算法 | scRNA-seq数据 | 模拟数据和真实单细胞数据集 |
| 239 | 2024-08-08 |
Surgical resection of glioblastomas induces pleiotrophin-mediated self-renewal of glioblastoma stem cells in recurrent tumors
2022-07-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab302
PMID:34964899
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研究论文 | 本文研究了手术切除胶质母细胞瘤后，肿瘤复发细胞中多能蛋白（PTN）介导的自我更新现象 | 首次揭示了手术切除胶质母细胞瘤后，PTN在肿瘤复发细胞中的作用及其对治疗抵抗和肿瘤复发的促进作用 | 研究主要基于动物模型和患者样本，未来需进一步在更大规模的人体研究中验证 | 探讨手术切除胶质母细胞瘤对肿瘤复发细胞表型的影响及其机制 | 胶质母细胞瘤及其复发肿瘤细胞 | NA | 脑肿瘤 | 18F-FET PET/CT成像，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23名匹配原发/复发肿瘤患者，190名胶质母细胞瘤患者 |
| 240 | 2024-08-08 |
Microglia activation, classification and microglia-mediated neuroinflammatory modulators in subarachnoid hemorrhage
2022-Jul, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.330589
PMID:34916410
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综述 | 本文综述了蛛网膜下腔出血中微胶质细胞激活、分类及其介导的神经炎症调节因子的研究进展 | 介绍了单细胞转录组学在微胶质细胞研究中的最新进展，并总结了基于转录组的微胶质细胞分类及其对微胶质细胞激活和神经炎症的启示 | NA | 旨在理解蛛网膜下腔出血后的疾病过程，特别是微胶质细胞激活的调节因子和促炎/抗炎细胞因子及趋化因子 | 微胶质细胞及其介导的神经炎症在蛛网膜下腔出血中的作用 | NA | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |