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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals that BMPR2 mutation regulates right ventricular function via ID genes
2022-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00327-2021
PMID:34857612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMPR2突变通过ID基因调控右心室功能的机制 | 首次证明BMPR2信号通过ID基因和USP9X调控心脏分化,并阐明其在先天性心脏病相关肺动脉高压中的作用机制 | 研究样本量有限,动物模型与人类疾病存在差异 | 阐明BMPR2信号通过下游效应子ID基因在心脏发育中促进先天性心脏病患者肺动脉高压进展的机制 | 先天性心脏病相关肺动脉高压患者、基因敲除小鼠、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞 | 单细胞测序 | 先天性心脏病和肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、共聚焦显微镜、超声检查 | 基因敲除动物模型、干细胞分化模型 | 单细胞RNA测序数据、影像数据、生理指标数据 | 25只基因敲除小鼠(其中12只发病)、患者来源iPSCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
ZetaSuite: computational analysis of two-dimensional high-throughput data from multi-target screens and single-cell transcriptomics
2022-07-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02729-4
PMID:35879727
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研究论文 | 开发用于分析二维高通量数据的Zeta统计量和ZetaSuite软件包 | 提出新的Zeta统计量,专门用于分析二维高通量数据,并开发配套软件工具 | NA | 解决功能基因组学中二维高通量数据分析的挑战 | 二维RNAi筛选数据、癌症依赖性筛选数据、单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNAi筛选、单细胞转录组学 | 统计模型 | 高通量功能数据、单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究TCDD暴露对斑马鱼精子发生的破坏机制 | 首次在环境相关浓度TCDD暴露下,利用单细胞RNA-seq技术解析斑马鱼睾丸中各细胞类型对病理学的不同贡献 | 研究仅针对斑马鱼模型,结果向人类推广需谨慎 | 探究TCDD暴露导致男性不育的环境暴露解释 | 斑马鱼睾丸组织中的各类生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期暴露TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 4 | 2025-10-06 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
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研究论文 | 本研究揭示了SH3GLB1通过调控自噬介导线粒体代谢从而促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制 | 首次发现SH3GLB1通过自噬调控线粒体代谢功能介导胶质母细胞瘤对TMZ的耐药性 | 机制研究主要基于体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、动物模型和临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析、细胞分子检测 | NA | RNA转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床肿瘤样本和细胞系,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
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研究论文 | 通过构建小鼠大脑发育图谱并与人类胶质瘤单细胞数据比较,揭示成人脑肿瘤获得胚胎样发育状态 | 首次系统绘制小鼠大脑发育时间轴单细胞图谱,并发现成人胶质瘤细胞具有胚胎期放射状胶质前体细胞的表达特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究人类脑肿瘤与神经发育阶段的关联机制 | 小鼠大脑发育细胞和人类胶质瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 超过10万个小鼠大脑细胞和100多例人类胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
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研究论文 | 本研究揭示了第3组先天淋巴细胞在膀胱防御中通过产生IL-17参与17型免疫应答的重要作用 | 首次通过活体成像和单细胞RNA测序技术证实膀胱中NCR阳性和阴性ILC3亚群在尿路致病菌感染后的局部增殖及IL-17产生机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类膀胱ILC3功能验证尚需进一步研究 | 探究膀胱防御中17型免疫应答的调控机制 | 小鼠和人类膀胱组织中的第3组先天淋巴细胞(ILC3) | 免疫学 | 膀胱感染 | 活体成像,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学构建了CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染中的参考图谱,揭示了细胞状态的动态变化 | 首次系统描绘了CD4+ T细胞在病毒感染过程中的转录状态适应机制,并建立了可用于外部数据分析的参考图谱 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染过程中的转录状态变化规律 | 病毒感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 本研究通过构建结膜上皮细胞模型,发现虽然结膜细胞允许SARS-CoV-2基因组表达,但不会形成有效感染 | 首次建立可维持至分化第75天的结膜上皮气液界面模型,并揭示结膜细胞通过NF-κB信号而非干扰素信号抵抗SARS-CoV-2有效感染的机制 | 研究基于体外模型,可能与体内实际情况存在差异;未深入探讨NF-κB信号通路的具体作用机制 | 探究SARS-CoV-2在人类眼表结膜上皮细胞的感染机制和免疫反应 | 结膜上皮细胞(基底细胞、基底上层细胞和表层上皮细胞)及成纤维细胞 | 传染病学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,成像分析,病毒学检测 | 器官型气液界面模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases
2022-07-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2022.05.002
PMID:35649411
|
研究论文 | 通过跨组织单细胞测序构建基质细胞图谱,识别四种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 首次创建跨组织成纤维细胞图谱,发现两种在四种慢性炎症疾病中普遍存在的促炎性成纤维细胞亚群 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要进一步功能验证 | 识别多种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 来自滑膜、肠道、肺和唾液腺的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个组织和供体的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Zebrafish transposable elements show extensive diversification in age, genomic distribution, and developmental expression
2022-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275655.121
PMID:34987056
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研究论文 | 本研究系统描述了斑马鱼转座元件的种群特征、基因组分布及其在胚胎发育过程中的表达模式 | 首次全面揭示斑马鱼转座元件的动态基因组生态系统,发现近2000个不同家族,并鉴定其发育阶段特异性和组织特异性表达模式 | 主要基于计算分析,需要后续实验验证转座元件的功能影响 | 研究转座元件对脊椎动物胚胎发育的影响 | 斑马鱼转座元件 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus
2022-07-01, Appetite
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.appet.2022.106022
PMID:35430298
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞类型及其转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较下丘脑中两种肠促胰岛素受体表达细胞的异质性和分子特征 | 研究仅使用转基因小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究GIPR/GLP-1R共激动剂增强减肥效果的潜在机制 | 下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Single-cell roadmap of human gonadal development
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04918-4
PMID:35794482
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等技术构建了人类性腺发育的全面图谱 | 首次结合单细胞转录组、空间转录组、染色质可及性分析和荧光显微镜技术,系统描绘了人类性腺发育的时空图谱,并鉴定了人类特异性调控程序 | 研究主要基于第一和第二孕期的组织样本,对更早期和晚期发育阶段的覆盖有限 | 揭示人类性腺发育的细胞和分子机制 | 人类和小鼠的性腺组织 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | 人类第一和第二孕期性腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells
2022-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00931-x
PMID:35725769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类骨髓造血干细胞休眠状态的连续谱系,并发现了透明质酸-GPRC5C信号轴调控休眠的新机制 | 首次发现孤儿受体GPRC5C在人类造血干细胞休眠中的关键作用,并阐明透明质酸通过GPRC5C维持干细胞休眠的分子机制 | 人类造血干细胞休眠的存在仍存在争议,研究主要基于纯化干细胞的分析 | 探究人类造血干细胞休眠状态的分子调控机制 | 人类和小鼠骨髓造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传功能获得和缺失分析, 结构建模, 生化检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 高度纯化的人类骨髓造血干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01097-3
PMID:35726057
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析人类多发性硬化脑组织,揭示了进行性多发性硬化的早期神经退行性通路 | 首次利用空间转录组学和蛋白质组学技术识别进行性多发性硬化中的多细胞机制,并追踪神经退行性变的时空分布阶段 | 研究基于新鲜冷冻的人脑组织样本,样本获取和处理可能存在技术限制 | 阐明进行性多发性硬化的复杂发病机制,为药物开发提供新框架 | 人类进行性多发性硬化患者的脑组织样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Abnormal Cyclic Nucleotide Signaling at the Outer Mitochondrial Membrane In Sympathetic Neurons During the Early Stages of Hypertension
2022-07, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨高血压早期阶段交感神经元外线粒体膜环核苷酸信号传导异常及其对自主神经功能的影响 | 首次发现高血压前期神经元外线粒体膜PDE2A2过表达导致环核苷酸信号异常,并提出位点特异性抑制PDE2A和PDE6D的治疗策略 | 研究主要聚焦于星状神经节神经元,未涉及其他交感神经节;机制研究尚未完全阐明所有信号传导通路 | 探究高血压早期交感神经元环核苷酸信号传导异常的分子机制 | Wistar大鼠和自发性高血压大鼠的星状神经节交感神经元 | 神经科学 | 高血压 | 单细胞RNA测序, FRET传感器, 分子生物学技术 | NA | 基因表达数据, 分子信号数据 | 年轻Wistar大鼠和自发性高血压大鼠的星状神经节神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Leveraging single-cell sequencing to unravel intratumour heterogeneity and tumour evolution in human cancers
2022-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5914
PMID:35438189
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析人类癌症瘤内异质性和肿瘤进化中的应用与进展 | 系统探讨了单细胞基因组测序技术如何揭示肿瘤发生、进展、转移和治疗抵抗的进化动力学,并涵盖空间背景下的原位测序技术和多模态单细胞测序方法 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解肿瘤异质性和进化机制 | 人类癌症组织 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 原位测序, 多模态单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
Dynamic Changes in the Gene Expression Patterns and Lipid Profiles in the Developing and Maturing Meibomian Glands
2022-Jul-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23147884
PMID:35887230
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠睑板腺发育和成熟过程中的脂质组和转录组变化,揭示了睑脂生物合成的分子机制 | 首次系统研究睑板腺从新生到成年阶段的动态基因表达模式和脂质谱变化,并采用单细胞RNA测序技术识别了不同细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型,人类睑板腺可能存在差异 | 阐明睑板腺发育成熟过程中睑脂生物合成的分子机制 | 小鼠睑板腺组织 | 单细胞生物学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序,脂质组学分析,转录组分析 | NA | 基因表达数据,脂质谱数据 | 新生至成年多个发育阶段的小鼠睑板腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
Rare and Common Variants in KIF15 Contribute to Genetic Risk of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202110-2439OC
PMID:35417304
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和基因负荷分析,发现KIF15基因的罕见有害变异和常见变异与特发性肺纤维化遗传风险相关 | 首次将非端粒酶途径的细胞增殖通路与IPF易感性联系起来,并确认KIF15在肺细胞复制中的特异性表达 | 样本量相对有限,功能验证主要在淋巴母细胞中进行,未在肺组织中进行直接验证 | 识别特发性肺纤维化和家族性肺纤维化中富含罕见有害变异的基因 | 特发性肺纤维化患者和对照人群 | 遗传学 | 特发性肺纤维化 | 全外显子测序,单细胞RNA测序,基因负荷分析,功能研究 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 发现队列:1,725病例和23,509对照;总队列:2,966病例和29,817对照 | NA | 全外显子测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
A single-cell analysis of thymopoiesis and thymic iNKT cell development in pigs
2022-07-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111050
PMID:35793622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建青春期早期猪胸腺细胞图谱,揭示猪胸腺细胞生成和iNKT细胞发育特征 | 首次建立猪胸腺单细胞图谱,发现猪iNKT细胞功能多样性显著不同于小鼠的iNKT0/1/2/17亚群分化模式 | 仅针对早期青春期猪胸腺进行研究,其他发育阶段和组织的免疫特征仍需探索 | 表征猪免疫系统特征,为改善猪健康和作为临床前模型提供基础 | 青春期早期猪胸腺细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过11,000个分化中的iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-07 |
[Investigation on the growth factor regulatory network of dermal fibroblasts in mouse full-thickness skin defect wounds based on single-cell RNA sequencing]
2022-Jul-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术研究小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的异质性及生长因子调控网络 | 首次在单细胞水平系统揭示小鼠皮肤创面愈合过程中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子信号网络中的核心作用 | 研究仅针对小鼠模型,样本量较小(正常组和创面组各5只),且仅观察了伤后第7天的时间点 | 探索小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子调控网络中的作用 | 8周龄雄性C57BL/6小鼠的正常皮肤组织和伤后第7天的全层皮肤缺损创面组织 | 单细胞生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | Seurat 3.0, CellChat 1.1.3 | 单细胞基因表达数据,免疫荧光图像数据 | 10只小鼠(5只正常,5只创面),另加2只用于验证实验 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台, Illumina Novaseq6000 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |