单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 246 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
|
研究论文 | 系统鉴定了地西他滨在体内诱导的全局基因组和转录组改变，包括全基因组亚硫酸氢盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序分析 | 首次系统描述了地西他滨在体内治疗过程中诱导的全局性、可逆性低甲基化及其相关转录组变化，并发现红系相关通路在治疗中受抑制而在复发时逆转 | 样本量有限且患者间变异大，限制了检测较小临床效应的统计效力 | 阐明地西他滨治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者时引起的体内分子变化机制 | 接受地西他滨治疗的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者的原代骨髓样本 | 机器学习和生物信息学 | 骨髓增生异常综合征, 急性髓系白血病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多名患者的原代骨髓样本 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA-seq of primary bone marrow neutrophils from female and male adult mice
2022-07-23, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01544-7
PMID:35871169
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研究论文 | 使用单细胞RNA-seq技术对成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞进行转录组分析 | 首次对雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞进行单细胞分辨率转录组分析，克服了中性粒细胞RNA含量低的技术挑战 | 仅分析了小鼠模型，尚未涉及人类样本或更复杂的生理病理条件 | 研究哺乳动物免疫系统的性别二态性，特别是中性粒细胞在单细胞水平的转录组差异 | 成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 约2500个雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞（具体数量需参考原文） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 3 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示斑马鱼与人类肝脏中保守的细胞身份和纤维化表型 | 首次建立成年斑马鱼肝脏的单细胞RNA测序图谱，发现colec11作为斑马鱼肝星状细胞的新保守标记物，并通过比较分析验证斑马鱼作为肝纤维化研究模型的实用性 | 未明确提及局限性 | 表征成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组以确定其作为研究肝纤维化模型的效用 | 成年斑马鱼肝脏和人类肝脏中的单细胞，尤其是肝星状细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 斑马鱼肝脏样本和人类肝脏样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 4 | 2026-04-24 |
Differential Expression Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data: Current Statistical Approaches and Outstanding Challenges
2022-Jul-18, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24070995
PMID:35885218
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综述 | 本文批判性讨论了单细胞RNA测序数据中差异表达分析的六类统计方法及其局限性 | 首次将差异表达分析方法系统划分为六类，并详细讨论每类方法的统计原理和局限性 | 方法分类可能不全面，且未提供实证数据集验证结论 | 综述单细胞RNA-seq数据差异表达分析的统计方法及挑战 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-13 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用，并探讨了其潜在的临床应用前景 | 系统性地回顾了scRNA-seq技术如何革新对肿瘤微环境中细胞间相互作用、通讯以及瘤内遗传异质性的理解，并展望了新的癌症治疗策略 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有文献进行总结和展望 | 理解肿瘤异质性、克隆起源、进展、干性及耐药性，并探索单细胞测序技术在肿瘤研究和临床治疗中的应用 | 肿瘤微环境中的细胞（包括肿瘤细胞和免疫细胞）及其基因表达模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-06 |
NFkB-signaling promotes glial reactivity and suppresses Müller glia-mediated neuron regeneration in the mammalian retina
2022-07, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24181
PMID:35388544
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研究论文 | 本研究探讨了NFkB信号通路在哺乳动物视网膜中如何影响胶质细胞对损伤的反应以及Müller胶质细胞向神经元重编程的过程 | 揭示了NFkB信号在损伤后Müller胶质细胞中的激活作用，并证明抑制NFkB能增强Ascl1过表达的Müller胶质细胞向神经元样细胞的重编程 | 研究主要基于啮齿动物视网膜模型，可能无法完全反映人类视网膜的再生机制 | 探究NFkB信号通路在调节哺乳动物视网膜Müller胶质细胞介导的神经元再生中的作用 | 啮齿动物视网膜中的Müller胶质细胞 | 神经再生 | 视网膜损伤 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-02 |
Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal
2022-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31591-y
PMID:35851580
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研究论文 | 本文通过体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学，揭示了食欲素神经元通过抑制腹外侧视前核的促睡眠神经元来促进觉醒的间接机制 | 发现食欲素神经元通过间接抑制促睡眠神经元来维持觉醒，这为理解觉醒维持提供了新的电路框架 | NA | 研究食欲素神经元如何通过神经回路机制促进和维持觉醒状态 | 食欲素神经元和腹外侧视前核的促睡眠神经元 | 神经科学 | NA | 体内光遗传学、体外光遗传学电路映射、单细胞转录组学 | NA | 神经活动数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-02 |
Cellular and immunometabolic mechanisms of inflammation in depression: Preliminary findings from single cell RNA sequencing and a tribute to Bruce McEwen
2022-Jul, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100462
PMID:35655933
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了重度抑郁症患者中炎症与快感缺失症状相关的免疫细胞亚群和转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了重度抑郁症患者中单核细胞和CD4 T细胞的免疫代谢重编程与炎症及行为症状的关联 | 样本量较小（仅6名患者），且为初步发现，需要更大规模研究验证 | 探究重度抑郁症中炎症的细胞和免疫代谢机制及其与行为症状的关系 | 重度抑郁症门诊患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名未用药的重度抑郁症门诊患者（3名高CRP，3名低CRP） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals that BMPR2 mutation regulates right ventricular function via ID genes
2022-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00327-2021
PMID:34857612
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMPR2突变通过ID基因调控右心室功能的机制 | 首次证明BMPR2信号通过ID基因和USP9X调控心脏分化，并阐明其在先天性心脏病相关肺动脉高压中的作用机制 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异 | 阐明BMPR2信号通过下游效应子ID基因在心脏发育中促进先天性心脏病患者肺动脉高压进展的机制 | 先天性心脏病相关肺动脉高压患者、基因敲除小鼠、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞 | 单细胞测序 | 先天性心脏病和肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、共聚焦显微镜、超声检查 | 基因敲除动物模型、干细胞分化模型 | 单细胞RNA测序数据、影像数据、生理指标数据 | 25只基因敲除小鼠（其中12只发病）、患者来源iPSCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
ZetaSuite: computational analysis of two-dimensional high-throughput data from multi-target screens and single-cell transcriptomics
2022-07-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02729-4
PMID:35879727
|
研究论文 | 开发用于分析二维高通量数据的Zeta统计量和ZetaSuite软件包 | 提出新的Zeta统计量，专门用于分析二维高通量数据，并开发配套软件工具 | NA | 解决功能基因组学中二维高通量数据分析的挑战 | 二维RNAi筛选数据、癌症依赖性筛选数据、单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNAi筛选、单细胞转录组学 | 统计模型 | 高通量功能数据、单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究TCDD暴露对斑马鱼精子发生的破坏机制 | 首次在环境相关浓度TCDD暴露下，利用单细胞RNA-seq技术解析斑马鱼睾丸中各细胞类型对病理学的不同贡献 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向人类推广需谨慎 | 探究TCDD暴露导致男性不育的环境暴露解释 | 斑马鱼睾丸组织中的各类生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期暴露TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 12 | 2025-10-06 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
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研究论文 | 本研究揭示了SH3GLB1通过调控自噬介导线粒体代谢从而促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制 | 首次发现SH3GLB1通过自噬调控线粒体代谢功能介导胶质母细胞瘤对TMZ的耐药性 | 机制研究主要基于体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、动物模型和临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析、细胞分子检测 | NA | RNA转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床肿瘤样本和细胞系，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
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研究论文 | 通过构建小鼠大脑发育图谱并与人类胶质瘤单细胞数据比较，揭示成人脑肿瘤获得胚胎样发育状态 | 首次系统绘制小鼠大脑发育时间轴单细胞图谱，并发现成人胶质瘤细胞具有胚胎期放射状胶质前体细胞的表达特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究人类脑肿瘤与神经发育阶段的关联机制 | 小鼠大脑发育细胞和人类胶质瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 超过10万个小鼠大脑细胞和100多例人类胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
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研究论文 | 本研究揭示了第3组先天淋巴细胞在膀胱防御中通过产生IL-17参与17型免疫应答的重要作用 | 首次通过活体成像和单细胞RNA测序技术证实膀胱中NCR阳性和阴性ILC3亚群在尿路致病菌感染后的局部增殖及IL-17产生机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类膀胱ILC3功能验证尚需进一步研究 | 探究膀胱防御中17型免疫应答的调控机制 | 小鼠和人类膀胱组织中的第3组先天淋巴细胞(ILC3) | 免疫学 | 膀胱感染 | 活体成像,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学构建了CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染中的参考图谱，揭示了细胞状态的动态变化 | 首次系统描绘了CD4+ T细胞在病毒感染过程中的转录状态适应机制，并建立了可用于外部数据分析的参考图谱 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染过程中的转录状态变化规律 | 病毒感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 本研究通过构建结膜上皮细胞模型，发现虽然结膜细胞允许SARS-CoV-2基因组表达，但不会形成有效感染 | 首次建立可维持至分化第75天的结膜上皮气液界面模型，并揭示结膜细胞通过NF-κB信号而非干扰素信号抵抗SARS-CoV-2有效感染的机制 | 研究基于体外模型，可能与体内实际情况存在差异；未深入探讨NF-κB信号通路的具体作用机制 | 探究SARS-CoV-2在人类眼表结膜上皮细胞的感染机制和免疫反应 | 结膜上皮细胞（基底细胞、基底上层细胞和表层上皮细胞）及成纤维细胞 | 传染病学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，成像分析，病毒学检测 | 器官型气液界面模型 | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases
2022-07-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2022.05.002
PMID:35649411
|
研究论文 | 通过跨组织单细胞测序构建基质细胞图谱，识别四种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 首次创建跨组织成纤维细胞图谱，发现两种在四种慢性炎症疾病中普遍存在的促炎性成纤维细胞亚群 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步功能验证 | 识别多种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 来自滑膜、肠道、肺和唾液腺的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个组织和供体的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Zebrafish transposable elements show extensive diversification in age, genomic distribution, and developmental expression
2022-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275655.121
PMID:34987056
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研究论文 | 本研究系统描述了斑马鱼转座元件的种群特征、基因组分布及其在胚胎发育过程中的表达模式 | 首次全面揭示斑马鱼转座元件的动态基因组生态系统，发现近2000个不同家族，并鉴定其发育阶段特异性和组织特异性表达模式 | 主要基于计算分析，需要后续实验验证转座元件的功能影响 | 研究转座元件对脊椎动物胚胎发育的影响 | 斑马鱼转座元件 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus
2022-07-01, Appetite
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.appet.2022.106022
PMID:35430298
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞类型及其转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较下丘脑中两种肠促胰岛素受体表达细胞的异质性和分子特征 | 研究仅使用转基因小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探究GIPR/GLP-1R共激动剂增强减肥效果的潜在机制 | 下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Single-cell roadmap of human gonadal development
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04918-4
PMID:35794482
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等技术构建了人类性腺发育的全面图谱 | 首次结合单细胞转录组、空间转录组、染色质可及性分析和荧光显微镜技术，系统描绘了人类性腺发育的时空图谱，并鉴定了人类特异性调控程序 | 研究主要基于第一和第二孕期的组织样本，对更早期和晚期发育阶段的覆盖有限 | 揭示人类性腺发育的细胞和分子机制 | 人类和小鼠的性腺组织 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | 人类第一和第二孕期性腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq | NA | NA |