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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of neuroepithelial cells and other cell types of the gills of zebrafish (Danio rerio) exposed to hypoxia
2022-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-13693-1
PMID:35710785
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了暴露于低氧环境下的斑马鱼鳃中的神经上皮细胞和其他细胞类型的转录组特征 | 首次全面揭示了斑马鱼鳃中多种细胞类型的转录组图谱,特别是神经上皮细胞在低氧条件下的基因表达变化 | NA | 研究斑马鱼鳃在低氧环境下的细胞转录组变化 | 斑马鱼鳃中的神经上皮细胞和其他细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,819个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Integrated analysis reveals the pivotal interactions between immune cells in the melanoma tumor microenvironment
2022-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14319-2
PMID:35710862
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研究论文 | 本研究通过综合分析微阵列数据和单细胞RNA测序数据,揭示了黑色素瘤微环境中免疫细胞间的关键相互作用 | 发现了CCL5-CCR1、SELPLG-SELL、CXCL10-CXCR3和CXCL9-CXCR3通路在肿瘤微环境中免疫细胞间通信的重要作用 | NA | 确定肿瘤与免疫系统相互作用的机制及其分子决定因素,以改善癌症免疫治疗 | 黑色素瘤微环境中免疫细胞间的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO2R获取的正常和恶性组织中的差异表达基因(DEGs),以及GSE123139中的单细胞分析数据 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Unbiased spatial proteomics with single-cell resolution in tissues
2022-06-16, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.05.022
PMID:35714588
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综述 | 本文综述了基于液相色谱-质谱(LC-MS)的单细胞水平微量蛋白质分析的挑战与最新进展 | 介绍了单细胞蛋白质组学技术的发展,以及如何通过新兴技术如多重成像和空间转录组学与超灵敏蛋白质组学结合,实现组织中单细胞空间组织的研究 | NA | 探讨单细胞蛋白质组学技术在生物学基础问题和精准医学中的应用潜力 | 单细胞水平的蛋白质组学分析及其在组织空间结构研究中的应用 | 蛋白质组学 | NA | 质谱(MS) | NA | 蛋白质数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Prostate organogenesis
2022-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200394
PMID:35726824
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研究论文 | 本文讨论了前列腺器官发生的过程及其在胚胎发育和青春期中的重要性 | 近年来,随着遗传谱系追踪、单细胞RNA测序和类器官培养方法等新技术的出现,对前列腺器官发生的研究有了重要进展 | NA | 探讨前列腺器官发生的机制及其在理解前列腺疾病中的相关性 | 前列腺的器官发生过程及其调控机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Nuclear mechanoprotection: From tissue atlases as blueprints to distinctive regulation of nuclear lamins
2022-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0080392
PMID:35719698
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研究论文 | 本文探讨了核层粘连蛋白在保护DNA免受损伤中的作用,并分析了其在不同细胞和组织中的表达模式和调控机制 | 通过单细胞RNA测序分析了主要公共数据集中层粘连蛋白的表达蓝图,并揭示了层粘连蛋白A、C与机械敏感因子Vinculin、Yap1和Piezo1的表达模式相似性 | 不同细胞和组织中层粘连蛋白表达和调控的差异性仍然是一个挑战 | 理解核层粘连蛋白在机械保护中的作用及其在不同细胞和组织中的表达和调控机制 | 核层粘连蛋白及其在细胞和组织中的表达和调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及主要公共数据集中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
BCG hydrogel promotes CTSS-mediated antigen processing and presentation, thereby suppressing metastasis and prolonging survival in melanoma
2022-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004133
PMID:35732347
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研究论文 | 本文研究了一种新型BCG裂解物及其制备的温敏性PLGA-PEG-PLGA水凝胶(BCG水凝胶)在黑色素瘤治疗中的抗肿瘤效果 | BCG水凝胶通过促进组织蛋白酶S(CTSS)介导的抗原加工和呈递,增强抗肿瘤免疫反应,抑制黑色素瘤转移并延长生存期 | 目前BCG水凝胶的临床转化尚需进一步研究 | 探讨BCG水凝胶在黑色素瘤治疗中的作用机制及临床应用前景 | BCG水凝胶对黑色素瘤的抗肿瘤效果及其对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),T细胞受体测序(TCR-sequencing),RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了B16F10和MC38同基因肿瘤模型,以及来自黑色素瘤患者的活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Effects of helminths on the human immune response and the microbiome
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00532-9
PMID:35732819
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review | 本文综述了寄生虫对人类免疫反应和微生物组的影响 | 介绍了最近关于人类挑战感染、自我感染者、旅行者和流行地区人群的研究如何增进我们对人类2型免疫及其对微生物组影响的理解 | 个体间反应的异质性和组织样本(除外周血外)的有限获取限制了对寄生虫的人体研究 | 探讨寄生虫感染对人类免疫系统的影响,并探索其作为治疗炎症性疾病的潜在疗法 | 人类免疫系统对寄生虫的反应及其对微生物组的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Ly6D+Siglec-H+ precursors contribute to conventional dendritic cells via a Zbtb46+Ly6D+ intermediary stage
2022-06-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31054-4
PMID:35705536
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和高维流式细胞术研究了骨髓中CD11cMHCIISiglec-HCCR9 DC前体细胞的分化和异质性 | 发现了Ly6D+Siglec-H+前体细胞通过Zbtb46+Ly6D+中间阶段贡献于常规树突状细胞(cDC),并揭示了I型干扰素刺激如何影响pDC和cDC的输出 | NA | 探讨骨髓中树突状细胞前体细胞的分化和异质性 | 骨髓中的CD11cMHCIISiglec-HCCR9 DC前体细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学,高维流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠骨髓中的DC前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
ID proteins promote the survival and primed-to-naive transition of human embryonic stem cells through TCF3-mediated transcription
2022-06-15, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04958-8
PMID:35701409
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研究论文 | 研究探讨了ID1和ID3蛋白在人类胚胎干细胞(hESCs)中的作用,特别是它们如何通过TCF3介导的转录促进细胞存活和从激活态到原始态的转变 | 首次揭示了ID1和ID3蛋白通过AKT信号通路调节人类胚胎干细胞的存活和多能性,并通过TCF3介导的转录抑制MCL1来促进AKT磷酸化 | NA | 研究ID1和ID3蛋白在人类胚胎干细胞中的具体作用及其对细胞存活和状态转变的影响 | 人类胚胎干细胞(hESCs)中的ID1和ID3蛋白 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ID1和ID3敲除线(IDs KO)以及过表达ID1的激活态hESCs | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Cell type matching in single-cell RNA-sequencing data using FR-Match
2022-06-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14192-z
PMID:35705694
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研究论文 | 本文介绍了FR-Match(v2.0)的显著增强,这是一种用于匹配查询数据集中细胞类型与参考图谱的多变量非参数统计测试方法 | FR-Match v2.0包括一个标准化程序,以促进跨平台集群级别的比较,并扩展了管道以允许细胞级别的匹配 | NA | 开发和验证用于细胞类型匹配的计算算法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型匹配 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数统计测试 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Identification, discrimination and heterogeneity of fibroblasts
2022-06-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30633-9
PMID:35701396
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综述 | 本文综述了近年来在成纤维细胞识别和异质性方面的最新进展,并讨论了它们与其他细胞类型的区别 | 利用单细胞转录组学技术,提供了详细的分子图谱,丰富了传统的组织学和免疫学描述,改进了细胞分类定义 | NA | 总结和讨论成纤维细胞识别和异质性的最新进展 | 成纤维细胞的识别、区分及其异质性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 分子图谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Genetic encoding of an esophageal motor circuit
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110962
PMID:35705034
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了核模糊(nAmb)神经元的三种分子特异性亚型,并探讨了它们在食道肌肉控制中的作用 | 首次通过基因表达谱和轴突投射图揭示了nAmb神经元的分子特异性亚型,并证实了Crhr2神经元在食道肌肉功能控制中的作用 | NA | 阐明食道运动控制的遗传编码电路 | 核模糊(nAmb)神经元的分子特异性亚型及其在食道肌肉控制中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Deciphering the origins and fates of steroidogenic lineages in the mouse testis
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110935
PMID:35705036
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了小鼠睾丸中类固醇生成细胞系(包括Leydig细胞和其前体细胞)的起源和分化动态 | 首次详细描述了小鼠睾丸中类固醇生成细胞系的双重起源及其在胚胎发育早期的分化过程 | NA | 探究小鼠睾丸中类固醇生成细胞系的起源和分化机制 | 小鼠睾丸中的Leydig细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个胚胎发育阶段的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Unravelling the sex-specific diversity and functions of adrenal gland macrophages
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110949
PMID:35705045
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传模型研究了肾上腺巨噬细胞的异质性及其发育机制 | 首次定义了肾上腺巨噬细胞的异质性,并发现了一种具有低主要组织相容性复合体II类表达的女性特异性亚群 | NA | 揭示肾上腺巨噬细胞的性别特异性多样性和功能 | 肾上腺巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Fbxw11 impairs the repopulation capacity of hematopoietic stem/progenitor cells
2022-06-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02926-9
PMID:35690796
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研究论文 | 研究探讨了Fbxw11蛋白在造血干细胞/祖细胞(HSPCs)中的作用及其对细胞增殖和分化的影响 | 首次揭示了Fbxw11在HSPCs中的功能,并展示了其对细胞周期分布和转录组变化的影响 | 研究主要集中在体外和体内实验,可能需要更多临床数据来验证这些发现 | 探究Fbxw11在HSPCs中的作用及其对细胞自我更新和分化的影响 | 造血干细胞/祖细胞(HSPCs) | NA | NA | 实时PCR,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 多个造血亚群细胞,具体数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Single_cell_GRN: gene regulatory network identification based on supervised learning method and Single-cell RNA-seq data
2022-Jun-11, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-022-00297-8
PMID:35690842
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研究论文 | 本文研究了七种分类器在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络(GRN)的性能 | 本文首次比较了监督学习方法在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络的性能,并发现支持向量机(SVM)、随机森林(RF)和K-最近邻(KNN)表现最佳 | 研究仅使用了三种真实的单细胞RNA测序数据集,可能需要更多数据集来验证结果的普遍性 | 评估不同分类器在单细胞RNA测序数据上推断基因调控网络的性能 | 七种分类器在单细胞RNA测序数据上的性能 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、朴素贝叶斯(NB)、GBDT、逻辑回归(LR)、决策树(DT)和K-最近邻(KNN) | 单细胞RNA测序数据 | 三种真实的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing
2022-06-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30963-8
PMID:35688820
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术探索了环状RNA在人和小鼠组织中的细胞景观 | 首次在单细胞水平上全面表征了环状RNA的细胞架构,并揭示了其在不同细胞类型中的特异性表达模式 | NA | 探索环状RNA在单细胞水平上的表达模式及其在不同细胞类型中的特异性 | 环状RNA在人和小鼠组织中的细胞景观 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 171个全长单细胞RNA-seq数据集,包含139,643个人和214,747个小鼠环状RNA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
LSH-GAN enables in-silico generation of cells for small sample high dimensional scRNA-seq data
2022-06-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03473-y
PMID:35688990
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research paper | 本文提出了一种改进的生成对抗网络LSH-GAN,用于生成高质量的细胞样本,以解决scRNA-seq数据下游分析中细胞样本不足的问题 | LSH-GAN通过使用局部敏感哈希更新生成器的训练过程,加快了样本生成速度,并提高了生成细胞样本的质量 | NA | 解决scRNA-seq数据下游分析中细胞样本不足的问题 | scRNA-seq数据中的细胞样本 | machine learning | NA | scRNA-seq | GAN | scRNA-seq数据 | 小样本 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Identification of the central intermediate in the extra-embryonic to embryonic endoderm transition through single-cell transcriptomics
2022-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00923-x
PMID:35681011
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研究论文 | 本文利用大规模单细胞RNA测序技术,解析了从胚外到胚胎内胚层过渡过程中的中间细胞类型 | 开发了一种单参数计算方法来关联数据集中的细胞类型,并首次在空间上定位了从胚外身份到胚胎内胚层的中间细胞类型 | 在胚胎干细胞分化过程中,这种细胞类型的证据较少 | 研究胚胎发育过程中细胞身份的获取及其分化路径 | FOXA2报告基因小鼠胚胎和向内胚层分化的胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用FOXA2报告基因小鼠胚胎和胚胎干细胞分化样本 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
Synaptic Cell Adhesion Molecule 3 (SynCAM3) Deletion Promotes Recovery from Spinal Cord Injury by Limiting Glial Scar Formation
2022-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23116218
PMID:35682897
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研究论文 | 研究探讨了SynCAM3缺失对脊髓损伤后胶质瘢痕形成的影响及其对功能恢复的作用 | 首次揭示了SynCAM3在脊髓损伤后胶质瘢痕形成中的作用,并提出其作为治疗脊髓损伤的新靶点 | 研究仅在SynCAM3敲除小鼠模型中进行,结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探究SynCAM3在脊髓损伤后胶质瘢痕形成中的作用及其对功能恢复的影响 | SynCAM3敲除小鼠与野生型小鼠在脊髓损伤后的表现 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序分析、定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)分析、免疫组织化学(IHC) | NA | NA | SynCAM3敲除小鼠与野生型小鼠作为对照 | NA | NA | NA | NA |