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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
[The Expression of RTN1 in Lung Adenocarcinoma and
Its Effect on Immune Microenvironment]
2022-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究探讨了RTN1在肺腺癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 首次报道了RTN1在肺腺癌患者中的表达及其对免疫微环境的影响 | 相关机制需要进一步研究 | 研究RTN1在肺腺癌中的表达及其与免疫浸润和生存的相关性 | 肺腺癌患者中的RTN1表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | Tumor Immune Estimation Resource 2.0 (TIMER 2.0), Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2 (GEPIA 2), 基因集富集分析, 单细胞测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用TCGA队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Drosophila Leg Disc Identifies a Long Non-Coding RNA in Late Development
2022-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23126796
PMID:35743238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了一种新型长非编码RNA在果蝇腿部发育中的作用 | 首次在果蝇腿部发育过程中鉴定出一种新型长非编码RNA，并通过单细胞技术验证了其在晚期发育中的高表达 | NA | 研究长非编码RNA在果蝇腿部发育中的作用 | 果蝇第三龄幼虫的腿部盘 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育时间点的果蝇第三龄幼虫腿部盘细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Reveals S100a8/a9 Regulates Autophagy and Apoptosis through the MAPK and PI3K-AKT Signaling Pathway in the Early Stage of Myocardial Infarction
2022-06-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11121911
PMID:35741040
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研究论文 | 本研究通过分析心肌梗死早期小鼠的scRNA-seq和mRNA-seq数据，发现S100a8和S100a9的表达先增加后减少，并与中性粒细胞数量变化相关，进一步通过功能富集分析发现S100a8和S100a9通过MAPK或PI3K-AKT信号通路调控心肌细胞的自噬和凋亡 | 本研究首次揭示了S100a8/a9在心肌梗死早期通过MAPK和PI3K-AKT信号通路调控心肌细胞自噬和凋亡的机制 | NA | 阐明心肌梗死早期发病机制并改善其早期治疗 | 心肌梗死早期心肌细胞自噬和凋亡的调控机制 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | scRNA-seq, mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Region-Specific Characteristics of Astrocytes and Microglia: A Possible Involvement in Aging and Diseases
2022-06-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11121902
PMID:35741031
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综述 | 本文综述了不同脑区星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在衰老和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序等技术发现具有独特分子特征和不同功能的星形胶质细胞和小胶质细胞 | NA | 探讨脑区特异性星形胶质细胞和小胶质细胞在理解大脑整体功能中的重要性 | 星形胶质细胞和小胶质细胞在不同脑区的异质性 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Comprehensive Integrated Single-Cell Whole Transcriptome Analysis Revealed the p-EMT Tumor Cells-CAFs Communication in Oral Squamous Cell Carcinoma
2022-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23126470
PMID:35742914
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研究论文 | 本研究通过综合分析口腔鳞状细胞癌（OSCC）的单细胞RNA测序数据，揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）与部分上皮-间质转化（p-EMT）肿瘤细胞之间的相互作用 | 研究发现了四种CAF亚型、一种p-EMT肿瘤细胞群体及肿瘤细胞周期，并揭示了CAFs与p-EMT肿瘤细胞在肿瘤转移过程中的TNFSF12-TNFRSF25/TNFRSF12A相互作用 | NA | 旨在深入分析并整合OSCC的单细胞RNA测序数据，定义OSCC中的CAFs和p-EMT亚群，并揭示其细胞间相互作用网络 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和部分上皮-间质转化（p-EMT）肿瘤细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
The Landscape of Noncoding RNA in Pulmonary Hypertension
2022-06-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12060796
PMID:35740920
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综述 | 本文综述了非编码RNA在肺动脉高压中的分类、生物发生、生物学功能及分子机制 | 强调了长非编码RNA和环状RNA在肺动脉高压中的重要作用及作为疾病生物标志物和治疗靶点的潜力 | NA | 总结非编码RNA在肺动脉高压中的研究进展，并探讨其作为生物标志物和治疗手段的应用与挑战 | 非编码RNA，特别是长非编码RNA和环状RNA | RNA研究 | 肺动脉高压 | RNA测序，单细胞和空间转录组学，RNA-蛋白质/RNA相互作用 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Recommendations of scRNA-seq Differential Gene Expression Analysis Based on Comprehensive Benchmarking
2022-Jun-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12060850
PMID:35743881
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研究论文 | 本文开发了一种新型模拟器，用于指导分析人员在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中选择合适的差异基因表达分析工具和参数 | 开发了一种能够重现实验数据特征的模拟器，并展示了基于负二项混合模型的方法（如glmmTMB和NEBULA-HL）在差异基因表达分析中的优越性 | NA | 指导分析人员选择合适的工具和参数进行单细胞RNA测序数据的差异基因表达分析 | 单细胞RNA测序数据的差异基因表达分析方法 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 负二项混合模型 | scRNA-seq数据 | 多条件、多受试者的模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Mouse Pancreas: Characteristic Features of Pancreatic Ductal Cells in Chronic Pancreatitis
2022-06-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13061015
PMID:35741777
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的转录组特征 | 首次详细描述了慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的单细胞转录组特征，并发现了疾病特异性生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探索慢性胰腺炎小鼠胰腺细胞的单细胞转录组特征及其在疾病中的作用 | 正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠的胰腺细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3825个细胞，来自一只正常小鼠和慢性胰腺炎小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Enabling automated and reproducible spatially resolved transcriptomics at scale
2022-Jun, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e09651
PMID:35756107
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研究论文 | 本文介绍了一种在广泛使用的Agilent Bravo液体处理平台上自动化的10x Genomics Visium文库构建方法，以提高空间转录组学分析的效率和重现性 | 提出的自动化方法将手动操作时间减少了80%以上，并提高了通量和稳健性 | NA | 旨在实现大规模空间转录组学分析的自动化和标准化 | 空间转录组学文库的自动化构建 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals immune dysregulation mediated by IL-17A in initiation of chronic lung injuries upon real-ambient particulate matter exposure
2022-06-23, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-022-00483-w
PMID:35739565
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了IL-17A介导的免疫失调在真实环境颗粒物暴露下慢性肺损伤启动中的作用 | 首次详细描述了IL-17A信号通路在亚慢性颗粒物暴露下肺纤维化进展中的作用 | NA | 阐明不同细胞集群和关键通路在颗粒物暴露后触发小鼠慢性肺损伤中的相互作用 | C57BL/6J雄性小鼠 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞转录组学 | IL-17A敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 六周龄C57BL/6J雄性小鼠，暴露于颗粒物或过滤空气16周 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Decoding lymphomyeloid divergence and immune hyporesponsiveness in G-CSF-primed human bone marrow by single-cell RNA-seq
2022-Jun-22, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00417-y
PMID:35732626
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了G-CSF处理后人骨髓中造血细胞的转录组变化 | 首次全面、无偏和高分辨率地调查了G-CSF处理后人骨髓的细胞和分子生态系统，揭示了G-CSF诱导的髓系偏向分化和T细胞及自然杀伤细胞的低反应性的细胞和分子基础 | 研究样本仅来自两名健康捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 探究G-CSF处理后人骨髓中淋巴髓系分化和免疫低反应性的机制 | G-CSF处理后人骨髓中的造血细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康捐赠者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of subcutaneous adipose tissues identifies therapeutic targets for cancer-associated lymphedema
2022-Jun-21, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00402-5
PMID:35725971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入解析了淋巴水肿患者皮下脂肪组织的细胞变化，并发现了PRG4/CLEC3B ASC亚群c3的显著扩张与脂肪组织纤维化的关联 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未进行临床试验验证 | 旨在发现癌症相关淋巴水肿的有效治疗靶点 | 淋巴水肿患者的皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 70,209个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Mycobacterium tuberculosis infection drives a type I IFN signature in lung lymphocytes
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110983
PMID:35732116
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和结核分枝杆菌（Mtb）感染小鼠的肺淋巴细胞，发现Mtb感染导致淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集 | 首次在单细胞层面揭示了Mtb感染后肺淋巴细胞中I型IFN信号特征的富集，并验证了Ly6A作为淋巴细胞活化标记物的上调 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 旨在深入理解结核分枝杆菌感染后免疫反应的细胞水平动态，以设计更好的结核病控制策略 | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和结核分枝杆菌感染小鼠的肺淋巴细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of a soft-tissue sarcoma model reveals the critical role of tumor-expressed MIF in shaping macrophage heterogeneity
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110977
PMID:35732118
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究软组织肉瘤模型，揭示肿瘤表达的MIF在塑造巨噬细胞异质性中的关键作用 | 首次详细描述了软组织肉瘤模型中巨噬细胞的不同激活状态，并证明了MIF在调节巨噬细胞激活状态和促肿瘤潜能中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类软组织肉瘤存在差异 | 探讨软组织肉瘤微环境中的免疫成分，特别是巨噬细胞的异质性及其调控机制 | 软组织肉瘤模型中的巨噬细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型中的软组织肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Joint profiling of gene expression and chromatin accessibility during amphioxus development at single-cell resolution
2022-06-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110979
PMID:35732129
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research paper | 本文通过单细胞核RNA测序（snRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，对文昌鱼的不同发育阶段进行了基因表达和染色质可及性的联合分析 | 首次在文昌鱼中进行基因表达和染色质可及性的单细胞分辨率联合分析，构建了文昌鱼的发育树 | NA | 探索脊椎动物的起源和进化 | 文昌鱼的基因表达和染色质可及性 | digital pathology | NA | 单细胞核RNA测序（snRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达和染色质可及性数据 | 涵盖文昌鱼的胚胎发生和成体组织不同阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Identification of prostate cancer subtypes based on immune signature scores in bulk and single-cell transcriptomes
2022-Jun-18, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-022-01719-7
PMID:35716212
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤免疫微环境中的28种免疫细胞类型的富集分数，通过无监督聚类方法识别前列腺癌的免疫特异性亚型 | 首次在大量和单细胞转录组数据中识别出前列腺癌的免疫特异性亚型，并探讨了这些亚型与临床特征的关系 | NA | 探索前列腺癌的免疫微环境异质性及其与临床特征的相关性 | 前列腺癌的免疫特异性亚型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 转录组数据 | 十个不同的肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Comprehensive characterization of the prostate tumor microenvironment identifies CXCR4/CXCL12 crosstalk as a novel antiangiogenic therapeutic target in prostate cancer
2022-06-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01597-7
PMID:35717322
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研究论文 | 本文详细描述了前列腺癌肿瘤内皮细胞（TEC）的特征，并揭示了CXCR4/CXCL12相互作用作为前列腺癌抗血管生成治疗新靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析，首次在前列腺癌中详细描述了肿瘤内皮细胞的分子特征，并验证了CXCR4/CXCL12相互作用作为治疗靶点 | 研究样本仅来自67例根治性前列腺切除术标本，且主要在体外和小鼠模型中验证，需要进一步在临床试验中验证其疗效 | 揭示前列腺癌肿瘤微环境中细胞间相互作用，寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤内皮细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 67例新鲜根治性前列腺切除术标本 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31131-8
PMID:35715410
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研究论文 | 本文通过比较并行多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq、RRBS和CNVs）研究了细胞在体外通过核重编程获得多能性和滋养层细胞状态的过程，揭示了两种状态获取的不同轨迹。 | 本研究首次展示了细胞重编程至多能性和滋养层细胞状态的特定轨迹，提出了‘V’形模型，并详细描述了两种状态获取的不同轨迹和阶段特异性标记物、阻断剂、促进剂及滋养层细胞亚群。 | NA | 探讨细胞在体外通过核重编程获得多能性和滋养层细胞状态的动态过程及其相似性。 | 细胞重编程至多能性和滋养层细胞状态的过程。 | 生物信息学 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, RRBS, CNVs | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
scCAN: single-cell clustering using autoencoder and network fusion
2022-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14218-6
PMID:35715568
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研究论文 | 介绍了一种名为scCAN的新方法，该方法利用自动编码器和网络融合技术对单细胞RNA测序数据进行无监督聚类 | scCAN能够准确地分离大型和稀疏的单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型，并且在准确性和可扩展性方面优于现有的先进方法 | NA | 开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据分析中的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 自动编码器和网络融合 | 自动编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 28个真实单细胞RNA测序数据集（超过三百万个细胞）和243个模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Benchmarking imputation methods for network inference using a novel method of synthetic scRNA-seq data generation
2022-Jun-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04778-9
PMID:35715748
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Biomodelling.jl的工具，用于生成合成scRNA-seq数据，并评估不同插补方法对基因调控网络推断算法性能的影响。 | 开发了一种新的合成scRNA-seq数据生成方法，用于基准测试基因调控网络推断的不同方法。 | NA | 评估插补方法对单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的影响。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 多尺度模型 | 基因表达数据 | 合成数据 | NA | NA | NA | NA |