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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of lower mitochondrial complex I expression is associated with cell metastasis of clear cell renal cell carcinoma
2022-Jun, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-242
PMID:35836523
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研究论文 | 本研究分析了线粒体复合物I（CI）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞转移中的作用 | 首次揭示了线粒体复合物I在ccRCC转移中的关键作用，并提出了CI和PPARG作为潜在的转移性ccRCC生物标志物 | NA | 探讨ccRCC转移的机制并开发有效的治疗方法 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的细胞转移机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络 | 基因表达数据 | 使用了GSE73121和TCGA-KIRC数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
The Role of Microglia in Neuroinflammation of the Spinal Cord after Peripheral Nerve Injury
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132083
PMID:35805167
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综述 | 本文综述了周围神经损伤后脊髓中微胶质细胞在神经炎症中的作用及其激活机制和功能 | 利用单细胞转录组学、新型遗传小鼠模型和活体成像等神经免疫研究技术，深入分析了微胶质细胞激活的机制及其在神经保护、退化、再生、突触可塑性和脊髓回路重组中的功能 | NA | 旨在阐明周围神经损伤后脊髓微胶质细胞与神经元相互作用的多样性，解决相关争议 | 微胶质细胞在脊髓中的激活机制及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
Single B Cell Gene Co-Expression Networks Implicated in Prognosis, Proliferation, and Therapeutic Responses in Non-Small Cell Lung Cancer Bulk Tumors
2022-Jun-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133123
PMID:35804895
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研究论文 | 本文通过比较非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤B细胞和正常B细胞的单细胞RNA测序数据，构建了肿瘤特异性B细胞基因共表达网络，并利用CRISPR-Cas9/RNA干扰筛选数据在92多个人类NSCLC上皮细胞系中筛选增殖基因，评估了这些基因的预后和预测价值。 | 本文首次构建了NSCLC肿瘤B细胞的基因共表达网络，并发现了一个九基因标志物，该标志物在NSCLC肿瘤转录组和蛋白质组中提供了准确的预后分层。 | NA | 探索非小细胞肺癌中B细胞功能障碍的机制及其在预后中的重要性，并寻找免疫治疗预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌肿瘤B细胞和正常B细胞的基因共表达网络。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 1313个NSCLC肿瘤转录组样本和103个蛋白质组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Astrocyte and Microglial Heterogeneity in Health and Disease
2022-06-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132021
PMID:35805105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究健康与疾病状态下星形胶质细胞和小胶质细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了星形胶质细胞和小胶质细胞在神经退行性疾病及HIV感染中的异质性 | NA | 旨在理解星形胶质细胞和小胶质细胞在维持神经功能中的异质性，并识别调节其对HIV反应的基因和机制 | 星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在疾病状态下的变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
Role of GDF15/MAPK14 Axis in Chondrocyte Senescence as a Novel Senomorphic Agent in Osteoarthritis
2022-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137043
PMID:35806043
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研究论文 | 本文探讨了GDF15/MAPK14轴在软骨细胞衰老中的作用，以及GDF15作为骨关节炎新型抗衰老剂的潜力 | 首次揭示了GDF15在骨关节炎中通过诱导血管生成促进软骨细胞衰老的作用 | NA | 研究GDF15在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 软骨细胞衰老和骨关节炎的进展 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序RNA | NA | 组织和滑膜液样本 | 来自骨关节炎患者的组织和滑膜液样本，C20A4细胞系和HUVEC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Hypothalamic CREB Regulates the Expression of Pomc-Processing Enzyme Pcsk2
2022-06-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131996
PMID:35805082
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研究论文 | 研究探讨了下丘脑CREB对Pomc加工酶Pcsk2表达的调控作用及其在实验性肥胖中的影响 | 首次证明了CREB在实验性肥胖中对下丘脑Pomc内肽酶系统的异常调控作用 | NA | 探究高脂饮食对下丘脑CREB表达及其对黑皮质素系统功能的影响 | 下丘脑Pomc神经元中的CREB及其对Pcsk2表达的调控 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序分析, PCR, 免疫印迹, ELISA和免疫荧光组织学检测 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Differentiation Trajectory of Limbal Stem and Progenitor Cells under Normal Homeostasis and upon Corneal Wounding
2022-06-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131983
PMID:35805068
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序在小鼠模型中识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群及其分化轨迹 | 本研究首次识别出两种潜在的角膜缘干细胞类型，并揭示了它们在正常稳态和伤口愈合过程中的分化轨迹 | NA | 旨在识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群 | 角膜缘干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Comparison of cell state models derived from single-cell RNA sequencing data: graph versus multi-dimensional space
2022-06-10, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022395
PMID:35801475
|
研究论文 | 本文比较了两种基于单细胞RNA测序数据的细胞状态模型：图模型和多维空间模型 | 首次对比了图模型和多维空间模型在构建细胞状态转换数学模型中的应用 | 主要集中在图模型和多维空间模型的优缺点比较，未涉及其他可能的模型 | 探讨和比较两种不同的细胞状态几何模型在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据和造血系统 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图模型和多维空间模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Telomerase positive CTCs with PSMA high expression associated with prostate cancer metastasis
2022-Jun, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-1140
PMID:35812202
|
研究论文 | 本研究探讨了前列腺特异性膜抗原（PSMA）高表达的循环肿瘤细胞（CTCs）与前列腺癌转移进展的关系 | 采用基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法，并通过基因本体（GO）功能分类和富集分析，证实了PSMA高表达组中增殖相关术语的富集 | NA | 旨在提供证据阐明PSMA高表达的CTCs与前列腺癌转移进展的关系 | 前列腺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法 | NA | 单细胞测序数据 | 共71名患者，分为局部前列腺癌组（44名）和转移性前列腺癌组（27名） | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
Integration and Reanalysis of Four RNA-Seq Datasets Including BALF, Nasopharyngeal Swabs, Lung Biopsy, and Mouse Models Reveals Common Immune Features of COVID-19
2022-Jun, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2022.22.e22
PMID:35799708
|
研究论文 | 本研究重新分析了四个COVID-19的RNA测序数据集，包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠，揭示了COVID-19的共同免疫特征。 | 使用统一的标准化方法重新分析多个RNA测序数据集，揭示了COVID-19的共同免疫特征，与单细胞RNA测序研究结果一致。 | NA | 理解COVID-19的发病机制，并开发更好的治疗策略。 | COVID-19患者的免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠的四个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Identification of a differentiation-related prognostic nomogram based on single-cell RNA sequencing in clear cell renal cell carcinoma
2022-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-15206-6
PMID:35768519
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研究论文 | 本研究通过回顾性分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，结合TCGA数据库中的批量RNA-seq数据，构建了基于分化相关基因（DRG）的预后风险签名（PRS）和预测透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者预后的诺模图 | 本研究首次构建了基于DRG的PRS和诺模图，用于预测ccRCC患者的预后，并揭示了细胞分化轨迹和肿瘤微环境（TME）演变在预测临床结果和潜在免疫治疗反应中的重要性 | NA | 旨在通过分析scRNA-seq数据和TCGA数据库中的批量RNA-seq数据，构建预测ccRCC患者预后的诺模图 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Activated-memory T cells influence naïve T cell fate: a noncytotoxic function of human CD8 T cells
2022-06-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03596-2
PMID:35768564
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研究论文 | 研究探讨了记忆T细胞与幼稚T细胞之间的相互作用及其对幼稚T细胞命运的影响 | 首次报道了人类幼稚CD8 T细胞在自体激活记忆CD8 T细胞存在下发生表型和转录变化的现象 | 研究主要集中在体外共培养实验，可能需要进一步的体内实验验证 | 探究记忆T细胞与幼稚T细胞之间的交叉对话及其对幼稚T细胞的影响 | 人类幼稚CD8 T细胞和激活的记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约3%的幼稚T细胞获得了激活/记忆标志物，约84%的幼稚T细胞发展出独特的激活转录组特征 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
Clinical significance and potential regulatory mechanism of overexpression of pituitary tumor-transforming gene transcription factor in bladder cancer
2022-Jun-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09810-y
PMID:35768832
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研究论文 | 本研究分析了垂体瘤转化基因-1（PTTG1）转录因子在膀胱癌（BLCA）中的异常表达及其临床意义，探讨了PTTG1与肿瘤微环境特征之间的关系，并预测了其在BLCA组织中的潜在转录活性 | 本研究首次详细探讨了PTTG1在膀胱癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系，并预测了其潜在的转录活性 | NA | 分析PTTG1在膀胱癌中的异常表达及其临床意义，探讨其与肿瘤微环境的关系，并预测其在BLCA组织中的潜在转录活性 | PTTG1在膀胱癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 免疫组织化学染色，CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 1037例膀胱癌样本与127例非膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Cell fate determining molecular switches and signaling pathways in Pax7-expressing somitic mesoderm
2022-Jun-28, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00407-0
PMID:35764624
|
研究论文 | 研究探讨了Pax7表达的体节中胚层在胚胎发育过程中细胞命运决定的分子开关和信号通路 | 通过单细胞转录组分析，揭示了肌肉、真皮和棕色脂肪细胞分化的时间特异性事件，并识别了潜在的标记基因和驱动谱系特异性分化的转录因子 | NA | 深入理解Pax7谱系在胚胎发育过程中的细胞命运决定机制 | Pax7表达的体节中胚层细胞及其在胚胎发育中的分化过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎中Pax7表达细胞在E9.5、E12.5、E14.5和E16.5时间点的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
A transcriptome atlas and interactive analysis platform for autoimmune disease
2022-06-27, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baac050
PMID:35758882
|
研究论文 | 本研究开发了一个用户友好的网络数据库工具IAAA，集成了大量自身免疫疾病转录组测序数据，并提供多种分析模块 | IAAA数据库整合了大量自身免疫疾病的bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，并提供可定制的分析模块 | NA | 开发一个集成自身免疫疾病转录组测序数据的数据库，并提供有效的分析工具 | 自身免疫疾病的转录组数据 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 929个样本的bulk RNA-seq数据和783,203个细胞的单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Phylovar: toward scalable phylogeny-aware inference of single-nucleotide variations from single-cell DNA sequencing data
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac254
PMID:35758771
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Phylovar的新方法，该方法能够扩展基于系统发育的变异检测方法，以处理包含数百万个位点的单细胞DNA测序数据集 | Phylovar方法在运行时间上优于SCIΦ，同时在单核苷酸变异检测的准确性上超过非系统发育感知的Monovar方法 | NA | 开发一种可扩展的、基于系统发育的单细胞DNA测序数据中单核苷酸变异检测方法 | 单细胞DNA测序数据中的单核苷酸变异 | 生物信息学 | 乳腺癌，神经退行性疾病 | 单细胞全基因组测序（scWGS），单细胞全外显子测序（scWES） | NA | DNA序列数据 | 乳腺癌数据包含32个细胞和3375个位点，神经细胞数据包含16个细胞和约250万个位点 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
psupertime: supervised pseudotime analysis for time-series single-cell RNA-seq data
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac227
PMID:35758781
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研究论文 | 本文介绍了一种名为psupertime的监督式伪时间分析方法，用于时间序列单细胞RNA测序数据 | psupertime方法基于回归模型，明确使用时间序列标签作为输入，能够识别沿时间序列一致变化的基因，并提供个体细胞的伪时间值及分类器，用于估计新数据中未知或不同的标签 | NA | 改进时间序列单细胞RNA测序数据的分析方法 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的基因变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
MOJITOO: a fast and universal method for integration of multimodal single-cell data
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac220
PMID:35758807
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MOJITOO的单细胞多模态数据整合方法，该方法使用典型相关分析快速且无需参数地检测多模态单细胞数据中的共享细胞表示 | MOJITOO方法在计算需求、原始潜在空间的保留和聚类方面优于现有方法，并且可以用于解释模态特异性分子特征与潜在空间之间的关联 | NA | 开发一种快速且通用的方法来整合多模态单细胞数据 | 多模态单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 典型相关分析 | NA | 单细胞数据 | 使用了双模态和三模态的单细胞数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Visualizing hierarchies in scRNA-seq data using a density tree-biased autoencoder
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac249
PMID:35758814
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research paper | 本文提出了一种从高维单细胞RNA测序数据中识别有意义树结构的方法，并开发了一种尊重树结构的视觉化技术 | 引入了密度树偏置自编码器（DTAE），这是一种强调数据在低维空间中树结构的自编码器 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的树结构，并开发相应的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据中的树结构 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Semi-deconvolution of bulk and single-cell RNA-seq data with application to metastatic progression in breast cancer
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac262
PMID:35758822
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研究论文 | 本文开发了一种新方法，利用参考scRNA-seq数据解释仅能获得bulk RNA-seq数据的样本集合，特别是在乳腺癌骨转移数据集上的应用证实了scRNA-seq数据在改善同患者bulk样本中细胞类型推断和定量方面的能力 | 提出了一种结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据的新方法，通过二次规划框架恢复bulk样本中更准确的细胞类型及其丰度 | 该方法在处理大量队列研究或存档样本的纵向分析时可能不总是可行 | 旨在理解肿瘤进展过程中细胞类型及其丰度的变化，以及这些变化如何影响转移潜能，从而指导新诊断或治疗的发展 | 乳腺癌转移过程中的细胞类型及其丰度 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 二次规划 | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |