单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2024-08-07 |
Occult polyclonality of preclinical pancreatic cancer models drives in vitro evolution
2022-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31376-3
PMID:35752636
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术揭示了假设为单克隆的胰腺癌（PDAC）细胞系和患者来源的类器官（PDOs）中存在的基因组和转录组多克隆性 | 首次揭示了胰腺癌细胞系和类器官中的多克隆性，并质疑了广泛使用的非转化胰腺细胞系作为实验对照的适用性 | 研究结果对实验数据的严谨性和可重复性产生了影响，但其具体影响尚不确定 | 探索胰腺癌细胞系和类器官的内在异质性 | 胰腺癌细胞系和患者来源的类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和转录组数据 | 多个独立的胰腺癌细胞系和类器官样本 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the genesis and heterogeneity of tumor microenvironment in pancreatic undifferentiated carcinoma with osteoclast-like giant-cells
2022-06-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01596-8
PMID:35733218
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境起源及异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境特征，并揭示了破骨细胞样巨细胞的起源 | 研究样本仅来自四名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境起源及功能 | 胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了来自四名患者的18,376个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
Identification of Functional Heterogeneity of Carcinoma-Associated Fibroblasts with Distinct IL6-Mediated Therapy Resistance in Pancreatic Cancer
2022-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1484
PMID:35348629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、多重免疫染色和多种遗传小鼠模型，识别了胰腺癌中具有不同IL6介导治疗抵抗的癌相关成纤维细胞（CAF）的功能异质性。 | 首次揭示了胰腺癌中癌相关成纤维细胞的不同亚型在治疗反应中的不同作用，并证明了IL6在αSMA+ CAFs中的缺失能增强吉西他滨的疗效，并与抗PD-1免疫治疗协同提高生存率。 | NA | 研究胰腺癌中癌相关成纤维细胞的功能异质性及其在治疗反应中的不同作用。 | 胰腺癌中的癌相关成纤维细胞及其在治疗抵抗中的作用。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫染色 | NA | 基因表达数据，免疫染色数据 | 使用了多种遗传小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
Stromal HIF2 Regulates Immune Suppression in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2022-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.02.024
PMID:35216965
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研究论文 | 本文研究了胰腺癌微环境中基质HIF2对免疫抑制的调控作用 | 首次揭示了HIF2在胰腺癌肿瘤微环境中的作用，并证明了其作为可药物治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨HIF2在胰腺癌免疫抑制中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 逆转录定量实时聚合酶链反应，免疫染色，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21-23只小鼠/组 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-07 |
Practical bioinformatics pipelines for single-cell RNA-seq data analysis
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2022.210041
PMID:37288243
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综述 | 本文概述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的计算分析流程，详细介绍了分析步骤 | 提供了基于最佳实践的指南 | NA | 帮助实验人员分析其数据，并协助用户更新其分析流程 | 单细胞RNA测序数据分析工具的选择和比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics sequencing and its applications in studying the nervous system
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210031
PMID:37288245
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综述 | 本文综述了单细胞多组学测序技术及其在神经系统研究中的应用 | 介绍了从单细胞转录组测序到多组学分析的发展，以及如何通过这些技术提高对神经系统的理解 | NA | 探讨单细胞多组学测序技术在神经系统研究中的应用及未来可能解决的科学问题 | 神经系统 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | 转录组、DNA甲基化组、染色质可及性等 | 从数百个细胞到数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics: new dimension of understanding biological complexity
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210037
PMID:37288247
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术的发展及其在理解生物复杂性中的应用 | 介绍了多种空间解析技术，这些技术提供了新的维度来探究区域基因表达、细胞微环境、解剖异质性和细胞间相互作用 | NA | 加速理解生物复杂性的新发现 | 空间转录组学技术及其在生物学中的应用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open-angle glaucoma
2022-Jun-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100142
PMID:36778138
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研究论文 | 研究通过将原发性开角型青光眼（POAG）患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞（iPSCs），并分化为视网膜类器官，与健康个体的细胞进行比较，评估疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 研究利用大规模iPSC研究揭示了遗传复杂疾病的上下文特异性特征，并通过单细胞RNA测序识别了簇特异性分子特征 | NA | 评估原发性开角型青光眼患者疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 原发性开角型青光眼患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞并分化为视网膜类器官 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共247,520个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162660
PMID:36633318
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研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的特征及其对预后的影响 | 首次综合多个队列数据库，详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值 | NA | 研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及四个基因表达综合系列（GSE）的结直肠癌队列 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Identifies Drug-Resistance Signature and Immunosuppressive Microenvironment in Metastatic Small Cell Lung Cancer (Advanced Genetics 2/03)
2022-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202270021
PMID:36618025
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了转移性小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | NA | 揭示小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
The Tumor Immune Profile of Murine Ovarian Cancer Models: An Essential Tool For Ovarian Cancer Immunotherapy Research
2022-06, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.crc-22-0017
PMID:36311166
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，对六种卵巢肿瘤模型进行了免疫原性分析，以全面表征和比较这些模型系统，反映卵巢癌的多样性。 | 本文首次详细分析了六种卵巢肿瘤模型的免疫特征，包括T细胞和骨髓细胞的浸润情况，以及免疫成分和细胞因子的分布，为卵巢癌免疫治疗研究提供了新的工具。 | 研究仅限于小鼠模型，可能与人类疾病的实际情况存在差异。 | 旨在为卵巢癌免疫治疗研究提供一个全面的模型系统，以测试免疫疗法的效果，探索免疫反应机制，并指导患者治疗方案的选择。 | 六种卵巢肿瘤模型，包括ID8-p53-/-, ID8-C3, STOSE, MOE-PTEN/KRAS等。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 细胞 | 六种卵巢肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
Th1 cytokine endotype discriminates and predicts severe complications in COVID-19
2022-06-01, European cytokine network
IF:2.2Q4
DOI:10.1684/ecn.2022.0477
PMID:36266985
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研究论文 | 本研究通过多重免疫表型分析和单细胞RNA测序，探讨了Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并根据血清细胞因子和全身炎症标志物将COVID-19病例分为四个严重程度递增的集群 | 本研究首次将COVID-19病例根据特定的炎症标志物进行集群分类，并探讨了这些集群与临床结果的关系 | NA | 研究Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并预测严重并发症 | COVID-19患者的Th1和Th2细胞因子/趋化因子及其与细胞介导免疫的关系 | NA | COVID-19 | 多重免疫表型分析，单细胞RNA测序 | NA | 血清细胞因子，全身炎症标志物 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomic analysis identifies Creb5 and CD11b-DCs as regulator of asthma exacerbations
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00556-1
PMID:36038770
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了哮喘加重的免疫调节因子，并确定了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的共同调节作用 | NA | 旨在识别哮喘加重的共同免疫因子，以促进统一靶向治疗的发展 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型，通过单细胞RNA测序分析肺部免疫细胞的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA深度测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型进行实验，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Overview of Transcriptomic Research on Type 2 Diabetes: Challenges and Perspectives
2022-06-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071176
PMID:35885959
|
综述 | 本文综述了使用表达阵列、RNA测序和单细胞测序进行的2型糖尿病转录组研究，并强调了相关的新发现和挑战 | 介绍了RNA测序和单细胞技术在转录组研究中的应用，这些新技术为发现新的生物标志物提供了可能 | 标准遗传方法无法完全解释2型糖尿病的遗传因素 | 探讨转录组分析在发现2型糖尿病及其并发症风险群体中的新生物标志物的作用 | 2型糖尿病及其微血管和大血管并发症 | NA | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Microfluidics Facilitates the Development of Single-Cell RNA Sequencing
2022-Jun-24, Biosensors
DOI:10.3390/bios12070450
PMID:35884253
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展历程及其在微流控技术中的应用 | 微流控技术在scRNA-seq中的应用极大地提高了测序通量 | 未提及具体限制 | 探讨微流控技术在促进scRNA-seq技术发展中的作用及未来方向 | 单细胞RNA测序技术 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Cerebrospinal Fluid as an Advanced Form of Liquid Biopsy for Neurological Disorders
2022-Jun-22, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12070812
PMID:35884620
|
review | 本文综述了利用脑脊液中单细胞RNA测序技术作为液体活检方法，用于中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病的诊断和监测 | 单细胞测序能提供罕见细胞群的新见解，揭示单细胞分辨率下的基因表达异质性，有助于理解疾病病理和治疗 | NA | 探讨单细胞RNA测序在脑脊液中的应用，以提高神经系统疾病的诊断和监测能力 | 中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病患者的脑脊液细胞 | digital pathology | neurological disorder | single-cell RNA sequencing | NA | cell | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Analysis of Melanoma Gene Expression Signatures at the Single-Cell Level Uncovers 45-Gene Signature Related to Prognosis
2022-Jun-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10071478
PMID:35884783
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研究论文 | 本文通过基因表达特征分类和Cox回归分析，在单细胞水平上生物学特征化黑色素瘤细胞，并构建了与黑色素瘤预后相关的基因特征 | 本文首次在单细胞水平上识别出与黑色素瘤预后相关的45基因特征（MPS_45），并验证了其在多个数据集中的预后预测能力 | NA | 建立精确的黑色素瘤预后相关基因特征 | 黑色素瘤细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq, RNA-seq | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤数据集，包括TCGA-SKCM、GSE65904、GSE19234和GSE53118 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
The Dynamic Nature of Human Dermal Fibroblasts Is Defined by Marked Variation in the Gene Expression of Specific Cytoskeletal Markers
2022-Jun-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12070935
PMID:35888024
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术研究人皮肤成纤维细胞的基因表达，并根据其遗传特征分离成纤维细胞亚群 | 首次报道了人皮肤成纤维细胞中特定基因的差异表达，这些基因可能有助于其在体内外的动态变化 | 尚未明确这些亚型成纤维细胞的特性是否能预测其来源或具有功能后果 | 研究人皮肤成纤维细胞的异质性和不同亚群的存在 | 人皮肤成纤维细胞及其亚群的基因表达 | NA | NA | 单细胞转录组学 (10X Genomics) | NA | 基因表达数据 | 成人皮肤样本和新生儿皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution
2022-06-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071109
PMID:35885892
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研究论文 | 本文通过整合甲基化阵列和单细胞RNA测序数据，探索了COVID-19患者在细胞类型水平上的DNA甲基化变异 | 开发了一种分析流程，将大量组织的知识转移到单细胞水平，发现了COVID-19患者全血中甲基化变异的显著细胞类型特异性 | NA | 理解COVID-19患者中由DNA甲基化调节的特定免疫反应细胞类型 | COVID-19患者的DNA甲基化变异 | 数字病理学 | COVID-19 | 甲基化测序 | NA | 甲基化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Neoantigens in precision cancer immunotherapy: from identification to clinical applications
2022-Jun-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002181
PMID:35838545
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综述 | 本文综述了癌症免疫治疗中基于新抗原的疗法，从识别到临床应用的进展 | 新抗原相关疗法在临床实践中的广泛应用，包括新抗原疫苗、新抗原特异性CD8+和CD4+ T细胞以及新抗原脉冲树突状细胞 | 需要不断努力揭示新抗原在抗肿瘤免疫中的全面作用并扩展其临床应用 | 总结新抗原研究的进展，并讨论其在精准癌症免疫治疗中的机遇和挑战 | 新抗原在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | NA | 下一代测序、高通量单细胞测序、质谱分析 | NA | 测序数据、质谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |