单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
The Tumor Immune Profile of Murine Ovarian Cancer Models: An Essential Tool For Ovarian Cancer Immunotherapy Research
2022-06, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.crc-22-0017
PMID:36311166
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，对六种卵巢肿瘤模型进行了免疫原性分析，以全面表征和比较这些模型系统，反映卵巢癌的多样性。 | 本文首次详细分析了六种卵巢肿瘤模型的免疫特征，包括T细胞和骨髓细胞的浸润情况，以及免疫成分和细胞因子的分布，为卵巢癌免疫治疗研究提供了新的工具。 | 研究仅限于小鼠模型，可能与人类疾病的实际情况存在差异。 | 旨在为卵巢癌免疫治疗研究提供一个全面的模型系统，以测试免疫疗法的效果，探索免疫反应机制，并指导患者治疗方案的选择。 | 六种卵巢肿瘤模型，包括ID8-p53-/-, ID8-C3, STOSE, MOE-PTEN/KRAS等。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 细胞 | 六种卵巢肿瘤模型 |
| 82 | 2024-08-08 |
Th1 cytokine endotype discriminates and predicts severe complications in COVID-19
2022-06-01, European cytokine network
IF:2.2Q4
DOI:10.1684/ecn.2022.0477
PMID:36266985
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研究论文 | 本研究通过多重免疫表型分析和单细胞RNA测序，探讨了Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并根据血清细胞因子和全身炎症标志物将COVID-19病例分为四个严重程度递增的集群 | 本研究首次将COVID-19病例根据特定的炎症标志物进行集群分类，并探讨了这些集群与临床结果的关系 | NA | 研究Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并预测严重并发症 | COVID-19患者的Th1和Th2细胞因子/趋化因子及其与细胞介导免疫的关系 | NA | COVID-19 | 多重免疫表型分析，单细胞RNA测序 | NA | 血清细胞因子，全身炎症标志物 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞 |
| 83 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomic analysis identifies Creb5 and CD11b-DCs as regulator of asthma exacerbations
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00556-1
PMID:36038770
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了哮喘加重的免疫调节因子，并确定了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Creb5和CD11b-DCs在哮喘加重中的共同调节作用 | NA | 旨在识别哮喘加重的共同免疫因子，以促进统一靶向治疗的发展 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型，通过单细胞RNA测序分析肺部免疫细胞的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA深度测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组 | 使用尘螨（HDM）小鼠模型进行实验，具体样本数量未详细说明 |
| 84 | 2024-08-08 |
Overview of Transcriptomic Research on Type 2 Diabetes: Challenges and Perspectives
2022-06-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071176
PMID:35885959
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综述 | 本文综述了使用表达阵列、RNA测序和单细胞测序进行的2型糖尿病转录组研究，并强调了相关的新发现和挑战 | 介绍了RNA测序和单细胞技术在转录组研究中的应用，这些新技术为发现新的生物标志物提供了可能 | 标准遗传方法无法完全解释2型糖尿病的遗传因素 | 探讨转录组分析在发现2型糖尿病及其并发症风险群体中的新生物标志物的作用 | 2型糖尿病及其微血管和大血管并发症 | NA | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Microfluidics Facilitates the Development of Single-Cell RNA Sequencing
2022-Jun-24, Biosensors
DOI:10.3390/bios12070450
PMID:35884253
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展历程及其在微流控技术中的应用 | 微流控技术在scRNA-seq中的应用极大地提高了测序通量 | 未提及具体限制 | 探讨微流控技术在促进scRNA-seq技术发展中的作用及未来方向 | 单细胞RNA测序技术 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Cerebrospinal Fluid as an Advanced Form of Liquid Biopsy for Neurological Disorders
2022-Jun-22, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12070812
PMID:35884620
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review | 本文综述了利用脑脊液中单细胞RNA测序技术作为液体活检方法，用于中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病的诊断和监测 | 单细胞测序能提供罕见细胞群的新见解，揭示单细胞分辨率下的基因表达异质性，有助于理解疾病病理和治疗 | NA | 探讨单细胞RNA测序在脑脊液中的应用，以提高神经系统疾病的诊断和监测能力 | 中枢神经系统肿瘤和非肿瘤疾病患者的脑脊液细胞 | digital pathology | neurological disorder | single-cell RNA sequencing | NA | cell | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Analysis of Melanoma Gene Expression Signatures at the Single-Cell Level Uncovers 45-Gene Signature Related to Prognosis
2022-Jun-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10071478
PMID:35884783
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研究论文 | 本文通过基因表达特征分类和Cox回归分析，在单细胞水平上生物学特征化黑色素瘤细胞，并构建了与黑色素瘤预后相关的基因特征 | 本文首次在单细胞水平上识别出与黑色素瘤预后相关的45基因特征（MPS_45），并验证了其在多个数据集中的预后预测能力 | NA | 建立精确的黑色素瘤预后相关基因特征 | 黑色素瘤细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq, RNA-seq | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤数据集，包括TCGA-SKCM、GSE65904、GSE19234和GSE53118 |
| 88 | 2024-08-08 |
The Dynamic Nature of Human Dermal Fibroblasts Is Defined by Marked Variation in the Gene Expression of Specific Cytoskeletal Markers
2022-Jun-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12070935
PMID:35888024
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术研究人皮肤成纤维细胞的基因表达，并根据其遗传特征分离成纤维细胞亚群 | 首次报道了人皮肤成纤维细胞中特定基因的差异表达，这些基因可能有助于其在体内外的动态变化 | 尚未明确这些亚型成纤维细胞的特性是否能预测其来源或具有功能后果 | 研究人皮肤成纤维细胞的异质性和不同亚群的存在 | 人皮肤成纤维细胞及其亚群的基因表达 | NA | NA | 单细胞转录组学 (10X Genomics) | NA | 基因表达数据 | 成人皮肤样本和新生儿皮肤样本 |
| 89 | 2024-08-08 |
Identification of COVID-19-Associated DNA Methylation Variations by Integrating Methylation Array and scRNA-Seq Data at Cell-Type Resolution
2022-06-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13071109
PMID:35885892
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研究论文 | 本文通过整合甲基化阵列和单细胞RNA测序数据，探索了COVID-19患者在细胞类型水平上的DNA甲基化变异 | 开发了一种分析流程，将大量组织的知识转移到单细胞水平，发现了COVID-19患者全血中甲基化变异的显著细胞类型特异性 | NA | 理解COVID-19患者中由DNA甲基化调节的特定免疫反应细胞类型 | COVID-19患者的DNA甲基化变异 | 数字病理学 | COVID-19 | 甲基化测序 | NA | 甲基化数据 | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Neoantigens in precision cancer immunotherapy: from identification to clinical applications
2022-Jun-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002181
PMID:35838545
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综述 | 本文综述了癌症免疫治疗中基于新抗原的疗法，从识别到临床应用的进展 | 新抗原相关疗法在临床实践中的广泛应用，包括新抗原疫苗、新抗原特异性CD8+和CD4+ T细胞以及新抗原脉冲树突状细胞 | 需要不断努力揭示新抗原在抗肿瘤免疫中的全面作用并扩展其临床应用 | 总结新抗原研究的进展，并讨论其在精准癌症免疫治疗中的机遇和挑战 | 新抗原在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | NA | 下一代测序、高通量单细胞测序、质谱分析 | NA | 测序数据、质谱数据 | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of lower mitochondrial complex I expression is associated with cell metastasis of clear cell renal cell carcinoma
2022-Jun, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-242
PMID:35836523
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研究论文 | 本研究分析了线粒体复合物I（CI）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞转移中的作用 | 首次揭示了线粒体复合物I在ccRCC转移中的关键作用，并提出了CI和PPARG作为潜在的转移性ccRCC生物标志物 | NA | 探讨ccRCC转移的机制并开发有效的治疗方法 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的细胞转移机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络 | 基因表达数据 | 使用了GSE73121和TCGA-KIRC数据库中的数据 |
| 92 | 2024-08-08 |
The Role of Microglia in Neuroinflammation of the Spinal Cord after Peripheral Nerve Injury
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132083
PMID:35805167
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综述 | 本文综述了周围神经损伤后脊髓中微胶质细胞在神经炎症中的作用及其激活机制和功能 | 利用单细胞转录组学、新型遗传小鼠模型和活体成像等神经免疫研究技术，深入分析了微胶质细胞激活的机制及其在神经保护、退化、再生、突触可塑性和脊髓回路重组中的功能 | NA | 旨在阐明周围神经损伤后脊髓微胶质细胞与神经元相互作用的多样性，解决相关争议 | 微胶质细胞在脊髓中的激活机制及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Single B Cell Gene Co-Expression Networks Implicated in Prognosis, Proliferation, and Therapeutic Responses in Non-Small Cell Lung Cancer Bulk Tumors
2022-Jun-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133123
PMID:35804895
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研究论文 | 本文通过比较非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤B细胞和正常B细胞的单细胞RNA测序数据，构建了肿瘤特异性B细胞基因共表达网络，并利用CRISPR-Cas9/RNA干扰筛选数据在92多个人类NSCLC上皮细胞系中筛选增殖基因，评估了这些基因的预后和预测价值。 | 本文首次构建了NSCLC肿瘤B细胞的基因共表达网络，并发现了一个九基因标志物，该标志物在NSCLC肿瘤转录组和蛋白质组中提供了准确的预后分层。 | NA | 探索非小细胞肺癌中B细胞功能障碍的机制及其在预后中的重要性，并寻找免疫治疗预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌肿瘤B细胞和正常B细胞的基因共表达网络。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 1313个NSCLC肿瘤转录组样本和103个蛋白质组样本 |
| 94 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Astrocyte and Microglial Heterogeneity in Health and Disease
2022-06-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132021
PMID:35805105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究健康与疾病状态下星形胶质细胞和小胶质细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了星形胶质细胞和小胶质细胞在神经退行性疾病及HIV感染中的异质性 | NA | 旨在理解星形胶质细胞和小胶质细胞在维持神经功能中的异质性，并识别调节其对HIV反应的基因和机制 | 星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在疾病状态下的变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Role of GDF15/MAPK14 Axis in Chondrocyte Senescence as a Novel Senomorphic Agent in Osteoarthritis
2022-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137043
PMID:35806043
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研究论文 | 本文探讨了GDF15/MAPK14轴在软骨细胞衰老中的作用，以及GDF15作为骨关节炎新型抗衰老剂的潜力 | 首次揭示了GDF15在骨关节炎中通过诱导血管生成促进软骨细胞衰老的作用 | NA | 研究GDF15在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 软骨细胞衰老和骨关节炎的进展 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序RNA | NA | 组织和滑膜液样本 | 来自骨关节炎患者的组织和滑膜液样本，C20A4细胞系和HUVEC细胞系 |
| 96 | 2024-08-08 |
Hypothalamic CREB Regulates the Expression of Pomc-Processing Enzyme Pcsk2
2022-06-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131996
PMID:35805082
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研究论文 | 研究探讨了下丘脑CREB对Pomc加工酶Pcsk2表达的调控作用及其在实验性肥胖中的影响 | 首次证明了CREB在实验性肥胖中对下丘脑Pomc内肽酶系统的异常调控作用 | NA | 探究高脂饮食对下丘脑CREB表达及其对黑皮质素系统功能的影响 | 下丘脑Pomc神经元中的CREB及其对Pcsk2表达的调控 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序分析, PCR, 免疫印迹, ELISA和免疫荧光组织学检测 | NA | RNA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Differentiation Trajectory of Limbal Stem and Progenitor Cells under Normal Homeostasis and upon Corneal Wounding
2022-06-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131983
PMID:35805068
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序在小鼠模型中识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群及其分化轨迹 | 本研究首次识别出两种潜在的角膜缘干细胞类型，并揭示了它们在正常稳态和伤口愈合过程中的分化轨迹 | NA | 旨在识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群 | 角膜缘干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 98 | 2024-08-08 |
Comparison of cell state models derived from single-cell RNA sequencing data: graph versus multi-dimensional space
2022-06-10, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022395
PMID:35801475
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研究论文 | 本文比较了两种基于单细胞RNA测序数据的细胞状态模型：图模型和多维空间模型 | 首次对比了图模型和多维空间模型在构建细胞状态转换数学模型中的应用 | 主要集中在图模型和多维空间模型的优缺点比较，未涉及其他可能的模型 | 探讨和比较两种不同的细胞状态几何模型在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据和造血系统 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图模型和多维空间模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 99 | 2024-08-08 |
Telomerase positive CTCs with PSMA high expression associated with prostate cancer metastasis
2022-Jun, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-1140
PMID:35812202
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺特异性膜抗原（PSMA）高表达的循环肿瘤细胞（CTCs）与前列腺癌转移进展的关系 | 采用基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法，并通过基因本体（GO）功能分类和富集分析，证实了PSMA高表达组中增殖相关术语的富集 | NA | 旨在提供证据阐明PSMA高表达的CTCs与前列腺癌转移进展的关系 | 前列腺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法 | NA | 单细胞测序数据 | 共71名患者，分为局部前列腺癌组（44名）和转移性前列腺癌组（27名） |
| 100 | 2024-08-08 |
Integration and Reanalysis of Four RNA-Seq Datasets Including BALF, Nasopharyngeal Swabs, Lung Biopsy, and Mouse Models Reveals Common Immune Features of COVID-19
2022-Jun, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2022.22.e22
PMID:35799708
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研究论文 | 本研究重新分析了四个COVID-19的RNA测序数据集，包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠，揭示了COVID-19的共同免疫特征。 | 使用统一的标准化方法重新分析多个RNA测序数据集，揭示了COVID-19的共同免疫特征，与单细胞RNA测序研究结果一致。 | NA | 理解COVID-19的发病机制，并开发更好的治疗策略。 | COVID-19患者的免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠的四个数据集 |