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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-30 |
Intrinsic entropy model for feature selection of scRNA-seq data
2022-06-08, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac008
PMID:35102420
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研究论文 | 本文提出了一种基于内在熵模型的特征选择方法，用于提高scRNA-seq数据聚类分析的准确性 | 通过推导熵分解公式，提出了一种新的特征选择方法——内在熵（IE）模型，用于识别信息丰富的基因 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的特征基因选择 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 内在熵（IE）模型 | scRNA-seq数据 | 模拟数据集和真实单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-30 |
Alveolar Basal Cells Differentiate towards Secretory Epithelial- and Aberrant Basaloid-like Cells In Vitro
2022-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11111820
PMID:35681516
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析体外培养的肺泡基底细胞在不同培养条件下的转录组特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了肺泡基底细胞在不同培养条件下的转录组变化 | NA | 探究特发性肺纤维化中肺泡基底细胞的分化过程及其转录组特征 | 肺泡基底细胞及其在不同培养条件下的转录组 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自外周纤维化肺组织的肺泡基底细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-30 |
Bronchial epithelium epithelial-mesenchymal plasticity forms aberrant basaloid-like cells in vitro
2022-06-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00254.2021
PMID:35438006
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研究论文 | 本研究探讨了上皮-间质转化（EMT）在支气管上皮细胞中形成异常基底样细胞的作用，并通过批量和单细胞RNA测序分析了EMT诱导的转录变化。 | 本研究首次揭示了支气管上皮细胞在体外通过EMT形成异常基底样细胞的转录变化，并提供了单细胞RNA-Seq数据的交互式浏览器。 | 研究未发现EMT诱导后细胞向成纤维细胞/肌成纤维细胞转化的证据，且仅显示部分EMT基因特征。 | 阐明EMT在支气管上皮细胞中形成异常基底样细胞的作用。 | 人支气管上皮细胞在不同培养条件下的转录变化。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序 | NA | RNA | 8,247个蛋白质编码基因和1,621个长非编码RNA基因在不同培养条件下的差异表达，以及6,020个蛋白质编码基因和907个长非编码RNA基因在EMT诱导后的转录重编程。 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-30 |
Astrocytes and oligodendrocytes undergo subtype-specific transcriptional changes in Alzheimer's disease
2022-06-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.03.008
PMID:35381189
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研究论文 | 本研究使用单核RNA测序技术（snRNA-seq）分析了阿尔茨海默病（AD）患者和非症状对照组大脑中星形胶质细胞和少突胶质细胞的转录组变化 | 本研究首次利用snRNA-seq技术详细描述了AD患者中星形胶质细胞和少突胶质细胞的亚型特异性转录组变化，并结合空间转录组学资源，揭示了健康和炎症大脑中星形胶质细胞亚型的定位 | 研究主要集中在星形胶质细胞和少突胶质细胞的转录组分析，未涉及其他类型细胞的贡献 | 深入理解阿尔茨海默病中胶质细胞的转录组异质性 | 阿尔茨海默病患者的星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | APOE Ɛ2/3人类AD患者和年龄及基因型匹配的非症状（NS）大脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-30 |
Male-Specific Activation of Lysine Demethylases 5B and 5C Mediates Alcohol-Induced Liver Injury and Hepatocyte Dedifferentiation
2022-06, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1895
PMID:35084807
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研究论文 | 本研究探讨了酒精相关肝病（ALD）中性别特异性的生物学途径，特别是在雄性小鼠中酒精诱导的肝细胞去分化和肿瘤发展。 | 发现了酒精在雄性小鼠中通过激活KDM5B和KDM5C去甲基酶促进肝细胞去分化和肿瘤发展的新机制。 | 研究主要集中在雄性小鼠，对雌性小鼠的影响未深入探讨。 | 定义酒精暴露下肝脏的性别特异性途径。 | 雄性和雌性小鼠的肝脏细胞。 | NA | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq） | NA | RNA序列数据 | 雄性和雌性小鼠的肝脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-05 |
Hermansky-Pudlak syndrome type 1 causes impaired anti-microbial immunity and inflammation due to dysregulated immunometabolism
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00572-1
PMID:36302964
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研究论文 | 本研究探讨了Hermansky-Pudlak综合症1型中免疫代谢失调对抗微生物免疫和炎症的影响 | 揭示了HPS1缺乏如何通过Rab32介导的mTOR信号通路改变代谢程序，并影响抗微生物反应 | 该研究的细胞机制和临床显著性仍需进一步验证 | 理解Hermansky-Pudlak综合症1型中炎症的细胞基础 | 研究HPS-1患者的外周血细胞和血清 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 大规模细胞测定、蛋白组学和转录组学分析 | NA | 血液样本、组织样本 | HPS-1患者的外周血细胞和血清样本 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-05 |
Genetic loss of function of Ptbp1 does not induce glia-to-neuron conversion in retina
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110849
PMID:35705053
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研究论文 | 这篇文章探讨了Ptbp1的遗传功能缺失是否会导致视网膜胶质细胞转化为神经元 | 揭示了Ptbp1的缺失不能有效诱导视网膜Mϋller胶质细胞转化为功能性神经元 | 仅在特定的基因突变体中研究了Ptbp1的功能，可能无法推广到其他细胞类型 | 研究Ptbp1在视网膜胶质细胞转化为神经元中的角色 | 成年视网膜Mϋller胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年视网膜Mϋller胶质细胞的突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-05 |
Fibroblast Heterogeneity in Healthy and Wounded Skin
2022-Jun-06, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041238
PMID:35667795
|
研究论文 | 本文讨论了健康和受伤皮肤中的成纤维细胞异质性。 | 利用单细胞测序技术，揭示了小鼠和人类皮肤中成纤维细胞的不同亚群体，并比较了其转录组特征。 | 未提及具体的局限性 | 研究成纤维细胞异质性对生理愈合及其在病理状态下的影响。 | 小鼠和人类的成纤维细胞。 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 使用了多种细胞群体，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing of zebrafish hair cells reveals novel genes potentially involved in hearing loss
2022-Jun-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04410-2
PMID:35753015
|
研究论文 | 本研究分析了斑马鱼毛细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了与听力损失相关的潜在新基因 | 首次在斑马鱼中系统分析不同类型毛细胞的分子特征，发现与听力损失相关的新基因 | 对毛细胞的分子特征的系统分析仍然不足，可能未涵盖所有相关基因 | 研究斑马鱼毛细胞的基因特征及其与听力损失的关系 | 斑马鱼的不同类型毛细胞，包括毛细胞亚型 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用来自Tg(Brn3c:mGFP)幼鱼的GFP+细胞进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-05 |
Immune landscape of a genetically engineered murine model of glioma compared with human glioma
2022-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148990
PMID:35653194
|
研究论文 | 本研究比较了基因工程小鼠模型与人类胶质瘤的免疫微环境 | 本研究利用Qk/Trp53/Pten三重敲除小鼠模型，探讨了胶质瘤的免疫微环境与人类胶质瘤的比较 | 该研究主要集中在小鼠模型中，可能不能完全代表人类疾病的复杂性 | 阐明胶质瘤的肿瘤生理病理及对治疗药物的前临床评估 | 研究对象包括QPP小鼠和患者来源的胶质瘤肿瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | QPP三重敲除模型 | 免疫谱分析 | 包括QPP小鼠以及人类胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-05 |
Localization of T cell clonotypes using the Visium spatial transcriptomics platform
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101391
PMID:35707680
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用Visium空间转录组平台定位T细胞克隆的新协议 | 该方法允许在组织切片中同时定位基因表达和T细胞克隆类型 | NA | 研究人类T细胞库的空间组织 | T细胞受体克隆和其在肿瘤微环境中的定位 | 数字病理 | NA | 空间转录组 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-05 |
Mouse splenocyte enrichment strategies via negative selection for broadened single-cell transcriptomics
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101402
PMID:35600930
|
研究论文 | 本研究提出了一种通过负选择策略富集小鼠脾细胞的协议 | 该方法通过免疫磁性负去ple增强了稀有免疫细胞群体，为单细胞转录组学提供了更广阔的细胞景观 | 文章中未提及研究的具体局限性 | 研究的目的是开发一种高效的脾细胞富集策略以提高下游分析的准确性 | 研究对象为小鼠脾脏的免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 免疫磁性负去ple | NA | 单细胞转录组数据 | 使用了小鼠的脾脏细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-05 |
Comprehensive characterization of tumor immune landscape following oncolytic virotherapy by single-cell RNA sequencing
2022-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03084-2
PMID:34716463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面描述了肿瘤免疫微环境在肿瘤溶瘤病毒治疗后的变化 | 首次全面分析了溶瘤病毒治疗引起的癌症中免疫变化 | 缺乏对长期治疗效果和不同类型肿瘤的研究 | 探究溶瘤病毒治疗如何改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成 | 分析了使用HSV-2基础的溶瘤病毒处理的癌瘤中的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 处理过和未处理的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
Fetal vs adult megakaryopoiesis
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009301
PMID:35108353
|
研究论文 | 本文探讨了胎儿与成人巨核细胞生成的差异，并指出这些差异反映了发育过程中增殖、多倍体化和细胞质成熟之间的独特解耦 | 研究挑战了传统的巨核细胞起源范式，并利用单细胞RNA测序技术更好地描述了胚胎、胎儿和成人巨核细胞的特征 | NA | 研究胎儿与成人巨核细胞生成的差异及其分子机制 | 胎儿和成人巨核细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02373-2021
PMID:35604813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Targeting macrophages for enhancing CD47 blockade-elicited lymphoma clearance and overcoming tumor-induced immunosuppression
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021013901
PMID:35134139
|
研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现紫杉醇能增强巨噬细胞对非霍奇金淋巴瘤的吞噬能力，从而提高CD47阻断疗法的疗效 | 首次发现紫杉醇能直接增强巨噬细胞的吞噬能力，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制 | 研究主要基于实验模型，尚未在临床试验中验证 | 探索通过调节肿瘤微环境增强淋巴瘤治疗效果的新策略 | 非霍奇金淋巴瘤及其相关巨噬细胞 | 肿瘤学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-07 |
Don't you forget about me(gakaryocytes)
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009302
PMID:34582554
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综述 | 本文综述了巨核细胞（MKs）在骨髓中的复杂分化过程及其在血小板生成和骨髓稳态中的多重功能 | 文章提出了巨核细胞不仅作为血小板前体，还可能通过细胞膜出芽和在远端器官如肺或肝脏中产生血小板，并参与骨髓稳态的维持 | NA | 探讨巨核细胞在体外和体内形成血小板前体的机制，并批判性地讨论巨核细胞作为免疫调节细胞的假设 | 巨核细胞及其在血小板生成和骨髓稳态中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自成人和胎儿骨髓及肺的巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Graphing cell relations in spatial transcriptomics
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00269-2
PMID:38177581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-07 |
Cell clustering for spatial transcriptomics data with graph neural networks
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00266-5
PMID:38177586
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络的无监督细胞聚类方法，用于空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型发现 | 利用空间转录组学和图神经网络，有效整合了基因表达信息和空间信息，提高了细胞聚类和细胞亚型发现的准确性 | NA | 改进基于空间转录组数据的细胞聚类和细胞亚型发现 | 空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | 五个体外和体内的空间数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
scPreGAN, a deep generative model for predicting the response of single-cell expression to perturbation
2022-06-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac357
PMID:35639705
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPreGAN的深度生成模型，用于预测单细胞表达对外部扰动的响应 | scPreGAN结合了自编码器和生成对抗网络，能够提取未扰动数据和扰动数据的共同信息，并预测扰动数据，实验表明其预测性能优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测单细胞表达对外部扰动响应的深度生成模型 | 单细胞表达数据及其对外部扰动的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 单细胞表达数据 | 三个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |