单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Phosphodiesterase type 5 inhibitors enhance chemotherapy in preclinical models of esophageal adenocarcinoma by targeting cancer-associated fibroblasts
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100541
PMID:35732148
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研究论文 | 研究通过靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）的肿瘤促进功能，使用磷酸二酯酶5型抑制剂（PDE5i）增强食管腺癌（EAC）的化疗效果 | 首次证明PDE5i可以防止正常成纤维细胞向CAF的转变，并消除已建立的EAC CAF的肿瘤促进功能，从而增强标准化疗的疗效 | NA | 研究如何通过靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞来增强食管腺癌的化疗效果 | 食管腺癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 磷酸二酯酶5型抑制剂（PDE5i） | NA | 蛋白质组学和单细胞RNA测序数据 | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02373-2021
PMID:35604813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Targeting macrophages for enhancing CD47 blockade-elicited lymphoma clearance and overcoming tumor-induced immunosuppression
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021013901
PMID:35134139
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现紫杉醇能增强巨噬细胞对非霍奇金淋巴瘤的吞噬能力，从而提高CD47阻断疗法的疗效 | 首次发现紫杉醇能直接增强巨噬细胞的吞噬能力，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制 | 研究主要基于实验模型，尚未在临床试验中验证 | 探索通过调节肿瘤微环境增强淋巴瘤治疗效果的新策略 | 非霍奇金淋巴瘤及其相关巨噬细胞 | 肿瘤学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 64 | 2024-08-07 |
Processing single-cell RNA-seq datasets using SingCellaR
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101266
PMID:35391938
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研究论文 | 本文提供了一个全面的分析协议，使用SingCellaR工具在R语言环境中处理多个单细胞RNA测序数据集 | 介绍了使用SingCellaR工具进行单细胞转录组分析的新方法 | NA | 开发和验证一个用于处理和分析单细胞RNA测序数据集的计算平台 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集 |
| 65 | 2024-08-07 |
In vivo labeling reveals continuous trafficking of TCF-1+ T cells between tumor and lymphoid tissue
2022-06-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210749
PMID:35472220
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研究论文 | 本文通过光转换技术研究肿瘤免疫细胞的动态迁移，揭示了TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织之间的持续循环 | 首次使用光转换技术结合单细胞转录组学和流式细胞术，揭示了CD8 T细胞在肿瘤内的快速耗竭过程及其在肿瘤和淋巴组织间的动态循环 | NA | 提高免疫检查点疗法的疗效，深入理解免疫细胞在肿瘤中的招募和维持机制 | TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织间的迁移及其动态变化 | 免疫学 | NA | 光转换技术，单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Don't you forget about me(gakaryocytes)
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009302
PMID:34582554
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综述 | 本文综述了巨核细胞（MKs）在骨髓中的复杂分化过程及其在血小板生成和骨髓稳态中的多重功能 | 文章提出了巨核细胞不仅作为血小板前体，还可能通过细胞膜出芽和在远端器官如肺或肝脏中产生血小板，并参与骨髓稳态的维持 | NA | 探讨巨核细胞在体外和体内形成血小板前体的机制，并批判性地讨论巨核细胞作为免疫调节细胞的假设 | 巨核细胞及其在血小板生成和骨髓稳态中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自成人和胎儿骨髓及肺的巨核细胞 |
| 67 | 2024-08-07 |
Graphing cell relations in spatial transcriptomics
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00269-2
PMID:38177581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Cell clustering for spatial transcriptomics data with graph neural networks
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00266-5
PMID:38177586
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络的无监督细胞聚类方法，用于空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型发现 | 利用空间转录组学和图神经网络，有效整合了基因表达信息和空间信息，提高了细胞聚类和细胞亚型发现的准确性 | NA | 改进基于空间转录组数据的细胞聚类和细胞亚型发现 | 空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | 五个体外和体内的空间数据集 |
| 69 | 2024-08-07 |
scPreGAN, a deep generative model for predicting the response of single-cell expression to perturbation
2022-06-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac357
PMID:35639705
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPreGAN的深度生成模型，用于预测单细胞表达对外部扰动的响应 | scPreGAN结合了自编码器和生成对抗网络，能够提取未扰动数据和扰动数据的共同信息，并预测扰动数据，实验表明其预测性能优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测单细胞表达对外部扰动响应的深度生成模型 | 单细胞表达数据及其对外部扰动的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 单细胞表达数据 | 三个真实数据集 |
| 70 | 2024-08-07 |
Occult polyclonality of preclinical pancreatic cancer models drives in vitro evolution
2022-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31376-3
PMID:35752636
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术揭示了假设为单克隆的胰腺癌（PDAC）细胞系和患者来源的类器官（PDOs）中存在的基因组和转录组多克隆性 | 首次揭示了胰腺癌细胞系和类器官中的多克隆性，并质疑了广泛使用的非转化胰腺细胞系作为实验对照的适用性 | 研究结果对实验数据的严谨性和可重复性产生了影响，但其具体影响尚不确定 | 探索胰腺癌细胞系和类器官的内在异质性 | 胰腺癌细胞系和患者来源的类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和转录组数据 | 多个独立的胰腺癌细胞系和类器官样本 |
| 71 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the genesis and heterogeneity of tumor microenvironment in pancreatic undifferentiated carcinoma with osteoclast-like giant-cells
2022-06-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01596-8
PMID:35733218
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境起源及异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境特征，并揭示了破骨细胞样巨细胞的起源 | 研究样本仅来自四名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞的肿瘤微环境起源及功能 | 胰腺未分化癌伴破骨细胞样巨细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了来自四名患者的18,376个细胞 |
| 72 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术研究了肺内皮细胞在炎症刺激下的动态变化和再生亚群 | 首次揭示了肺微血管内皮细胞中存在免疫反应和血管发育两种不同功能的亚群，并发现Sox17过表达可防止内皮细胞的炎症激活 | NA | 研究肺内皮细胞在炎症刺激下的响应机制及其再生能力 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞样本 |
| 73 | 2024-08-07 |
Identification of Functional Heterogeneity of Carcinoma-Associated Fibroblasts with Distinct IL6-Mediated Therapy Resistance in Pancreatic Cancer
2022-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1484
PMID:35348629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、多重免疫染色和多种遗传小鼠模型，识别了胰腺癌中具有不同IL6介导治疗抵抗的癌相关成纤维细胞（CAF）的功能异质性。 | 首次揭示了胰腺癌中癌相关成纤维细胞的不同亚型在治疗反应中的不同作用，并证明了IL6在αSMA+ CAFs中的缺失能增强吉西他滨的疗效，并与抗PD-1免疫治疗协同提高生存率。 | NA | 研究胰腺癌中癌相关成纤维细胞的功能异质性及其在治疗反应中的不同作用。 | 胰腺癌中的癌相关成纤维细胞及其在治疗抵抗中的作用。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫染色 | NA | 基因表达数据，免疫染色数据 | 使用了多种遗传小鼠模型进行研究 |
| 74 | 2024-08-07 |
Stromal HIF2 Regulates Immune Suppression in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2022-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.02.024
PMID:35216965
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研究论文 | 本文研究了胰腺癌微环境中基质HIF2对免疫抑制的调控作用 | 首次揭示了HIF2在胰腺癌肿瘤微环境中的作用，并证明了其作为可药物治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨HIF2在胰腺癌免疫抑制中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 逆转录定量实时聚合酶链反应，免疫染色，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21-23只小鼠/组 |
| 75 | 2024-08-07 |
Practical bioinformatics pipelines for single-cell RNA-seq data analysis
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2022.210041
PMID:37288243
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综述 | 本文概述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的计算分析流程，详细介绍了分析步骤 | 提供了基于最佳实践的指南 | NA | 帮助实验人员分析其数据，并协助用户更新其分析流程 | 单细胞RNA测序数据分析工具的选择和比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics sequencing and its applications in studying the nervous system
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210031
PMID:37288245
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综述 | 本文综述了单细胞多组学测序技术及其在神经系统研究中的应用 | 介绍了从单细胞转录组测序到多组学分析的发展，以及如何通过这些技术提高对神经系统的理解 | NA | 探讨单细胞多组学测序技术在神经系统研究中的应用及未来可能解决的科学问题 | 神经系统 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | 转录组、DNA甲基化组、染色质可及性等 | 从数百个细胞到数万个细胞 |
| 77 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics: new dimension of understanding biological complexity
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210037
PMID:37288247
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术的发展及其在理解生物复杂性中的应用 | 介绍了多种空间解析技术，这些技术提供了新的维度来探究区域基因表达、细胞微环境、解剖异质性和细胞间相互作用 | NA | 加速理解生物复杂性的新发现 | 空间转录组学技术及其在生物学中的应用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open-angle glaucoma
2022-Jun-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100142
PMID:36778138
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研究论文 | 研究通过将原发性开角型青光眼（POAG）患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞（iPSCs），并分化为视网膜类器官，与健康个体的细胞进行比较，评估疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 研究利用大规模iPSC研究揭示了遗传复杂疾病的上下文特异性特征，并通过单细胞RNA测序识别了簇特异性分子特征 | NA | 评估原发性开角型青光眼患者疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 原发性开角型青光眼患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞并分化为视网膜类器官 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共247,520个细胞 |
| 79 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162660
PMID:36633318
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研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的特征及其对预后的影响 | 首次综合多个队列数据库，详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值 | NA | 研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及四个基因表达综合系列（GSE）的结直肠癌队列 |
| 80 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Identifies Drug-Resistance Signature and Immunosuppressive Microenvironment in Metastatic Small Cell Lung Cancer (Advanced Genetics 2/03)
2022-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202270021
PMID:36618025
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了转移性小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | NA | 揭示小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |