单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 261 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Embryonic vascular establishment requires protein C receptor-expressing endothelial progenitors
2022-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200419
PMID:35587592
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研究论文 | 本研究确定了蛋白C受体（Procr）作为内皮祖细胞的标记物，并探讨了Procr+祖细胞在胚胎血管发育中的作用 | 本研究揭示了Procr表达比先前认知的更早（胚胎第7.5天），并通过单细胞RNA测序分析确定了Procr+细胞在内皮细胞分化和成熟起始阶段的位置 | NA | 阐明内皮祖细胞的分子身份及其在胚胎血管建立中的作用 | 蛋白C受体（Procr）表达的内皮祖细胞及其在胚胎血管发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 整个胚胎的Procr+细胞 |
| 202 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity and intratumoral crosstalk in human endometrial cancer
2022-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13249
PMID:35560676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类子宫内膜癌的异质性和肿瘤内相互作用 | 发现了恶性细胞与免疫细胞及血管相关成纤维细胞的密切相互作用，为治疗提供了潜在靶点 | NA | 探索子宫内膜癌进展的机制并开发新的治疗策略 | 子宫内膜癌及其正常组织样本 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个子宫内膜癌样本和2个正常子宫内膜样本 |
| 203 | 2024-08-08 |
Single Cell Multiomic Approaches to Disentangle T Cell Heterogeneity
2022-06, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2022.04.008
PMID:35577000
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综述 | 本文综述了单细胞多组学领域的快速发展，介绍了常用的单细胞分析方法流程及其优势和潜在局限性 | 单细胞多组学技术的发展和专用计算工具的准确性提高，使得能够基于基因表达模式区分看似相同的细胞 | 分析步骤中可能引入的分析偏差和数据解释的潜在不准确性 | 探讨单细胞多组学分析方法及其在T细胞受体重建中的应用 | 单细胞分析方法流程、生物信息学工具及其在T细胞受体重建中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 204 | 2024-08-08 |
Benchmarking spatial and single-cell transcriptomics integration methods
2022-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01481-8
PMID:35577955
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Benchmarking spatial and single-cell transcriptomics integration methods for transcript distribution prediction and cell type deconvolution
2022-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01480-9
PMID:35577954
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研究论文 | 本文通过比较分析16种整合方法，评估了它们在预测空间转录组数据中未检测到的转录本分布和进行细胞类型反卷积的表现 | 首次独立研究比较了多种空间转录组与单细胞RNA测序数据整合方法的性能 | NA | 评估和比较空间转录组与单细胞RNA测序数据整合方法的性能 | 16种整合方法在预测转录本空间分布和细胞类型反卷积中的表现 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 45对配对数据集和32个模拟数据集 |
| 206 | 2024-08-08 |
Hoxb5 reprogrammes murine multipotent blood progenitors into haematopoietic stem cell-like cells
2022-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13235
PMID:35582777
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Hoxb5在多能血液祖细胞中的表达效果 | 发现Hoxb5能在多能血液祖细胞中诱导产生一种新的细胞类型，具有长期多系造血重建能力 | NA | 研究Hoxb5在多能血液祖细胞中的表达效果及其对造血干细胞样细胞生成的影响 | 多能血液祖细胞及Hoxb5的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用Mx1cre/RosaLSL-Hoxb5-EGFP/+小鼠模型进行实验 |
| 207 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of the Mongolia sheep testis reveals a conserved and divergent transcriptome landscape of mammalian spermatogenesis
2022-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200152R
PMID:35583907
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了蒙古绵羊、人类、食蟹猴和小鼠在精子发生过程中同源基因的保守性、差异及其生物学功能 | 研究揭示了蒙古绵羊与人类在精子发生过程中的基因表达保守性，并提供了新的分子调控机制信息 | NA | 探索蒙古绵羊精子发生的分子调控机制，并为建立大型哺乳动物男性不育疾病模型提供基础 | 蒙古绵羊、人类、食蟹猴和小鼠的精子发生过程 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及蒙古绵羊、人类、食蟹猴和小鼠的多个样本 |
| 208 | 2024-08-08 |
Serine Protease Inhibitors Restrict Host Susceptibility to SARS-CoV-2 Infections
2022-06-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00892-22
PMID:35532162
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research paper | 本研究使用基于多个人类供体来源的肺细胞3D模型，通过转录组学方法发现较低易感性的供体显示出丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPINA1、SERPINE1和SERPINE2的高表达水平，这些蛋白酶抑制剂通过抑制细胞丝氨酸蛋白酶TMPRSS2来阻止病毒刺突蛋白的切割和TMPRSS2介导的病毒进入靶细胞，从而限制宿主对SARS-CoV-2感染的易感性。 | 本研究首次确定了丝氨酸蛋白酶抑制剂作为限制宿主对SARS-CoV-2感染易感性的因素，并揭示了其抗病毒机制。 | 研究主要基于体外肺细胞模型，尚未在临床上验证丝氨酸蛋白酶抑制剂的治疗效果。 | 旨在识别影响个体对SARS-CoV-2易感性的宿主因子，并探索其作为抗病毒药物开发的潜在靶点。 | 研究对象为人类肺细胞模型中的丝氨酸蛋白酶抑制剂及其对SARS-CoV-2感染的影响。 | NA | COVID-19 | 转录组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个供体来源的肺细胞 |
| 209 | 2024-08-08 |
Kidney Organoids Are Capable of Forming Tumors, but Not Teratomas
2022-06-22, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac009
PMID:35524742
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研究论文 | 研究iPSC衍生的肾脏类器官在免疫缺陷小鼠模型中的长期安全性和稳定性，以及其肿瘤形成能力 | 发现肾脏类器官在长期植入后具有形成肿瘤的能力，并揭示了与未分化iPSCs相关的独特甲基化基因簇 | 未检测到导致肿瘤细胞在肾脏类器官中出现的遗传变化 | 研究肾脏类器官的长期安全性和稳定性，以及其恶性转化的潜力 | iPSC衍生的肾脏类器官及其在免疫缺陷小鼠模型中的肿瘤形成能力 | 再生医学 | 肾脏疾病 | 基因表达分析，单细胞测序，免疫组化 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据，组织学数据 | 103个植入的肾脏类器官 |
| 210 | 2024-08-08 |
Genomic sequences and RNA-binding proteins predict RNA splicing efficiency in various single-cell contexts
2022-06-13, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac321
PMID:35552604
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研究论文 | 本文通过利用最新的RNA速度工具，评估了多种单细胞RNA-Seq数据集中的相对剪接效率，并发现大量基因组特征和120种RNA结合蛋白特征对跨多个组织和器官的相对RNA剪接效率具有高度预测性 | 本文首次展示了基因组特征和RNA结合蛋白特征对跨多个组织和器官的相对RNA剪接效率的高度预测性 | NA | 旨在理解基因表达的调控机制和估计单细胞中的RNA速度 | RNA剪接效率及其在不同单细胞环境中的基因组调控和随机性 | 基因组学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因组特征和RNA结合蛋白特征 | 多种单细胞RNA-Seq数据集 |
| 211 | 2024-08-08 |
Developmental landscape of human forebrain at a single-cell level identifies early waves of oligodendrogenesis
2022-06-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.016
PMID:35523173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC-seq技术，揭示了人类前脑在胚胎发育早期的少突胶质细胞生成过程 | 首次在人类前脑中发现并证实了早在胚胎发育第8周就出现的少突胶质细胞谱系细胞的第一波生成 | NA | 探究人类前脑在胚胎发育早期的少突胶质细胞生成过程及其调控机制 | 人类前脑的神经多样性和少突胶质细胞生成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq, 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及胚胎发育第8至10周的人类前脑样本 |
| 212 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional profiling of human carotid plaques reveals a subpopulation of endothelial cells associated with stroke incidences
2022-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17354
PMID:35527426
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了有症状和无症状患者颈动脉斑块中的细胞异质性，并揭示了与中风发生相关的内皮细胞亚群 | 首次揭示了有症状和无症状颈动脉斑块中内皮细胞的异质性，并发现了与斑块稳定性和出血相关的特定基因AOC3 | NA | 揭示不同颈动脉斑块中的细胞异质性及其与中风发生的关系 | 有症状和无症状患者的颈动脉斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 有症状和无症状患者的颈动脉斑块样本 |
| 213 | 2024-08-08 |
A downsampling method enables robust clustering and integration of single-cell transcriptome data
2022-06, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2022.104093
PMID:35537690
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研究论文 | 本文提出了一种基于最小无偏代表点（MURP）的模型驱动下采样算法，用于增强单细胞转录组数据的聚类和整合 | MURP算法通过减少基因水平的随机独立误差并保留生物学来源的协方差结构，提供了一种无偏的细胞群体表示 | NA | 调整单细胞RNA测序数据中的随机噪声、采样偏差和批次效应，以增强下游分析的鲁棒性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | MURP | 转录组数据 | NA |
| 214 | 2024-08-08 |
Isolation of macrophages from mouse skin wounds for single-cell RNA sequencing
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101337
PMID:35496783
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研究论文 | 本文描述了一种从皮肤伤口中分离免疫细胞并进行单细胞RNA测序的方法 | 使用改进的Smart-seq2协议提高了速度和准确性 | NA | 理解组织修复中巨噬细胞的异质性 | 皮肤伤口中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 215 | 2024-08-08 |
miR-6077 promotes cisplatin/pemetrexed resistance in lung adenocarcinoma via CDKN1A/cell cycle arrest and KEAP1/ferroptosis pathways
2022-Jun-14, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.03.020
PMID:35505963
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9筛选技术，发现miR-6077通过调控CDKN1A/细胞周期阻滞和KEAP1/铁死亡途径，促进肺癌腺癌对顺铂/培美曲塞的耐药性 | 首次揭示miR-6077在肺癌腺癌中通过调控CDKN1A和KEAP1途径影响顺铂/培美曲塞的耐药性，为克服临床化疗耐药提供新策略 | NA | 探讨miR-6077在肺癌腺癌中对顺铂/培美曲塞耐药性的作用机制 | 肺癌腺癌细胞及其对顺铂/培美曲塞的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR-Cas9筛选, RNA测序, 单细胞测序 | NA | RNA | 细胞系和患者来源的异种移植模型 |
| 216 | 2024-08-08 |
FXR/ASS1 axis attenuates the TAA-induced liver injury through arginine metabolism
2022-06-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.04.073
PMID:35477090
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研究论文 | 本研究探讨了FXR/ASS1轴通过调节精氨酸代谢减轻TAA诱导的肝损伤的机制 | 首次揭示了FXR通过上调ASS1表达促进精氨酸合成，从而减轻TAA诱导的肝损伤 | NA | 阐明FXR/ASS1轴在TAA诱导的肝损伤中的保护作用及其机制 | FXR、ASS1及精氨酸代谢在TAA诱导的肝损伤中的作用 | NA | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 217 | 2024-08-08 |
Dysregulated ligand-receptor interactions from single-cell transcriptomics
2022-06-13, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac294
PMID:35482476
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研究论文 | 本文开发了一种名为scLR的统计方法，用于检测两种条件下失调的配体-受体相互作用，通过建模配体和受体表达产物的分布，考虑样本间变异和小样本量问题。 | scLR方法同时考虑配体和受体的表达，从多个单细胞转录组数据中识别跨条件失调的相互作用。 | NA | 研究细胞间通讯中的配体-受体相互作用，特别是在不同生物条件下的失调情况。 | 单细胞转录组数据中的配体-受体相互作用。 | 生物信息学 | COVID-19感染、肺纤维化 | 单细胞转录组学 | 统计模型 | 转录组数据 | 小样本量 |
| 218 | 2024-08-08 |
Imputing dropouts for single-cell RNA sequencing based on multi-objective optimization
2022-06-13, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac300
PMID:35485740
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研究论文 | 本文开发了一种基于多目标优化的单细胞RNA测序数据丢弃值填补方法 | 该方法假设数据结合了三种潜在结构，并通过多目标优化学习这些结构的组合权重和潜在结构，从而进行丢弃值的填补 | NA | 解决单细胞RNA测序中的丢弃值问题 | 单细胞RNA测序数据中的丢弃值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多目标优化 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 219 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq of human esophageal epithelium in homeostasis and allergic inflammation
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159093
PMID:35472002
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类食管上皮细胞在稳态和过敏性炎症状态下的基因表达变化 | 揭示了过敏性炎症中食管上皮细胞分化程序的阻断，以及与该阻断相关的转录因子失调和细胞间通讯改变 | NA | 探究食管上皮细胞在过敏性炎症中的动态变化，为理解食管健康和疾病提供框架 | 人类食管上皮细胞 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 220 | 2024-08-08 |
New insights into tuft cell formation: Implications for structure-function relationships
2022-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2022.102082
PMID:35468541
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研究论文 | 本文总结了关于簇细胞发育和功能在不同疾病状态和器官系统中的最新研究 | 利用单细胞转录组学和计算生物学的新进展，深入探讨了簇细胞形成和成熟的遗传和环境因素 | NA | 探讨簇细胞的形成及其在结构-功能关系中的作用 | 簇细胞的形成和功能 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |