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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-18 |
A stromal Integrated Stress Response activates perivascular cancer-associated fibroblasts to drive angiogenesis and tumour progression
2022-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00918-8
PMID:35654839
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠中的ATF4,发现基质细胞中整合应激反应通过激活血管周围癌症相关成纤维细胞,促进血管生成和肿瘤进展 | 首次揭示基质ATF4作为关键驱动因子,调控癌症相关成纤维细胞功能、恶性进展和转移,并阐明其通过调控胶原合成和氨基酸代谢的机制 | 摘要未提及具体局限性 | 探究宿主基质细胞中ATF4在肿瘤血管生成和进展中的作用及机制 | 小鼠模型中的黑色素瘤和胰腺肿瘤,以及人黑色素瘤和胰腺肿瘤样本 | 癌症生物学 | 黑色素瘤, 胰腺癌 | 条件性基因敲除, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-08-04 |
Epigenetic and Transcriptomic Programming of HSC Quiescence Signaling in Large for Gestational Age Neonates
2022-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137323
PMID:35806330
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表观基因组学、单细胞转录组学和体外分析,探究大于胎龄新生儿造血干细胞静息信号的表观遗传和转录组编程 | 采用多模态单细胞(表观)基因组学方法,首次将DNA甲基化变化与HSPC功能改变相关联,并揭示表观遗传编程影响HSC静息能力 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究大于胎龄新生儿HSPC中DNA甲基化改变的功能影响,特别是HSC静息信号的改变 | 大于胎龄新生儿的造血干细胞和祖细胞(HSPC),尤其是造血干细胞(HSC) | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学 | 大于胎龄(过度胎儿生长) | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学、体外分析 | NA | 单细胞表观基因组数据、单细胞转录组数据 | NA(摘要未明确样本数量) | NA | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-08-02 |
Occult polyclonality of preclinical pancreatic cancer models drives in vitro evolution
2022-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31376-3
PMID:35752636
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研究论文 | 本研究应用单细胞测序技术揭示临床前胰腺癌模型中潜在的克隆异质性,并探讨其对实验可重复性的影响 | 首次通过单细胞测序技术系统揭示假定单克隆的胰腺癌细胞系和患者来源类器官中存在基因组和转录组多克隆性,并揭露实验室间培养差异及2D到3D转换引起的转录组变化 | 研究结果对已建立的临床前模型在不同实验室间实验数据的严谨性和可重复性影响存在不确定性,且未明确干预措施 | 探讨临床前胰腺癌模型中潜在的克隆异质性及其对实验有效性和可重复性的影响 | 胰腺癌细胞系和患者来源类器官 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 全外显子测序、单细胞拷贝数变异测序、单细胞核染色质开放性测序、荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 多种胰腺癌细胞系和患者来源类器官,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞拷贝数变异测序、单细胞核染色质开放性测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-26 |
Novel bi-allelic variants in KASH5 are associated with meiotic arrest and non-obstructive azoospermia
2022-06-30, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaac021
PMID:35674372
|
研究论文 | 本研究在非梗阻性无精子症患者中鉴定出KASH5基因的新型双等位变异,证实其与减数分裂阻滞和男性不育相关 | 首次在人类细胞中评估KASH5蛋白表达,并揭示LINC复合物在人类和小鼠中的保守调控机制 | 功能验证主要依赖小鼠模型,人类样本数量有限,具体分子机制尚需进一步研究 | 探究KASH5基因变异与非梗阻性无精子症和减数分裂阻滞的关联 | 非梗阻性无精子症患者及其不孕姐妹 | 机器学习 | 男性不育症 | 全外显子组测序、CNV芯片、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据、单细胞转录组数据 | 1例先证者及其姐妹,以及Kash5基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-04-30 |
Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154334
PMID:35349491
|
研究论文 | 该研究通过I期临床试验,评估了供者来源的记忆样自然杀伤细胞在单倍体相合造血干细胞移植后复发患者中的扩增、持久性和疗效 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术在纵向时间点对输入体内的记忆样NK细胞亚群进行高分辨率特征分析,揭示了其在免疫相容环境中的快速扩增和长期持续能力 | 初始仅纳入6例患者,样本量较小,且未详细阐述记忆样NK细胞与T细胞和肿瘤靶标的相互作用机制 | 评估供者来源的细胞因子诱导的记忆样NK细胞治疗异基因造血干细胞移植后髓系肿瘤复发的安全性和有效性 | 接受单倍体相合造血干细胞移植后复发的髓系肿瘤患者 | 数字病理学 | 髓系肿瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫表型数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在小鼠模型中通过单细胞转录组学系统描绘了GBM进展全过程中免疫细胞组成的大规模纵向变化,并发现与临床样本的低级别胶质瘤和GBM中相似的微胶质细胞和巨噬细胞关系 | 未明确提及局限性 | 研究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态演变及标准治疗的影响 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者活检样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者低级别胶质瘤和GBM活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-23 |
Molecular Characterization of Membranous Nephropathy
2022-06, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021060784
PMID:35477557
|
研究论文 | 本研究通过机器学习框架分析膜性肾病(MN)患者肾组织基因表达,识别其分子特征并揭示与足细胞相关的病理机制 | 首次结合机器学习、跨队列基因差异分析和单细胞测序数据,系统鉴定MN的独特分子特征,并发现其与转录因子NF-κB靶点及足细胞基因表达上调的关联 | 研究依赖于现有队列数据,未涉及MN亚型或治疗反应的分子分层,且样本来源可能受限于特定人群 | 揭示膜性肾病的分子通路和病理机制,为疾病分类和靶向治疗提供依据 | 膜性肾病患者的肾组织样本 | 机器学习 | 膜性肾病 | 基因表达分析、单细胞测序 | 机器学习框架 | 基因表达数据 | 来自NEPTUNE和ERCB队列的参与者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-22 |
Single-cell transcriptome and accessible chromatin dynamics during endocrine pancreas development
2022-06-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2201267119
PMID:35733248
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和染色质可及性分析,揭示了小鼠胰腺内分泌细胞分化过程中的基因调控网络 | 首次结合单细胞转录组学、染色质可及性分析和遗传标记技术,在单细胞分辨率下解析胰腺内分泌细胞谱系分化的转录因子网络,并提出Neurog3可能作为先驱转录因子的新见解 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;单细胞分析可能受技术噪音影响;未深入探讨其他胰腺细胞类型 | 解析胰腺内分泌细胞发育过程中的基因调控网络和谱系分化机制 | 小鼠胰腺内分泌细胞(包括β细胞、α细胞和δ细胞) | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、遗传标记、流式细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠胰腺内分泌细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-06 |
Fetal vs adult megakaryopoiesis
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009301
PMID:35108353
|
综述 | 本文综述了胎儿与成人巨核细胞生成的差异,探讨其分子机制、发育调控及临床意义 | 挑战传统观念,提出胎儿和新生儿巨核细胞生成具有发育独特的增殖、多倍体化和细胞质成熟解耦特征,而非“不成熟”,并强调单细胞RNA测序技术对巨核细胞亚群功能分化的新见解 | NA | 比较胎儿与成人巨核细胞生成的生物学差异,并探讨其分子机制和临床相关性 | 胎儿、新生儿和成人的巨核细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-02 |
Altered patterning of trisomy 21 interneuron progenitors
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.001
PMID:35623352
|
研究论文 | 本研究通过分析唐氏综合征(21三体)患者的大脑皮层及利用诱导多能干细胞模型,揭示了21三体导致中间神经元前体细胞模式改变及数量减少的机制 | 首次结合成人脑组织立体学分析与21三体诱导多能干细胞模型,发现COUP-TFII+前体细胞减少与WNT信号通路异常在唐氏综合征皮层中间神经元发育缺陷中的关键作用 | 研究主要基于体外干细胞模型,体内验证尚不充分;WNT信号激活仅部分恢复表型,提示存在其他调控机制 | 探究唐氏综合征大脑神经元减少及智力障碍的发育机制 | 唐氏综合征患者大脑皮层组织、21三体人类诱导多能干细胞及其同基因对照 | 发育神经生物学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序、立体学分析、干细胞分化 | 人类诱导多能干细胞分化模型 | 基因表达数据、细胞计数数据 | 未明确样本数量,使用成人DS皮层组织及多株iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-02-03 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,探索了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的遗传调控机制及其与免疫疾病风险变异的关联 | 首次在单细胞水平上系统性地绘制了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控图谱,并揭示了免疫疾病风险变异如何调控激活过程中的基因表达变化 | 研究仅针对健康个体,未直接验证疾病状态下的调控机制;样本量相对有限(119人),可能影响罕见变异的检测 | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化,以解释免疫疾病的遗传易感性机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-11-13 |
Profiling of lung SARS-CoV-2 and influenza virus infection dissects virus-specific host responses and gene signatures
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01881-2021
PMID:34675048
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研究论文 | 通过空间转录组学分析比较SARS-CoV-2和流感病毒感染的肺部宿主反应差异 | 首次使用空间转录组学技术揭示SARS-CoV-2在肺部非均匀分布特征及其与干扰素反应的关联 | 样本量有限,主要基于尸检组织样本 | 解析SARS-CoV-2和流感病毒特异性宿主反应及基因特征 | COVID-19患者、H1N1流感患者和未感染对照者的肺部组织 | 空间转录组学 | COVID-19, 流感 | 靶向转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | COVID-19患者、流感患者和未感染对照的肺部组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMX平台 | NanoString GeoMX数字空间分析平台用于FFPE组织 |
| 14 | 2025-10-06 |
New insights into tuft cell formation: Implications for structure-function relationships
2022-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2022.102082
PMID:35468541
|
综述 | 总结簇细胞形成与功能的最新研究进展,重点关注不同疾病状态和器官系统中的发育机制 | 利用单细胞转录组学和计算生物学方法揭示簇细胞形成与成熟的遗传和环境调控机制 | NA | 探讨簇细胞的发育过程及其在不同器官系统中的功能作用 | 簇细胞(哨兵化学感应细胞) | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序识别肺内皮细胞在炎症损伤过程中的动态炎症和再生亚群 | 首次在肺微血管内皮中发现具有明确功能分工的免疫反应亚群(immuneEC)和血管发育亚群(devEC),并证实Sox17过表达可抑制内皮细胞炎症激活 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型,在其他类型肺损伤中的普适性需进一步验证 | 探究肺内皮细胞亚群在炎症损伤过程中的动态变化和功能分工 | 肺血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段,当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Phosphodiesterase type 5 inhibitors enhance chemotherapy in preclinical models of esophageal adenocarcinoma by targeting cancer-associated fibroblasts
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100541
PMID:35732148
|
研究论文 | 本研究证明磷酸二酯酶5抑制剂通过靶向癌症相关成纤维细胞增强食管腺癌化疗效果 | 首次发现PDE5抑制剂可通过靶向CAFs逆转食管腺癌的化疗耐药性 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 探索克服食管腺癌化疗耐药性的新策略 | 食管腺癌及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 癌症研究 | 食管腺癌 | shotgun蛋白质组学,单细胞RNA测序 | PDX模型 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Processing single-cell RNA-seq datasets using SingCellaR
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101266
PMID:35391938
|
研究论文 | 介绍使用SingCellaR R软件包分析单细胞RNA测序数据的综合分析流程 | 提供针对多数据集分析的统一解决方案,结合定制化流程和现有工具 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的标准化分析流程 | 人造血干细胞和祖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
In vivo labeling reveals continuous trafficking of TCF-1+ T cells between tumor and lymphoid tissue
2022-06-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210749
PMID:35472220
|
研究论文 | 通过光转换技术研究TCF-1+ T细胞在肿瘤与淋巴组织间的持续迁移过程 | 首次利用肿瘤免疫细胞区室光转换技术实时追踪淋巴细胞进出肿瘤的动态过程 | 研究主要关注CD8 T细胞,未涉及其他免疫细胞类型 | 了解免疫细胞在肿瘤中的招募和维持机制 | TCF-1+ CD8 T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学,流式细胞术,光转换技术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Mapping the developing human immune system across organs
2022-06-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo0510
PMID:35549310
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研究论文 | 通过整合九种胎儿组织的单细胞测序数据,重建了人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 首次系统描绘人类发育免疫系统作为跨组织分布网络的全景图谱,揭示了髓系和淋巴系细胞亚群效应功能的晚期获得机制 | 研究局限于胎儿发育阶段,未涵盖出生后免疫系统发育过程 | 重建人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 人类九种胎儿组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗原受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 九种人类胎儿组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |