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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-13 |
Profiling of lung SARS-CoV-2 and influenza virus infection dissects virus-specific host responses and gene signatures
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01881-2021
PMID:34675048
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研究论文 | 通过空间转录组学分析比较SARS-CoV-2和流感病毒感染的肺部宿主反应差异 | 首次使用空间转录组学技术揭示SARS-CoV-2在肺部非均匀分布特征及其与干扰素反应的关联 | 样本量有限,主要基于尸检组织样本 | 解析SARS-CoV-2和流感病毒特异性宿主反应及基因特征 | COVID-19患者、H1N1流感患者和未感染对照者的肺部组织 | 空间转录组学 | COVID-19, 流感 | 靶向转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | COVID-19患者、流感患者和未感染对照的肺部组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMX平台 | NanoString GeoMX数字空间分析平台用于FFPE组织 |
| 2 | 2025-10-06 |
New insights into tuft cell formation: Implications for structure-function relationships
2022-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2022.102082
PMID:35468541
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综述 | 总结簇细胞形成与功能的最新研究进展,重点关注不同疾病状态和器官系统中的发育机制 | 利用单细胞转录组学和计算生物学方法揭示簇细胞形成与成熟的遗传和环境调控机制 | NA | 探讨簇细胞的发育过程及其在不同器官系统中的功能作用 | 簇细胞(哨兵化学感应细胞) | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序识别肺内皮细胞在炎症损伤过程中的动态炎症和再生亚群 | 首次在肺微血管内皮中发现具有明确功能分工的免疫反应亚群(immuneEC)和血管发育亚群(devEC),并证实Sox17过表达可抑制内皮细胞炎症激活 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型,在其他类型肺损伤中的普适性需进一步验证 | 探究肺内皮细胞亚群在炎症损伤过程中的动态变化和功能分工 | 肺血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段,当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Epigenetic and Transcriptomic Programming of HSC Quiescence Signaling in Large for Gestational Age Neonates
2022-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137323
PMID:35806330
|
研究论文 | 通过整合单细胞表观基因组学、转录组学和体外分析,研究胎儿过度生长对造血干细胞静息信号的表观遗传编程影响 | 首次采用多模态单细胞(表观)基因组学方法揭示人类胎儿过度生长通过表观遗传编程影响造血干细胞静息信号机制 | 功能影响的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究DNA甲基化改变与造血干细胞功能改变的功能性联系 | 大于胎龄儿造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 胎儿生长异常 | 单细胞表观基因组学,单细胞转录组学,体外功能分析 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞表观基因组学,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome and accessible chromatin dynamics during endocrine pancreas development
2022-06-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2201267119
PMID:35733248
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析小鼠胰腺内分泌细胞分化过程,揭示转录因子调控网络 | 首次在单细胞水平同时分析转录组和染色质可及性动态,发现Neurog3可能作为先驱转录因子调控胰腺内分泌谱系 | 研究仅针对小鼠模型,人类胰腺发育可能存在差异 | 解析胰腺内分泌细胞发育过程中的基因调控网络 | 小鼠胰腺内分泌细胞(β细胞、α细胞、δ细胞) | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测定, 流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA-seq数据, ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Phosphodiesterase type 5 inhibitors enhance chemotherapy in preclinical models of esophageal adenocarcinoma by targeting cancer-associated fibroblasts
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100541
PMID:35732148
|
研究论文 | 本研究证明磷酸二酯酶5抑制剂通过靶向癌症相关成纤维细胞增强食管腺癌化疗效果 | 首次发现PDE5抑制剂可通过靶向CAFs逆转食管腺癌的化疗耐药性 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 探索克服食管腺癌化疗耐药性的新策略 | 食管腺癌及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 癌症研究 | 食管腺癌 | shotgun蛋白质组学,单细胞RNA测序 | PDX模型 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Processing single-cell RNA-seq datasets using SingCellaR
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101266
PMID:35391938
|
研究论文 | 介绍使用SingCellaR R软件包分析单细胞RNA测序数据的综合分析流程 | 提供针对多数据集分析的统一解决方案,结合定制化流程和现有工具 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的标准化分析流程 | 人造血干细胞和祖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
In vivo labeling reveals continuous trafficking of TCF-1+ T cells between tumor and lymphoid tissue
2022-06-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210749
PMID:35472220
|
研究论文 | 通过光转换技术研究TCF-1+ T细胞在肿瘤与淋巴组织间的持续迁移过程 | 首次利用肿瘤免疫细胞区室光转换技术实时追踪淋巴细胞进出肿瘤的动态过程 | 研究主要关注CD8 T细胞,未涉及其他免疫细胞类型 | 了解免疫细胞在肿瘤中的招募和维持机制 | TCF-1+ CD8 T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学,流式细胞术,光转换技术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Mapping the developing human immune system across organs
2022-06-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo0510
PMID:35549310
|
研究论文 | 通过整合九种胎儿组织的单细胞测序数据,重建了人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 首次系统描绘人类发育免疫系统作为跨组织分布网络的全景图谱,揭示了髓系和淋巴系细胞亚群效应功能的晚期获得机制 | 研究局限于胎儿发育阶段,未涵盖出生后免疫系统发育过程 | 重建人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 人类九种胎儿组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗原受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 九种人类胎儿组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Molecularly defined circuits for cardiovascular and cardiopulmonary control
2022-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04760-8
PMID:35650438
|
研究论文 | 通过分子和功能分析揭示小鼠心脏副交感神经控制回路的两个平行亚型 | 首次在分子层面识别出两种功能不同的脑干神经元亚型(ACV和ACP),分别对应独立的心脏控制回路和心肺协调回路 | 研究仅在小鼠模型中进行,人类系统中是否存在类似回路尚待验证 | 解析心脏副交感神经控制回路的分子和功能多样性 | 小鼠脑干疑核(Amb)中的心脏支配神经元 | 神经科学 | 心血管疾病 | 逆行神经元追踪, 单细胞RNA测序, 光遗传学, 生理学实验 | NA | 基因表达数据, 生理信号数据 | 每侧疑核约50个神经元(ACV约35个,ACP约15个) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化及其与免疫疾病遗传风险的关联 | 首次在单细胞水平系统描绘CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控,发现35%的eQTL基因在激活过程中呈现动态调控,并揭示免疫疾病风险变异显著富集于这些动态调控基因 | 研究仅针对健康个体,未直接验证在疾病状态下的调控机制;样本量相对有限(119人) | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化及其与免疫疾病的关联机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞转录组测序 | eQTL分析 | 单细胞RNA测序数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Transitional Anal Cells Mediate Colonic Re-epithelialization in Colitis
2022-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.02.031
PMID:35227778
|
研究论文 | 本研究揭示了肛门过渡区细胞在结肠炎中介导结肠上皮再生的新机制 | 首次发现肛门过渡区细胞能够迁移至结肠损伤区域并建立永久性鳞状新上皮结构 | 研究主要基于小鼠模型,人类IBD中的验证仍需进一步研究 | 探究邻近器官上皮细胞是否参与急性结肠炎的上皮再生过程 | 转基因小鼠的结肠炎模型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组测序, 3D成像, 谱系追踪, 生物物理建模 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Efficacy and limitations of senolysis in atherosclerosis
2022-06-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab208
PMID:34142149
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老标志物在动脉粥样硬化中的特异性以及遗传和药物性衰老细胞清除(senolysis)对疾病的影响 | 揭示了传统衰老标志物p16在动脉粥样硬化中的局限性,并首次比较了遗传性和药物性衰老细胞清除策略的不同效果 | 传统衰老标志物缺乏特异性,药物性衰老细胞清除可能引起非特异性效应如单核细胞和血小板减少 | 评估衰老细胞清除在动脉粥样硬化治疗中的疗效和局限性 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)、小鼠动脉粥样硬化模型、人类VSMCs培养细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、谱系追踪、细胞培养 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 人类和小鼠VSMCs细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
|
研究论文 | 本研究探讨肝细胞癌肿瘤微环境如何通过细胞因子梯度调控先天淋巴细胞的组成和可塑性 | 首次在肝细胞癌中系统揭示肿瘤微环境通过细胞因子梯度调控ILC亚群转化和功能可塑性 | 样本量相对有限,未在更多癌种中验证发现的特异性 | 研究肿瘤微环境对先天淋巴细胞在肝细胞癌中的调控机制 | 48例肝细胞癌患者的肿瘤组织、癌旁组织和边缘组织 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序,AbSeq | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,批量RNA测序数据 | 48例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies the interaction of altered renal tubules with basophils orchestrating kidney fibrosis
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01200-7
PMID:35552540
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示了肾脏纤维化中改变肾小管与嗜碱性粒细胞的相互作用机制 | 首次发现促纤维化肾小管通过分泌CXCL1招募CXCR2阳性嗜碱性粒细胞,并证实这些细胞是IL-6和Th17细胞招募的重要来源 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究肾脏纤维化过程中的免疫调控机制 | 小鼠肾脏纤维化模型和人类肾脏纤维化患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序,免疫染色,基因表达分析 | NA | 单细胞基因表达数据,bulk RNA-seq数据,免疫组织化学数据 | 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
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研究论文 | 本研究揭示了严重COVID-19患者CD4+ T细胞功能失调与TNF-α/TNFR1信号通路的依赖性关系 | 首次证明严重COVID-19中CD4+ T细胞功能失调依赖于TNF-α/TNFR1通路,且TNF-α阻断能挽救T细胞功能 | 研究样本量有限,需要更大规模研究验证TNF-α阻断治疗的临床效益 | 探究严重COVID-19患者T细胞功能失调的免疫机制 | 148名严重COVID-19患者及轻度康复患者的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 148名严重COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Chemotherapy Coupled to Macrophage Inhibition Induces T-cell and B-cell Infiltration and Durable Regression in Triple-Negative Breast Cancer
2022-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3714
PMID:35442423
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研究论文 | 本研究开发了一种联合低剂量环磷酰胺与巨噬细胞抑制剂的治疗方案,在三阴性乳腺癌临床前模型中诱导T细胞和B细胞浸润并实现持久肿瘤消退 | 首次将化疗与巨噬细胞抑制相结合,在三阴性乳腺癌模型中诱导形成三级淋巴结构并实现长期肿瘤消退 | 研究基于临床前小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 开发针对三阴性乳腺癌的有效免疫联合治疗方案 | 三阴性乳腺癌小鼠模型及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,高维成像技术 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 多个高度侵袭性三阴性乳腺癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-07 |
Internal oligo(dT) priming introduces systematic bias in bulk and single-cell RNA sequencing count data
2022-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac035
PMID:35651651
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研究论文 | 本研究揭示了oligo(dT)引物在RNA测序中引起的系统性偏差,并开发了计算方法来识别和消除这种偏差 | 首次系统性地描述了内部oligo(dT)引物在bulk和单细胞RNA测序中的偏差问题,并开发了专门的算法来解决这一问题 | 研究主要基于公共数据集分析,缺乏实验验证;对基因表达量化的具体影响程度仍需进一步确认 | 评估oligo(dT)引物在RNA测序中对基因表达量化的系统性偏差影响 | 多种bulk和单细胞RNA测序平台产生的公共数据集 | 转录组学 | NA | RNA测序 | 计算算法 | RNA测序数据 | 多个公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |