单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 245 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the Comma-1D cell line as a unique model for mammary gland development and breast cancer
2022-05-15, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.259329
PMID:35502723
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究，揭示了Comma-1D细胞系在乳腺发育和乳腺癌研究中的独特模型作用 | 发现Comma-1D细胞系包含具有腔上皮和基底上皮特征的主要细胞群，以及具有混合谱系和双潜能特征的较小细胞群 | 研究主要基于细胞系模型，可能与体内情况存在差异 | 研究乳腺上皮细胞异质性的发展及其对肿瘤发生的影响 | Comma-1D细胞系及其在乳腺发育和乳腺癌研究中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个Comma-1D细胞群 |
| 142 | 2024-08-08 |
Simplified, Shear Induced Generation of Double Emulsions for Robust Compartmentalization during Single Genome Analysis
2022-May-11, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c22692
PMID:35502700
|
研究论文 | 本文展示了双乳液滴（DE）在单基因分析中通过防止内容混合来解决单乳液滴（SE）的不稳定性问题 | 开发了一种简单的一层双乳液滴制造装置，兼容简单的表面处理，使得双乳液滴设备的制造更加容易，促进了其更广泛的应用 | NA | 解决单乳液滴在分析过程中的不稳定性问题，提高多步骤反应在液滴中的可行性 | 双乳液滴的稳定性和其在单基因分析中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
scSemiAE: a deep model with semi-supervised learning for single-cell transcriptomics
2022-May-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04703-0
PMID:35513780
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scSemiAE的半监督降维方法，基于自编码器模型，用于单细胞转录组学数据分析 | scSemiAE方法利用带有细胞亚群标签的数据集信息，指导寻找更好的低维表示，从而简化进一步分析 | NA | 开发一种半监督学习方法，用于单细胞RNA测序数据的降维和细胞亚群识别 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器（Autoencoder） | 转录组数据 | 五个公共数据集 |
| 144 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA sequencing of cultured human endometrial CD140b+CD146+ perivascular cells highlights the importance of in vivo microenvironment
2022-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02872-6
PMID:35513860
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Dual functions of microRNA-17 in maintaining cartilage homeostasis and protection against osteoarthritis
2022-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30119-8
PMID:35508470
|
研究论文 | 本文研究了微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的双重功能 | 首次报道了微RNA-17在骨关节炎中的保护作用及其通过靶向病理分解代谢因子来预防骨关节炎的机制 | NA | 探讨微RNA-17在维持软骨稳态和预防骨关节炎中的作用 | 微RNA-17在骨关节炎中的表达及其对软骨细胞的影响 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及透明软骨中的两种不同表层软骨细胞群体（C1/C2） |
| 146 | 2024-08-08 |
Author Correction: scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2022-May-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30331-6
PMID:35508488
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Single-cell N6-methyladenosine regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to colorectal cancer progression and immunotherapy
2022-05-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03395-7
PMID:35509079
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了N6-甲基腺苷（m6A）RNA甲基化调节因子在肿瘤微环境（TME）中的作用，以及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 首次揭示了m6A甲基化介导的肿瘤微环境细胞间通信在调控肿瘤生长和抗肿瘤免疫调节过程中的作用 | NA | 探究m6A RNA甲基化在肿瘤微环境中的功能及其对结直肠癌进展和免疫治疗的影响 | 结直肠癌肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 65,362个单细胞来自33个结直肠癌肿瘤样本 |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Distinct Immune Landscape of Myeloid Cells in Coronary Culprit Plaques Causing Acute Coronary Syndrome
2022-05-03, Circulation
IF:35.5Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal a unique memory-like NK cell subset that accumulates with ageing and correlates with disease severity in COVID-19
2022-05-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01049-3
PMID:35501841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了一种独特的记忆样NK细胞亚群，该亚群随年龄积累，并与COVID-19疾病严重程度相关 | 发现了一种独特的记忆样NK细胞亚群（NK2.1），该亚群在老年人群中积累，具有促炎特性，并表现出I型干扰素反应状态 | NA | 研究年龄对人类NK细胞的影响，特别是在单细胞水平上，并探讨其在COVID-19疾病中的作用 | 人类淋巴细胞和NK细胞，以及COVID-19患者和健康个体的NK细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总共124名年轻和老年健康捐赠者，以及56名年轻和老年COVID-19患者 |
| 150 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the immune heterogeneity and the repopulation of microglia by Hif1α in mice after spinal cord injury
2022-05-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04864-z
PMID:35504882
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓损伤后免疫细胞的异质性和微胶质细胞的再生过程 | 首次展示了脊髓损伤后微胶质细胞的再生来源及其调控因子Hif1α的作用 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞的再生机制及其对功能恢复的影响 | 小鼠脊髓损伤后的免疫细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后的早期和晚期阶段的免疫细胞 |
| 151 | 2024-08-08 |
High-throughput single-сell sequencing in cancer research
2022-05-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00990-4
PMID:35504878
|
综述 | 本文综述了高通量单细胞测序技术在肿瘤细胞演化、肿瘤免疫学和肿瘤免疫治疗领域的临床应用 | 介绍了单细胞测序在评估肿瘤进展、环境扰动响应、肿瘤微环境异质性和细胞间相互作用中的应用 | 讨论了单细胞分析在癌症研究中的局限性 | 总结单细胞测序在肿瘤研究中的临床应用，并分析肿瘤细胞对治疗的响应和免疫检查点免疫治疗的响应或抵抗 | 肿瘤细胞、基质细胞和浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 大量细胞 |
| 152 | 2024-08-08 |
Ferroptosis-related local immune cytolytic activity in tumor microenvironment of basal cell and squamous cell carcinoma
2022-05-02, Aging
DOI:10.18632/aging.204057
PMID:35501667
|
研究论文 | 本研究系统分析了铁死亡相关基因（FRGs）及其在基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC）中的局部免疫细胞溶解活性（LICA）和肿瘤微环境（TME）代谢功能差异 | 首次详细揭示了铁死亡在BCC和SCC中的作用，并提出了基于FRGs的NQO1稳态模型 | 仅基于两个bulk RNA-seq数据集和一个单细胞RNA-seq数据集进行分析，可能需要更多数据支持 | 提高对BCC和SCC肿瘤进展及治疗效果差异的理解，寻找潜在的治疗靶点 | 基底细胞癌（BCC）和鳞状细胞癌（SCC） | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个bulk RNA-seq数据集（GSE7553和GSE125285）和一个单细胞RNA-seq数据集（GSE123813） |
| 153 | 2024-08-08 |
Expression-based species deconvolution and realignment removes misalignment error in multispecies single-cell data
2022-May-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04676-0
PMID:35501695
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的生物信息学流程，用于处理多物种单细胞数据中的错配错误，通过基于表达的物种反卷积和重对齐来最小化错误 | 开发了一种新的生物信息学流程，用于处理人和鼠混合单细胞分析中的错配错误和外显子多重映射事件 | NA | 评估错配错误和外显子多重映射事件的影响，并开发新的算法来最小化这些错误 | 人和鼠混合单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 包含乳腺癌异种移植组织的多种物种多样本单细胞文库 |
| 154 | 2024-08-08 |
The macrophage-associated microRNA-4715-3p / Gasdermin D axis potentially indicates fibrosis progression in nonalcoholic fatty liver disease: evidence from transcriptome and biological data
2022-05, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2072602
PMID:35521691
|
研究论文 | 本研究旨在探索非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中可能指示或介导的新因子，通过使用多个批量和单细胞RNA测序数据集，明确了细胞群体的景观，并发现了NAFLD进展过程中显著高浸润的巨噬细胞（MPs）。 | 本研究通过蛋白质-蛋白质相互作用分析和验证，确定了八个作为有前景目标的枢纽基因，并预测了微小RNA（miR）-蛋白质相互作用，验证了在游离脂肪酸（FFA）诱导的巨噬细胞损伤模型中的作用。 | NA | 探索非酒精性脂肪肝病进展中可能指示或介导的新因子 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及相关分子 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个批量和单细胞RNA测序数据集 |
| 155 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of the aging mouse colon
2022-May-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104202
PMID:35479413
|
研究论文 | 本文通过大规模单细胞测序技术研究了衰老小鼠结肠上皮细胞和免疫细胞的变化 | 发现了新的特定区域标记物以及与衰老相关的细胞组成和信号通路变化，如从吸收性向分泌性上皮细胞的转变，幼稚淋巴细胞的耗竭以及eIF2信号的诱导 | NA | 探究衰老过程中结肠特定区域的变化及其影响 | 衰老小鼠的结肠上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 大量小鼠结肠上皮细胞和免疫细胞 |
| 156 | 2024-08-08 |
Epigenetics of alcohol-related liver diseases
2022-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2022.100466
PMID:35462859
|
综述 | 本文综述了酒精相关性肝病（ARLD）中酒精诱导的表观遗传改变的当前知识，包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA变化、3D染色质结构和增强子-启动子相互作用等 | 利用下一代测序、DNA甲基化分析、组蛋白修饰分析和机器学习等创新技术，对ARLD的病理生理学有了重大理解 | NA | 总结酒精相关性肝病中的表观遗传改变，并探讨其在诊断和管理中的临床应用 | 酒精相关性肝病中的表观遗传变化及其临床应用 | 表观遗传学 | 肝病 | 下一代测序、DNA甲基化分析、组蛋白修饰分析、单细胞测序 | 机器学习 | DNA、RNA、染色质结构 | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Novel spike-ins for single-cell sequencing enable ground-truth RNA counting
2022-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01456-9
PMID:35468968
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Molecular spikes: a gold standard for single-cell RNA counting
2022-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01446-x
PMID:35468967
|
研究论文 | 本文介绍了分子尖峰（molecular spikes），一种用于单细胞RNA计数的RNA spike-ins，其中包含内置的唯一分子标识符（UMIs），用于识别单细胞RNA测序（scRNA-seq）中准确RNA计数的关键实验和计算条件 | 首次引入分子尖峰作为评估单细胞RNA计数性能的实验策略，并开发了相应的R包UMIcountR，以改进新方法的验证和细胞mRNA量的估计与调整 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序中的RNA计数准确性 | 单细胞RNA测序中的RNA计数性能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment restores liver macrophages homeostasis to alleviate mouse acute liver injury revealed by single-cell analysis
2022-05, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106229
PMID:35470065
|
研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示间充质干细胞治疗恢复肝脏巨噬细胞稳态以缓解小鼠急性肝损伤 | 本文利用单细胞RNA测序技术精确区分巨噬细胞群体，并揭示间充质干细胞的免疫调节机制 | NA | 研究间充质干细胞治疗急性肝损伤的机制 | 小鼠急性肝损伤及间充质干细胞的治疗效果 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠 |
| 160 | 2024-08-08 |
β-Hydroxybutyrate suppresses colorectal cancer
2022-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04649-6
PMID:35477756
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠模型中进行饮食筛选，发现酮体β-羟基丁酸（BHB）通过表面受体Hcar2和转录调节因子Hopx抑制结直肠癌的生长 | 首次揭示了BHB通过特定信号通路抑制结直肠癌的机制，并提供了新的预防和治疗策略 | NA | 探索新的结直肠癌预防和治疗策略 | 结直肠癌及其相关代谢物β-羟基丁酸的作用机制 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |