单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 245 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Conservation and divergence of myelin proteome and oligodendrocyte transcriptome profiles between humans and mice
2022-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77019
PMID:35543322
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研究论文 | 本文通过定量蛋白质组学分析人类和鼠类髓鞘的蛋白质组成，发现结构髓鞘蛋白的相对丰度在人类和C57Bl/6N鼠之间高度相关，但也存在一些特异性的蛋白质表达差异 | 首次系统比较了人类和鼠类髓鞘蛋白质组和少突胶质细胞转录组谱的相似性与差异性 | NA | 探讨人类和鼠类髓鞘蛋白质组成和少突胶质细胞转录组谱的相似性与差异性 | 人类和鼠类的髓鞘蛋白质和少突胶质细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 人类和C57Bl/6N鼠的髓鞘样本 |
| 122 | 2024-08-08 |
Decoding the pathogenesis of Diamond-Blackfan anemia using single-cell RNA-seq
2022-May-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00389-z
PMID:35534476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自不同治疗组（未治疗、糖皮质激素响应和非响应）的Diamond-Blackfan贫血（DBA）患者的纯化红系前体细胞的转录组 | 首次将红系前体细胞的固有较短细胞周期与DBA发病机制联系起来，并证明了干扰素介导的细胞周期控制在糖皮质激素临床疗效中的作用 | NA | 探索Diamond-Blackfan贫血的发病机制及潜在治疗策略 | DBA患者的红系前体细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同治疗组的DBA患者骨髓中的红系前体细胞 |
| 123 | 2024-08-08 |
Robust and scalable barcoding for massively parallel long-read sequencing
2022-05-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-11656-0
PMID:35538127
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研究论文 | 本文介绍了使用NS-watermark条形码技术在ONT MinION平台上对两种远缘物种的扩增子进行标记和同时测序的方法 | 首次报道了基于微阵列的合成作为大型寡核苷酸池来源用于条形码技术，并实现了迄今为止最大数量的非随机标签并行测序 | NA | 验证NS-watermark条形码在长读长测序技术中的错误校正能力和应用潜力 | NS-watermark条形码在ONT MinION平台上的应用 | 测序技术 | NA | ONT | NA | 序列数据 | 3840个NS-watermark条形码 |
| 124 | 2024-08-08 |
Identification of distinct non-myogenic skeletal-muscle-resident mesenchymal cell populations
2022-05-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110785
PMID:35545045
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研究论文 | 本文通过多种技术手段，包括谱系/报告基因分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光染色和分化实验，对正常和受伤的小鼠肌肉中的非肌源性肌肉驻留间充质细胞进行了详细鉴定 | 本文首次鉴定出六种不同的Pdgfra非肌源性肌肉驻留间充质细胞群，并描述了它们从共同前体细胞向两个不同分化轨迹的演变 | NA | 进一步定义肌肉驻留间充质细胞群 | 非肌源性肌肉驻留间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 小鼠肌肉组织 |
| 125 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics provides insights into hypertrophic cardiomyopathy
2022-05-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110809
PMID:35545053
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析肥厚型心肌病患者的间隔心肌切除样本，揭示了与疾病相关的基因、转录因子和细胞大小的功能联系 | 首次利用单细胞RNA测序技术在人类肥厚型心脏中揭示了心肌细胞异质性和分子事件，为开发增强疗法提供了新见解 | NA | 深入理解驱动心肌细胞肥大的基因网络，以改进治疗策略 | 肥厚型心肌病患者的间隔心肌切除样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Global coordination level in single-cell transcriptomic data
2022-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-11507-y
PMID:35534606
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研究论文 | 本文系统分析了单细胞转录组数据中基因全局协调水平（GCL）的性能 | 开发了一种'自上而下'的方法来评估单细胞转录组数据中基因之间的全局协调水平 | 单个异常细胞可能对计算出的GCL有不成比例的影响，且GCL受数据中集群存在的影响 | 评估和分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中基因的全局协调水平 | 单细胞转录组数据中的基因协调水平 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 127 | 2024-08-08 |
Adamantinomatous craniopharyngioma cyst fluid can trigger inflammatory activation of microglia to damage the hypothalamic neurons by inducing the production of β-amyloid
2022-May-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02470-6
PMID:35525962
|
research paper | 本研究构建了一种新的动物模型，用于研究颅咽管瘤囊液引起的下丘脑损伤及其机制 | 首次发现颅咽管瘤囊液能够触发小胶质细胞的炎症激活，从而损伤下丘脑 | NA | 构建可靠的颅咽管瘤囊液诱导的下丘脑损伤动物模型，并探索囊液导致下丘脑损伤的具体机制 | 颅咽管瘤囊液对下丘脑的影响及其机制 | NA | 颅咽管瘤 | ScRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及颅咽管瘤样本 |
| 128 | 2024-08-08 |
The role of serum amyloid A1 in the adipogenic differentiation of human adipose-derived stem cells basing on single-cell RNA sequencing analysis
2022-05-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02873-5
PMID:35525990
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了血清淀粉样蛋白A1（SAA1）在人脂肪干细胞向脂肪细胞分化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了SAA1在脂肪干细胞分化过程中的表达变化及其对炎症反应的调控作用 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境的影响 | 探究SAA1在人脂肪干细胞向脂肪细胞分化中的分子机制 | 人脂肪干细胞及其向脂肪细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 共分析了8849个细胞，其中未分化组4415个细胞，分化组4634个细胞 |
| 129 | 2024-08-08 |
Single-cell characterization of malignant phenotypes and microenvironment alteration in retinoblastoma
2022-05-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04904-8
PMID:35523772
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组和全外显子测序分析，详细描述了视网膜母细胞瘤（RB）中的恶性表型和微环境改变 | 首次详细描绘了RB中单细胞水平的恶性表型和微环境特征，揭示了肿瘤细胞和微环境在RB恶性进展中的作用 | NA | 探究视网膜母细胞瘤中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境对恶性进展的影响 | 视网膜母细胞瘤患者的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 儿童常见眼内原发性恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序和全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 7名RB患者的肿瘤样本，约70,000个细胞 |
| 130 | 2024-08-08 |
Human branching cholangiocyte organoids recapitulate functional bile duct formation
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.011
PMID:35523140
|
研究论文 | 本文报道了建立人类分支胆管上皮细胞类器官（BRCO）培养方法，这些类器官自发组织成复杂的管状结构，类似于肝内胆管的结构 | BRCOs能够模拟肝内胆管的分支生长，并且这种生长依赖于JAG1/NOTCH2信号传导，为胆管疾病的研究提供了改进的模型 | NA | 研究胆管上皮细胞类器官的分支形态发生及其在胆管疾病研究中的应用 | 人类分支胆管上皮细胞类器官（BRCO）及其在胆管癌类器官中的应用 | 数字病理学 | 胆管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 类器官 | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
p57Kip2 imposes the reserve stem cell state of gastric chief cells
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.001
PMID:35523142
|
研究论文 | 本文研究了p57在维持胃主细胞干细胞状态中的作用 | 首次确定p57作为调节胃主细胞干细胞状态的分子开关 | NA | 探讨p57在胃主细胞干细胞状态中的作用及其对组织再生的影响 | 胃主细胞及其干细胞状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序，dox诱导的谱系追踪 | NA | RNA | 小鼠 |
| 132 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.821
PMID:35522918
|
研究论文 | 本研究构建了首个涵盖整个妊娠期的孕妇外周血单个核细胞的单细胞图谱 | 首次构建了孕妇外周血单个核细胞的单细胞图谱，并开发了特定细胞类型模型来预测正常妊娠的孕周 | NA | 旨在深入理解孕妇外周血单个核细胞在妊娠期间的组成变化 | 孕妇的外周血单个核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 特定细胞类型模型 | RNA | 198,356个外周血单个核细胞来自136名孕妇 |
| 133 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling-guided combination therapy of c-Fos and histone deacetylase inhibitors in diffuse large B-cell lymphoma
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.798
PMID:35522945
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术评估了c-Fos和组蛋白去乙酰化酶抑制剂在弥漫大B细胞淋巴瘤中的联合治疗效果 | 本研究筛选并确认了LAQ824在弥漫大B细胞淋巴瘤中的高效性，并提出了一种基于HDACi的联合治疗策略 | NA | 探索更优的组蛋白去乙酰化酶抑制剂及优化相关的联合治疗策略 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
RETRACTED: Parallel bimodal single-cell sequencing of transcriptome and methylome provides molecular and translational insights on oocyte maturation and maternal aging
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110379
PMID:35526740
|
correction | 本文已被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Reestablishment of spermatogenesis after more than 20 years of cryopreservation of rat spermatogonial stem cells reveals an important impact in differentiation capacity
2022-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001618
PMID:35536782
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研究论文 | 本文研究了经过超过20年冷冻保存的鼠精原干细胞在移植后恢复生精功能的能力 | 首次展示了长期冷冻保存的精原干细胞在移植后仍能产生所有分化类型的生殖细胞，尽管效率较低 | 长期冷冻的细胞在移植后分化效率降低，且显示出精子发生过程中的部分阻断 | 探讨长期冷冻保存对精原干细胞分化能力的影响 | 鼠精原干细胞及其在长期冷冻后的移植和分化能力 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals novel cellular heterogeneity of monocytes during Hymenoptera venom allergy
2022-May, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.12151
PMID:35540108
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，揭示了膜翅目毒液过敏（HVA）患者外周血细胞中的单核细胞异质性及其分子机制 | 本文首次通过单细胞RNA测序和多种计算模型分析，揭示了HVA患者急性期单核细胞数量增加及其在先天免疫反应、白细胞活化和细胞解毒中的主要作用 | NA | 探究膜翅目毒液过敏（HVA）患者外周免疫反应的分子机制 | HVA患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | CNN | 转录组数据 | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Migratory and anti-fibrotic programmes define the regenerative potential of human cardiac progenitors
2022-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00899-8
PMID:35550611
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研究论文 | 本研究通过结合谱系追踪和单细胞转录组学技术，揭示了人类心脏前体细胞在非人类灵长类心脏损伤模型中的再生潜能及其抗纤维化机制 | 本研究首次揭示了人类心脏前体细胞通过CXCL12/CXCR4介导的趋化作用和SLIT2/ROBO1指导的纤维细胞排斥作用，实现心脏肌肉修复和功能恢复的新机制 | NA | 探讨人类心脏前体细胞在心脏再生中的作用及其机制 | 人类心脏前体细胞在心脏损伤后的再生和抗纤维化作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 非人类灵长类和猪的心脏损伤模型 |
| 138 | 2024-08-08 |
Mucosal-Associated Invariant T (MAIT) cells are highly activated in duodenal tissue of humans with Vibrio cholerae O1 infection: A preliminary report
2022-05, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010411
PMID:35551522
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研究论文 | 本文研究了在霍乱弧菌O1感染期间，黏膜相关不变T（MAIT）细胞在人类十二指肠组织中的存在和表型 | 首次展示了在霍乱感染期间，十二指肠中的MAIT细胞比外周血中的MAIT细胞更为激活 | 由于样本量小，研究结果为初步报告 | 探讨MAIT细胞在急性肠道感染中的作用，特别是在黏膜水平上的作用 | 十二指肠活检和配对外周血样本中的MAIT细胞 | NA | NA | 免疫组织化学染色，流式细胞术，单细胞测序 | NA | 组织样本，血液样本 | 5名霍乱患者（中位年龄32岁，范围26-44岁，1名女性）的十二指肠活检，10名患者的流式细胞术分析（中位年龄31岁，范围23-36岁，1名女性） |
| 139 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis
2022-05-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.009
PMID:35512701
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研究论文 | 本研究利用Stereo-seq技术对91个斑马鱼胚胎切片在发育前24小时内的六个关键时间点进行了空间转录组分析，重建了斑马鱼胚胎发育过程中的细胞命运转变和分子变化的空间解析发育轨迹。 | 首次在接近细胞大小的分辨率下，通过空间转录组学技术，详细描绘了斑马鱼胚胎发育过程中的基因表达景观和发育轨迹。 | NA | 旨在通过空间转录组学技术，深入理解脊椎动物胚胎发育过程中的细胞命运决定和分子变化。 | 斑马鱼胚胎在发育前24小时内的基因表达和细胞命运转变。 | 数字病理学 | NA | Stereo-seq | NA | 空间转录组数据 | 91个斑马鱼胚胎切片，覆盖六个关键时间点，共获得152,977个spots。 |
| 140 | 2024-08-08 |
Deep neural network modeling identifies biomarkers of response to immune-checkpoint therapy
2022-May-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104228
PMID:35494249
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研究论文 | 开发了一种名为DeepGeneX的计算框架，利用深度神经网络模型和特征消除技术，从单细胞RNA测序数据中筛选出六个关键基因，用于预测免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用深度神经网络模型从大量基因数据中筛选出关键的六个基因，用于准确预测免疫疗法的反应 | NA | 开发一种新的计算框架，用于识别预测免疫检查点疗法反应的生物标志物 | 单细胞RNA测序数据和免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因数据 | 约26,000个基因 |