单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 245 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Tumor-associated macrophage heterogeneity is driven by tissue territories in breast cancer
2022-05-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110865
PMID:35613577
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和空间定位成像技术，探讨了肿瘤相关巨噬细胞在乳腺肿瘤中的异质性及其与组织区域的关系 | 发现肿瘤相关巨噬细胞的转录组程序根据其在乳腺导管间质或肿瘤上皮中的定位，遵循两种主要的分化路径，并且这种多样性仅在自发肿瘤模型中检测到 | NA | 探讨环境扰动如何影响肿瘤相关巨噬细胞的身份和功能 | 肿瘤相关巨噬细胞在乳腺肿瘤中的异质性及其与组织区域的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 未具体说明样本数量 |
| 82 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of human Vδ1 T cells reveals a pathogen-driven adaptive differentiation program
2022-05-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110858
PMID:35613583
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学、T细胞受体（TCR）克隆型分配、ATAC-seq和免疫表型分析，探讨了适应性γδ T细胞免疫生物学的转录调控 | 揭示了成人Vδ1 T细胞分为TCF7LEF1Granzyme B（T）或T-betEomesBLIMP-1Granzyme B（T）转录亚型，并发现克隆型扩增的TCR仅在T细胞中检测到 | NA | 理解适应性γδ T细胞免疫生物学的转录调控 | 成人Vδ1 T细胞的转录亚型和克隆型扩增的TCR | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学, TCR克隆型分配, ATAC-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Cell cycle gene regulation dynamics revealed by RNA velocity and deep-learning
2022-05-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30545-8
PMID:35606383
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术结合深度学习方法，揭示了细胞周期中基因调控动力学的详细定量理解 | 提出了一种名为DeepCycle的深度学习方法，用于分析单细胞RNA测序数据，构建了高分辨率的细胞周期转录组图谱 | NA | 深入理解细胞周期中的基因调控动力学 | 细胞周期相关基因的转录动态 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习（DeepCycle） | RNA | 不同细胞系统的scRNA-seq文库 |
| 84 | 2024-08-08 |
Poly-γ-glutamic acid/Alum adjuvanted pH1N1 vaccine-immunized aged mice exhibit a significant increase in vaccine efficacy with a decrease in age-associated CD8+ T cell proportion in splenocytes
2022-May-23, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-022-00282-z
PMID:35606855
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研究论文 | 本研究探讨了聚γ-谷氨酸和铝（PGA/Alum）佐剂对老年小鼠（18个月）疫苗效力的影响及其机制 | PGA/Alum佐剂提高了老年小鼠的抗原摄取和树突状细胞激活，增加了抗原特异性IFN-γ+CD8+ T淋巴细胞频率，并减少了与年龄相关的CD8+ T细胞比例 | NA | 研究PGA/Alum佐剂对老年小鼠流感疫苗效力的影响及其机制 | 老年小鼠的疫苗效力及免疫机制 | 疫苗学 | 流感 | 流式细胞术，单细胞转录组测序 | NA | 细胞，基因表达 | 老年小鼠（18个月）和年轻小鼠（6周） |
| 85 | 2024-08-08 |
New adventures in spatial transcriptomics
2022-05-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.021
PMID:35609527
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research paper | 本文介绍了Stereo-seq这一空间转录组学方法，并展示了其在不同生物学背景下的应用 | Stereo-seq作为一种新的空间转录组学方法，能够解析基因调控途径在细胞空间排列中的作用 | NA | 研究基因调控途径在复杂动态过程中的作用 | 基因调控途径及其在细胞空间排列中的作用 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Expression and function of the luteinizing hormone choriogonadotropin receptor in human endometrial stromal cells
2022-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-12495-9
PMID:35597810
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研究论文 | 研究人类子宫内膜基质细胞中黄体生成激素/绒毛膜促性腺激素受体（LHCGR）的表达与功能 | 发现了一小部分表达LHCGR转录本的子宫内膜基质细胞亚群，这可能解释了文献中关于LHCGR表达的矛盾证据 | 未能重现LHCGR在子宫内膜基质细胞中的功能活性 | 探究LHCGR在人类子宫内膜中的表达及其功能活性 | 人类子宫内膜基质细胞中的LHCGR | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G-蛋白偶联受体 | RNA | 包括整个周期的子宫内膜组织和培养的人类子宫内膜基质细胞的批量RNA测序数据，以及单细胞RNA测序数据 |
| 87 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveals immune landscape for interstitial cystitis
2022-05-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00962-8
PMID:35589692
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，揭示了间质性膀胱炎的免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学技术结合，详细描绘了间质性膀胱炎的免疫细胞分布和相互作用 | 研究样本仅限于女性患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究免疫系统在间质性膀胱炎中的作用 | 间质性膀胱炎患者及压力性尿失禁对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 135,091个CD45免疫细胞来自15名间质性膀胱炎女性患者和9名对照组 |
| 88 | 2024-08-08 |
A 3D gene expression atlas of the floral meristem based on spatial reconstruction of single nucleus RNA sequencing data
2022-05-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30177-y
PMID:35595749
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研究论文 | 本文提出了一种结合单核RNA测序和基于显微镜的3D空间重建技术，用于重建3D花序分生组织中个体细胞的全基因组基因表达模式 | 本文创新性地将单核RNA测序与3D空间重建技术结合，恢复了发育器官中细胞的原始位置，从而将基因活性与细胞身份和功能联系起来 | NA | 旨在通过空间重建的单细胞转录组图谱来理解植物形态发生 | 研究对象为花序分生组织中的细胞异质性及其基因表达模式 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 89 | 2024-08-08 |
BMP4 drives primed to naïve transition through PGC-like state
2022-05-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30325-4
PMID:35589713
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了BMP4诱导的小鼠从激活态到原始态的转变过程，发现这一转变并非直接逆转细胞命运，而是通过类似原始生殖细胞的状态进行 | 揭示了从激活态到原始态转变的替代路径，并深入了解了生殖细胞的发育机制 | NA | 研究小鼠干细胞中从激活态到原始态的转变过程及其机制 | 小鼠的激活态和原始态干细胞及其转变过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal necroptosis-based molecular classification, tumor microenvironment infiltration characterization, and prognosis prediction in colorectal cancer
2022-05-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03431-6
PMID:35590418
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了基于坏死性凋亡的分子分类、肿瘤微环境浸润特征及结直肠癌的预后预测 | 首次全面探索了坏死性凋亡相关基因在结直肠癌中的作用，并开发了NRG_score用于预测患者生存结果 | NA | 揭示坏死性凋亡相关基因在肿瘤微环境中的潜在作用及其与临床病理参数和患者预后的关联 | 结直肠癌中的坏死性凋亡相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自复旦大学上海癌症中心的病人队列 |
| 91 | 2024-08-08 |
Approaching deconvolution with Fermi's mindset
2022-05-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.04.004
PMID:35588698
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学（ST）技术在连接组织功能与细胞类型空间组织方面的应用，并介绍了利用ST数据生成过程细节的新算法以克服技术变异和细胞亚型差异带来的挑战。 | 本文引入了一种新的算法，该算法细致地结合了ST数据生成过程的细节，有望解决技术变异和细胞亚型差异带来的挑战。 | NA | 探索空间转录组学技术在连接组织功能与细胞类型空间组织方面的应用。 | 空间转录组学数据及其在组织功能与细胞类型空间组织中的应用。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
Forward single-cell sequencing into clinical application: Understanding of ageing and rejuvenation from clinical observation to single-cell solution
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.827
PMID:35593205
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Extracellular vesicles from lung tissue drive bone marrow neutrophil recruitment in inflammation
2022-05, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12223
PMID:35595717
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研究论文 | 本文研究了肺组织来源的细胞外囊泡（EVs）在炎症条件下促进骨髓中性粒细胞趋化的作用 | 首次报道了肺EVs通过传递双链DNA（dsDNA）促进骨髓中性粒细胞的趋化，并揭示了其分子机制 | NA | 探讨肺EVs在体内生理或病理功能中的作用 | 肺组织来源的细胞外囊泡及其对骨髓中性粒细胞趋化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及人类和鼠类肺组织样本 |
| 94 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and microenvironment of human oesophageal high-grade intraepithelial neoplasia
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.874
PMID:35608199
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，探讨了人食管高级别上皮内瘤变（HIN）的起源细胞及其微环境 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了HIN可能起源于慢循环的KRT15high STMN1low细胞，并描述了HIN独特的肿瘤微环境特征 | NA | 探究人食管高级别上皮内瘤变的分子和功能特性，特别是其起源细胞和微环境 | 人食管高级别上皮内瘤变及其邻近组织细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个HIN及邻近组织的细胞样本 |
| 95 | 2024-08-08 |
Triple-serotype chimeric oncolytic adenovirus exerts multiple synergistic mechanisms against solid tumors
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004691
PMID:35609942
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研究论文 | 本研究探讨了一种具有协同机制的溶瘤腺病毒（OncoViron）在治疗多种实体瘤中的疗效 | OncoViron通过选择性复制介导抗癌因子的高表达，特异性地针对多种实体瘤，并显著抑制癌细胞增殖。此外，OncoViron还能与程序性死亡1（PD-1）抗体和嵌合抗原受体（CAR）T细胞联合使用，显示出强大的抗癌效果 | NA | 研究溶瘤腺病毒OncoViron在治疗多种实体瘤中的疗效及其协同机制 | 溶瘤腺病毒OncoViron及其在多种实体瘤细胞系中的抗癌效果 | 癌症免疫治疗 | 实体瘤 | 细胞学实验、植入肿瘤模型、单细胞测序、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多种植入实体瘤模型的免疫缺陷小鼠、免疫活性小鼠和人类化小鼠 |
| 96 | 2024-08-08 |
Selectively Imaging Cranial Sensory Ganglion Neurons Using AAV-PHP.S
2022 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0373-21.2022
PMID:35610024
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研究论文 | 本文利用AAV-PHP.S载体选择性地标记并成像小鼠颅神经的感觉神经节细胞 | 引入AAV-PHP.S衣壳，增强了对周围神经元的趋向性，并结合GFP或mScarlet荧光蛋白，实现了对特定感觉神经节的选择性标记 | NA | 探索并验证AAV-PHP.S在选择性标记和成像周围感觉神经元中的应用 | 小鼠颅神经V、VII、IX和X的感觉神经节细胞 | 神经科学 | NA | AAV-PHP.S | NA | 图像 | 约66%的膝状神经节神经元被转导 |
| 97 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of macrophage infiltration in non-small cell lung cancer reveals determinants of sensitivity and resistance to anti-PD1/PD-L1 antibodies
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003890
PMID:35618288
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研究论文 | 研究非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞浸润的空间转录组学，揭示对抗PD1/PD-L1抗体敏感性和抵抗性的决定因素 | 通过空间转录组学分析，揭示了肿瘤相关巨噬细胞在非小细胞肺癌中对抗免疫检查点抑制剂的敏感性和抵抗性的新机制 | 研究样本仅限于152名非小细胞肺癌患者，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞浸润对非小细胞肺癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗反应的预测价值 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本及其对免疫检查点抑制剂的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | NanoString GeoMx免疫通路检测 | NA | 转录组数据 | 152名非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 |
| 98 | 2024-08-08 |
Integrative analysis of scRNA-seq and scATAC-seq revealed transit-amplifying thymic epithelial cells expressing autoimmune regulator
2022-05-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73998
PMID:35578835
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）分析，揭示了表达自身免疫调节因子（Aire）的髓质胸腺上皮细胞（mTECs）在成年胸腺中的增殖和分化机制 | 首次发现并描述了在成年胸腺中增殖的AireCD80 mTECs，这些细胞在经过短暂的增殖后转变为静止状态并高表达组织特异性抗原（TSAs） | NA | 探究成年胸腺中髓质胸腺上皮细胞的分化机制 | 髓质胸腺上皮细胞（mTECs）及其在成年胸腺中的增殖和分化过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
A murine model of large-scale bone regeneration reveals a selective requirement for Sonic Hedgehog
2022-May-17, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00225-8
PMID:35581202
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研究论文 | 本文通过小鼠大规模肋骨再生模型，研究了Sonic Hedgehog (SHH)在大规模骨愈合中的早期和关键作用 | 发现SHH在大规模损伤中对骨再生的独特需求，以及其在Prrx1表达的Sox9阴性间充质细胞中的必要性 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨SHH在其他物种或人体中的作用 | 探究Sonic Hedgehog在大规模骨再生中的作用机制 | 小鼠的肋骨再生 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肋骨再生组织样本 |
| 100 | 2024-08-08 |
Twist2-driven chromatin remodeling governs the postnatal maturation of dermal fibroblasts
2022-05-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110821
PMID:35584664
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研究论文 | 本文揭示了Twist2驱动的染色质重塑在真皮成纤维细胞出生后成熟过程中的作用 | 首次阐明了Twist2在真皮成纤维细胞出生后成熟过程中的关键作用及其对再生能力的调控机制 | NA | 探讨真皮成纤维细胞出生后成熟过程中的内在细胞机制 | 真皮成纤维细胞的出生后成熟过程 | NA | NA | 单细胞转录组学、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | 基因组数据 | NA |