单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 246 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Adversarial domain translation networks for integrating large-scale atlas-level single-cell datasets
2022-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00251-y
PMID:38177826
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Portal的统一框架，利用对抗域翻译网络来学习大规模图谱级别单细胞RNA-seq数据集的协调表示 | Portal框架在集成过程中能更好地保留生物变异，且在低内存消耗下快速集成数百万个细胞 | NA | 开发一种能够有效集成和协调大规模单细胞RNA-seq数据集的方法 | 大规模图谱级别的单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗域翻译网络 | 单细胞RNA-seq数据 | 数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Single-cell Characterization of the Cellular Landscape of Acral Melanoma Identifies Novel Targets for Immunotherapy
2022-05-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3145
PMID:35247927
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肢端黑色素瘤的转录组景观，并识别了新的免疫治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了肢端黑色素瘤的细胞类型和免疫景观，并发现了多个可用于治疗的免疫检查点 | 研究样本数量有限，仅包括九个临床样本（五个原发，四个转移） | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肢端黑色素瘤的细胞景观，并发现新的免疫治疗靶点 | 肢端黑色素瘤的细胞类型和免疫景观 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 九个临床样本（五个原发，四个转移） | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Pan-cancer analysis reveals RIPK2 predicts prognosis and promotes immune therapy resistance via triggering cytotoxic T lymphocytes dysfunction
2022-05-04, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00475-8
PMID:35508972
|
研究论文 | 本研究探讨了RIPK2在33种癌症中的表达、基因改变情况及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次阐明了RIPK2在多种癌症中的预后价值及其通过触发细胞毒性T淋巴细胞功能障碍促进免疫治疗抵抗的作用 | NA | 研究RIPK2在人类泛癌中的预后作用及对免疫治疗反应的影响 | RIPK2在33种癌症中的表达、基因改变情况及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 33种癌症的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Calcium channel blockers potentiate gemcitabine chemotherapy in pancreatic cancer
2022-05-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2200143119
PMID:35476525
|
研究论文 | 本研究探索了钙通道阻滞剂增强吉西他滨化疗在胰腺癌中的效果 | 通过单细胞RNA测序和高通量蛋白质组分析，发现钙/钙调蛋白信号通路在吉西他滨耐药肿瘤细胞中的富集，并证实钙通道阻滞剂能抑制生存促进的ERK信号传导，增强吉西他滨的治疗反应 | NA | 寻找新的策略来预防、延迟或克服吉西他滨的耐药性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的吉西他滨耐药性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，高通量蛋白质组分析 | NA | RNA，蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 antigen exposure history shapes phenotypes and specificity of memory CD8+ T cells
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01184-4
PMID:35383307
|
研究论文 | 本研究利用主要组织相容性复合体多聚体和单细胞RNA测序技术，分析了不同抗原暴露次数（包括疫苗接种、初次感染和突破性感染）对SARS-CoV-2反应性T细胞的影响。 | 研究发现，抗原暴露顺序影响Spike特异性和非Spike特异性T细胞的分布，且突破性感染能多样化T细胞记忆库。 | NA | 探讨重复暴露于SARS-CoV-2抗原对记忆T细胞的影响。 | SARS-CoV-2反应性T细胞。 | 免疫学 | 冠状病毒病2019 | 主要组织相容性复合体多聚体，单细胞RNA测序 | NA | T细胞受体序列 | 超过4,000个表位特异性T细胞抗原受体序列 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Development and validation of prognostic and diagnostic model for pancreatic ductal adenocarcinoma based on scRNA-seq and bulk-seq datasets
2022-05-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab343
PMID:34957503
|
研究论文 | 本文开发并验证了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序数据集的胰腺导管腺癌（PDAC）预后和诊断模型 | 本文通过比较肿瘤细胞和正常导管细胞的差异表达基因（DEGs），利用多变量Cox或逻辑回归分析构建了预后和诊断模型，并开发了一种易于使用的诺模图来预测PDAC的2年和3年总体生存率 | NA | 开发和验证胰腺导管腺癌的预后和诊断模型 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其预后和诊断 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型，逻辑回归模型 | 基因-细胞矩阵 | 从GSA数据库下载的scRNA-seq分析的原始基因-细胞矩阵数据 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-08 |
Retraction notice to "Parallel bimodal single-cell sequencing of transcriptome and methylome provides molecular and translational insights on oocyte maturation and maternal aging" [Genomics, 114/3 (2022) 110379]
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110541
PMID:36528977
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-08 |
Where Are They Now: Spatial and Molecular Diversity of Tissue-Resident Macrophages in the Kidney
2022-05, Seminars in nephrology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.semnephrol.2022.10.002
PMID:36435683
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏组织驻留巨噬细胞（KRMs）的空间和分子多样性及其在肾脏疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别了KRMs的不同亚群，这些亚群在分子、功能和空间上具有独特性，并能在肾脏损伤后动态变化 | NA | 旨在理解KRMs亚群的多样性，以开发治疗肾脏疾病和促进肾脏健康的新疗法 | 肾脏组织驻留巨噬细胞（KRMs）及其在肾脏疾病中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 分子数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-08 |
Human obstructive (postvasectomy) and nonobstructive azoospermia - Insights from scRNA-Seq and transcriptome analysis
2022-May, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.09.004
PMID:35782978
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸活检样本，探索其分子基础和转录调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了阻塞性和非阻塞性无精症患者的转录组变化，特别是在Sertoli细胞和生殖细胞的相互作用方面的发现 | 研究样本量较小，仅包括两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示无精症的分子病因和转录调控机制 | 阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-08 |
An Integrative Analysis of the Immune Features of Inactivated SARS-CoV-2 Vaccine (CoronaVac)
2022-May-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10060878
PMID:35746486
|
研究论文 | 本文通过体外免疫细胞反应和大规模多组学分析，详细研究了接种CoronaVac（一种灭活SARS-CoV-2疫苗）后参与者的外周血单个核细胞（PBMCs）的免疫特征 | 首次详细描述了CoronaVac疫苗接种后的体外免疫特征，包括T细胞和B细胞的反应以及多组学分析结果 | NA | 深入理解CoronaVac疫苗的体外免疫特征 | 接种CoronaVac疫苗的参与者和COVID-19康复者的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 大规模 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Increased expression of tribbles homolog 3 predicts poor prognosis and correlates with tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma: a bioinformatics study
2022-05, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2086380
PMID:35726370
|
研究论文 | 本研究探讨了TRIB3在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了TRIB3在ccRCC中的表达与肿瘤侵袭性和患者预后的关联，并分析了其与免疫细胞类型的关系 | 研究主要基于公开数据库和细胞实验，缺乏临床样本的直接验证 | 评估TRIB3在ccRCC中的生物学作用及其对患者预后的影响 | TRIB3在ccRCC中的表达及其与肿瘤微环境和免疫细胞的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | RT-qPCR, 蛋白质印迹, Transwell迁移实验, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 免疫细胞数据 | 使用The Cancer Genome Atlas的公开数据，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
The Modulatory Effect of Cyclocarya paliurus Flavonoids on Intestinal Microbiota and Hypothalamus Clock Genes in a Circadian Rhythm Disorder Mouse Model
2022-May-31, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu14112308
PMID:35684108
|
research paper | 研究了富含黄酮类化合物（CPF）的饮食对肠道微生物群、代谢物和下丘脑时钟基因在诱发昼夜节律紊乱小鼠模型中的影响 | 采用多组学分析方法，发现CPF补充改变了由昼夜节律紊乱诱导的肠道微生物群和代谢物的特定组成和功能，并显著调节了与昼夜节律、髓鞘形成和神经退行性疾病相关基因的表达 | NA | 探讨CPF对昼夜节律紊乱小鼠模型中肠道微生物群和下丘脑时钟基因的影响 | 肠道微生物群、代谢物和下丘脑时钟基因 | NA | circadian rhythm disorder | multi-omics profiling, single-cell RNA-seq | NA | microbiota, metabolites, gene expression | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
Long-Term High-Fat High-Fructose Diet Induces Type 2 Diabetes in Rats through Oxidative Stress
2022-May-24, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu14112181
PMID:35683981
|
研究论文 | 研究长期高脂高果糖饮食对大鼠胰腺结构和功能的影响及其与2型糖尿病的关系 | 首次通过单细胞RNA测序验证了氧化还原酶在不同胰岛亚群中的转录水平变化，并揭示了长期高脂高果糖饮食和衰老相关的胰腺胰岛功能衰退的潜在机制 | NA | 探讨长期高脂高果糖饮食对大鼠胰腺结构和功能的影响及其与2型糖尿病的关系 | 大鼠胰腺结构和功能 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物化学参数、炎症因子、氧化应激指标 | 大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Blocking connexin 43 and its promotion of ATP release from renal tubular epithelial cells ameliorates renal fibrosis
2022-05-31, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04910-w
PMID:35641484
|
研究论文 | 本文探讨了肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物，特别是通过连接蛋白43（Cx43）促进的三磷酸腺苷（ATP）释放，在肾纤维化中的作用。 | 首次全面研究了Cx43在肾间质纤维化中的作用，并揭示了Cx43通过促进ATP释放，诱导巨噬细胞焦亡，进而加速肾纤维化的机制。 | 研究主要基于动物模型和临床样本，需要进一步的临床试验验证其结果的普遍性和有效性。 | 探讨肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物在肾纤维化中的作用，特别是Cx43和ATP的作用。 | 肾小管上皮细胞、巨噬细胞、肾纤维化 | NA | 肾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | RNA序列 | 包括来自阻塞性肾病的患者样本和单侧输尿管阻塞（UUO）的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data
2022-05-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03476-9
PMID:35637301
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Chord的集成机器学习算法，用于识别单细胞RNA测序数据中的双细胞 | Chord通过集成多种双细胞检测方法，提高了准确性和稳定性，并具有模块化架构，便于新工具的整合 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中双细胞检测的问题 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习算法 | RNA测序数据 | 包含真实和合成数据的不同数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Characteristics of alveolar macrophages in bronchioalveolar lavage fluids from active tuberculosis patients identified by single-cell RNA sequencing
2022-May-28, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.36.20220007
PMID:35635159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 | 首次在单细胞分辨率下描述了活动性结核病患者肺泡巨噬细胞的特征，并探讨了其与炎症信号通路及基本巨噬细胞功能的关系 | 研究样本量较小，仅包括三名活动性结核病患者和三名健康成人作为对照 | 展示活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 | 活动性结核病患者的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 三名活动性结核病患者和三名健康成人 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Activation-induced pyroptosis contributes to the loss of MAIT cells in chronic HIV-1 infected patients
2022-05-27, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-022-00384-1
PMID:35619176
|
研究论文 | 本研究探讨了激活诱导的焦亡在慢性HIV-1感染患者中导致黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）丢失的机制 | 首次揭示了激活诱导的MAIT细胞焦亡在HIV-1感染患者中的作用，并关联了系统性T细胞激活、微生物移位和肠道损伤的标志 | 研究样本仅限于中国北京的一家医院，可能限制了结果的普遍性 | 识别导致HIV-1感染患者中MAIT细胞丢失的机制 | HIV-1感染患者的MAIT细胞及其焦亡特征 | 免疫学 | HIV/AIDS | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 127名HIV-1感染者，包括69名未治疗患者、28名完全应答者、15名免疫非应答者和15名精英控制者 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Toll-like receptor 9 deficiency induces osteoclastic bone loss via gut microbiota-associated systemic chronic inflammation
2022-May-27, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00210-3
PMID:35624094
|
研究论文 | 本研究首次展示了TLR9缺陷小鼠表现出低骨量和低级别系统性慢性炎症，这种炎症由肠道微生物群失调引起，并导致骨丢失。 | 本研究首次揭示了TLR9信号通过肠道微生物群与免疫系统和骨骼系统的连接，对维持炎症、造血和骨代谢的稳态至关重要。 | NA | 探讨TLR9在正常骨重塑中的作用及其机制。 | TLR9缺陷小鼠的骨量、系统性慢性炎症及肠道微生物群变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TLR9缺陷小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Glutamine Metabolism Is Required for Alveolar Regeneration during Lung Injury
2022-05-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12050728
PMID:35625656
|
研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺代谢在肺损伤后肺泡再生的作用，特别是在特发性肺纤维化（IPF）患者和博莱霉素诱导的纤维化小鼠模型中的作用。 | 首次揭示了谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的关键作用，特别是在肺纤维化过程中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者的细胞样本，可能需要进一步的人体临床试验来验证结果。 | 研究谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的作用，特别是在肺损伤和纤维化过程中的作用。 | 特发性肺纤维化患者和小鼠的肺泡II型细胞（AT2细胞）。 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组和代谢组分析 | NA | RNA | 包括IPF患者的AT2细胞和小鼠的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Chemoprevention of Lung Cancer with a Combination of Mitochondria-Targeted Compounds
2022-May-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14102538
PMID:35626143
|
研究论文 | 本研究评估了针对线粒体的化合物组合（Mito-HNK和Mito-LND）在预防小鼠肺癌中的效果 | 首次探讨了Mito-HNK和Mito-LND组合在肺癌预防中的协同作用，并通过单细胞RNA测序分析了其作用机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索针对线粒体的化合物组合在肺癌化学预防中的效果 | 小鼠肺癌模型 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |