单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 245 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Krüppel-like factors in bone biology
2022-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2022.110308
PMID:35301064
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综述 | 本文综述了Krüppel样因子（KLF）家族在骨骼发育中的多种功能，包括其在干细胞维持和分化、细胞凋亡及细胞周期中的作用 | 本文填补了关于KLF家族在骨骼发育中作用的综述空白，并探讨了其在不同动物模型中的基因型-表型相关性 | NA | 旨在全面总结KLF家族在骨骼发育中的重要性及其通过不同信号通路的功能 | KLF家族在骨骼发育中的作用及其在软骨细胞和成骨细胞发育中的表观遗传调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用公开的小鼠后肢单细胞RNA测序数据 |
| 202 | 2024-08-08 |
Linking the genotypes and phenotypes of cancer cells in heterogenous populations via real-time optical tagging and image analysis
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00853-x
PMID:35301448
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研究论文 | 本文展示了一种定制的光学显微镜系统，结合快速自动图像分析和可见光激活染料，实现了对大型异质细胞群中特定功能细胞动态的筛选和选择性光标记，进而通过单细胞RNA测序技术，功能性注释了多种癌细胞的转录组特征，并识别了驱动侵袭性迁移和间质样形态的关键基因和通路。 | 本文创新性地结合了光学标记和单细胞RNA测序技术，无需依赖分子生物标志物，即可对稀有细胞亚群进行富集，并揭示功能表型背后的分子机制。 | NA | 旨在将癌细胞的基因型与表型联系起来，特别是在时间变化的表型变化方面，以揭示驱动肿瘤细胞亚群生长的分子机制。 | 研究对象包括MCF10A细胞、MDA-MB-231细胞和患者来源的头颈鳞状细胞癌。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 涉及多种癌细胞类型和患者来源的细胞样本 |
| 203 | 2024-08-08 |
Understanding initiation and progression of hepatocellular carcinoma through single cell sequencing
2022-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2022.188720
PMID:35304295
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 提供了对肿瘤微环境、癌症干细胞、循环肿瘤细胞及免疫细胞亚群的深入理解 | 讨论了单细胞RNA测序技术现有的局限性和改进方向 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深化对肝细胞癌的理解，以推动个性化精准治疗 | 肝细胞癌的发病机制、微环境及免疫逃逸 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 204 | 2024-08-08 |
Functional single-cell sequencing links dynamic phenotypes to their genotypes
2022-05, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00877-3
PMID:35304585
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Revisiting hematopoiesis: applications of the bulk and single-cell transcriptomics dissecting transcriptional heterogeneity in hematopoietic stem cells
2022-05-21, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac002
PMID:35265979
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综述 | 本文综述了利用批量和单细胞转录组学技术解析造血干细胞转录异质性的最新发现和计算方法 | 利用下一代测序技术（NGS）在批量和单细胞水平上增加了对造血干细胞工作模型的理解 | NA | 深入理解造血干细胞稳态及其扰动的整体调控景观，以解析保护性免疫与自身免疫 | 造血干细胞及其在免疫系统中的作用 | NA | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 206 | 2024-08-08 |
Bibliometric review of ATAC-Seq and its application in gene expression
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac061
PMID:35255493
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综述 | 本文综述了ATAC-Seq技术及其在基因表达研究中的应用，并分析了相关文献的特征 | 构建了使用ATAC-Seq研究过的物种的系统发育树，并总结了人类疾病和其他物种的研究发现 | 主要集中在Mus musculus和Homo sapiens的研究，其他物种的数据仍在积累中 | 探讨ATAC-Seq技术在基因表达研究中的应用及其在多组学数据分析中的作用 | ATAC-Seq技术及其在不同物种中的应用 | 测序技术 | NA | ATAC-Seq, ChIP-seq, RNA-seq | NA | 基因组数据 | Mus musculus和Homo sapiens的研究占ATAC-Seq数据的约90% |
| 207 | 2024-08-08 |
Immunostimulatory Cancer-Associated Fibroblast Subpopulations Can Predict Immunotherapy Response in Head and Neck Cancer
2022-05-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3570
PMID:35262677
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研究论文 | 本文通过高维单细胞RNA测序研究了头颈癌相关成纤维细胞亚群对免疫疗法反应的预测作用 | 本文首次识别出能够预测免疫检查点抑制剂反应的头颈癌相关成纤维细胞亚群，并揭示了其在调节肿瘤微环境中免疫调节环境的功能 | NA | 研究头颈癌相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的免疫调节作用及其对免疫疗法反应的预测价值 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及其治疗前后的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28名头颈鳞状细胞癌患者 |
| 208 | 2024-08-08 |
Construction and evaluation of an integrated predictive model for chronic kidney disease based on the random forest and artificial neural network approaches
2022-05-07, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.02.099
PMID:35276459
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研究论文 | 本研究旨在通过结合随机森林和人工神经网络方法，构建并评估一个用于慢性肾脏病早期预测的综合预测模型 | 本研究通过结合随机森林和人工神经网络方法，构建了一个新的综合预测模型，并发现了与慢性肾脏病发展相关的关键基因 | NA | 识别关键生物标志物并构建一个用于慢性肾脏病早期预测的综合模型 | 慢性肾脏病患者 | 机器学习 | 慢性肾脏病 | RNA-seq | 随机森林 (RF) 和人工神经网络 (ANN) | 基因表达数据和临床信息 | 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的慢性肾脏病患者数据 |
| 209 | 2024-08-08 |
Complement protein C1q activates lung fibroblasts and exacerbates silica-induced pulmonary fibrosis in mice
2022-05-07, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.02.090
PMID:35278885
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研究论文 | 研究探讨了补体蛋白C1q在肺纤维化中的作用及其对肺成纤维细胞的影响 | 首次揭示了C1q在硅诱导的肺纤维化中的作用，并提出了C1q作为肺纤维化治疗靶点的可能性 | NA | 探究C1q在肺纤维化中的作用及其对肺成纤维细胞的影响 | C1q蛋白、肺成纤维细胞、硅诱导的肺纤维化小鼠模型 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C1q缺陷小鼠和正常小鼠 |
| 210 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mycosis fungoides reveals a cluster of actively proliferating lymphocytes
2022-May, The Australasian journal of dermatology
DOI:10.1111/ajd.13794
PMID:35254671
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了一位70岁男性患者皮肤病变中的淋巴细胞增殖情况 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了活跃增殖的淋巴细胞群 | NA | 探索皮肤淋巴瘤中的个性化医疗方法 | 皮肤病变中的淋巴细胞 | 数字病理学 | 皮肤淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一位70岁男性患者的皮肤病变样本 |
| 211 | 2024-08-08 |
Museum of spatial transcriptomics
2022-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01409-2
PMID:35273392
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综述 | 本文综述了自1987年以来空间转录组学技术及其数据分析方法的发展历程，并分析了该领域的趋势 | 提供了对空间转录组学技术及其数据分析方法的全面回顾，并将其置于历史背景下进行分析 | NA | 全面记录空间基因表达技术和数据分析方法，并分析该领域的趋势 | 空间转录组学技术及其数据分析方法 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 212 | 2024-08-08 |
Genomic and Single-Cell Landscape Reveals Novel Drivers and Therapeutic Vulnerabilities of Transformed Cutaneous T-cell Lymphoma
2022-05-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-1207
PMID:35247891
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研究论文 | 本研究通过综合多组学方法，包括全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫分析，揭示了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的新驱动因素和治疗脆弱性。 | 首次提供了转化性皮肤T细胞淋巴瘤的全面基因组改变图谱，并识别出潜在的预后标志物和新的治疗靶点。 | NA | 揭示转化性皮肤T细胞淋巴瘤的基因组和单细胞层面的新驱动因素及治疗脆弱性。 | 56名转化性皮肤T细胞淋巴瘤患者的肿瘤生态系统。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫分析 | NA | 基因组数据、单细胞数据、免疫数据 | 70个皮肤活检样本，16个单细胞皮肤活检样本 |
| 213 | 2024-08-08 |
Single cell study of cellular diversity and mutual communication in chronic heart failure and drug repositioning
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110322
PMID:35219850
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性心力衰竭小鼠模型中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信，并探索了潜在的治疗药物 | 首次详细描述了慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞景观，并利用CMap技术识别了潜在的新型抗心衰药物 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证 | 揭示慢性心力衰竭中非心肌细胞的细胞多样性和相互通信机制，并探索新的治疗策略 | 慢性心力衰竭小鼠模型中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 214 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cell types heterogenicity of human discoid lateral meniscus cells
2022-05, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30704
PMID:35220586
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了盘状外侧半月板细胞的细胞类型异质性 | 首次比较了盘状和正常半月板之间的基因表达和细胞异质性，并发现了两个新的特定于盘状半月板的细胞群 | NA | 旨在识别盘状半月板中的特定细胞群及其标记基因，为盘状半月板的治疗和病因提供理论基础 | 盘状外侧半月板细胞和骨关节炎外侧半月板细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 九个细胞群，包括七个经验定义的细胞群和两个新的特定于盘状半月板的细胞群 |
| 215 | 2024-08-08 |
Pharmacological Perturbation of Mechanical Contractility Enables Robust Transdifferentiation of Human Fibroblasts into Neurons
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202104682
PMID:35240008
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研究论文 | 本文报道了一种通过靶向细胞骨架并暴露于谱系指定环境来将成纤维细胞转化为神经元的强效方法 | 本文首次通过单一分子抑制肌动蛋白收缩来破坏细胞骨架，促进细胞软化和YAP/TAZ的核外输出，诱导神经元样状态 | NA | 研究细胞命运转换和再生医学 | 人包皮成纤维细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 216 | 2024-08-08 |
Spatial and transcriptional heterogeneity of pancreatic beta cell neogenesis revealed by a time-resolved reporter system
2022-May, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05662-0
PMID:35243521
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研究论文 | 本文通过时间分辨报告系统研究了胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 | 首次揭示了β细胞新生过程中空间和转录异质性的新特征 | NA | 探究胰腺β细胞新生过程中的空间和转录异质性 | 胰腺β细胞新生过程中的空间和转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类胚胎干细胞衍生的β样细胞 |
| 217 | 2024-08-08 |
Entinostat Decreases Immune Suppression to Promote Antitumor Responses in a HER2+ Breast Tumor Microenvironment
2022-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0170
PMID:35201318
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析了entinostat和免疫检查点抑制剂联合治疗对HER2阳性乳腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次全面描述了entinostat诱导的肿瘤微环境从促肿瘤向抗肿瘤转变的详细变化，特别是在髓系细胞中的变化 | NA | 探讨entinostat如何通过改变免疫抑制性肿瘤微环境来增强免疫检查点抑制剂的抗肿瘤反应 | HER2阳性乳腺癌肿瘤微环境中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受entinostat和ICI治疗的小鼠的HER2过度表达的乳腺癌肿瘤样本 |
| 218 | 2024-08-08 |
Genomic Correlates of Outcome in Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy for Metastatic Melanoma
2022-05-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1060
PMID:35190823
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）疗法在转移性黑色素瘤中的基因组相关性 | 首次揭示了新抗原负荷与总体生存率的正相关性，并发现特定基因表达与治疗反应之间的关系 | 样本量相对较小，且研究结果需要在更大规模的研究中验证 | 确定肿瘤浸润淋巴细胞疗法在转移性黑色素瘤中的治疗结果的基因组相关性 | 转移性黑色素瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 全外显子测序（WES），RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 64个样本进行全外显子测序，34个样本进行RNA测序 |
| 219 | 2024-08-08 |
Discovery and Application of Postnatal Nucleus Pulposus Progenitors Essential for Intervertebral Disc Homeostasis and Degeneration
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202104888
PMID:35195356
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，鉴定了在小鼠和人类样本中表达urotensin II受体（UTS2R）的产后髓核前体细胞（ProNPs），并探讨了其在椎间盘稳态和退变中的作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了产后髓核前体细胞的存在及其在椎间盘退变中的作用，并提出了潜在的诊断和治疗靶点。 | NA | 探讨产后髓核前体细胞在椎间盘稳态和退变中的作用及其潜在的诊断和治疗价值。 | 小鼠和人类的产后髓核前体细胞及其在椎间盘退变中的作用。 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 220 | 2024-08-08 |
Neuropilin-1-Mediated SARS-CoV-2 Infection in Bone Marrow-Derived Macrophages Inhibits Osteoclast Differentiation
2022-05, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200007
PMID:35195371
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research paper | 研究SARS-CoV-2通过神经纤毛蛋白-1（NRP1）感染骨髓来源的巨噬细胞（BMMs）并抑制破骨细胞分化的情况 | 首次发现NRP1而非ACE2是SARS-CoV-2进入BMMs的关键受体，并揭示了SARS-CoV-2感染抑制BMMs向破骨细胞分化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨SARS-CoV-2在骨髓来源巨噬细胞中的感染机制及其对破骨细胞分化的影响 | SARS-CoV-2感染的骨髓来源巨噬细胞及其对破骨细胞分化的影响 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 使用野生型和beta株（B.1.351）病毒感染的小鼠模型 |