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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-27 |
Liver Colonization by Colorectal Cancer Metastases Requires YAP-Controlled Plasticity at the Micrometastatic Stage
2022-05-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0933
PMID:35570706
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移过程中YAP控制的细胞可塑性在微转移阶段的关键作用 | 发现微转移灶缺乏癌症干细胞,而明显转移灶通过多细胞阶段的细胞可塑性重新产生癌症干细胞 | NA | 研究结直肠癌肝转移的分子机制和细胞动态变化 | 结直肠癌患者肝标本、小鼠肝脏转移模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 活体显微镜、单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA- and CAGE-seq Reveals Tooth-Enriched Genes
2022-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211049785
PMID:34806461
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和CAGE测序技术识别牙齿特异性表达基因 | 首次结合scRNA-seq和CAGE-seq技术鉴定牙齿发育关键基因,开发新型生物信息学分析方法 | 仅使用出生后第1天小鼠磨牙数据,未验证其他发育阶段 | 鉴定牙齿发育过程中的重要功能基因 | 小鼠牙齿胚和磨牙细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, CAGE测序 | NA | 基因表达数据 | 12,212个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, CAGE-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Workflow Optimization for Identification of Female Germline or Oogonial Stem Cells in Human Ovarian Cortex Using Single-Cell RNA Sequence Analysis
2022-05-27, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac015
PMID:35263439
|
研究论文 | 通过优化单细胞RNA测序分析流程,在成人卵巢皮质组织中鉴定出女性生殖系或卵原干细胞 | 优化分析工作流程参数后成功识别出与卵原干细胞基因表达谱匹配的稀有生殖系细胞,并发现成人卵巢中存在进行减数分裂I的生殖细胞证据 | 未详细说明具体优化参数和流程细节,样本量未明确说明 | 验证成人卵巢皮质组织中卵原干细胞的存在并优化鉴定方法 | 成人人类卵巢皮质组织中的细胞 | 单细胞测序分析 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序分析(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Electrical responses from human retinal cone pathways associate with a common genetic polymorphism implicated in myopia
2022-05-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119675119
PMID:35594404
|
研究论文 | 本研究通过视网膜电图分析发现人类视网膜锥细胞通路电反应与近视相关GJD2基因多态性存在关联 | 首次将GJD2基因多态性与特定视网膜锥细胞通路功能联系起来,揭示了近视发展的潜在神经机制 | 样本仅来自成年双胞胎志愿者,未包含儿童或青少年群体 | 探究近视相关基因变异对视网膜信号传导的影响机制 | 186名成年双胞胎志愿者及3名视网膜疾病患者 | 视觉神经科学 | 近视 | 视网膜电图记录,单细胞转录组分析,基因分型 | 混合线性模型 | 电生理信号,基因分型数据,转录组数据 | 186名双胞胎志愿者+3名患者 | NA | 视网膜电图,单细胞转录组测序 | NA | 国际标准ERG刺激协议 |
| 5 | 2025-10-06 |
Cross-tissue immune cell analysis reveals tissue-specific features in humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl5197
PMID:35549406
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和VDJ测序分析12名成人供体16个组织的免疫细胞,揭示组织特异性免疫特征 | 开发了CellTypist机器学习工具进行快速精确的细胞类型注释,首次系统解析跨组织免疫细胞异质性 | 样本量相对有限(12名供体),组织类型覆盖范围有待扩展 | 系统解析人类不同组织中免疫细胞的异质性和组织特异性特征 | 12名成人供体的16个组织样本中的免疫细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 约360,000个细胞,来自12名供体的16个组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
A dynamic single cell-based framework for digital twins to prioritize disease genes and drug targets
2022-05-06, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01048-4
PMID:35513850
|
研究论文 | 提出基于动态单细胞数据的数字孪生框架,用于优先排序疾病基因和药物靶点 | 开发了可扩展的多细胞网络模型框架,通过分析细胞类型间分子相互作用的动态变化来优先排序上游调控基因 | 模型复杂性高,缺乏线性层次结构,时间依赖性变化增加了优先排序的难度 | 建立数字孪生计算疾病模型,用于生物标志物和药物发现 | 季节性过敏性鼻炎患者的外周血单核细胞及其他炎症性疾病数据 | 计算生物学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 多细胞网络模型 | 单细胞RNA测序数据,批量分析数据 | 季节性过敏性鼻炎患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Human branching cholangiocyte organoids recapitulate functional bile duct formation
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.011
PMID:35523140
|
研究论文 | 本研究建立了具有分支形态的人类胆管细胞类器官模型,模拟了肝内胆管的复杂管状结构形成过程 | 首次成功培养出具有分支形态的人类胆管细胞类器官,突破了传统囊性类器官的形态限制 | 研究主要基于体外模型,需要进一步验证其在体内环境中的功能表现 | 开发更接近生理状态的人类胆管发育和疾病研究模型 | 人类胆管细胞类器官和胆管癌肿瘤类器官 | 组织工程 | 胆道疾病 | 单细胞转录组测序,功能分析 | 类器官模型 | 基因表达数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
p57Kip2 imposes the reserve stem cell state of gastric chief cells
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.001
PMID:35523142
|
研究论文 | 本研究揭示了p57Kip2作为胃主细胞储备干细胞状态的分子开关机制 | 首次发现p57蛋白是调控胃主细胞储备干细胞状态的分子开关,揭示了其在组织稳态和损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探究胃主细胞在组织稳态和损伤修复过程中的分子调控机制 | 小鼠胃主细胞 | 细胞生物学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Mapping the epithelial-immune cell interactome upon infection in the gut and the upper airways
2022-05-02, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00224-x
PMID:35501398
|
研究论文 | 提出一个整合计算生物学框架,模拟病毒感染如何改变上皮细胞与免疫细胞间的相互作用网络 | 开发了整合细胞内/细胞间网络与单细胞RNA-seq数据的计算框架,首次系统映射感染后上皮-免疫细胞相互作用组 | 作为概念验证研究,仅聚焦于肠道和上呼吸道上皮感染,需要进一步实验验证 | 解析病毒感染如何改变上皮-免疫细胞相互作用调控炎症反应 | SARS-CoV-2感染的人类回肠/结肠类器官和气道纤毛上皮细胞 | 计算生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 整合网络模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Replicative history marks transcriptional and functional disparity in the CD8+ T cell memory pool
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01171-9
PMID:35393592
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为DivisionRecorder的遗传追踪方法,揭示了CD8+ T细胞记忆池中复制历史与功能差异的关系 | 首次开发了能够记录体内细胞增殖历史的遗传追踪系统,并证明复制历史可区分T细胞记忆池中的不同功能亚群 | NA | 研究复制历史与CD8+ T细胞记忆亚群形成的关系 | CD8+ T细胞记忆池 | 免疫学 | NA | 遗传追踪、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-07 |
The Tabula Sapiens: A multiple-organ, single-cell transcriptomic atlas of humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl4896
PMID:35549404
|
研究论文 | 构建了一个包含24种人类组织器官、近50万个细胞的单细胞转录组图谱 | 首次使用同一供体的多个组织器官创建单细胞转录组图谱,能够分析T细胞在不同组织间的克隆分布、B细胞的组织特异性突变率以及共享细胞类型在不同组织中的细胞周期状态 | NA | 创建人类多器官单细胞转录组参考图谱,研究细胞类型在不同组织中的分布和基因表达差异 | 人类24种不同组织和器官的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 近500,000个细胞,来自24种不同组织器官,多数来自同一供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-07 |
Emerging drug targets for triple-negative breast cancer: a guided tour of the preclinical landscape
2022-05, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2077188
PMID:35574694
|
综述 | 本文系统综述了三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点及其临床前研究进展 | 基于可药性、治疗效力、TNBC特异性及免疫治疗应用等标准,全面评估癌细胞膜分子、细胞内信号通路和肿瘤微环境等新兴靶点 | 靶点识别验证面临分子异质性、临床前到临床转化失败等挑战,缺乏统一评估标准 | 探索三阴性乳腺癌的新型有效靶向治疗策略 | 三阴性乳腺癌的分子靶点和肿瘤微环境 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 热稳定II型内含子逆转录酶测序, 人源化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-10-07 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
|
研究论文 | 通过多模态方法研究猕猴肺肉芽肿,揭示结核病控制的细胞相关性 | 首次通过共配准纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量,系统识别肉芽肿中细菌控制的细胞相关性 | 研究仅限于猕猴模型,人类肉芽肿可能存在差异 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制与持续的细胞和分子机制 | 食蟹猕猴肺结核肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, PET-CT成像 | NA | 影像数据, 基因表达数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-07 |
Variant-specific vaccination induces systems immune responses and potent in vivo protection against SARS-CoV-2
2022-05-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100634
PMID:35561673
|
研究论文 | 本研究评估了针对不同SARS-CoV-2变异株的特异性LNP-mRNA疫苗的免疫反应和保护效果 | 首次系统比较野生型和变异株特异性疫苗的免疫反应,并通过单细胞转录组学揭示免疫细胞群体和基因表达的系统性变化 | 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体验证 | 评估变异株特异性LNP-mRNA疫苗的免疫效果和保护效力 | SARS-CoV-2病毒变异株(野生型、B.1.351、B.1.617) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,BCR-seq,TCR-seq,中和抗体检测 | 动物模型 | 基因表达数据,免疫受体序列数据 | 动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,免疫受体测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-07 |
Immunostimulatory Cancer-Associated Fibroblast Subpopulations Can Predict Immunotherapy Response in Head and Neck Cancer
2022-05-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3570
PMID:35262677
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定头颈癌中免疫刺激性癌症相关成纤维细胞亚群及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次在头颈癌中识别出能够预测PD-1抑制剂反应的特定癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示其功能机制 | 样本量较小(4例患者进行单细胞测序),需要更大规模研究验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚群在头颈癌免疫治疗反应中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序,体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 4例患者治疗前后配对样本(单细胞测序),28例患者队列(批量转录组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-07 |
β-Hydroxybutyrate suppresses colorectal cancer
2022-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04649-6
PMID:35477756
|
研究论文 | 本研究通过代谢物信号通路揭示了β-羟基丁酸通过Hcar2受体和Hopx转录调控因子抑制结直肠癌的机制 | 首次发现酮体BHB通过Hcar2/Hopx通路抑制肠道肿瘤发生,并提出单一代谢物干预可作为结直肠癌防治新策略 | 动物模型与人类临床样本的验证仍需进一步扩大样本量 | 探索代谢物信号通路在结直肠癌预防和治疗中的作用机制 | 自发性动物模型、癌症类器官、结直肠癌患者活检组织 | 癌症代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,饮食筛选,类器官培养 | 动物模型,类器官模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 结直肠癌患者活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
Urine Proteomics and Renal Single-Cell Transcriptomics Implicate Interleukin-16 in Lupus Nephritis
2022-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42023
PMID:34783463
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研究论文 | 通过尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学分析,揭示白细胞介素-16在狼疮性肾炎中的重要作用 | 首次结合纵向尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学,发现IL-16在狼疮性肾炎中的关键作用 | 样本量较小(30例患者),需要更大规模研究验证 | 探索狼疮性肾炎的新型生物标志物和治疗靶点 | 狼疮性肾炎患者和健康对照 | 生物信息学 | 狼疮性肾炎 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 30例狼疮性肾炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | NA |
| 18 | 2024-12-11 |
Multiscale PHATE identifies multimodal signatures of COVID-19
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01186-x
PMID:35228707
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiscale PHATE的方法,通过扫描数据的所有粒度级别来学习直接预测疾病结果的抽象生物特征 | 提出了Multiscale PHATE方法,结合扩散凝聚过程,能够在不同分辨率下分析数据拓扑结构,从而提取生物学见解 | NA | 开发一种能够处理复杂和高维数据的计算工具,以提取生物学见解 | COVID-19患者的细胞数据,包括5400万细胞来自168名住院患者 | 生物信息学 | COVID-19 | Multiscale PHATE, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) | NA | 细胞数据 | 5400万细胞来自168名住院患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-11-13 |
Myoblast deactivation within engineered human skeletal muscle creates a transcriptionally heterogeneous population of quiescent satellite-like cells
2022-05, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 研究优化了在体外培养的人工骨骼肌组织中使人类肌原细胞失活的方法,形成了一种转录异质性的静止卫星细胞群 | 首次在体外人工骨骼肌环境中成功模拟了静止卫星细胞的形成,并利用单细胞RNA测序技术揭示了其转录组变化 | 研究主要集中在体外实验,尚未在体内验证其效果 | 探索在体外人工骨骼肌环境中形成静止卫星细胞的方法,为研究人类肌肉再生和疾病相关的卫星细胞功能障碍提供平台 | 人类肌原细胞和人工骨骼肌组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个肌原细胞样本和人工骨骼肌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-09-28 |
Deconvolution of the hematopoietic stem cell microenvironment reveals a high degree of specialization and conservation
2022-May-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104225
PMID:35494238
|
研究论文 | 本文开发了一种定制的生物信息学管道,整合了公共和专有的单细胞RNA测序数据,以揭示造血干细胞微环境的复杂性和特异性 | 首次鉴定了14种中间细胞状态和11个分化阶段,提供了迄今为止最全面的鼠类造血干细胞调节微环境描述,并推测了人类和鼠类之间微环境调节的保守特征 | NA | 理解正常和恶性人类造血的调控机制 | 造血干细胞的调节微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |