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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-08 |
Are TEMs Canceled? Questioning the Functional Relevance of Tie2-Expressing Macrophages
2022-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0330
PMID:35373288
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研究论文 | 本文探讨了Tie2表达的单核细胞/巨噬细胞(TEM)在肿瘤生长和进展中的功能相关性 | 通过使用骨髓特异性删除Tie2受体和单细胞RNA测序数据的综合分析,提供了有力的数据表明Tie2阳性巨噬细胞并不参与肿瘤血管生成或化疗后的复发 | NA | 挑战Tie2表达的单核细胞/巨噬细胞(TEM)在肿瘤生长和进展中的功能重要性 | Tie2表达的单核细胞/巨噬细胞(TEM)在肿瘤生长和进展中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
142 | 2024-08-08 |
Subtyping of microsatellite stability colorectal cancer reveals guanylate binding protein 2 (GBP2) as a potential immunotherapeutic target
2022-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004302
PMID:35383115
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研究论文 | 本研究通过无监督聚类将微卫星稳定结直肠癌患者分为免疫类和非免疫类,并探讨了鸟苷酸结合蛋白2(GBP2)在免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次报道了GBP2与微卫星稳定结直肠癌免疫监视和免疫治疗的相关性,并发现GBP2表达与免疫类结直肠癌的关联 | NA | 探讨微卫星稳定结直肠癌的免疫异质性及GBP2作为免疫检查点阻断疗法联合治疗靶点的潜力 | 微卫星稳定结直肠癌患者及GBP2在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组织化学(mIHC)、单细胞测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 1424名微卫星稳定结直肠癌患者 |
143 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics reveals antiparasitic targets associated with essential behaviors in the human parasite Brugia malayi
2022-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010399
PMID:35390105
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研究论文 | 本文采用空间转录组学方法,研究了人类寄生虫布鲁加马来丝虫(Brugia malayi)头部组织中的基因表达模式,以揭示与寄生虫基本行为相关的抗寄生虫靶点。 | 首次应用空间转录组学技术于布鲁加马来丝虫的头部组织,揭示了新的药物和疫苗靶点。 | NA | 开发针对淋巴丝虫病(LF)的有效成虫杀虫剂,并探索新的抗丝虫药物和疫苗靶点。 | 布鲁加马来丝虫的头部组织,特别是控制寄生虫摄食、感觉、分泌和生殖行为的组织。 | 数字病理学 | 热带病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 超过6000万人受淋巴丝虫病影响 |
144 | 2024-08-08 |
Hepatocellular carcinoma-infiltrating γδ T cells are functionally defected and allogenic Vδ2+ γδ T cell can be a promising complement
2022-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.800
PMID:35390227
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研究论文 | 研究肝细胞癌(HCC)中浸润的γδ T细胞的功能缺陷状态,并探讨同种异体Vδ2+ γδ T细胞作为补充疗法的潜力 | 首次揭示了HCC微环境中γδ T细胞的功能缺陷特征,并证明了同种异体Vδ2 γδ T细胞在HCC细胞疗法中的应用潜力 | NA | 解析肝细胞癌中浸润的γδ T细胞的免疫景观和功能状态,为同种异体Vδ2 γδ T细胞在HCC免疫治疗中的应用提供基础证据 | 肝细胞癌中的γδ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 来自肝细胞癌肿瘤和健康供体肝脏的γδ T细胞 |
145 | 2024-08-08 |
Fate mapping and scRNA sequencing reveal origin and diversity of lymph node stromal precursors
2022-04-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.03.002
PMID:35358427
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组分析,揭示了淋巴结间质前体的起源和多样性 | 首次确定了淋巴结间质和内皮祖细胞的起源,并展示了间质多样性在淋巴结发育早期就已开始 | NA | 确定淋巴结间质和内皮祖细胞的起源、转录谱和组成 | 淋巴结间质细胞和内皮祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
146 | 2024-08-08 |
Neutrophils direct preexisting matrix to initiate repair in damaged tissues
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01166-6
PMID:35354953
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研究论文 | 本文通过标记小鼠腹膜、肝脏和盲肠周围的细胞外基质,展示了预先存在的基质如何在不同损伤模型中跨器官转移到伤口中,并探讨了这一过程对组织愈合的影响。 | 首次揭示了中性粒细胞依赖HSF-整合素AM/B2-kindlin3通路转移预先存在的基质,这一发现为减少多种条件下瘢痕形成提供了治疗窗口。 | NA | 探究内部器官在受伤后如何通过新的结缔组织进行愈合,并阐明其中的细胞和分子事件。 | 小鼠的腹膜、肝脏和盲肠在受伤后的愈合过程。 | NA | NA | 蛋白质组学、遗传谱系追踪、选择性损伤、单细胞RNA测序、遗传和化学筛选。 | NA | 细胞外基质、RNA序列。 | 小鼠模型。 |
147 | 2024-08-08 |
Genetic instability from a single S phase after whole-genome duplication
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04578-4
PMID:35355016
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研究论文 | 本文研究了人类细胞在全基因组复制后第一个S期中的DNA损伤情况及其机制 | 首次揭示了四倍体细胞在第一个间期中DNA复制动力学受到干扰,导致DNA复制不足和过度复制区域的出现 | NA | 探讨全基因组复制后四倍体细胞在第一个间期中的遗传不稳定性及其对肿瘤发生的影响 | 人类细胞在全基因组复制后的DNA复制过程 | NA | 癌症 | DNA梳理和单细胞测序 | NA | DNA | NA |
148 | 2024-08-08 |
Training can't always lead to Olympic macrophages
2022-04-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI158468
PMID:35362477
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研究论文 | 本研究通过结合体外训练免疫模型与单细胞RNA测序,探讨了训练免疫诱导后人类单核细胞的异质性 | 首次详细描述了训练免疫诱导后单核细胞的三种不同转录组特征,并发现淋巴细胞在单核细胞微环境中的存在显著影响训练免疫 | 细胞和分子机制的理解尚不完全,需要进一步深入分析 | 探讨训练免疫诱导后免疫细胞的异质性及其在疾病治疗中的潜在应用 | 人类单核细胞及其在训练免疫中的表现 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种人类疾病或接种卡介苗个体的单核细胞 |
149 | 2024-08-08 |
Non-linear archetypal analysis of single-cell RNA-seq data by deep autoencoders
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010025
PMID:35363784
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研究论文 | 本文介绍了一种基于深度自编码器的单细胞非线性原型分析方法scAAnet,用于识别基因表达程序并推断其在细胞间的相对活性 | scAAnet通过引入基于计数分布的损失项和原型约束,能够处理原始计数数据的稀疏性和过度分散性,并提取生物学上有意义的基因表达程序 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序数据发现细胞类型间的连续状态和共享的基因表达程序 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 使用了公开的单细胞RNA测序数据集,包括胰腺胰岛数据集、肺特发性肺纤维化数据集和前额叶皮质数据集 |
150 | 2024-08-08 |
Chaperone-mediated autophagy plays an important role in regulating retinal progenitor cell homeostasis
2022-04-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02809-z
PMID:35365237
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研究论文 | 研究IFITM3在鼠神经视网膜祖细胞中的功能及其调控机制 | 发现IFITM3通过伴侣介导的自噬(CMA)而非巨自噬(MA)调节鼠神经视网膜祖细胞的存活和增殖 | NA | 探索IFITM3在鼠神经视网膜祖细胞中的功能和调控机制 | 鼠神经视网膜祖细胞(mNRPCs) | NA | NA | 单细胞测序, RNA干扰, CCK-8检测, RNA-seq, 实时定量PCR, 免疫荧光检测, 蛋白质印迹, 自噬流检测 | NA | 单细胞测序数据, mRNA表达数据, 蛋白质水平数据 | NA |
151 | 2024-08-08 |
Genetic characteristics involving the PD-1/PD-L1/L2 and CD73/A2aR axes and the immunosuppressive microenvironment in DLBCL
2022-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004114
PMID:35365585
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和靶向深度测序探讨了弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中PD-1/PD-L1/L2和CD73/A2aR轴的遗传特征及其对免疫抑制微环境的影响 | 发现SP140是PD-L1的新型易位伙伴,并检测到PD-L1和PD-L2之间的新倒位,两者均导致PD-L1表达上调 | 未提及 | 研究DLBCL中PD-1/PD-L1/L2和CD73/A2aR轴的遗传特征及其对免疫抑制微环境的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的PD-1/PD-L1/L2和CD73/A2aR轴 | NA | 淋巴瘤 | 全外显子测序、靶向深度测序、RNA测序、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 未提及具体样本数量 |
152 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29366-6
PMID:35365629
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研究论文 | 本文通过单细胞和空间分析,揭示了结直肠癌中FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的相互作用 | 首次展示了结直肠癌中FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞在14个独立队列中的正相关性,并通过免疫荧光染色和空间转录组学验证了它们的紧密定位 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中特定细胞类型的组成及其潜在起源和调控机制 | 结直肠癌中的FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | 细胞, 组织 | 54,103个细胞, 2550个样本 |
153 | 2024-08-08 |
Defining the early stages of intestinal colonisation by whipworms
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29334-0
PMID:35365634
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研究论文 | 研究鞭虫在宿主肠道早期定植的过程 | 首次使用Trichuris muris感染小鼠和鼠类盲肠类器官作为体外鞭虫感染和活体蠕虫的器官模型,揭示了鞭虫侵入肠道上皮的过程和宿主-寄生虫相互作用 | NA | 探究鞭虫如何侵入宿主上皮并建立感染 | 鞭虫的早期感染事件 | NA | 慢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠盲肠样本 |
154 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human bone-marrow-derived mesenchymal stem cells and functional subpopulation identification
2022-04, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00749-5
PMID:35365767
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析人类骨髓来源的间充质干细胞(MSCs),并识别其功能性亚群 | 首次通过scRNA-seq技术揭示了MSCs的三个主要亚群及其发育轨迹,为MSCs的生物学特性和临床应用提供了新的见解 | 研究样本可能受不同供体和不同传代次数的影响,需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 识别MSCs的亚群并阐明它们之间的关系,以促进其在临床中的应用 | 人类骨髓来源的间充质干细胞及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
155 | 2024-08-08 |
pRB-Depleted Pluripotent Stem Cell Retinal Organoids Recapitulate Cell State Transitions of Retinoblastoma Development and Suggest an Important Role for pRB in Retinal Cell Differentiation
2022-04-29, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac008
PMID:35325233
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研究论文 | 本文通过建立两种疾病模型,研究了视网膜母细胞瘤(Rb)发展过程中的细胞状态转变,并探讨了pRB在视网膜细胞分化中的重要作用。 | 本文首次使用pRB耗竭的人胚胎干细胞系和患者特异性诱导多能干细胞系建立视网膜类器官模型,揭示了pRB在视网膜细胞分化中的关键作用,并发现了Rb样簇和新的细胞标记物。 | NA | 研究视网膜母细胞瘤发展过程中的细胞状态转变及其机制。 | 视网膜母细胞瘤的细胞状态转变和pRB在视网膜细胞分化中的作用。 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了pRB耗竭的人胚胎干细胞系和患者特异性诱导多能干细胞系。 |
156 | 2024-08-08 |
One-step induction of photoreceptor-like cells from human iPSCs by delivering transcription factors
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103987
PMID:35330684
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研究论文 | 本文开发了一种新方法,通过引入转录因子CRX和NEUROD1,从人类诱导多能干细胞(iPSCs)中一步诱导生成类似光感受器的细胞(iPRCs) | 该方法简化了光感受器细胞的分化过程,从多步骤减少到一步,并成功生成了表达光感受器标记的iPRCs | NA | 开发一种简化的方法来生成光感受器细胞,以促进相关研究和疾病模型及药物发现的应用 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)和光感受器细胞(PRCs) | 干细胞研究 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
157 | 2024-08-08 |
Coupling of angiogenesis and odontogenesis orchestrates tooth mineralization in mice
2022-04-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211789
PMID:35319724
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研究论文 | 本文通过建立一种成像技术,以单细胞分辨率可视化小鼠牙齿血管的三维结构,并结合单细胞RNA测序,揭示了血管生成与牙生成在牙齿矿化过程中的耦合机制。 | 本文首次鉴定了一种独特的内皮细胞亚型——牙周尖端样内皮细胞,这些细胞在牙生成过程中表现出高度的血管生成活性和可塑性,并通过代谢组学分析证实了这些血管在牙生成中的磷酸盐输送作用。 | NA | 揭示血管生成与牙生成在牙齿矿化过程中的耦合机制。 | 小鼠牙齿的血管结构及其在牙生成中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 单细胞水平 |
158 | 2024-08-08 |
Markers of rejection of a lung allograft: state of the art
2022-04, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.2217/bmm-2021-1013
PMID:35315284
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综述 | 本文综述了用于发现肺移植排斥标志物的新兴和现有技术,包括表观遗传修饰和单细胞RNA测序 | 介绍了利用新技术如表观遗传修饰和单细胞RNA测序来发现新的生物标志物 | NA | 探讨早期诊断或预测慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)的生物标志物研究现状 | 肺移植排斥的生物标志物 | NA | 肺移植 | 表观遗传修饰、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
159 | 2024-08-08 |
New insights into Human Hematopoietic Stem and Progenitor Cells via Single-Cell Omics
2022-04, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-022-10330-2
PMID:35318612
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术深入研究了人类造血干细胞和祖细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序和多组学技术揭示了人类造血干细胞和祖细胞在发育过程中的不同分化路径,并发现了新的细胞群体 | NA | 探索造血干细胞和祖细胞在单细胞层面的广泛临床应用潜力 | 人类造血干细胞和祖细胞及其在疾病发展中的作用 | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序,多组学技术 | NA | 单细胞数据 | NA |
160 | 2024-08-08 |
Research Techniques Made Simple: Spatial Transcriptomics
2022-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.12.014
PMID:35331388
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综述 | 本文综述了空间转录组学(ST)方法,总结了数据分析方法,包括与单细胞转录组学数据的整合,并讨论了其在皮肤病学研究中的应用 | 空间转录组学技术保留了RNA分子在原位的空间上下文,使得能够在完整组织中定位细胞类型及其相关基因表达 | NA | 探讨空间转录组学技术在理解皮肤稳态和疾病中微环境模式和细胞间相互作用的应用 | 空间转录组学技术及其在皮肤病学研究中的应用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | NA |