单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Repurposing antiparasitic antimonials to noncovalently rescue temperature-sensitive p53 mutations
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110622
PMID:35417717
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研究论文 | 本文旨在通过筛选温度敏感的p53突变体，利用抗寄生虫药物钾锑酒石酸盐（PAT）进行药理学救援，以热稳定性作为化合物筛选的指标 | 首次发现抗寄生虫药物PAT能够通过非共价结合稳定代表性的温度敏感突变体p53-V272M，并显示出抗肿瘤活性 | NA | 探索利用抗寄生虫药物治疗特定p53突变型癌症的可能性 | 温度敏感的p53突变体及相关的癌症细胞 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 815个常见的p53错义突变中筛选出65个潜在可治疗的突变 |
| 122 | 2024-08-08 |
Clinicopathological value of the upregulation of cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2 in osteosarcoma
2022-04-11, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01234-8
PMID:35410253
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研究论文 | 本研究探讨了细胞周期依赖性激酶调节亚单位2（CKS2）在骨肉瘤（OS）中的临床病理价值 | 首次通过多种技术手段证实了CKS2在骨肉瘤组织中的上调表达，并分析了其与临床病理参数的关系 | 尽管研究显示CKS2在骨肉瘤中的表达上调，但Kaplan-Meier曲线未显示出高CKS2表达组与低CKS2表达组在总体生存率上的显著差异 | 研究CKS2在骨肉瘤中的表达及其对临床病理参数的影响 | 骨肉瘤组织和非肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC） | NA | 组织微阵列数据 | 217例骨肉瘤样本和87例非肿瘤样本 |
| 123 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing coupled to TCR profiling of large granular lymphocyte leukemia T cells
2022-04-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29175-x
PMID:35411048
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序结合TCR分析，探讨了T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）在阿仑单抗治疗前后的变化 | 首次展示了T-LGLL中效应记忆T细胞的普遍存在以及T细胞受体（TCR）多样性的丧失，并揭示了治疗前后细胞凋亡基因表达的变化 | NA | 探究T-LGLL的病理生理机制及阿仑单抗治疗的效果 | T-LGLL患者的CD3 T细胞 | 数字病理学 | 淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序，TCR分析 | NA | RNA序列数据 | 13名患者 |
| 124 | 2024-08-08 |
Tracking down tumor-specific T cells
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.007
PMID:35413268
|
research paper | 本文通过两篇发表在《Cancer Cell》上的论文，展示了如何利用单细胞测序技术定义识别肿瘤特异性T细胞的分子表型 | 利用单细胞测序技术定义肿瘤特异性T细胞的分子表型 | NA | 研究如何通过单细胞测序技术识别肿瘤特异性T细胞 | 肿瘤特异性T细胞 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 分子表型数据 | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiles of neoantigen-reactive T cells in human gastrointestinal cancers
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.005
PMID:35413272
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研究论文 | 本研究通过免疫筛选与单细胞RNA测序相结合的方法，分析了胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 发现了新生抗原反应性CD8 T细胞和CD4 T细胞在胃肠道癌症中表现出独特的转录组特征，这些特征可能为利用这些细胞进行治疗提供新的机会 | NA | 研究胃肠道癌症中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中的新生抗原反应性T细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胆管癌和胰腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 126 | 2024-08-08 |
Neoantigen-specific CD4+ T cells in human melanoma have diverse differentiation states and correlate with CD8+ T cell, macrophage, and B cell function
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.006
PMID:35413271
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体序列，识别了浸润人黑色素瘤的肿瘤特异性CD4 T细胞的特征及其功能相关性 | 首次详细描述了肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的多样分化状态及其与CD8 T细胞、巨噬细胞和B细胞功能的关联 | NA | 探究肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的作用及其与免疫细胞功能的关联 | 人黑色素瘤中的肿瘤特异性CD4 T细胞及其功能相关性 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Cells from Degenerating and Non-Degenerating Intervertebral Discs from the Same Individual Reveals New Biomarkers for Intervertebral Disc Degeneration
2022-Apr-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073993
PMID:35409356
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析技术，从同一患者的退变和非退变椎间盘组织中鉴定出新的细胞特异性生物标志物，并定义了不同细胞群 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了退变和非退变椎间盘细胞的功能差异，并发现了与细胞类型和退变状态相关的分子功能、生物过程和转录因子 | NA | 鉴定新的椎间盘退变生物标志物，以改善诊断和治疗选项 | 退变和非退变的人类椎间盘细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自同一患者的退变和非退变椎间盘组织 |
| 128 | 2024-08-08 |
DNMT3A-dependent DNA methylation is required for spermatogonial stem cells to commit to spermatogenesis
2022-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01040-z
PMID:35410378
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研究论文 | 本文研究了DNA甲基化在精子发生中的作用，特别是DNMT3A依赖的DNA甲基化对精原干细胞（SSC）分化和精子发生的影响。 | 首次揭示了DNMT3A在精原干细胞中广泛甲基化基因组的作用，以及其对SSC可塑性的控制。 | NA | 探讨DNA甲基化在男性生育中的关键作用，特别是精原干细胞分化和终身精子发生供应的表观遗传编程。 | 精原干细胞（SSC）和精子发生过程中的DNA甲基化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序和染色质状态分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Mapping human haematopoietic stem cells from haemogenic endothelium to birth
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04571-x
PMID:35418685
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研究论文 | 本文通过创建单细胞转录组图谱，追踪了人类造血干细胞（HSCs）从胚胎早期到出生的发育过程 | 首次详细描述了HSCs在不同造血部位的成熟过程，并识别了区分HSCs与前体细胞的特定基因标记 | NA | 研究人类造血干细胞的发育过程及其分子机制 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从胚胎早期到出生的多个造血组织样本 |
| 130 | 2024-08-08 |
Correction to 'STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing'
2022-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac254
PMID:35390158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies a migratory keratinocyte subpopulation expressing THBS1 in epidermal wound healing
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104130
PMID:35391830
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了在表皮伤口愈合过程中表达THBS1的迁移性角质形成细胞亚群。 | 首次发现LPA通过RHO/ROCK-SRF信号通路诱导表达THBS1的角质形成细胞亚群分化，并揭示了THBS1在角质形成细胞迁移中的作用。 | NA | 探究角质形成细胞分化及其在表皮伤口愈合中的作用机制。 | 人类角质形成细胞及小鼠伤口皮肤中的角质形成细胞亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类角质形成细胞和小鼠伤口皮肤样本 |
| 132 | 2024-08-08 |
Single cell enhancer activity distinguishes GABAergic and cholinergic lineages in embryonic mouse basal ganglia
2022-04-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2108760119
PMID:35377797
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研究论文 | 本研究结合增强子标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，在胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中区分和描绘神经元谱系的特化过程 | 本研究展示了scRNA-seq与基于增强子的标记相结合，解析小鼠大脑发育中复杂的神经元特化路径的能力 | NA | 本研究旨在描绘和区分胚胎期小鼠基底神经节的神经元谱系特化过程 | 研究对象包括小鼠胚胎期的内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的神经元谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的多个神经元群体 |
| 133 | 2024-08-08 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞，识别了细胞类型特异性的cis-eQTL和trans-eQTL，并探讨了这些eQTL在自身免疫疾病中的作用 | 首次结合遗传流行病学与单细胞RNA测序技术，揭示了免疫系统中个体间变异的主要驱动因素 | NA | 研究细胞类型特异性的遗传调控对自身免疫疾病的影响 | 外周血单个核细胞的基因表达及其在自身免疫疾病中的作用 | 遗传学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞 |
| 134 | 2024-08-08 |
Population genetics meets single-cell sequencing
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abq0426
PMID:35389792
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在理解人类疾病遗传基础中的应用 | 结合群体遗传学与单细胞测序技术，探索疾病的遗传机制 | NA | 研究单细胞测序技术在揭示人类疾病遗传基础中的作用 | 人类疾病的遗传基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Intranasal delivery of a small-molecule ErbB inhibitor promotes recovery from acute and late-stage CNS inflammation
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154824
PMID:35393953
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研究论文 | 研究通过鼻内递送小分子ErbB抑制剂afatinib，探讨其在急性及晚期中枢神经系统（CNS）炎症中的治疗效果 | 结合CNS单细胞转录组数据和小分子筛选，发现并验证了afatinib通过阻断ErbB信号通路，有效减轻炎症性星形胶质细胞极化并促进组织再生功能 | NA | 探索治疗急性及晚期CNS炎症的新疗法 | 多发性硬化症（MS）及其动物模型中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类原代星形胶质细胞 |
| 136 | 2024-08-08 |
Stanniocalcin 1 promotes metastasis, lipid metabolism and cisplatin chemoresistance via the FOXC2/ITGB6 signaling axis in ovarian cancer
2022-Apr-07, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02315-3
PMID:35392966
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研究论文 | 本文研究了抑钙素1（STC1）在卵巢癌中的作用，特别是其在转移、脂质代谢和顺铂（DDP）化疗耐药性中的作用及其机制。 | 首次揭示了STC1通过FOXC2/ITGB6信号轴促进卵巢癌的转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性。 | NA | 探讨STC1在卵巢癌中的功能及其在转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性中的作用机制。 | 卵巢癌组织及其转移组织，以及相关的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和免疫组化分析 | NA | 组织样本 | 包括卵巢癌组织、邻近癌组织和腹膜转移组织 |
| 137 | 2024-08-08 |
A universal deep neural network for in-depth cleaning of single-cell RNA-Seq data
2022-04-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29576-y
PMID:35393428
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research paper | 本文设计并开发了AutoClass模型，集成自编码器和分类器两个深度神经网络组件，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | AutoClass模型不依赖特定数据分布假设，能有效清理多种噪声和伪影，且在多个单细胞RNA测序数据分析中表现优于现有方法 | NA | 开发一种通用的深度神经网络模型，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据中的噪声和伪影 | machine learning | NA | scRNA-Seq | deep neural network | RNA-Seq data | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Type 2 immune polarization is associated with cardiopulmonary disease in preterm infants
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz8454
PMID:35385341
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研究论文 | 研究分析了早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系 | 首次详细描述了2型免疫极化在早产儿心肺疾病中的作用，并探讨了多种治疗干预的可能性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系，并寻找可能的治疗方法 | 早产儿及其心肺疾病 | 免疫学 | 心肺疾病 | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 51名早产儿，20名健康足月婴儿，5名健康成人 |
| 139 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of the ventral posterolateral nucleus-enriched thalamic regions from HSV-1-infected mice reveal a novel microglia/microglia-like transcriptional response
2022-Apr-06, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02437-7
PMID:35387656
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中CD11b+免疫细胞的转录反应，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应。 | 发现了一种新的微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应，这种反应与一个罕见的细胞群体相关，可能揭示了微胶质细胞对HSV-1感染的反应机制。 | NA | 旨在识别不同的微胶质细胞/类似微胶质细胞，并描述在单纯疱疹脑炎期间可能涉及的机制和信号通路。 | HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中的CD11b+免疫细胞，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞。 | 数字病理学 | 单纯疱疹脑炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从HSV-1感染的C57BL/6 N小鼠的背侧后侧核区域分离的细胞 |
| 140 | 2024-08-08 |
Elastic dosage compensation by X-chromosome upregulation
2022-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29414-1
PMID:35388014
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性分析，详细探讨了X染色体上调在哺乳动物发育过程中的动态及其对RNA水平的影响 | 揭示了X染色体上调在性别和谱系特异性中的弹性调节机制，并阐明了其在X染色体失活过程中的不同程度的作用 | NA | 探讨X染色体上调与X染色体失活之间的调控联系及其在哺乳动物剂量补偿中的作用 | X染色体上调的动态及其对RNA水平的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析 | NA | RNA | NA |