单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiles of neoantigen-reactive T cells in human gastrointestinal cancers
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.005
PMID:35413272
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研究论文 | 本研究通过免疫筛选与单细胞RNA测序相结合的方法，分析了胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 发现了新生抗原反应性CD8 T细胞和CD4 T细胞在胃肠道癌症中表现出独特的转录组特征，这些特征可能为利用这些细胞进行治疗提供新的机会 | NA | 研究胃肠道癌症中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中的新生抗原反应性T细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胆管癌和胰腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 122 | 2024-08-08 |
Neoantigen-specific CD4+ T cells in human melanoma have diverse differentiation states and correlate with CD8+ T cell, macrophage, and B cell function
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.006
PMID:35413271
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体序列，识别了浸润人黑色素瘤的肿瘤特异性CD4 T细胞的特征及其功能相关性 | 首次详细描述了肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的多样分化状态及其与CD8 T细胞、巨噬细胞和B细胞功能的关联 | NA | 探究肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的作用及其与免疫细胞功能的关联 | 人黑色素瘤中的肿瘤特异性CD4 T细胞及其功能相关性 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Cells from Degenerating and Non-Degenerating Intervertebral Discs from the Same Individual Reveals New Biomarkers for Intervertebral Disc Degeneration
2022-Apr-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073993
PMID:35409356
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析技术，从同一患者的退变和非退变椎间盘组织中鉴定出新的细胞特异性生物标志物，并定义了不同细胞群 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了退变和非退变椎间盘细胞的功能差异，并发现了与细胞类型和退变状态相关的分子功能、生物过程和转录因子 | NA | 鉴定新的椎间盘退变生物标志物，以改善诊断和治疗选项 | 退变和非退变的人类椎间盘细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自同一患者的退变和非退变椎间盘组织 |
| 124 | 2024-08-08 |
DNMT3A-dependent DNA methylation is required for spermatogonial stem cells to commit to spermatogenesis
2022-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01040-z
PMID:35410378
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研究论文 | 本文研究了DNA甲基化在精子发生中的作用，特别是DNMT3A依赖的DNA甲基化对精原干细胞（SSC）分化和精子发生的影响。 | 首次揭示了DNMT3A在精原干细胞中广泛甲基化基因组的作用，以及其对SSC可塑性的控制。 | NA | 探讨DNA甲基化在男性生育中的关键作用，特别是精原干细胞分化和终身精子发生供应的表观遗传编程。 | 精原干细胞（SSC）和精子发生过程中的DNA甲基化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序和染色质状态分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Mapping human haematopoietic stem cells from haemogenic endothelium to birth
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04571-x
PMID:35418685
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研究论文 | 本文通过创建单细胞转录组图谱，追踪了人类造血干细胞（HSCs）从胚胎早期到出生的发育过程 | 首次详细描述了HSCs在不同造血部位的成熟过程，并识别了区分HSCs与前体细胞的特定基因标记 | NA | 研究人类造血干细胞的发育过程及其分子机制 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从胚胎早期到出生的多个造血组织样本 |
| 126 | 2024-08-08 |
Correction to 'STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing'
2022-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac254
PMID:35390158
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies a migratory keratinocyte subpopulation expressing THBS1 in epidermal wound healing
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104130
PMID:35391830
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了在表皮伤口愈合过程中表达THBS1的迁移性角质形成细胞亚群。 | 首次发现LPA通过RHO/ROCK-SRF信号通路诱导表达THBS1的角质形成细胞亚群分化，并揭示了THBS1在角质形成细胞迁移中的作用。 | NA | 探究角质形成细胞分化及其在表皮伤口愈合中的作用机制。 | 人类角质形成细胞及小鼠伤口皮肤中的角质形成细胞亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类角质形成细胞和小鼠伤口皮肤样本 |
| 128 | 2024-08-08 |
Single cell enhancer activity distinguishes GABAergic and cholinergic lineages in embryonic mouse basal ganglia
2022-04-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2108760119
PMID:35377797
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研究论文 | 本研究结合增强子标记和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，在胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中区分和描绘神经元谱系的特化过程 | 本研究展示了scRNA-seq与基于增强子的标记相结合，解析小鼠大脑发育中复杂的神经元特化路径的能力 | NA | 本研究旨在描绘和区分胚胎期小鼠基底神经节的神经元谱系特化过程 | 研究对象包括小鼠胚胎期的内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的神经元谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 胚胎期11.5天的小鼠内侧、外侧和尾侧神经节隆起（MGE、LGE和CGE）中的多个神经元群体 |
| 129 | 2024-08-08 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞，识别了细胞类型特异性的cis-eQTL和trans-eQTL，并探讨了这些eQTL在自身免疫疾病中的作用 | 首次结合遗传流行病学与单细胞RNA测序技术，揭示了免疫系统中个体间变异的主要驱动因素 | NA | 研究细胞类型特异性的遗传调控对自身免疫疾病的影响 | 外周血单个核细胞的基因表达及其在自身免疫疾病中的作用 | 遗传学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 982名健康个体的1,267,758个外周血单个核细胞 |
| 130 | 2024-08-08 |
Population genetics meets single-cell sequencing
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abq0426
PMID:35389792
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在理解人类疾病遗传基础中的应用 | 结合群体遗传学与单细胞测序技术，探索疾病的遗传机制 | NA | 研究单细胞测序技术在揭示人类疾病遗传基础中的作用 | 人类疾病的遗传基础 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Intranasal delivery of a small-molecule ErbB inhibitor promotes recovery from acute and late-stage CNS inflammation
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154824
PMID:35393953
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研究论文 | 研究通过鼻内递送小分子ErbB抑制剂afatinib，探讨其在急性及晚期中枢神经系统（CNS）炎症中的治疗效果 | 结合CNS单细胞转录组数据和小分子筛选，发现并验证了afatinib通过阻断ErbB信号通路，有效减轻炎症性星形胶质细胞极化并促进组织再生功能 | NA | 探索治疗急性及晚期CNS炎症的新疗法 | 多发性硬化症（MS）及其动物模型中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类原代星形胶质细胞 |
| 132 | 2024-08-08 |
Stanniocalcin 1 promotes metastasis, lipid metabolism and cisplatin chemoresistance via the FOXC2/ITGB6 signaling axis in ovarian cancer
2022-Apr-07, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02315-3
PMID:35392966
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研究论文 | 本文研究了抑钙素1（STC1）在卵巢癌中的作用，特别是其在转移、脂质代谢和顺铂（DDP）化疗耐药性中的作用及其机制。 | 首次揭示了STC1通过FOXC2/ITGB6信号轴促进卵巢癌的转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性。 | NA | 探讨STC1在卵巢癌中的功能及其在转移、脂质代谢和顺铂化疗耐药性中的作用机制。 | 卵巢癌组织及其转移组织，以及相关的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和免疫组化分析 | NA | 组织样本 | 包括卵巢癌组织、邻近癌组织和腹膜转移组织 |
| 133 | 2024-08-08 |
A universal deep neural network for in-depth cleaning of single-cell RNA-Seq data
2022-04-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29576-y
PMID:35393428
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research paper | 本文设计并开发了AutoClass模型，集成自编码器和分类器两个深度神经网络组件，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | AutoClass模型不依赖特定数据分布假设，能有效清理多种噪声和伪影，且在多个单细胞RNA测序数据分析中表现优于现有方法 | NA | 开发一种通用的深度神经网络模型，用于深度清理单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据中的噪声和伪影 | machine learning | NA | scRNA-Seq | deep neural network | RNA-Seq data | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Type 2 immune polarization is associated with cardiopulmonary disease in preterm infants
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz8454
PMID:35385341
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研究论文 | 研究分析了早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系 | 首次详细描述了2型免疫极化在早产儿心肺疾病中的作用，并探讨了多种治疗干预的可能性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨早产儿中2型免疫极化与心肺疾病的关系，并寻找可能的治疗方法 | 早产儿及其心肺疾病 | 免疫学 | 心肺疾病 | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 51名早产儿，20名健康足月婴儿，5名健康成人 |
| 135 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of the ventral posterolateral nucleus-enriched thalamic regions from HSV-1-infected mice reveal a novel microglia/microglia-like transcriptional response
2022-Apr-06, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02437-7
PMID:35387656
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中CD11b+免疫细胞的转录反应，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应。 | 发现了一种新的微胶质细胞/类似微胶质细胞的转录反应，这种反应与一个罕见的细胞群体相关，可能揭示了微胶质细胞对HSV-1感染的反应机制。 | NA | 旨在识别不同的微胶质细胞/类似微胶质细胞，并描述在单纯疱疹脑炎期间可能涉及的机制和信号通路。 | HSV-1感染的小鼠背侧后侧核区域中的CD11b+免疫细胞，特别是微胶质细胞/类似微胶质细胞。 | 数字病理学 | 单纯疱疹脑炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从HSV-1感染的C57BL/6 N小鼠的背侧后侧核区域分离的细胞 |
| 136 | 2024-08-08 |
Elastic dosage compensation by X-chromosome upregulation
2022-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29414-1
PMID:35388014
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性分析，详细探讨了X染色体上调在哺乳动物发育过程中的动态及其对RNA水平的影响 | 揭示了X染色体上调在性别和谱系特异性中的弹性调节机制，并阐明了其在X染色体失活过程中的不同程度的作用 | NA | 探讨X染色体上调与X染色体失活之间的调控联系及其在哺乳动物剂量补偿中的作用 | X染色体上调的动态及其对RNA水平的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析 | NA | RNA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals aberrant stromal cells and heterogeneous endothelial cells in alcohol-induced osteonecrosis of the femoral head
2022-04-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03271-6
PMID:35388143
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索酒精诱导的股骨头坏死（ONFH）中期的和晚期的转录组图谱 | 发现了ONFH中基质细胞的成骨-脂肪分化紊乱以及MEF2C和JUND调控因子的改变，并报道了表达ACKR1的血管内皮细胞簇具有强烈的趋化性和较弱的血管生成能力 | NA | 揭示酒精诱导的股骨头坏死中单细胞转录组特征，以促进对ONFH发病机制的进一步研究 | 酒精诱导的股骨头坏死中的细胞 | 数字病理学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 年龄匹配的髋骨关节炎和股骨颈骨折样本作为对照 |
| 138 | 2024-08-08 |
In vivo base editing rescues cone photoreceptors in a mouse model of early-onset inherited retinal degeneration
2022-04-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29490-3
PMID:35383196
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研究论文 | 本文研究了通过腺嘌呤碱基编辑器（ABE）在体内修复Rpe65突变，以延长LCA小鼠模型中锥状光感受器的存活时间 | 首次展示了碱基编辑在体内修复Rpe65突变，延长锥状光感受器存活时间，并恢复视觉功能 | NA | 开发一种既能补偿RPE65功能丧失又能保护光感受器免受进一步退化的治疗方法 | LCA小鼠模型中的锥状光感受器 | 遗传学 | 视网膜退化 | 腺嘌呤碱基编辑器（ABE） | NA | 单细胞RNA测序 | LCA小鼠模型 |
| 139 | 2024-08-08 |
A targetable 'rogue' neutrophil-subset, [CD11b+DEspR+] immunotype, is associated with severity and mortality in acute respiratory distress syndrome (ARDS) and COVID-19-ARDS
2022-04-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-09343-1
PMID:35379853
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研究论文 | 本文研究了表达DEspR的CD11b+中性粒细胞亚群在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）和COVID-19相关ARDS中的作用及其与疾病严重程度和死亡率的关联 | 首次报道了DEspR+CD11b+中性粒细胞亚群在ARDS和COVID-19-ARDS中的显著关联，并展示了通过人源化抗DEspR-IgG4抗体诱导其凋亡的可能性 | NA | 探讨DEspR+CD11b+中性粒细胞亚群在ARDS和COVID-19-ARDS中的病理作用及其作为治疗靶点的潜力 | DEspR+CD11b+中性粒细胞亚群及其在ARDS和COVID-19-ARDS中的作用 | 免疫学 | 急性呼吸窘迫综合征 | scRNA-seq | NA | RNA | 包括ARDS和COVID-19-ARDS患者的肺组织样本及外周血中性粒细胞 |
| 140 | 2024-08-08 |
ACE2 and COVID-19 Susceptibility and Severity
2022-Apr, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2021.0805
PMID:35371596
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研究论文 | 本研究分析了肺部ACE2表达的群体特征，ACE2与COVID-19的孟德尔随机化研究，以及SARS-CoV-2的比较趋向性 | 通过整合多个COVID-19全基因组关联研究（GWAS）和ACE2的cis-表达数量性状位点（cis-eQTL），孟德尔随机化分析证明了ACE2在COVID-19易感性和严重性中的因果作用，并提出了ACE2作为早期COVID-19治疗的潜在目标 | NA | 探讨ACE2在COVID-19易感性和严重性中的作用，并分析SARS-CoV-2与其他呼吸病毒的趋向性 | 肺部ACE2表达，ACE2与COVID-19的关系，SARS-CoV-2的趋向性 | NA | COVID-19 | 孟德尔随机化（MR），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个COVID-19全基因组关联研究（GWAS）的群体，人类肺组织样本 |