单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2024-08-08	Single-Cell Sequencing: Ariadne's Thread in the Maze of Acute Myeloid Leukemia 2022-Apr-15, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics12040996 PMID:35454044	综述	本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病（AML）研究中的应用，揭示了其对AML克隆结构和突变历史的洞察	单细胞技术提供了AML克隆结构的新见解，揭示了从诊断、治疗到复发的突变历史	NA	探讨单细胞技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对疾病理解和治疗的影响	急性髓系白血病（AML）及其克隆结构和突变历史	数字病理学	血液肿瘤	单细胞测序	NA	基因组、转录组、表观遗传和蛋白质组数据	NA
102	2024-08-08	G-Protein Subunit Gamma 4 as a Potential Biomarker for Predicting the Response of Chemotherapy and Immunotherapy in Bladder Cancer 2022-04-14, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes13040693 PMID:35456499	研究论文	本文探讨了GNG4在膀胱癌中的表达及其作为预测化疗和免疫治疗反应的潜在生物标志物的作用	首次研究GNG4在膀胱癌中的作用及其作为指导化疗或免疫治疗标志物的潜力	NA	研究GNG4在膀胱癌治疗反应预测中的潜在作用	GNG4在膀胱癌中的表达及其与免疫细胞浸润和基因突变的关系	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	NA	RNA序列数据	七个膀胱癌队列
103	2024-08-08	Deciphering Cardiac Biology and Disease by Single-Cell Transcriptomic Profiling 2022-04-12, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom12040566 PMID:35454155	综述	本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了心脏中细胞的多样性和动态变化	通过识别细胞异质性、构建调控网络、构建谱系轨迹和绘制细胞间对话，深化了对心脏的理解	NA	介绍心脏前体细胞及其在胚胎发育中的转录调控，强调心脏健康与疾病中的细胞异质性和细胞亚型功能	心脏细胞的多样性和动态变化	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	数百至数百万个单细胞
104	2024-08-08	Novel Techniques and Future Perspective for Investigating Critical-Size Bone Defects 2022-Apr-11, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering9040171 PMID:35447731	综述	本文综述了研究关键尺寸骨缺损的当前动物模型和四种新颖分析技术	介绍了四种新技术：质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Luminex试剂，用于增强细胞分析、组织特异性成像、转录组详细分析和蛋白质分泌组全面分析	未具体提及	开发侵入性较小但同样有效的治疗选项，以促进骨桥接	关键尺寸骨缺损的愈合过程	NA	骨科疾病	质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Luminex试剂	NA	细胞、组织、转录组、蛋白质	未具体提及
105	2024-08-08	The macrophage: a key player in the pathophysiology of peripheral neuropathies 2022-Apr-16, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-022-02454-6 PMID:35429971	综述	本文综述了巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性的最新知识，特别关注了它们在周围神经系统中的作用及其与活性氧物种的相互作用。	利用命运图谱和单细胞转录组学等新技术，详细描述了组织驻留巨噬细胞在周围神经系统中的起源和命运，并深入理解了它们在周围神经病变中的功能。	NA	总结巨噬细胞在周围神经病变中的作用，并探讨针对特定巨噬细胞以减轻周围神经系统功能缺陷的潜在益处。	巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性，以及它们与活性氧物种的相互作用。	NA	周围神经病变	命运图谱、单细胞转录组学	NA	NA	NA
106	2024-08-08	Sphingolipids control dermal fibroblast heterogeneity 2022-04-15, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.abh1623 PMID:35420948	研究论文	本文通过结合高分辨率质谱成像和单细胞转录组学技术，测量了人类真皮成纤维细胞的脂质组和转录组，探讨了脂质代谢途径的细胞间变异对皮肤结构组织中细胞状态建立的影响。	首次展示了鞘脂组成如何定义成纤维细胞亚群，并揭示了鞘脂代谢重塑驱动细胞状态转变的机制。	NA	研究细胞间脂质异质性对多细胞系统自组织的影响。	人类真皮成纤维细胞的脂质组和转录组。	NA	NA	高分辨率质谱成像，单细胞转录组学	NA	脂质组，转录组	个体人类真皮成纤维细胞
107	2024-08-08	Redefining inflammatory macrophage phenotypes across stages and tissues by single-cell transcriptomics 2022-04-15, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abo4652 PMID:35427177	研究论文	通过单细胞转录组数据重新定义炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型	利用单细胞转录组技术揭示了单核细胞衍生巨噬细胞的主要激活路径，为炎症性组织巨噬细胞提供了一个框架	NA	研究炎症性巨噬细胞在不同阶段和组织中的表型	单核细胞衍生巨噬细胞及其在炎症组织中的激活路径	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组	NA	转录组数据	NA
108	2024-08-08	Interactive single-cell data analysis using Cellar 2022-04-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-29744-0 PMID:35422041	研究论文	本文介绍了一种名为Cellar的软件工具，用于支持单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较	Cellar提供交互式支持，能够统一分配细胞类型，并适用于不同的平台和数据类型	NA	开发一种软件工具，以改进跨大型联盟、平台和模式的细胞类型分配能力	单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较	生物信息学	NA	单细胞测序，空间蛋白质组学	NA	单细胞数据，空间数据	多个HuBMAP数据集
109	2024-08-08	Tissue-resident CD8+ T cells drive compartmentalized and chronic autoimmune damage against CNS neurons 2022-04-13, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abl6157 PMID:35417189	研究论文	研究探讨了中枢神经系统（CNS）自身免疫疾病的慢性机制，特别是组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用	发现了在CNS疾病中，组织驻留的CD8 T细胞通过特定的分化程序，维持局部神经炎症和渐进性神经元损失，这一过程依赖于CD4 T细胞	NA	揭示组织驻留CD8 T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用及其机制	组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用	免疫学	神经系统疾病	单细胞转录组学、高维度流式细胞术、组织病理学	NA	细胞	使用了人类自身免疫性脑炎和鼠模型中的样本
110	2024-08-08	Generation of resolving memory neutrophils through pharmacological training with 4-PBA or genetic deletion of TRAM 2022-04-13, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-022-04809-6 PMID:35418110	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，发现了一类具有促炎症消退特性的中性粒细胞亚群，并探讨了通过药物4-PBA或遗传删除TRAM分子来训练中性粒细胞进入消退状态的机制。	首次发现4-PBA能够有效训练中性粒细胞进入消退状态，并增强其吞噬和杀菌功能，同时揭示了这一过程的分子机制。	NA	研究中性粒细胞在促进炎症消退中的作用及其潜在的治疗应用。	中性粒细胞及其在炎症消退中的作用。	免疫学	炎症性疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
111	2024-08-08	Distinct phases of adult microglia proliferation: a Myc-mediated early phase and a Tnfaip3-mediated late phase 2022-Apr-12, Cell discovery IF:13.0Q1 DOI:10.1038/s41421-022-00377-3 PMID:35411038	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，揭示了在小鼠脊髓中由坐骨神经损伤诱导的两种不同阶段的微胶质细胞增殖，每种阶段具有不同的基因表达谱	首次阐明了成年微胶质细胞增殖的两个不同阶段，分别由Myc和Tnfaip3介导，并揭示了这两个阶段之间的相互作用	NA	探讨成年微胶质细胞增殖的机制及其在神经疾病中的作用	微胶质细胞在小鼠脊髓中的增殖过程	神经科学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化	NA	基因表达数据	小鼠脊髓样本
112	2024-08-08	An immune subtype-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis 2022-04-12, Aging DOI:10.18632/aging.204012 PMID:35413690	研究论文	本研究基于单细胞测序分析，将肝细胞癌分为免疫细胞和非免疫细胞亚型，并构建了一个与免疫亚型相关的肝细胞癌预后标志物模型	通过单细胞测序分析，发现了两种亚型中的差异表达基因，并利用这些基因构建了一个新的肝细胞癌预后模型	NA	探索肝细胞癌的免疫微环境，并构建一个准确的预后评估模型	肝细胞癌的免疫亚型及其预后标志物	数字病理学	肝癌	单细胞测序	Cox和Lasso回归模型	基因表达数据	使用GEO数据库中的GSE146115数据集
113	2024-08-08	Semantic clustering analysis of E3-ubiquitin ligases in gastrointestinal tract defines genes ontology clusters with tissue expression patterns 2022-Apr-12, BMC gastroenterology IF:2.5Q2 DOI:10.1186/s12876-022-02265-2 PMID:35413796	研究论文	本研究使用语义双聚类技术分析小鼠胃肠道中E3泛素连接酶及其相关基因的表达谱，揭示了基因本体簇及其组织表达模式	本研究采用优化的语义聚类协议，揭示了胃肠道特异性泛素连接酶及其相关基因的表达谱中的可读性和独特模式，扩展了我们对这些基因本体关系的认识	NA	研究旨在通过语义聚类分析改进和扩展泛素连接酶的功能分类	小鼠胃肠道中的E3泛素连接酶及其相关基因	NA	NA	语义双聚类技术，主成分分析（PCA），均匀流形近似和投影技术（UMAP）	NA	单细胞RNA测序数据	小鼠模型
114	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing of the retina in a model of retinitis pigmentosa reveals early responses to degeneration in rods and cones 2022-04-12, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-022-01280-9 PMID:35413909	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，在视网膜色素变性模型中分析了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的反应	首次在视网膜色素变性模型中使用单细胞RNA测序技术，揭示了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的动态变化	由于视网膜的异质性，检测早期锥状光感受器对杆状光感受器死亡的反应特别困难	研究视网膜色素变性中杆状和锥状光感受器的退化机制	视网膜色素变性模型中的杆状和锥状光感受器	数字病理学	视网膜疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	在视网膜色素变性小鼠模型rd10中进行研究
115	2024-08-08	Progenitor potential of lung epithelial organoid cells in a transplantation model 2022-04-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110662 PMID:35417699	研究论文	本研究探讨了肺上皮类器官细胞在移植模型中的祖细胞潜能	首次展示了肺祖细胞在移植后能够功能性植入，并维持其类器官形成能力	NA	研究肺祖细胞在移植后的功能性植入和再生能力	肺上皮类器官细胞，包括SCA1阴性状态富集的AT2细胞（SNO）和多潜能SCA1阳性祖细胞（SPO）	数字病理学	肺疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	移植到受损小鼠肺部的SNO和SPO细胞
116	2024-08-08	Brown adipose tissue involution associated with progressive restriction in progenitor competence 2022-04-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110575 PMID:35417710	研究论文	本文研究了人类棕色脂肪组织（BAT）的退化过程，发现这一过程与前体细胞的棕色脂肪生成能力丧失有关，并通过单细胞RNA测序揭示了FSTL1基因在BAT退化中的作用。	首次在兔子和人类中观察到BAT退化与前体细胞FSTL1表达减少的关系，并证实了FSTL1在维持BAT功能中的作用。	研究主要集中在兔子和老鼠模型上，对人类的直接应用可能有限。	探讨人类棕色脂肪组织退化的机制及其与前体细胞功能的关系。	人类和兔子的棕色脂肪组织及其前体细胞。	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
117	2024-08-08	Repurposing antiparasitic antimonials to noncovalently rescue temperature-sensitive p53 mutations 2022-04-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110622 PMID:35417717	研究论文	本文旨在通过筛选温度敏感的p53突变体，利用抗寄生虫药物钾锑酒石酸盐（PAT）进行药理学救援，以热稳定性作为化合物筛选的指标	首次发现抗寄生虫药物PAT能够通过非共价结合稳定代表性的温度敏感突变体p53-V272M，并显示出抗肿瘤活性	NA	探索利用抗寄生虫药物治疗特定p53突变型癌症的可能性	温度敏感的p53突变体及相关的癌症细胞	癌症研究	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	815个常见的p53错义突变中筛选出65个潜在可治疗的突变
118	2024-08-08	Clinicopathological value of the upregulation of cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2 in osteosarcoma 2022-04-11, BMC medical genomics IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s12920-022-01234-8 PMID:35410253	研究论文	本研究探讨了细胞周期依赖性激酶调节亚单位2（CKS2）在骨肉瘤（OS）中的临床病理价值	首次通过多种技术手段证实了CKS2在骨肉瘤组织中的上调表达，并分析了其与临床病理参数的关系	尽管研究显示CKS2在骨肉瘤中的表达上调，但Kaplan-Meier曲线未显示出高CKS2表达组与低CKS2表达组在总体生存率上的显著差异	研究CKS2在骨肉瘤中的表达及其对临床病理参数的影响	骨肉瘤组织和非肿瘤组织	数字病理学	骨肉瘤	免疫组织化学（IHC）	NA	组织微阵列数据	217例骨肉瘤样本和87例非肿瘤样本
119	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing coupled to TCR profiling of large granular lymphocyte leukemia T cells 2022-04-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-29175-x PMID:35411048	研究论文	研究通过单细胞RNA测序结合TCR分析，探讨了T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）在阿仑单抗治疗前后的变化	首次展示了T-LGLL中效应记忆T细胞的普遍存在以及T细胞受体（TCR）多样性的丧失，并揭示了治疗前后细胞凋亡基因表达的变化	NA	探究T-LGLL的病理生理机制及阿仑单抗治疗的效果	T-LGLL患者的CD3 T细胞	数字病理学	淋巴增生性疾病	单细胞RNA测序，TCR分析	NA	RNA序列数据	13名患者
120	2024-08-08	Tracking down tumor-specific T cells 2022-04-11, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.007 PMID:35413268	research paper	本文通过两篇发表在《Cancer Cell》上的论文，展示了如何利用单细胞测序技术定义识别肿瘤特异性T细胞的分子表型	利用单细胞测序技术定义肿瘤特异性T细胞的分子表型	NA	研究如何通过单细胞测序技术识别肿瘤特异性T细胞	肿瘤特异性T细胞	digital pathology	NA	单细胞测序	NA	分子表型数据	NA