单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Technique integration of single-cell RNA sequencing with spatially resolved transcriptomics in the tumor microenvironment
2022-Apr-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02580-4
PMID:35440049
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肿瘤微环境中的整合应用 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，以充分利用两者的优势，深入探索复杂的组织结构和相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序与空间转录组学整合方法在肿瘤微环境中的应用，特别是在细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 肿瘤微环境中的细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
Metacell-2: a divide-and-conquer metacell algorithm for scalable scRNA-seq analysis
2022-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02667-1
PMID:35440087
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研究论文 | 介绍了一种名为Metacell-2的递归分治算法，用于高效地将任何大小的单细胞RNA测序数据集分解成称为metacells的小而紧密的细胞群 | Metacell-2算法提高了异常细胞检测和稀有细胞类型识别的能力 | NA | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序分析方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分治算法 | 基因表达数据 | 涉及人类骨髓细胞图谱和鼠胚胎数据 |
| 103 | 2024-08-08 |
Endothelial progenitor cells stimulate neonatal lung angiogenesis through FOXF1-mediated activation of BMP9/ACVRL1 signaling
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29746-y
PMID:35440116
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研究论文 | 本文研究了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成的分子机制 | 首次揭示了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成和肺泡化的机制 | NA | 探究内皮祖细胞在新生肺血管生成中的作用及其分子机制 | 内皮祖细胞、FOXF1、BMP9、ACVRL1 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Foxf1突变小鼠和ACDMPV患者的肺组织 |
| 104 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of diffuse large B cell lymphoma
2022-04-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110713
PMID:35443163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本的94,324个细胞的转录组，揭示了恶性细胞中的73个基因表达程序和复杂的细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤的高度异质性和复杂的肿瘤微环境，特别是发现了B细胞淋巴瘤中恶性细胞与T细胞间的CD70-CD27共刺激相互作用 | NA | 深入理解B细胞淋巴瘤的发病机制，并为设计靶向免疫治疗策略提供新思路 | 弥漫大B细胞淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 94,324个细胞来自17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本 |
| 105 | 2024-08-08 |
Correction to: Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2022-Apr-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01564-2
PMID:35436930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Identification of Transcription Factors Regulating SARS-CoV-2 Tropism Factor Expression by Inferring Cell-Type-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Human Lungs
2022-04-17, Viruses
DOI:10.3390/v14040837
PMID:35458567
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研究论文 | 本研究通过计算方法识别调控SARS-CoV-2趋向性因子的转录因子，并构建了人类肺部细胞类型的特定转录调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序数据构建了健康捐赠者和COVID-19患者的SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络，并分析了转录因子在健康和感染网络中的差异调控作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人类肺部细胞中的趋向性因子表达的转录调控机制 | SARS-CoV-2趋向性因子的转录调控网络 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康捐赠者和COVID-19患者的肺部细胞 |
| 107 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing: Ariadne's Thread in the Maze of Acute Myeloid Leukemia
2022-Apr-15, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics12040996
PMID:35454044
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病（AML）研究中的应用，揭示了其对AML克隆结构和突变历史的洞察 | 单细胞技术提供了AML克隆结构的新见解，揭示了从诊断、治疗到复发的突变历史 | NA | 探讨单细胞技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对疾病理解和治疗的影响 | 急性髓系白血病（AML）及其克隆结构和突变历史 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观遗传和蛋白质组数据 | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
G-Protein Subunit Gamma 4 as a Potential Biomarker for Predicting the Response of Chemotherapy and Immunotherapy in Bladder Cancer
2022-04-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13040693
PMID:35456499
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研究论文 | 本文探讨了GNG4在膀胱癌中的表达及其作为预测化疗和免疫治疗反应的潜在生物标志物的作用 | 首次研究GNG4在膀胱癌中的作用及其作为指导化疗或免疫治疗标志物的潜力 | NA | 研究GNG4在膀胱癌治疗反应预测中的潜在作用 | GNG4在膀胱癌中的表达及其与免疫细胞浸润和基因突变的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 七个膀胱癌队列 |
| 109 | 2024-08-08 |
Deciphering Cardiac Biology and Disease by Single-Cell Transcriptomic Profiling
2022-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040566
PMID:35454155
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了心脏中细胞的多样性和动态变化 | 通过识别细胞异质性、构建调控网络、构建谱系轨迹和绘制细胞间对话，深化了对心脏的理解 | NA | 介绍心脏前体细胞及其在胚胎发育中的转录调控，强调心脏健康与疾病中的细胞异质性和细胞亚型功能 | 心脏细胞的多样性和动态变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数百至数百万个单细胞 |
| 110 | 2024-08-08 |
Novel Techniques and Future Perspective for Investigating Critical-Size Bone Defects
2022-Apr-11, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9040171
PMID:35447731
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综述 | 本文综述了研究关键尺寸骨缺损的当前动物模型和四种新颖分析技术 | 介绍了四种新技术：质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Luminex试剂，用于增强细胞分析、组织特异性成像、转录组详细分析和蛋白质分泌组全面分析 | 未具体提及 | 开发侵入性较小但同样有效的治疗选项，以促进骨桥接 | 关键尺寸骨缺损的愈合过程 | NA | 骨科疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Luminex试剂 | NA | 细胞、组织、转录组、蛋白质 | 未具体提及 |
| 111 | 2024-08-08 |
The macrophage: a key player in the pathophysiology of peripheral neuropathies
2022-Apr-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02454-6
PMID:35429971
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性的最新知识，特别关注了它们在周围神经系统中的作用及其与活性氧物种的相互作用。 | 利用命运图谱和单细胞转录组学等新技术，详细描述了组织驻留巨噬细胞在周围神经系统中的起源和命运，并深入理解了它们在周围神经病变中的功能。 | NA | 总结巨噬细胞在周围神经病变中的作用，并探讨针对特定巨噬细胞以减轻周围神经系统功能缺陷的潜在益处。 | 巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性，以及它们与活性氧物种的相互作用。 | NA | 周围神经病变 | 命运图谱、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Interactive single-cell data analysis using Cellar
2022-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29744-0
PMID:35422041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cellar的软件工具，用于支持单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | Cellar提供交互式支持，能够统一分配细胞类型，并适用于不同的平台和数据类型 | NA | 开发一种软件工具，以改进跨大型联盟、平台和模式的细胞类型分配能力 | 单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，空间蛋白质组学 | NA | 单细胞数据，空间数据 | 多个HuBMAP数据集 |
| 113 | 2024-08-08 |
Tissue-resident CD8+ T cells drive compartmentalized and chronic autoimmune damage against CNS neurons
2022-04-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl6157
PMID:35417189
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研究论文 | 研究探讨了中枢神经系统（CNS）自身免疫疾病的慢性机制，特别是组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 发现了在CNS疾病中，组织驻留的CD8 T细胞通过特定的分化程序，维持局部神经炎症和渐进性神经元损失，这一过程依赖于CD4 T细胞 | NA | 揭示组织驻留CD8 T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用及其机制 | 组织驻留记忆T细胞在慢性CNS自身免疫中的作用 | 免疫学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、高维度流式细胞术、组织病理学 | NA | 细胞 | 使用了人类自身免疫性脑炎和鼠模型中的样本 |
| 114 | 2024-08-08 |
Generation of resolving memory neutrophils through pharmacological training with 4-PBA or genetic deletion of TRAM
2022-04-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04809-6
PMID:35418110
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，发现了一类具有促炎症消退特性的中性粒细胞亚群，并探讨了通过药物4-PBA或遗传删除TRAM分子来训练中性粒细胞进入消退状态的机制。 | 首次发现4-PBA能够有效训练中性粒细胞进入消退状态，并增强其吞噬和杀菌功能，同时揭示了这一过程的分子机制。 | NA | 研究中性粒细胞在促进炎症消退中的作用及其潜在的治疗应用。 | 中性粒细胞及其在炎症消退中的作用。 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Distinct phases of adult microglia proliferation: a Myc-mediated early phase and a Tnfaip3-mediated late phase
2022-Apr-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00377-3
PMID:35411038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，揭示了在小鼠脊髓中由坐骨神经损伤诱导的两种不同阶段的微胶质细胞增殖，每种阶段具有不同的基因表达谱 | 首次阐明了成年微胶质细胞增殖的两个不同阶段，分别由Myc和Tnfaip3介导，并揭示了这两个阶段之间的相互作用 | NA | 探讨成年微胶质细胞增殖的机制及其在神经疾病中的作用 | 微胶质细胞在小鼠脊髓中的增殖过程 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脊髓样本 |
| 116 | 2024-08-08 |
An immune subtype-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2022-04-12, Aging
DOI:10.18632/aging.204012
PMID:35413690
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析，将肝细胞癌分为免疫细胞和非免疫细胞亚型，并构建了一个与免疫亚型相关的肝细胞癌预后标志物模型 | 通过单细胞测序分析，发现了两种亚型中的差异表达基因，并利用这些基因构建了一个新的肝细胞癌预后模型 | NA | 探索肝细胞癌的免疫微环境，并构建一个准确的预后评估模型 | 肝细胞癌的免疫亚型及其预后标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的GSE146115数据集 |
| 117 | 2024-08-08 |
Semantic clustering analysis of E3-ubiquitin ligases in gastrointestinal tract defines genes ontology clusters with tissue expression patterns
2022-Apr-12, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02265-2
PMID:35413796
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研究论文 | 本研究使用语义双聚类技术分析小鼠胃肠道中E3泛素连接酶及其相关基因的表达谱，揭示了基因本体簇及其组织表达模式 | 本研究采用优化的语义聚类协议，揭示了胃肠道特异性泛素连接酶及其相关基因的表达谱中的可读性和独特模式，扩展了我们对这些基因本体关系的认识 | NA | 研究旨在通过语义聚类分析改进和扩展泛素连接酶的功能分类 | 小鼠胃肠道中的E3泛素连接酶及其相关基因 | NA | NA | 语义双聚类技术，主成分分析（PCA），均匀流形近似和投影技术（UMAP） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of the retina in a model of retinitis pigmentosa reveals early responses to degeneration in rods and cones
2022-04-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01280-9
PMID:35413909
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在视网膜色素变性模型中分析了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的反应 | 首次在视网膜色素变性模型中使用单细胞RNA测序技术，揭示了杆状和锥状光感受器在早期退化过程中的动态变化 | 由于视网膜的异质性，检测早期锥状光感受器对杆状光感受器死亡的反应特别困难 | 研究视网膜色素变性中杆状和锥状光感受器的退化机制 | 视网膜色素变性模型中的杆状和锥状光感受器 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在视网膜色素变性小鼠模型rd10中进行研究 |
| 119 | 2024-08-08 |
Progenitor potential of lung epithelial organoid cells in a transplantation model
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110662
PMID:35417699
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研究论文 | 本研究探讨了肺上皮类器官细胞在移植模型中的祖细胞潜能 | 首次展示了肺祖细胞在移植后能够功能性植入，并维持其类器官形成能力 | NA | 研究肺祖细胞在移植后的功能性植入和再生能力 | 肺上皮类器官细胞，包括SCA1阴性状态富集的AT2细胞（SNO）和多潜能SCA1阳性祖细胞（SPO） | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 移植到受损小鼠肺部的SNO和SPO细胞 |
| 120 | 2024-08-08 |
Brown adipose tissue involution associated with progressive restriction in progenitor competence
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110575
PMID:35417710
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研究论文 | 本文研究了人类棕色脂肪组织（BAT）的退化过程，发现这一过程与前体细胞的棕色脂肪生成能力丧失有关，并通过单细胞RNA测序揭示了FSTL1基因在BAT退化中的作用。 | 首次在兔子和人类中观察到BAT退化与前体细胞FSTL1表达减少的关系，并证实了FSTL1在维持BAT功能中的作用。 | 研究主要集中在兔子和老鼠模型上，对人类的直接应用可能有限。 | 探讨人类棕色脂肪组织退化的机制及其与前体细胞功能的关系。 | 人类和兔子的棕色脂肪组织及其前体细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |