单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了胰腺导管细胞癌（PDAC）从原发部位向淋巴结转移过程中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的变化 | 提出了“进化侵袭水平（ELI）”框架，描述了基质侵袭性的进化，并发现了在PDAC进展的不同阶段，成纤维细胞亚群的显著变化 | NA | 探究胰腺导管细胞癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的角色和变化 | 胰腺导管细胞癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用Peng等人发表的单细胞RNA测序数据和The Cancer Genome Atlas中的大量RNAseq数据 |
| 62 | 2024-08-07 |
Profibrotic properties of C1q+ interstitial macrophages in silica-induced pulmonary fibrosis in mice
2022-04-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.02.037
PMID:35180470
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研究论文 | 研究探讨了C1q+间质巨噬细胞在硅尘诱导的小鼠肺纤维化中的促纤维化特性 | 首次揭示了间质巨噬细胞在肺纤维化中的具体作用，并提出了针对这些细胞的潜在治疗策略 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其潜在的治疗策略 | 硅尘诱导的小鼠肺纤维化模型中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 63 | 2024-08-07 |
Cellular heterogeneity of human fallopian tubes in normal and hydrosalpinx disease states identified using scRNA-seq
2022-04-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.02.017
PMID:35320732
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自正常和输卵管积水疾病状态的人类输卵管细胞的异质性 | 首次构建了包含12种主要细胞类型的输卵管细胞图谱，并识别出四种纤毛和六种非纤毛分泌上皮亚型 | 仅分析了四名健康和两名输卵管积水患者的样本，样本量有限 | 探究输卵管稳态在正常发育和疾病中的细胞异质性 | 人类输卵管细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 59,738个细胞来自四名健康受试者，17,798个细胞来自两名输卵管积水患者 |
| 64 | 2024-08-07 |
IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor
2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100439
PMID:35304419
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研究论文 | 本研究探讨了IL-22在早产中对母胎免疫的作用，发现IL-22 T细胞在早产妇女的母胎界面富集，并在体内外实验中展示了IL-22在早产中的双重作用：组织损伤和宿主防御。 | 首次展示了IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的富集，并通过体内外实验证实了IL-22在早产中的双重作用。 | 研究主要集中在小鼠模型和体外人系统，可能需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探讨IL-22在晚期妊娠中母胎免疫的作用及其在早产中的作用机制。 | IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的分布及其在早产中的作用。 | 免疫学 | 早产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及早产妇女和小鼠的母胎组织样本 |
| 65 | 2024-08-07 |
Neuroinflammation creates an immune regulatory niche at the meningeal lymphatic vasculature near the cribriform plate
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01158-6
PMID:35347285
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研究论文 | 研究发现在神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管通过淋巴管生成来排出多余液体，并可能获得改变的表型以调节免疫。 | 首次报道了神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管上调与抗原呈递相关的基因，如主要组织相容性复合体II类、粘附分子和免疫调节分子，形成一个免疫调节微环境。 | NA | 探讨神经炎症期间脑膜淋巴管在免疫调节中的作用。 | 健康和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中筛板附近的脑膜淋巴管。 | NA | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和EAE小鼠模型的脑膜淋巴管样本 |
| 66 | 2024-08-07 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
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研究论文 | 本文使用低温电子显微镜研究了由α4、β3和δ亚基组装的外突触GABAA受体的结构，以及包含γ2亚基的对应物，发现两种具有不同化学计量和排列的受体亚型，这些亚型与先前观察到的突触α1-包含受体不同 | 本文首次提供了结构和功能证据，表明选定的GABAR排列可以作为同时响应GABA和组胺两种神经递质的巧合检测器 | NA | 探讨GABAA受体的组装原理及其对GABA能信号传导的影响 | GABAA受体的结构和功能 | 神经科学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构数据 | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975
PMID:35395014
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研究论文 | 本文介绍了一种基于隐狄利克雷分配（LDA）的新方法，用于检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用相关基因变化 | 该方法不依赖于现有的生物学知识数据库，而是通过分析物理相互作用的细胞数据来检测基因表达变化 | 文章未明确提及该方法的局限性 | 开发一种新的方法来检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用 | 研究细胞间相互作用对基因表达的影响 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | LDA | 基因表达数据 | 涉及两个物理相互作用细胞的数据集和一个标准液滴法生成的数据集 |
| 68 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 69 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Infection Induces Ferroptosis of Sinoatrial Node Pacemaker Cells
2022-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320518
PMID:35255712
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，特别是通过仓鼠模型和人类胚胎干细胞（hESC）衍生的类似窦房结（SAN）起搏细胞进行研究。 | 本文首次展示了SARS-CoV-2可以直接感染心脏的主要起搏细胞，并诱导铁死亡，这是一种可能导致COVID-19患者心律失常的机制。 | 由于难以分离和培养人类SAN细胞，研究主要依赖于仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 探索SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，并寻找保护这些细胞免受感染的药物。 | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应、免疫染色、单细胞RNA测序和高含量化学筛选。 | NA | RNA | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 |
| 70 | 2024-08-07 |
ESR1 mutant breast cancers show elevated basal cytokeratins and immune activation
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29498-9
PMID:35440136
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
The purinergic P2Y14 receptor links hepatocyte death to hepatic stellate cell activation and fibrogenesis in the liver
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe5795
PMID:35385339
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研究论文 | 本文探讨了嘌呤能受体P2Y14在肝细胞死亡与肝星状细胞激活及纤维化中的作用 | 首次揭示了P2Y14受体及其配体在肝细胞死亡与肝纤维化之间的直接联系 | NA | 研究肝纤维化的机制及潜在的治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞及P2Y14受体 | NA | 肝病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 多个小鼠模型及人类样本 |
| 72 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomic reconstruction of the mouse olfactory glomerular map suggests principles of odor processing
2022-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01030-8
PMID:35314823
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术，生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的地图 | 本研究首次生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的详细地图，并提出了可能的组织原则，有助于大脑进行气味解码 | 研究仅限于小鼠嗅球中的glomeruli位置，未涉及其他物种或更广泛的嗅觉系统功能 | 探究小鼠嗅球中glomeruli位置与气味辨别之间的关系 | 小鼠嗅球中的glomeruli位置及其在气味处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 73 | 2024-08-07 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
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综述 | 本文综述了胰腺导管化生（PDM）的分子信号机制及其在早期胰腺癌检测和干预中的新兴生物标志物 | 揭示了PDM形成和演变的细胞和分子新见解，有助于理解PDM的细胞起源和功能意义及其在细胞和分子水平的调控 | NA | 探讨PDM的生物学特性及其在胰腺再生和肿瘤发生管理中的临床意义 | 胰腺导管化生（PDM）及其相关生物标志物 | NA | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
Loss of Rnf43 Accelerates Kras-Mediated Neoplasia and Remodels the Tumor Immune Microenvironment in Pancreatic Adenocarcinoma
2022-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.12.273
PMID:34973294
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研究论文 | 本研究描述了一种遗传工程小鼠模型（GEMM），该模型具有条件性表达的致癌Kras和外分泌细胞中Rnf43催化域的缺失，用于研究RNF43突变对胰腺导管腺癌（PDAC）的影响。 | 本研究首次展示了RNF43缺失加速Kras介导的胰腺肿瘤形成，并重塑了肿瘤免疫微环境，为PDAC的免疫治疗提供了新的策略。 | NA | 研究RNF43突变对胰腺导管腺癌的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用。 | 遗传工程小鼠模型（GEMM）中的胰腺导管腺癌。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KRC和KC小鼠模型 |
| 75 | 2024-08-07 |
Downregulated cytotoxic CD8+ T-cell identifies with the NKG2A-soluble HLA-E axis as a predictive biomarker and potential therapeutic target in keloids
2022-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00834-1
PMID:35039632
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研究论文 | 本研究旨在通过分析瘢痕疙瘩组织和血液细胞，发现细胞毒性CD8 T细胞下调是瘢痕疙瘩的一个特征，并探讨NKG2A/CD94复合体和可溶性人类白细胞抗原-E（sHLA-E）在其中的作用。 | 首次揭示了NKG2A/CD94复合体在瘢痕疙瘩中的上调现象，并发现sHLA-E作为诊断和预后标志物的潜力。 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证sHLA-E作为生物标志物的有效性。 | 寻找瘢痕疙瘩的分子和细胞水平特征，以开发新的生物标志物和治疗靶点。 | 瘢痕疙瘩组织和血液细胞中的细胞毒性CD8 T细胞及NKG2A/CD94复合体。 | 免疫学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和组织样本 | 104名瘢痕疙瘩患者，512名健康捐赠者，100名其他疾病患者 |
| 76 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of Nicotiana attenuata corolla cells reveals the biosynthetic pathway of a floral scent
2022-04, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.17992
PMID:35075650
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了野生烟草Nicotiana attenuata花冠细胞中苯乙酮（BA）的生物合成途径 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了野生烟草花冠细胞中苯乙酮的完整生物合成途径 | NA | 揭示植物细胞类型特异性代谢的分子特征 | 野生烟草Nicotiana attenuata的花冠细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 3756个单细胞 |
| 77 | 2024-08-08 |
Genetic perturbations go spatial
2022-Apr-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100120
PMID:36776528
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研究论文 | 本文介绍了一种利用蛋白质条码（Pro-Codes）追踪CRISPR修饰细胞并测量其对肿瘤微环境影响的方法 | 首次采用蛋白质条码和空间转录组学技术，对完整组织中的CRISPR修饰细胞进行多重成像和空间转录组学分析 | NA | 研究细胞内在特征及其与环境的相互作用对组织-肿瘤交互作用的影响 | CRISPR修饰细胞及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | CRISPR, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Intermittent protein restriction protects islet β cells and improves glucose homeostasis in diabetic mice
2022-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.12.024
PMID:36546138
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性蛋白质限制（IPR）在糖尿病控制中的有效性 | IPR不仅显著降低了糖尿病小鼠的高血糖，还改善了胰岛β细胞的数量、增殖和功能，并减少了肝脏中的葡萄糖产生 | NA | 探索间歇性蛋白质限制在糖尿病治疗中的效果 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了链脲佐菌素处理和瘦素受体缺陷的db/db小鼠模型 |
| 79 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of transcription factor regulatory networks reveals molecular basis for subtype-specific dysregulation in acute myeloid leukemia
2022-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000113
PMID:35957668
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，全面绘制了急性髓系白血病（AML）亚型中与恶性相关的转录因子（TF）激活网络，揭示了亚型特异性失调的分子基础。 | 首次在单细胞分辨率下阐明了AML亚型中的转录因子调控网络，并揭示了亚型特异性失调的分子机制。 | NA | 揭示急性髓系白血病亚型特异性失调的分子基础，并为AML的发病机制和潜在的诊断与治疗靶点提供新的视角。 | 急性髓系白血病（AML）及其亚型的转录因子调控网络。 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自AML患者和健康捐赠者的单细胞RNA测序数据 |
| 80 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing-based immunological feature analysis of a COVID-19 patient with recurrent positive SARS-CoV-2 RNA
2022-04-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001956
PMID:35730376
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |