单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Locus-specific expression of transposable elements in single cells with CELLO-seq
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01093-1
PMID:34782740
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研究论文 | 研究使用CELLO-seq技术在单细胞水平上测量转座元件在特定位点的表达 | CELLO-seq技术结合长读长单细胞RNA测序和计算分析，能够测量转座元件在特定位点的表达 | 研究指出只有少数非常年轻的元素在老鼠中无法高置信度地映射回参考序列 | 探索转座元件在单细胞中的位点特异性表达及其与潜在调控因子的关系 | 转座元件在两细胞期小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞中的表达 | 基因组学 | NA | CELLO-seq | NA | RNA序列 | 两细胞期小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞 |
| 62 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Infection Induces Ferroptosis of Sinoatrial Node Pacemaker Cells
2022-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320518
PMID:35255712
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，特别是通过仓鼠模型和人类胚胎干细胞（hESC）衍生的类似窦房结（SAN）起搏细胞进行研究。 | 本文首次展示了SARS-CoV-2可以直接感染心脏的主要起搏细胞，并诱导铁死亡，这是一种可能导致COVID-19患者心律失常的机制。 | 由于难以分离和培养人类SAN细胞，研究主要依赖于仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 探索SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，并寻找保护这些细胞免受感染的药物。 | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应、免疫染色、单细胞RNA测序和高含量化学筛选。 | NA | RNA | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 |
| 63 | 2024-08-07 |
ESR1 mutant breast cancers show elevated basal cytokeratins and immune activation
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29498-9
PMID:35440136
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
The purinergic P2Y14 receptor links hepatocyte death to hepatic stellate cell activation and fibrogenesis in the liver
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe5795
PMID:35385339
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研究论文 | 本文探讨了嘌呤能受体P2Y14在肝细胞死亡与肝星状细胞激活及纤维化中的作用 | 首次揭示了P2Y14受体及其配体在肝细胞死亡与肝纤维化之间的直接联系 | NA | 研究肝纤维化的机制及潜在的治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞及P2Y14受体 | NA | 肝病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 多个小鼠模型及人类样本 |
| 65 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomic reconstruction of the mouse olfactory glomerular map suggests principles of odor processing
2022-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01030-8
PMID:35314823
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术，生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的地图 | 本研究首次生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的详细地图，并提出了可能的组织原则，有助于大脑进行气味解码 | 研究仅限于小鼠嗅球中的glomeruli位置，未涉及其他物种或更广泛的嗅觉系统功能 | 探究小鼠嗅球中glomeruli位置与气味辨别之间的关系 | 小鼠嗅球中的glomeruli位置及其在气味处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 66 | 2024-08-07 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
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综述 | 本文综述了胰腺导管化生（PDM）的分子信号机制及其在早期胰腺癌检测和干预中的新兴生物标志物 | 揭示了PDM形成和演变的细胞和分子新见解，有助于理解PDM的细胞起源和功能意义及其在细胞和分子水平的调控 | NA | 探讨PDM的生物学特性及其在胰腺再生和肿瘤发生管理中的临床意义 | 胰腺导管化生（PDM）及其相关生物标志物 | NA | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Loss of Rnf43 Accelerates Kras-Mediated Neoplasia and Remodels the Tumor Immune Microenvironment in Pancreatic Adenocarcinoma
2022-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.12.273
PMID:34973294
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研究论文 | 本研究描述了一种遗传工程小鼠模型（GEMM），该模型具有条件性表达的致癌Kras和外分泌细胞中Rnf43催化域的缺失，用于研究RNF43突变对胰腺导管腺癌（PDAC）的影响。 | 本研究首次展示了RNF43缺失加速Kras介导的胰腺肿瘤形成，并重塑了肿瘤免疫微环境，为PDAC的免疫治疗提供了新的策略。 | NA | 研究RNF43突变对胰腺导管腺癌的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用。 | 遗传工程小鼠模型（GEMM）中的胰腺导管腺癌。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KRC和KC小鼠模型 |
| 68 | 2024-08-07 |
Downregulated cytotoxic CD8+ T-cell identifies with the NKG2A-soluble HLA-E axis as a predictive biomarker and potential therapeutic target in keloids
2022-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00834-1
PMID:35039632
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研究论文 | 本研究旨在通过分析瘢痕疙瘩组织和血液细胞，发现细胞毒性CD8 T细胞下调是瘢痕疙瘩的一个特征，并探讨NKG2A/CD94复合体和可溶性人类白细胞抗原-E（sHLA-E）在其中的作用。 | 首次揭示了NKG2A/CD94复合体在瘢痕疙瘩中的上调现象，并发现sHLA-E作为诊断和预后标志物的潜力。 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证sHLA-E作为生物标志物的有效性。 | 寻找瘢痕疙瘩的分子和细胞水平特征，以开发新的生物标志物和治疗靶点。 | 瘢痕疙瘩组织和血液细胞中的细胞毒性CD8 T细胞及NKG2A/CD94复合体。 | 免疫学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和组织样本 | 104名瘢痕疙瘩患者，512名健康捐赠者，100名其他疾病患者 |
| 69 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of Nicotiana attenuata corolla cells reveals the biosynthetic pathway of a floral scent
2022-04, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.17992
PMID:35075650
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了野生烟草Nicotiana attenuata花冠细胞中苯乙酮（BA）的生物合成途径 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了野生烟草花冠细胞中苯乙酮的完整生物合成途径 | NA | 揭示植物细胞类型特异性代谢的分子特征 | 野生烟草Nicotiana attenuata的花冠细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 3756个单细胞 |
| 70 | 2024-08-08 |
Genetic perturbations go spatial
2022-Apr-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100120
PMID:36776528
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研究论文 | 本文介绍了一种利用蛋白质条码（Pro-Codes）追踪CRISPR修饰细胞并测量其对肿瘤微环境影响的方法 | 首次采用蛋白质条码和空间转录组学技术，对完整组织中的CRISPR修饰细胞进行多重成像和空间转录组学分析 | NA | 研究细胞内在特征及其与环境的相互作用对组织-肿瘤交互作用的影响 | CRISPR修饰细胞及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | CRISPR, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Intermittent protein restriction protects islet β cells and improves glucose homeostasis in diabetic mice
2022-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.12.024
PMID:36546138
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性蛋白质限制（IPR）在糖尿病控制中的有效性 | IPR不仅显著降低了糖尿病小鼠的高血糖，还改善了胰岛β细胞的数量、增殖和功能，并减少了肝脏中的葡萄糖产生 | NA | 探索间歇性蛋白质限制在糖尿病治疗中的效果 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了链脲佐菌素处理和瘦素受体缺陷的db/db小鼠模型 |
| 72 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of transcription factor regulatory networks reveals molecular basis for subtype-specific dysregulation in acute myeloid leukemia
2022-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000113
PMID:35957668
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，全面绘制了急性髓系白血病（AML）亚型中与恶性相关的转录因子（TF）激活网络，揭示了亚型特异性失调的分子基础。 | 首次在单细胞分辨率下阐明了AML亚型中的转录因子调控网络，并揭示了亚型特异性失调的分子机制。 | NA | 揭示急性髓系白血病亚型特异性失调的分子基础，并为AML的发病机制和潜在的诊断与治疗靶点提供新的视角。 | 急性髓系白血病（AML）及其亚型的转录因子调控网络。 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自AML患者和健康捐赠者的单细胞RNA测序数据 |
| 73 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing-based immunological feature analysis of a COVID-19 patient with recurrent positive SARS-CoV-2 RNA
2022-04-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001956
PMID:35730376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
The science of Hirschsprung disease: What we know and where we are headed
2022-Apr, Seminars in pediatric surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.sempedsurg.2022.151157
PMID:35690468
|
综述 | 本文综述了Hirschsprung病的科学研究，包括其基本生物学、动物模型、当前热点和未来研究方向 | 介绍了遗传风险评估、干细胞疗法、非侵入性诊断技术、单细胞测序技术和基因型-表型相关性等前沿研究 | NA | 探讨Hirschsprung病的科学基础和未来研究方向 | Hirschsprung病及其相关神经肠道疾病 | NA | 神经肠道疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
Insight into the potential pathogenesis of human osteoarthritis via single-cell RNA sequencing data on osteoblasts
2022-04-20, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022297
PMID:35603405
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了人类骨关节炎中成骨细胞的潜在发病机制 | 首次全面分析了骨关节炎中成骨细胞的分子程序，并构建了miRNA-mRNA调控网络 | 实验验证的miRNA数量有限，可能未涵盖所有潜在的调控关系 | 探究骨关节炎中成骨细胞的分子功能及其在疾病发病机制中的作用 | 成骨细胞及其在骨关节炎中的分子表达和功能 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 4387个成骨细胞样本 |
| 76 | 2024-08-08 |
Analysis of single-cell RNA-sequencing data identifies a hypoxic tumor subpopulation associated with poor prognosis in triple-negative breast cancer
2022-04-06, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022271
PMID:35603379
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群，并探讨其与不良预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与三阴性乳腺癌不良预后相关的缺氧肿瘤亚群，并构建了预测总体生存的风险评分模型 | 需要进一步研究缺氧肿瘤微环境中的细胞间通讯异质性 | 探索三阴性乳腺癌中缺氧肿瘤亚群与不良预后的机制 | 三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群及其在肿瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞RNA测序数据GSM4476488，以及来自The Cancer Genome Atlas和GEO的数据集 |
| 77 | 2024-08-08 |
A New Generation of Lineage Tracing Dynamically Records Cell Fate Choices
2022-Apr-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23095021
PMID:35563412
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综述 | 本文综述了基于CRISPR/Cas9的谱系追踪技术（CbLT）在动态记录细胞命运选择方面的最新进展 | 利用CRISPR/Cas9条形码编辑进行大规模谱系追踪，重建细胞的伪时间轨迹，提高谱系追踪的准确性 | 讨论了当前应用中的局限性和潜在的技术陷阱 | 重建谱系关系和细胞命运图谱的发展 | 细胞命运选择和谱系追踪 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis for Oncogenic Mechanisms Underlying Oral Squamous Cell Carcinoma Carcinogenesis with Candida albicans Infection
2022-Apr-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23094833
PMID:35563222
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）与白色念珠菌感染相关的致癌机制及潜在治疗标志物 | 首次揭示了在有和无白色念珠菌感染情况下，OSCC致癌过程中的特定细胞群及其相关信号通路，并验证了stratifin（SFN）作为OSCC感染的特异性标志物 | NA | 验证口腔鳞状细胞癌（OSCC）与白色念珠菌感染相关的致癌机制，并识别早期检测OSCC和治疗靶点的生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其与白色念珠菌感染的关系 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及正常口腔黏膜、口腔潜在恶性病变（OPMD）和OSCC组织的细胞亚型 |
| 79 | 2024-08-08 |
Glioblastoma Embryonic-like Stem Cells Exhibit Immune-Evasive Phenotype
2022-Apr-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092070
PMID:35565200
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研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤中具有胚胎干细胞样特征的肿瘤干细胞群体的免疫逃避机制 | 首次识别出同时高表达胚胎干细胞标志物并下调免疫相关途径的肿瘤干细胞群体，并提供了配对的基因表达和DNA甲基化图谱以探索胶质母细胞瘤免疫治疗的潜在治疗补充 | NA | 揭示胶质母细胞瘤中的免疫逃避机制 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤干细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 诱导多能干细胞技术, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据 | 28个来自患者的胶质母细胞瘤数据集 |
| 80 | 2024-08-08 |
Heterogeneous microenvironment analysis to explore the potential regulatory role of endothelial-mesenchymal transition in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-Apr, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-1438
PMID:35571445
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研究论文 | 本研究通过分析特发性肺纤维化（IPF）相关的单细胞测序和基因表达谱数据，探讨了内皮细胞向间充质细胞转化的潜在调控作用及其对IPF发展的影响 | 本研究首次详细分析了IPF发展过程中细胞微环境的变化，特别是内皮细胞向间充质细胞转化的过程，并揭示了相关基因在其中的调控作用 | NA | 探索特发性肺纤维化（IPF）发展过程中细胞微环境的变化及其潜在的调控机制 | 特发性肺纤维化（IPF）的细胞微环境及其中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 基因表达谱 | NA |