单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-05	A zebrafish reporter line reveals immune and neuronal expression of endogenous retrovirus 2022-04-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.048921 PMID:35142349	研究论文	这项研究揭示了斑马鱼内源性逆转录病毒在免疫和神经系统中的表达	首个在任何物种中建立的体内逆转录病毒报告线，提供了新工具来研究ERV的功能	对哺乳动物基因组中众多复制的研究尚存在工具不足的问题	研究内源性逆转录病毒（ERV）在健康和疾病中的作用	斑马鱼内源性逆转录病毒zferv的八个拷贝	数字病理	自体炎症疾病与神经疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序、活体成像	NA	NA	NA
42	2024-08-05	Critical changes in hypothalamic gene networks in response to pancreatic cancer as found by single-cell RNA sequencing 2022-04, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2022.101441 PMID:35031523	研究论文	本研究探讨了胰腺癌对下丘脑基因网络的影响，特别是在癌症恶病质中的作用	首次利用单细胞RNA测序分析了下丘脑在胰腺癌引起的恶病质响应中的细胞类型特异性变化	研究仅在小鼠模型中进行，临床转化仍需更多研究	揭示胰腺癌导致的恶病质对下丘脑的分子影响	小鼠模型的下丘脑及其对胰腺癌的响应	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型的具体样本数量未在摘要中提供
43	2024-08-05	Single-cell sequencing of human midbrain reveals glial activation and a Parkinson-specific neuronal state 2022-04-29, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awab446 PMID:34919646	研究论文	该研究揭示了人类中脑的胶质细胞激活和特定于帕金森病的神经元状态	首次通过单核RNA测序揭示了特定于帕金森病的神经元细胞集群及其在运动障碍中的作用	研究仍需更多探讨以确认免疫信号和免疫调节治疗在帕金森病中的作用	表征所有中脑细胞类型在帕金森病病理中的贡献	来自六例特发性帕金森病患者及五例年龄/性别匹配对照的中脑单核样本	数字病理学	帕金森病	单核RNA测序	NA	基因表达数据	41,000多单核转录组，来自六例特发性帕金森病患者和五例匹配对照
44	2024-08-05	Hypoxic, glycolytic metabolism is a vulnerability of B-acute lymphoblastic leukemia-initiating cells 2022-04-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110752 PMID:35476984	研究论文	这篇文章探讨了高风险B-急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中白血病起始细胞（LICs）的特性及其代谢弱点	发现抑制缺氧和糖酵解对MLL-r B-ALL LICs有害，提供了治疗靶向的新思路	对高风险B-ALL中LICs的特性理解仍不完全	研究高风险B-急性淋巴细胞白血病中的白血病起始细胞及其代谢特性	MLL重排的B-ALL中的白血病起始细胞	数字病理学	骨髓瘤	单细胞转录组学	NA	NA	NA
45	2024-08-05	Single-cell transcriptional profiling of murine conjunctival immune cells reveals distinct populations expressing homeostatic and regulatory genes 2022-04, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1038/s41385-022-00507-w PMID:35361907	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠结膜免疫细胞的不同群体	识别了新的中性粒细胞和MHCII巨噬细胞群体，发现结膜中有不同的免疫细胞群体及其基因的表达特征	NA	研究小鼠结膜区域的免疫细胞群体及其基因表达特征	结膜免疫细胞群体	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
46	2024-08-05	Impaired primordial follicle assembly in offspring ovaries from zearalenone-exposed mothers involves reduced mitochondrial activity and altered epigenetics in oocytes 2022-Apr-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04288-0 PMID:35469021	研究论文	本研究探讨了ZEA暴露对新生小鼠卵巢中原始卵泡形成的影响以及其在卵母细胞中的表观遗传学改变	揭示了ZEA引起的线粒体活性降低和卵母细胞中表观遗传学改变是导致原始卵泡组装受损的机制	未涉及长期ZEA暴露对后代长期生育能力的影响	研究ZEA对小鼠卵巢原始卵泡形成和卵母细胞基因表达的影响	母鼠及其新生小鼠的卵巢及卵母细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	新生小鼠卵巢样本数量未具体说明
47	2024-08-05	Endothelial plasticity drives aberrant vascularization and impedes cardiac repair after myocardial infarction 2022-Apr, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-022-00047-3 PMID:35571674	研究论文	本文探讨了心肌梗死后内皮细胞的可塑性如何驱动异常血管化并妨碍心脏修复	提出针对获得性内皮细胞变化的靶向治疗，以正常化血管并促进心脏修复	目前仅在小鼠模型中进行了验证，临床适用性尚需进一步研究	研究心肌梗死后血管异常的机制及相关治疗策略	主要关注与心肌梗死相关的内皮细胞	数字病理学	心脏病	单细胞转录组分析	NA	NA	小鼠模型
48	2024-08-07	Human distal lung maps and lineage hierarchies reveal a bipotent progenitor 2022-04, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-022-04541-3 PMID:35355018	研究论文	本研究通过空间转录组学和单细胞分析技术，揭示了人类远端气道的细胞类型和分子特征，包括首次描述的LGR5成纤维细胞和TRB特异性AT0细胞及TRB分泌细胞	首次全面描绘了人类远端气道的细胞图谱，并发现了一种双潜能的AT0细胞状态，这种细胞在肺再生和疾病中起关键作用	研究主要基于非人类灵长类模型和人类器官培养，可能与实际人体肺部情况存在差异	旨在理解人类远端气道的细胞组成和分子身份，以及这些信息在健康和疾病中的应用	人类远端气道，包括终末和呼吸性细支气管（TRBs）的细胞类型和分子特征	数字病理学	呼吸系统疾病	空间转录组学，单细胞分析	NA	细胞数据	包括非人类灵长类模型、人类器官培养和组织样本
49	2024-08-07	The molecular and phenotypic makeup of fetal human skin T lymphocytes 2022-04-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.199781 PMID:34604909	研究论文	本文描述了一种从胎儿人皮肤中分离和扩增大量T细胞的新工作流程	首次使用单细胞转录组学和TCR谱分析技术，详细描述了胎儿皮肤T淋巴细胞的分子和表型特征	NA	深入理解胎儿皮肤免疫机制及其在未来治疗干预中的潜在应用	胎儿人皮肤的T淋巴细胞	免疫学	NA	单细胞转录组学，TCR谱分析	NA	细胞	大量胎儿皮肤活检样本
50	2024-08-07	Generation of human islet cell type-specific identity genesets 2022-04-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-29588-8 PMID:35440614	研究论文	本文通过单细胞转录组学元分析，识别并构建了描述人胰岛α、β、γ和δ细胞身份的基因集	这些基因集比先前发表的基因集更准确地定义了胰岛细胞身份，并能揭示细胞身份变化及其遗传机制	NA	开发用于治疗糖尿病的胰岛素分泌替代细胞	人胰岛α、β、γ和δ细胞的身份基因集	数字病理学	糖尿病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
51	2024-08-07	Heterogeneity and clonality of kidney-infiltrating T cells in murine lupus nephritis 2022-04-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.156048 PMID:35271505	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序分析了小鼠狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的异质性和克隆性	发现CD8+和CD4+肾脏浸润T细胞在狼疮性肾炎中的不同分化状态，揭示了肾脏微环境对T细胞的抑制作用	NA	探讨狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的功能状态及其与疾病进展的关系	小鼠狼疮性肾炎模型中的肾脏浸润T细胞	免疫学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序, TCR测序	NA	RNA序列	NA
52	2024-08-07	Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts 2022-Apr-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers14092197 PMID:35565326	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据分析了胰腺导管细胞癌（PDAC）从原发部位向淋巴结转移过程中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的变化	提出了“进化侵袭水平（ELI）”框架，描述了基质侵袭性的进化，并发现了在PDAC进展的不同阶段，成纤维细胞亚群的显著变化	NA	探究胰腺导管细胞癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的角色和变化	胰腺导管细胞癌及其相关成纤维细胞	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	使用Peng等人发表的单细胞RNA测序数据和The Cancer Genome Atlas中的大量RNAseq数据
53	2024-08-07	Profibrotic properties of C1q+ interstitial macrophages in silica-induced pulmonary fibrosis in mice 2022-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2022.02.037 PMID:35180470	研究论文	研究探讨了C1q+间质巨噬细胞在硅尘诱导的小鼠肺纤维化中的促纤维化特性	首次揭示了间质巨噬细胞在肺纤维化中的具体作用，并提出了针对这些细胞的潜在治疗策略	研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步的人体研究来验证结果	探讨间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其潜在的治疗策略	硅尘诱导的小鼠肺纤维化模型中的间质巨噬细胞	数字病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
54	2024-08-07	Cellular heterogeneity of human fallopian tubes in normal and hydrosalpinx disease states identified using scRNA-seq 2022-04-11, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.02.017 PMID:35320732	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自正常和输卵管积水疾病状态的人类输卵管细胞的异质性	首次构建了包含12种主要细胞类型的输卵管细胞图谱，并识别出四种纤毛和六种非纤毛分泌上皮亚型	仅分析了四名健康和两名输卵管积水患者的样本，样本量有限	探究输卵管稳态在正常发育和疾病中的细胞异质性	人类输卵管细胞	数字病理学	不孕症	scRNA-seq	NA	细胞数据	59,738个细胞来自四名健康受试者，17,798个细胞来自两名输卵管积水患者
55	2024-08-07	A Comprehensive Immune Cell Atlas of Cystic Kidney Disease Reveals the Involvement of Adaptive Immune Cells in Injury-Mediated Cyst Progression in Mice 2022-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2021030278 PMID:35110364	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术构建了囊性肾病的免疫细胞图谱，揭示了适应性免疫细胞在损伤介导的囊肿进展中的作用。	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了囊性肾病中免疫细胞的多样性和功能，特别是适应性免疫细胞在损伤加速囊肿疾病中的关键作用。	研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。	旨在无偏见地识别影响囊肿生长速率的修饰细胞，特别是在损伤和非损伤的纤毛突变肾脏中。	囊性肾病中的免疫细胞，特别是适应性免疫细胞。	数字病理学	囊性肾病	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	79,355个细胞
56	2024-08-07	IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor 2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2100439 PMID:35304419	研究论文	本研究探讨了IL-22在早产中对母胎免疫的作用，发现IL-22 T细胞在早产妇女的母胎界面富集，并在体内外实验中展示了IL-22在早产中的双重作用：组织损伤和宿主防御。	首次展示了IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的富集，并通过体内外实验证实了IL-22在早产中的双重作用。	研究主要集中在小鼠模型和体外人系统，可能需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。	探讨IL-22在晚期妊娠中母胎免疫的作用及其在早产中的作用机制。	IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的分布及其在早产中的作用。	免疫学	早产	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及早产妇女和小鼠的母胎组织样本
57	2024-08-07	Neuroinflammation creates an immune regulatory niche at the meningeal lymphatic vasculature near the cribriform plate 2022-04, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-022-01158-6 PMID:35347285	研究论文	研究发现在神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管通过淋巴管生成来排出多余液体，并可能获得改变的表型以调节免疫。	首次报道了神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管上调与抗原呈递相关的基因，如主要组织相容性复合体II类、粘附分子和免疫调节分子，形成一个免疫调节微环境。	NA	探讨神经炎症期间脑膜淋巴管在免疫调节中的作用。	健康和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中筛板附近的脑膜淋巴管。	NA	神经炎症	单细胞RNA测序	NA	RNA	健康和EAE小鼠模型的脑膜淋巴管样本
58	2024-08-07	Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling 2022-04, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-022-04517-3 PMID:35355020	研究论文	本文使用低温电子显微镜研究了由α4、β3和δ亚基组装的外突触GABAA受体的结构，以及包含γ2亚基的对应物，发现两种具有不同化学计量和排列的受体亚型，这些亚型与先前观察到的突触α1-包含受体不同	本文首次提供了结构和功能证据，表明选定的GABAR排列可以作为同时响应GABA和组胺两种神经递质的巧合检测器	NA	探讨GABAA受体的组装原理及其对GABA能信号传导的影响	GABAA受体的结构和功能	神经科学	NA	低温电子显微镜	NA	结构数据	NA
59	2024-08-07	Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq 2022-04, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975 PMID:35395014	研究论文	本文介绍了一种基于隐狄利克雷分配（LDA）的新方法，用于检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用相关基因变化	该方法不依赖于现有的生物学知识数据库，而是通过分析物理相互作用的细胞数据来检测基因表达变化	文章未明确提及该方法的局限性	开发一种新的方法来检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用	研究细胞间相互作用对基因表达的影响	单细胞测序	NA	scRNA-seq	LDA	基因表达数据	涉及两个物理相互作用细胞的数据集和一个标准液滴法生成的数据集
60	2024-08-07	Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia 2022-04, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-022-01720-7 PMID:35288693	研究论文	本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态	发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征	研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制	探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态	KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病	数字病理学	儿童白血病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	未具体说明样本数量