单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-09-16 |
Host cell maturation modulates parasite invasion and sexual differentiation in Plasmodium berghei
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm7348
PMID:35476438
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研究论文 | 本文研究了宿主细胞成熟对疟原虫入侵和性分化的影响 | 首次全面分析了宿主细胞成熟状态对疟原虫适应性的关键作用 | NA | 探讨宿主细胞成熟状态如何影响疟原虫的入侵和性分化 | 疟原虫在宿主红细胞中的复制和性分化过程 | NA | 疟疾 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22 | 2024-09-08 |
Heparanase Blockade as a Novel Dual-Targeting Therapy for COVID-19
2022-04-13, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-22
PMID:35319225
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研究论文 | 研究评估了肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理和治疗中的作用 | 首次提出肝素酶抑制剂Roneparstat作为COVID-19的双靶点治疗药物，既能减少病毒感染又能抑制炎症反应 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析，尚未进行临床试验验证 | 探索肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理中的作用，并验证其作为双靶点治疗药物的潜力 | SARS-CoV-2、SARS-CoV-1、HTLV-1和HIV-1病毒，以及COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 |
| 23 | 2024-09-02 |
Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1970
PMID:35389781
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的分子和遗传关联 | 首次使用大规模单细胞RNA测序技术（mux-seq）对SLE患者的免疫细胞进行全面分析，并结合基因型数据进行细胞类型特异性的cis-表达数量性状位点映射 | NA | 探索系统性红斑狼疮（SLE）中免疫细胞类型特异性的分子和遗传关联 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（mux-seq） | NA | 基因表达数据 | 162例SLE患者和99例对照组的外周血单个核细胞，共计超过120万个细胞 |
| 24 | 2024-08-30 |
Spatial transcriptomic analysis reveals inflammatory foci defined by senescent cells in the white matter, hippocampi and cortical grey matter in the aged mouse brain
2022-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00521-7
PMID:35098444
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法分析了老年小鼠大脑中细胞衰老的空间分布及其与神经炎症的关系 | 首次使用空间转录组学技术，结合组织学信息，精确地定位了老年小鼠大脑中包含衰老细胞的微域，并分析了这些区域的基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性 | 探讨衰老细胞在大脑中的空间分布及其与年龄相关认知衰退的关系 | 老年C57BL/6小鼠的大脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 3个月和28个月大的C57BL/6小鼠各若干只 |
| 25 | 2024-08-28 |
Neuronal apoptosis drives remodeling states of microglia and shifts in survival pathway dependence
2022-04-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76564
PMID:35481836
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研究论文 | 研究探讨了凋亡神经元如何影响小胶质细胞的状态，包括溶酶体和脂质代谢基因表达以及对集落刺激因子1受体（CSF1R）生存依赖性的影响。 | 通过单细胞RNA测序（scRNAseq）分析了小胶质细胞在与凋亡神经元相互作用时的多样性和基因表达变化，发现这些相互作用推动了小胶质细胞的多种重塑状态，并改变了其对生存途径CSF1R的依赖性。 | 研究主要集中在早期幼鼠视网膜的小胶质细胞上，可能不完全代表所有神经系统的情况。 | 探究凋亡神经元与小胶质细胞相互作用如何影响小胶质细胞的状态和生存途径依赖性。 | 早期幼鼠视网膜的小胶质细胞，包括野生型、缺乏神经元凋亡（Bax KO）和CSF1R抑制剂处理的小鼠。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 涉及野生型、Bax KO和PLX3397处理的小鼠视网膜小胶质细胞样本 |
| 26 | 2024-08-28 |
Single-Cell RNA Sequencing for Plant Research: Insights and Possible Benefits
2022-Apr-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23094497
PMID:35562888
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物研究中的应用，强调了其在揭示细胞类型和状态方面的潜力 | scRNA-seq技术提高了生物系统分析的时空分辨率，能够全面表征常见和稀有细胞类型及细胞状态 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨scRNA-seq在植物科学中的应用及其在环境应激适应中的作用 | 植物细胞类型和状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 27 | 2024-08-28 |
A mesenchymal to epithelial switch in Fgf10 expression specifies an evolutionary-conserved population of ionocytes in salivary glands
2022-04-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110663
PMID:35417692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Fgf10:R26-tdTomato小鼠模型，揭示了FGF10细胞在唾液腺中的表达从间充质向上皮细胞的转变，并探讨了这一转变对唾液腺离子细胞功能的影响。 | 首次展示了FGF10细胞在唾液腺中的表达从间充质向上皮细胞的转变，并发现上皮FGF10细胞表达古代离子细胞标志物，表明这些细胞可能是唾液腺中的特化离子细胞。 | NA | 探讨FGF10在唾液腺发育中的作用及其在上皮细胞中的表达变化。 | 唾液腺中的FGF10细胞及其在发育过程中的表达变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用tamoxifen诱导的Fgf10:R26-tdTomato小鼠模型进行研究 |
| 28 | 2024-08-28 |
Cellular and molecular atlas of the placenta from a COVID-19 pregnant woman infected at midgestation highlights the defective impacts on foetal health
2022-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13204
PMID:35141964
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研究论文 | 本研究跟踪了一名在孕中期感染SARS-CoV-2的孕妇，通过对其胎盘和胎儿组织的组织学检查及单细胞RNA测序，揭示了COVID-19对胎盘和胎儿健康的缺陷影响。 | 首次详细描述了孕中期SARS-CoV-2感染对胎盘和胎儿健康的细胞和分子层面的影响。 | 研究样本仅为一例，可能不足以代表所有孕中期COVID-19感染的情况。 | 探讨孕中期SARS-CoV-2感染对母婴健康的影响。 | 孕中期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘和胎儿组织。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 1例 |
| 29 | 2024-08-27 |
TNF is a potential therapeutic target to suppress prostatic inflammation and hyperplasia in autoimmune disease
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29719-1
PMID:35440548
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研究论文 | 本研究通过分析医疗记录数据、患者样本和体内模型，评估了炎症对前列腺组织的影响，并探讨了通过靶向炎症来限制前列腺炎症和增生的可能性 | 首次揭示了自身免疫疾病患者中良性前列腺增生（BPH）的高发性，并证明了肿瘤坏死因子（TNF）拮抗剂治疗可以显著降低BPH的发生 | 研究主要基于医疗记录数据和实验室模型，可能需要更多的临床试验来验证结果 | 探讨自身免疫疾病中前列腺炎症和增生的治疗靶点 | 自身免疫疾病患者的前列腺组织 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 医疗记录数据、组织样本 | 112,152份医疗记录，人类和小鼠组织样本 |
| 30 | 2024-08-27 |
High-resolution Slide-seqV2 spatial transcriptomics enables discovery of disease-specific cell neighborhoods and pathways
2022-Apr-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104097
PMID:35372810
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研究论文 | 本文利用高分辨率的Slide-seqV2空间转录组技术，在健康和疾病状态下的小鼠和人肾脏组织中进行研究，揭示了疾病特异性的细胞邻域和通路 | 首次应用Slide-seqV2技术于疾病过程和治疗相关通路的阐明 | NA | 探索高分辨率空间转录组技术在疾病过程中的应用 | 小鼠和人的肾脏组织，包括健康和疾病状态 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | 九个不同的人类肾脏组织样本和多个小鼠模型 |
| 31 | 2024-08-27 |
Dirichlet process mixture models for single-cell RNA-seq clustering
2022-04-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.059001
PMID:35237784
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研究论文 | 本文比较了贝叶斯隐狄利克雷分配（LDA）方法与其非参数对应方法——分层狄利克雷过程（HDP）在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类中的应用 | 首次详细比较了LDA和HDP在scRNA-seq数据聚类中的性能 | LDA和HDP的性能依赖于数据集，且HDP有时会过度细分聚类 | 提高单细胞RNA测序数据分析中定义有意义聚类分辨率的过程 | 比较LDA和HDP在scRNA-seq数据聚类中的性能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 隐狄利克雷分配（LDA），分层狄利克雷过程（HDP） | 基因表达数据 | 四个scRNA-seq数据集（免疫细胞、肾脏、胰腺和绒毛膜/胎盘） |
| 32 | 2024-08-27 |
Explainable multiview framework for dissecting spatial relationships from highly multiplexed data
2022-04-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02663-5
PMID:35422018
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研究论文 | 本文介绍了MISTy框架，一个灵活、可扩展且可解释的机器学习框架，用于从高度多重化的空间组学数据中提取关系 | MISTy框架通过构建多个关注不同空间或功能上下文的视图来解析不同效应 | NA | 开发一种可扩展的方法，利用空间信息从高度多重化的空间技术中提取关系 | 高度多重化的空间组学数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | NA | 机器学习框架 | 空间组学数据 | 数十到数千个测量标记 |
| 33 | 2024-08-27 |
Identification of germline monoallelic mutations in IKZF2 in patients with immune dysregulation
2022-04-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006367
PMID:34920454
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研究论文 | 本文报道了在免疫失调患者中发现的IKZF2基因的种系单等位基因突变，并探讨了这些突变对人类造血和免疫功能的影响 | 首次鉴定出IKZF2基因的种系突变，并揭示了这些突变导致T滤泡辅助细胞和NK细胞数量减少以及免疫功能障碍的机制 | NA | 研究IKZF2基因种系突变对人类造血和免疫功能的影响 | 患有系统性红斑狼疮、免疫性血小板减少症或EBV相关噬血细胞性淋巴组织细胞增生症的患者 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序，蛋白质组分析 | NA | RNA，蛋白质 | 6名患者 |
| 34 | 2024-08-27 |
Single-cell transcriptomic analysis of the immune cell landscape in the aged mouse brain after ischemic stroke
2022-Apr-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02447-5
PMID:35392936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了老年小鼠脑部缺血性中风后的免疫细胞景观 | 首次在单细胞分辨率下描绘了老年中风脑部的免疫细胞群体，并发现至少6种微胶质细胞亚型，包括一种潜在的中风特异性亚型 | NA | 旨在确定中风如何影响老年脑部的免疫细胞群体 | 老年小鼠脑部缺血性中风后的免疫细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | NA |
| 35 | 2024-08-27 |
Characterization of the treatment-naive immune microenvironment in melanoma with BRAF mutation
2022-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004095
PMID:35383113
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研究论文 | 本研究探讨了BRAF突变型黑色素瘤在未经治疗情况下的免疫微环境特征，并分析了其与免疫检查点阻断疗法反应差异的关系。 | 首次详细描述了BRAF突变型黑色素瘤在未经治疗情况下的免疫微环境特征，并探讨了其与免疫疗法反应差异的潜在机制。 | 研究主要基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，可能需要更多实验验证和临床数据支持。 | 探讨BRAF突变型黑色素瘤的免疫微环境特征及其与免疫疗法反应差异的关系。 | BRAF突变型和野生型黑色素瘤患者的免疫微环境。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | RNA | 涉及BRAF突变型和野生型黑色素瘤患者的多个样本 |
| 36 | 2024-08-27 |
Clinical and translational values of spatial transcriptomics
2022-04-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00960-w
PMID:35365599
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学（ST）的发展及其与单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合在理解分子发病机制和发现疾病特异性生物标志物中的临床和转化价值 | 结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了人类组织病理表型与分子改变之间的联系，定义了细胞间分子通信和时空分子医学知识 | 讨论了基于测序和基于成像技术的优缺点，并强调了空间转录组学面临的机会和挑战 | 评估空间转录组学在理解分子发病机制和发现疾病特异性生物标志物中的临床和转化价值 | 空间转录组学技术及其在神经学、胚胎发育、肿瘤学和炎症等领域的应用 | 分子医学 | NA | 空间转录组学（ST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 37 | 2024-08-27 |
Single Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Inflammatory Macrophage Subset as a Druggable Target for Alleviating Acute Kidney Injury
2022-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202103675
PMID:35112806
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤（IRI-AKI）小鼠模型中，识别出一种独特的炎症性巨噬细胞亚群S100a9 Ly6c IMs，并探讨了其作为药物靶点缓解AKI的潜力。 | 首次在IRI-AKI模型中识别出S100a9 Ly6c IMs这一早期响应AKI的独特巨噬细胞亚群，并验证了针对S100A8/A9信号通路的小分子抑制剂在保护肾脏功能和减少炎症反应方面的效果。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类AKI中进行临床试验验证。 | 探索急性肾损伤的治疗新策略，特别是通过靶向特定巨噬细胞亚群来调节炎症反应。 | 急性肾损伤（AKI）中的巨噬细胞异质性及其在炎症和组织修复中的作用。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠IRI模型中的单核吞噬细胞系统 |
| 38 | 2024-08-27 |
Ontogeny and Vulnerabilities of Drug-Tolerant Persisters in HER2+ Breast Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1265
PMID:34911733
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研究论文 | 研究探讨了HER2阳性乳腺癌中药物耐受持久细胞（DTP）的发育及其脆弱性 | 首次详细描述了HER2酪氨酸激酶抑制剂暴露后DTP的特征，并揭示了其通过雌激素受体依赖性诱导SGK3来重塑PI3K/AKT/mTORC1通路以实现AKT非依赖性mTORC1激活的机制 | NA | 研究HER2阳性乳腺癌中药物耐受持久细胞的特性和耐药机制 | HER2阳性乳腺癌细胞及其对酪氨酸激酶抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 慢病毒条码/单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 39 | 2024-08-26 |
Identification and validation of a seven-gene prognostic marker in colon cancer based on single-cell transcriptome analysis
2022-04, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12041
PMID:35352485
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在结肠癌中识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物。 | 通过单细胞RNA测序技术，本研究首次识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物，为结肠癌的预后预测提供了新的潜在标志物。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别并验证结肠癌的预后标志物。 | 结肠癌患者的单细胞RNA测序数据、体细胞变异数据和临床报告。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析和最小绝对收缩与选择算子方法 | 转录组数据 | 结肠癌患者的数据，包括治疗前后的样本 |
| 40 | 2024-08-09 |
Concurrent delivery of immune checkpoint blockade modulates T cell dynamics to enhance neoantigen vaccine-generated antitumor immunity
2022-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00352-7
PMID:35393580
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研究论文 | 本文研究了新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤特异性T细胞反应的影响 | 通过单细胞测序揭示了联合治疗诱导的特定CD8 T细胞群体的特征，这些细胞具有活跃的趋化因子信号、较低的共抑制受体表达和较高的细胞毒性 | NA | 探讨新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤控制的有效性及其机制 | 新抗原疫苗生成的T细胞与免疫检查点阻断的协同作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 超过100,000个T细胞 |