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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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221 | 2024-08-08 |
Single-Cell, Single-Nucleus, and Spatial RNA Sequencing of the Human Liver Identifies Cholangiocyte and Mesenchymal Heterogeneity
2022-04, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1854
PMID:34792289
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研究论文 | 本研究通过匹配的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)分析了73,295个人类肝脏细胞的转录组景观 | 本研究首次结合scRNA-seq和snRNA-seq技术,揭示了人类肝脏中胆管细胞和间质细胞的异质性,并发现了罕见的肝脏间质细胞亚型和胆管细胞前体 | 细胞解离相关的细胞扰动可能限制了完全捕捉人类肝脏实质细胞部分的能力 | 旨在通过高分辨率转录组分析,全面描绘健康人类肝脏中的实质细胞群体 | 人类肝脏中的细胞类型及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 73,295个人类肝脏细胞 |
222 | 2024-08-08 |
Data-driven comparison of multiple high-dimensional single-cell expression profiles
2022-Apr, Journal of human genetics
IF:2.6Q2
DOI:10.1038/s10038-021-00989-9
PMID:34719682
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研究论文 | 本文提出了一种完全数据驱动的计算生物学方法,用于比较多个高维单细胞表达数据集,如流式细胞术和scRNA-seq数据,以阐明疾病机制。 | 该方法克服了传统基于细胞子集比较的挑战,并促进了机器学习和基因集分析等进一步分析。 | NA | 旨在通过比较多个单细胞表达数据集来阐明疾病机制。 | 研究对象为多个高维单细胞表达数据集,如流式细胞术和scRNA-seq数据。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 表达数据 | NA |
223 | 2024-08-08 |
Satb1 expression in retinal ganglion cells of marmosets, macaques, and humans
2022-04, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25258
PMID:34622958
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研究论文 | 本研究利用针对转录因子Satb1的抗体,研究了狨猴、猕猴和人类视网膜中Satb1的表达情况 | 发现旧世界(人类和猕猴)和新世界(狨猴)灵长类动物视网膜神经节细胞中转录因子的表达并不保守,并将分子标记与特定细胞类型联系起来 | NA | 研究不同物种视网膜神经节细胞中Satb1的表达情况 | 狨猴、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 狨猴、猕猴和人类各一种 |
224 | 2024-08-08 |
Visualization and Analysis of Single Cell RNA-Seq Data by Maximizing Correntropy Based Non-Negative Low Rank Representation
2022-04, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3110766
PMID:34495855
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MccNLRR的新型scRNA-seq数据分析模型,用于处理高技术噪声和数据丢失问题 | 采用最大相关熵准则作为有效的损失函数,对高噪声和大数据异常值更为鲁棒,同时利用低秩表示捕捉数据的全局和局部结构 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在生物问题分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | MccNLRR | 数据 | NA |
225 | 2024-08-08 |
Interaction of long non-coding RNAs and circular RNAs with microRNAs for the regulation of immunological responses in human cancers
2022-04, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2021.05.029
PMID:34090752
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研究论文 | 本文探讨了长非编码RNA、环状RNA与微小RNA在人类癌症免疫反应调控中的相互作用 | 文章揭示了非编码RNA在免疫调节中的新角色,特别是通过外泌体传递非编码RNA重塑接收细胞中的不同通路和蛋白质网络 | NA | 深入理解非编码RNA在免疫系统中的调控机制,以期将实验室发现转化为临床有效的治疗方法 | 长非编码RNA、环状RNA和微小RNA在免疫反应中的调控作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
226 | 2024-08-09 |
Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00830-w
PMID:33603203
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研究论文 | 本文开发了一种名为RCTD的计算方法,用于分解空间转录组学中的细胞类型混合物,并校正不同测序技术间的差异 | RCTD方法利用单细胞RNA-seq学到的细胞类型特征来分解细胞类型混合物,并能准确再现已知的细胞类型和亚型定位模式 | NA | 开发一种新的计算方法来分解空间转录组学中的细胞类型混合物 | 空间转录组学中的细胞类型混合物 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | RCTD | 转录组数据 | 模拟数据集、Slide-seq和Visium的小鼠脑数据集 |