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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2024-08-08 |
Prostate luminal progenitor cells: from mouse to human, from health to disease
2022-04, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-021-00561-2
PMID:35079142
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综述 | 本文综述了前列腺腔内祖细胞的研究进展,从鼠类到人类,从健康到疾病 | 近年来,单细胞转录组学的兴起使得对鼠类和人类前列腺腔内祖细胞的全面分析成为可能 | NA | 探讨前列腺腔内祖细胞在前列腺病理生理中的作用及其对雄激素剥夺疗法的抵抗性 | 前列腺腔内祖细胞 | NA | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
202 | 2024-08-08 |
Transient Cell Cycle Induction in Cardiomyocytes to Treat Subacute Ischemic Heart Failure
2022-04-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过引入4个细胞周期因子(4F)促进心肌细胞增殖,以治疗亚急性缺血性心力衰竭 | 使用新型瞬时且心肌细胞特异性的病毒构建体,减少了细胞周期因子的致癌潜力 | NA | 研究强制心肌细胞增殖的过程,并推进该方法的临床可行性 | 心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型每组10只,猪模型每组6-7只 |
203 | 2024-08-08 |
Age-related differences in immune dynamics during SARS-CoV-2 infection in rhesus macaques
2022-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101314
PMID:35039442
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研究论文 | 研究使用恒河猴模型探讨年龄相关的SARS-CoV-2感染免疫动力学差异 | 首次在恒河猴模型中详细分析了年龄对SARS-CoV-2感染后免疫反应的影响,特别是在急性后期阶段 | 研究仅限于恒河猴模型,可能不完全适用于人类 | 探究年龄对SARS-CoV-2感染免疫反应的影响 | 老年和年轻恒河猴的SARS-CoV-2感染免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组学、多参数流式细胞术、多重免疫组织化学、细胞因子检测、脂质组学分析 | NA | RNA、临床观察、胸部X光片、细胞因子、脂质 | 16只恒河猴(8只老年,8只年轻) |
204 | 2024-08-08 |
Automation enables high-throughput and reproducible single-cell transcriptomics library preparation
2022-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2021.10.018
PMID:35058211
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程,用于提高单细胞RNA测序(scRNA-seq)文库制备的通量并减少操作时间 | 通过自动化流程,将scRNA-seq文库制备的通量提高至48个反应,并将操作时间减少75% | NA | 提高单细胞RNA测序的效率和可重复性 | 单细胞RNA测序文库制备的自动化流程 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | RNA | 最多48个反应 |
205 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy
2022-04-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-0551
PMID:35061025
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了增生性糖尿病视网膜病变(PDR)中的纤维血管膜(FVM),揭示了微胶质细胞在FVM中的新角色 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了PDR-FVM中微胶质细胞的GPNMB+亚群,及其在纤维化和纤维生成中的作用 | NA | 探讨微胶质细胞在增生性糖尿病视网膜病变中的病理生理作用 | 增生性糖尿病视网膜病变中的纤维血管膜 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 手术采集的PDR-FVM样本 |
206 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of tumour evolution in multiple myeloma - opportunities for precision medicine
2022-04, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00593-y
PMID:35017721
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多发性骨髓瘤(MM)中的应用,探讨了其在揭示MM克隆进化模式和个体细胞突变及表型特征方面的潜力 | 利用单细胞测序技术深入解析MM及其前体阶段的遗传异质性,为精准医疗提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在多发性骨髓瘤中的应用及其对临床诊断和治疗策略的潜在影响 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的遗传异质性和克隆进化模式 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
207 | 2024-08-08 |
The Type 2 Asthma Mediator IL-13 Inhibits Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Infection of Bronchial Epithelium
2022-04, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0364OC
PMID:34982656
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研究论文 | 研究探讨了IL-13在抑制SARS-CoV-2感染支气管上皮细胞中的作用 | 首次揭示了IL-13对SARS-CoV-2感染的影响,并发现IL-13通过调节特定mRNA的表达来抑制病毒复制 | 研究主要集中在体外细胞实验,尚未在临床环境中验证IL-13的效果 | 探究IL-13在SARS-CoV-2感染中的作用及其潜在的保护机制 | 人支气管上皮细胞(HBECs)和SARS-CoV-2病毒 | NA | 哮喘 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种细胞类型和个体样本 |
208 | 2024-08-08 |
Molecular insights into the early stage of glomerular injury in IgA nephropathy using single-cell RNA sequencing
2022-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2021.12.011
PMID:34968552
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | 揭示了内皮细胞在IgA肾病早期发病机制中的关键作用,并发现了多种肾小球内旁分泌途径和肾小球-肾小管细胞间相互作用途径 | NA | 深入理解IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | IgA肾病早期阶段的肾小球相关细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用ddY小鼠模型进行研究 |
209 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一例罕见的人喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 首次系统研究了喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制,并通过单细胞测序技术揭示了肿瘤异质性和肿瘤微环境组成 | 仅基于一例病例进行研究,可能存在样本量不足的问题 | 探索喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 一例74岁男性患者的喉软骨肉瘤及其周围软骨组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 5455个单细胞 |
210 | 2024-08-08 |
Early Tumor-Immune Microenvironmental Remodeling and Response to First-Line Fluoropyrimidine and Platinum Chemotherapy in Advanced Gastric Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0888
PMID:34933901
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研究论文 | 本文通过结合全外显子测序、批量RNA和单细胞转录组学,研究了HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者在接受一线氟嘧啶和铂类化疗前后肿瘤免疫微环境的变化,并定义了与化疗反应相关的特征。 | 首次详细描述了化疗对肿瘤免疫微环境的具体影响,包括自然杀伤细胞的招募、肿瘤相关巨噬细胞的减少等,并提出了未来治疗策略的候选方法。 | 研究未观察到早期治疗采样中的显著基因组变化,且样本量未明确提及。 | 探讨标准化疗对肿瘤免疫微环境的影响,并识别与化疗反应相关的特征。 | HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者。 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
211 | 2024-08-08 |
3D collagen matrices modulate the transcriptional trajectory of bone marrow hematopoietic progenitors into macrophage lineage commitment
2022-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.032
PMID:34901544
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研究论文 | 研究使用3D胶原蛋白水凝胶和胶原蛋白-海藻酸盐水凝胶来探讨造血祖细胞的行为,并揭示了3D微环境中造血祖细胞向巨噬细胞分化的转录轨迹 | 首次揭示了3D胶原蛋白水凝胶中造血祖细胞向巨噬细胞分化的独特成熟轨迹,并展示了3D巨噬细胞与其他造血群集之间基于配体-修复相互作用的增强交流 | NA | 探究外基质提供的物理信号对骨髓中造血干细胞和祖细胞命运决定的影响 | 造血祖细胞及其在3D胶原蛋白水凝胶中的行为 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从二维和三维水凝胶中随机选择的细胞 |
212 | 2024-08-08 |
Toxicity of perfluorooctanoic acid on zebrafish early embryonic development determined by single-cell RNA sequencing
2022-04-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2021.127888
PMID:34862108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了全氟辛酸(PFOA)对斑马鱼早期胚胎发育的影响 | 首次详细报告了PFOA如何影响斑马鱼胚胎发育中不同细胞群体,并识别了受影响的特定细胞群体 | NA | 研究PFOA对斑马鱼早期胚胎发育的毒性影响 | 斑马鱼胚胎在2-30小时pf(受精后小时)期间暴露于1-100 μg/L的PFOA | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼胚胎在2-30小时pf期间暴露于不同浓度的PFOA |
213 | 2024-08-08 |
Isocitrate dehydrogenase mutations are associated with altered IL-1β responses in acute myeloid leukemia
2022-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01487-9
PMID:34857894
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研究论文 | 本研究探讨了异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)突变对急性髓系白血病细胞内信号传导的影响 | 首次展示了IDH2突变细胞对IL-1β的增强反应,并确认了这一信号通路作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 研究IDH2突变对急性髓系白血病细胞内信号传导的影响 | IDH2突变细胞及其对IL-1β的反应 | NA | 急性髓系白血病 | 磷酸特异性流式细胞术和质谱细胞术 | NA | RNA序列 | NA |
214 | 2024-08-08 |
Inflammatory molecular endotypes of nasal polyps derived from White and Japanese populations
2022-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.11.017
PMID:34863854
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研究论文 | 本文通过全转录组和单细胞RNA基因表达分析,研究了白人和日本人群中鼻息肉的炎症分子亚型差异 | 首次通过全转录组和单细胞RNA测序技术,分析了不同种族和地理区域的鼻息肉炎症特征差异 | 研究样本仅限于居住在美国的白人和居住在日本的日本患者,可能无法完全代表所有种族和地理区域 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉在不同种族和地理区域中的炎症特征差异 | 白人和日本患者的鼻息肉组织 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 全转录组RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8名白人患者和9名日本患者,以及46名白人和31名日本患者的独立验证集 |
215 | 2024-08-08 |
Identification of Vulnerable Interneuron Subtypes in 15q13.3 Microdeletion Syndrome Using Single-Cell Transcriptomics
2022-04-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2021.09.012
PMID:34838304
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据,识别了15q13.3微缺失综合征中易受影响的中间神经元亚型 | 提出并验证了一种预测CNV基因对大脑发育影响的新策略,并通过分析单细胞转录组数据和在小鼠模型中验证,揭示了Klf13基因在特定发育阶段的表达模式及其对神经元发育的影响 | NA | 研究15q13.3微缺失综合征对大脑发育的影响机制 | 15q13.3微缺失综合征中的中间神经元亚型 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含皮质中间神经元的单细胞转录组数据,以及Df(h15q13.3)/+和Klf13+/-胚胎的小鼠模型 |
216 | 2024-08-08 |
Super-resolved spatial transcriptomics by deep data fusion
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01075-3
PMID:34845373
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研究论文 | 本文介绍了一种结合空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据来推断更高分辨率表达图谱的方法 | 利用深度生成模型,该方法能够表征微米尺度解剖特征的转录组,并能仅从组织学图像预测空间基因表达 | NA | 提高空间转录组学的空间分辨率 | 空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 图像数据 | NA |
217 | 2024-08-08 |
Redefining intestinal immunity with single-cell transcriptomics
2022-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-021-00470-y
PMID:34848830
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学在重塑我们对肠道免疫系统理解方面的作用 | 利用单细胞转录组学技术,深入解析了肠道免疫系统的复杂性,包括早期肠道发育、与邻近微生物群的相互作用、肠道免疫细胞的多样性、肠道内的区域化以及与非免疫细胞的相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在肠道免疫系统研究中的应用 | 肠道免疫系统及其与微生物群和非免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
218 | 2024-08-08 |
Generation and characterization of stable pig pregastrulation epiblast stem cell lines
2022-04, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00592-9
PMID:34848870
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研究论文 | 本文介绍了从猪胚胎E10前原肠胚外胚层(pgEpiSCs)成功建立和维持稳定的多能干细胞系的培养方法 | 首次成功建立了稳定的猪前原肠胚外胚层干细胞系,并通过化学抑制WNT相关信号通路及FGF/ERK、JAK/STAT3和Activin/Nodal途径维持其多能性特征 | NA | 开发用于建立和维持猪多能干细胞系的新型体外培养介质,并探索其在生物学研究和再生医学中的应用潜力 | 猪胚胎E10前原肠胚外胚层细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析、Hi-C分析 | NA | 细胞 | 超过240次传代的多能干细胞系 |
219 | 2024-08-08 |
The effects of TNF-α/TNFR2 in regulatory T cells on the microenvironment and progression of gastric cancer
2022-04-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33873
PMID:34766338
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研究论文 | 研究探讨了TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | 揭示了TNFR2 Tregs在肿瘤微环境中高浸润水平,并处于激活和效应状态,为胃癌治疗提供了新的理论基础 | NA | 探索TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
220 | 2024-08-08 |
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01091-3
PMID:34764492
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Scissor的方法,通过整合批量和单细胞测序数据来识别与特定表型相关的细胞亚群 | Scissor方法通过量化单个细胞与批量样本之间的相似性,并优化回归模型以识别相关亚群,从而直接将单细胞数据中的细胞簇与特定表型联系起来 | NA | 开发一种方法,能够从单细胞测序数据中识别与特定表型相关的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据和表型相关的批量表达数据 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 面肩肱型肌营养不良, 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 表达数据 | NA |