单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 247 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
A global timing mechanism regulates cell-type-specific wiring programmes
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04418-5
PMID:35197627
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研究论文 | 本文描述了通过类固醇激素（蜕皮激素）诱导的转录因子级联反应，在果蝇视觉系统神经元中调控细胞类型特异性连接程序的全球计时机制。 | 首次揭示了蜕皮激素途径如何通过单细胞测序调控共有的及细胞类型特异性目标基因表达，这些基因涉及突触成熟和细胞表面蛋白，从而影响神经连接的特异性。 | NA | 探讨神经回路组装中精确时空表达的细胞识别分子调控机制，特别是时间因素的确定。 | 果蝇视觉系统神经元中的蜕皮激素途径及其对神经连接特异性的调控。 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | 转录因子级联反应 | 基因表达数据 | 涉及果蝇视觉系统神经元 |
| 162 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis uncovers the molecular and cellular characteristics of thin endometrium
2022-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101579R
PMID:35201635
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了薄型子宫内膜的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建了薄型子宫内膜的转录组图谱，并识别了七种细胞类型，揭示了薄型子宫内膜中细胞类型比例和差异表达基因的富集通路 | 研究样本仅来自一名薄型子宫内膜患者和一名对照志愿者，可能存在样本量不足的问题 | 揭示薄型子宫内膜影响子宫内膜容受性的可能机制 | 薄型子宫内膜患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 18775个单个细胞 |
| 163 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the new existence form of dermal papilla cells in the hair follicle regeneration of cashmere goats
2022-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110316
PMID:35202721
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了山羊毛囊再生过程中真皮乳头细胞的新存在形式及其在毛发生长和维护中的关键作用 | 首次通过单细胞测序技术揭示了山羊毛囊再生过程中真皮乳头细胞的四种中间细胞状态及其在毛发生长和维护中的具体功能 | NA | 探索人类脱发问题中真皮乳头干细胞分化的深层机制 | 山羊的毛囊再生过程及真皮乳头细胞的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 164 | 2024-08-08 |
Clonal relations in the mouse brain revealed by single-cell and spatial transcriptomics
2022-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01011-x
PMID:35210624
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研究论文 | 本文通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑中早期前体细胞的克隆关系及其细胞表型 | 首次在体内使用条形码技术同时分析小鼠大脑中细胞表型和克隆关系，结合空间转录组学揭示了克隆相关细胞的迁移模式 | NA | 探究小鼠大脑中成熟细胞类型与前体细胞之间的谱系关系 | 小鼠大脑中的神经前体细胞及其克隆关系 | NA | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 数千个克隆 |
| 165 | 2024-08-08 |
Targeting IRE1 endoribonuclease activity alleviates cardiovascular lesions in a murine model of Kawasaki disease vasculitis
2022-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157203
PMID:35167493
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研究论文 | 研究通过遗传和药物手段减轻内质网应激，探讨其在川崎病血管炎小鼠模型中心血管病变发展的作用 | 首次探讨了内质网应激在川崎病病理生理学中的潜在作用，并证明了内质网应激与川崎病发病机制的因果关系 | NA | 研究内质网应激在川崎病心血管病变发展中的作用及潜在治疗靶点 | 川崎病小鼠模型及人类患者数据 | 心血管疾病 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型及人类患者 |
| 166 | 2024-08-08 |
Deep structural clustering for single-cell RNA-seq data jointly through autoencoder and graph neural network
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac018
PMID:35172334
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研究论文 | 提出了一种名为scDSC的深度结构聚类方法，用于单细胞RNA测序数据，结合了基于零膨胀负二项（ZINB）模型的自动编码器和图神经网络（GNN）模块 | scDSC方法通过引入ZINB模型和GNN模块，有效处理了单细胞RNA测序数据中的噪声、高维度和缺失事件问题，并采用相互监督策略统一了两种深度神经架构 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，以识别潜在的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器和图神经网络 | RNA测序数据 | 涉及六个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 167 | 2024-08-08 |
A human pluripotent stem cell-based model of SARS-CoV-2 infection reveals an ACE2-independent inflammatory activation of vascular endothelial cells through TLR4
2022-03-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.01.015
PMID:35180397
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研究论文 | 本文报道了一种基于人多能干细胞的SARS-CoV-2感染模型，揭示了血管内皮细胞通过TLR4的ACE2非依赖性炎症激活 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过TLR4途径在ACE2缺乏的内皮细胞中诱导炎症激活，并提供了单细胞RNA测序数据支持 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未涉及临床患者的广泛验证 | 探究SARS-CoV-2诱导的血管内皮炎症的直接致病机制 | 人多能干细胞衍生的内皮细胞及SARS-CoV-2感染 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括轻度和重度COVID-19患者的循环内皮细胞 |
| 168 | 2024-08-08 |
Deterministic scRNA-seq captures variation in intestinal crypt and organoid composition
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01391-1
PMID:35165449
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研究论文 | 本文开发了一种名为DisCo的确定性mRNA捕获珠和细胞共封装滴落系统，用于处理低输入样本（<500个细胞），并展示了其在分析肠道类器官和隐窝细胞异质性方面的应用 | DisCo系统通过结合机器视觉和多层微流控技术，实现了对低输入单细胞悬液的高效连续处理，捕获效率超过70%，速度可达每小时350个细胞 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以高效处理小规模个体组织样本 | 肠道类器官和隐窝的细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 分析了31个不同发育阶段的肠道类器官和多个小鼠肠道隐窝 |
| 169 | 2024-08-08 |
Aberrant translation regulated by METTL1/WDR4-mediated tRNA N7-methylguanosine modification drives head and neck squamous cell carcinoma progression
2022-03, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12273
PMID:35179319
|
研究论文 | 本文研究了tRNA N7-甲基鸟苷（m7G）修饰在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）发生和发展中的功能及机制 | 首次揭示了METTL1/WDR4介导的tRNA m7G修饰在HNSCC进展中的作用 | NA | 探究tRNA m7G修饰在HNSCC中的功能和机制 | tRNA m7G甲基转移酶复合物成分METTL1/WDR4在HNSCC中的作用 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用细胞功能丧失和功能获得实验、异种移植模型、条件性敲除和敲入小鼠模型进行研究 |
| 170 | 2024-08-08 |
Second Heart Field-Derived Cells Contribute to Angiotensin II-Mediated Ascending Aortopathies
2022-03-29, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了第二心场（SHF）来源的细胞在血管紧张素II（AngII）介导的升主动脉病变中的作用 | 发现SHF来源的细胞通过LRP1和转化生长因子-β信号通路在维持血管完整性中起关键作用，并揭示了PAI1在AngII诱导的升主动脉病变中的重要作用 | NA | 确定SHF来源的细胞是否以及如何参与升主动脉病变 | 升主动脉病变患者和AngII注射小鼠的升主动脉 | 心血管疾病 | NA | 质谱辅助蛋白质组学和单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质和mRNA | 人类升主动脉瘤组织和AngII注射小鼠的升主动脉 |
| 171 | 2024-08-08 |
Blue light responses in Cancer borealis stomatogastric ganglion neurons
2022-03-28, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.01.064
PMID:35148862
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研究论文 | 研究了蓝光对Cancer borealis螃蟹的口胃神经系统（STG）神经元活动的影响 | 首次发现并研究了STG神经元对蓝光的固有反应，并识别了潜在的介导分子cryptochrome | NA | 探索蓝光如何影响STG神经元的活动及其潜在机制 | Cancer borealis螃蟹的STG神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
Evidence of islet CADM1-mediated immune cell interactions during human type 1 diabetes
2022-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153136
PMID:35133983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析免疫细胞群，揭示了CADM1介导的细胞间相互作用在人类1型糖尿病中的作用 | 首次揭示了CADM1在1型糖尿病中作为细胞间相互作用的关键分子，可能成为预防该病的新治疗靶点 | NA | 探讨CADM1在1型糖尿病中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 人类1型糖尿病患者的胰腺组织 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1型糖尿病患者、自身抗体阳性个体及无糖尿病个体 |
| 173 | 2024-08-08 |
JEBIN: analyzing gene co-expressions across multiple datasets by joint network embedding
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab603
PMID:35134135
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研究论文 | 本文提出了一种名为JEBIN的方法，通过联合嵌入多个二分网络来分析跨多个数据集的基因共表达关系 | JEBIN能够以非线性和全局相似性的方式推断基因共表达关联，并能在线性时间复杂度内整合具有不同分布的数据集 | NA | 旨在通过元分析多源数据有效解决从单一数据集推断稳定基因共表达关联的难题 | 基因共表达模式及其在肝细胞癌（HCC）中的应用 | 生物信息学 | 肝癌 | 联合嵌入 | 二分网络 | 转录组数据 | 涉及多个表达数据集，包括肝细胞癌及其邻近正常组织的数据，以及最新的肝细胞癌单细胞RNA-seq数据 |
| 174 | 2024-08-08 |
scHFC: a hybrid fuzzy clustering method for single-cell RNA-seq data optimized by natural computation
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab588
PMID:35136924
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研究论文 | 本文提出了一种名为scHFC的混合模糊聚类方法，该方法通过自然计算优化，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | scHFC方法结合了模糊C均值（FCM）和Gath-Geva（GG）算法，并通过模拟退火算法和遗传算法进行优化，提高了聚类准确性和算法稳定性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据的聚类方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模糊聚类 | 基因表达数据 | 17个单细胞RNA测序数据集 |
| 175 | 2024-08-08 |
Improving bulk RNA-seq classification by transferring gene signature from single cells in acute myeloid leukemia
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac002
PMID:35136933
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPAGE的新方法，用于开发单细胞基因对签名（scGPS），以改善急性髓系白血病（AML）中的批量RNA-seq分类 | scPAGE方法通过解决不同测序技术间的差异，成功将单细胞基因签名转移到批量数据中，提高了分类性能 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术提高批量RNA-seq数据的分类准确性 | 急性髓系白血病（AML）的单细胞和批量RNA-seq数据 | 基因组学 | 血液病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
Erratum: Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.01.010
PMID:35141349
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of human corneal endothelium implicates lncRNA NEAT1 in Fuchs endothelial corneal dystrophy
2022-Mar-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.01.005
PMID:35141048
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序发现人类角膜内皮细胞的异质性，并揭示长非编码RNA NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜内皮细胞的四个亚群，并发现NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良中的关键作用 | NA | 探讨Fuchs内皮角膜营养不良的发展机制 | 人类角膜内皮细胞和Fuchs内皮角膜营养不良 | NA | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康人类角膜和UVA诱导的小鼠Fuchs内皮角膜营养不良模型 |
| 178 | 2024-08-08 |
Correction to: Redefining intestinal immunity with single-cell transcriptomics
2022-Mar, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00483-1
PMID:35132163
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Spatial components of molecular tissue biology
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01182-1
PMID:35132261
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研究论文 | 本文探讨了在空间分辨率下分析RNA和蛋白质表达的方法，并强调了开发相应计算工具的重要性 | 本文提出了将生物学问题和相关计算算法分类的方法，以促进空间转录组学和蛋白质组学的发展 | NA | 旨在最大化利用这些技术获得的生物学见解 | 细胞和组织在健康和疾病中的空间分析 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质表达数据 | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Vec2image: an explainable artificial intelligence model for the feature representation and classification of high-dimensional biological data by vector-to-image conversion
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab584
PMID:35106553
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研究论文 | 本文介绍了Vec2image模型，这是一个可解释的人工智能框架，通过向图像转换的方法来表示和分类高维生物数据 | Vec2image模型通过主成分坐标转换、深度残差神经网络和嵌入式k-最近邻表示在伪图像上进行特征工程、特征选择和分类器训练，提高了性能并提供了机制上的解释 | NA | 开发一个可解释的人工智能模型，用于高维生物数据的有效学习和分类 | 高维生物数据，特别是组织特异性单细胞数据和多个人胰岛scRNA-seq数据 | 机器学习 | 糖尿病 | scRNA-seq | CNN | 图像 | 多个人的胰岛scRNA-seq数据集 |