单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 247 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
scGR-seq: Integrated analysis of glycan and RNA in single cells
2022-03-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101179
PMID:35243371
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞中糖类和RNA联合分析的方法scGR-seq | scGR-seq结合了基于DNA条形码的凝集素糖类分析和单细胞转录组分析，用于揭示多细胞系统中糖类的细胞异质性 | NA | 开发一种新的技术用于单细胞中糖类和RNA的联合分析 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)和hiPSC衍生的神经前体细胞(NPCs) | NA | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA数据 | 使用人诱导多能干细胞和其衍生的神经前体细胞进行实验 |
| 142 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals PDGFRα+ stromal cell subpopulations that promote proacinar cell differentiation in embryonic salivary gland organoids
2022-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200167
PMID:35224622
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PDGFRα+基质细胞亚群在胚胎唾液腺类器官中促进前腺泡细胞分化的作用 | 首次识别出表达Fgf2和Fgf10的Pdgfra+基质细胞亚群，并阐明了其在促进前腺泡细胞分化中的作用机制 | 研究主要集中在胚胎唾液腺类器官，未涉及其他器官或成年唾液腺的具体应用 | 探讨基质细胞在器官发育中对上皮祖细胞分化的调控机制 | 胚胎唾液腺类器官中的基质细胞和上皮祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个基质细胞亚群和上皮祖细胞 |
| 143 | 2024-08-08 |
Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.02.001
PMID:35231421
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法，探讨了肾细胞癌（RCC）中三级淋巴结构（TLS）内B细胞反应的性质 | 首次详细描述了TLS在肾细胞癌中促进B细胞成熟和抗体产生的过程，并揭示了其与免疫治疗反应的关联 | NA | 研究TLS在肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 肾细胞癌中的三级淋巴结构（TLS）及其内的B细胞反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 144 | 2024-08-08 |
BRN2 as a key gene drives the early primate telencephalon development
2022-Mar-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl7263
PMID:35245119
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研究论文 | 本文研究了BRN2基因在早期灵长类大脑皮层发育中的关键作用 | 发现了BRN2基因在灵长类大脑扩张中的新机制功能 | NA | 探讨保守基因在灵长类大脑扩张中的作用 | BRN2基因及其在灵长类大脑发育中的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及猕猴样本 |
| 145 | 2024-08-08 |
Landscape of adenosine-to-inosine RNA recoding across human tissues
2022-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28841-4
PMID:35246538
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研究论文 | 本文介绍了一种新的检测方法，分析了9125个GTEx RNA-seq样本，生成了一个高度准确的包含1517个编码区域内编辑位点及其在人类组织中编辑水平的图谱。 | 提出了一种新的检测方法，能够系统地发现人类和其他哺乳动物中的RNA重编码位点。 | NA | 揭示人类组织中RNA重编码的全貌，并探讨其在人类生理和疾病中的作用。 | 人类组织中的RNA重编码位点及其编辑水平。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 9125个GTEx RNA-seq样本 |
| 146 | 2024-08-08 |
The clinicopathological characteristics, prognosis and immune microenvironment mapping in MSI-H/MMR-D endometrial carcinomas
2022-Mar-03, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-022-00466-5
PMID:35239036
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研究论文 | 研究了MSI-H/MMR-D子宫内膜癌的临床病理特征、预后及其与免疫微环境的关系 | 通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了MMR-D子宫内膜癌组织中的免疫景观，并探讨了免疫亚群在MSI子宫内膜癌中的作用 | NA | 探讨MSI亚型在子宫内膜癌中的预后价值及其与免疫环境的相关性 | MSI-H/MMR-D子宫内膜癌患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据和临床数据 | 78个POLE样本，123个MSI样本，299个其他EC样本，以及3371个细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 147 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatially resolved analysis uncovers cell heterogeneity of breast cancer
2022-03-03, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01236-0
PMID:35241110
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研究论文 | 本研究结合单核RNA测序（snRNA-seq）和基于微阵列的空间转录组学（ST）技术，分析了乳腺癌组织中的细胞异质性和空间分布 | 首次将单细胞和空间转录组学技术结合，揭示了乳腺癌细胞的亚型及其空间组织结构 | NA | 揭示乳腺癌细胞的异质性和复杂细胞结构对疾病进展和治疗反应的影响 | 乳腺癌组织中的细胞亚型及其空间分布 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq），基于微阵列的空间转录组学（ST） | NA | RNA序列 | 大型乳腺癌RNA-seq队列 |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics links malignant T cells to the tumor immune landscape in cutaneous T cell lymphoma
2022-03-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28799-3
PMID:35241665
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和全外显子测序技术，解析了皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的肿瘤内和病变间的异质性，并提出了一种多步骤的肿瘤演化模型 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了CTCL中恶性T细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | NA | 旨在深入理解皮肤T细胞淋巴瘤的本质，并为未来的精准医疗提供基础 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者的恶性T细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA分析，全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 19个皮肤病变样本来自15名CTCL患者 |
| 149 | 2024-08-08 |
Guidelines for bioinformatics of single-cell sequencing data analysis in Alzheimer's disease: review, recommendation, implementation and application
2022-03-02, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00517-z
PMID:35236372
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综述 | 本文系统回顾了用于分析单细胞测序数据并应用于阿尔茨海默病（AD）的生物信息学方法，并提供了具体的分析方向和研究设计指南 | 本文实现了推荐的每个主要分析方向的工作流程，并将其应用于AD中的大规模单核RNA测序（snRNA-seq）数据集 | 本文未明确提及具体的局限性 | 提供单细胞测序数据分析的全面回顾，并为AD及其他疾病或生物系统的单细胞水平研究提供有价值的资源 | 单细胞测序数据分析方法及其在阿尔茨海默病中的应用 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大规模单核RNA测序（snRNA-seq）数据集 |
| 150 | 2024-08-08 |
Integrated analysis on transcriptome and behaviors defines HTT repeat-dependent network modules in Huntington's disease
2022-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.05.004
PMID:35224162
|
研究论文 | 本研究通过综合分析转录组和行为学数据，揭示了亨廷顿病中HTT重复依赖的网络模块 | 首次进行了与CAG重复扩展相关的表型特征与基因型的综合分析，并发现了与行为特征显著相关的基因共表达组 | NA | 揭示亨廷顿病中与CAG重复长度相关的行为特征和基因表达模式 | 亨廷顿病的CAG重复扩展敲入小鼠的转录组和行为学特征 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和microRNA数据 | 445个mRNA样本和445个microRNA样本，以及396个PhenoCube行为和111个NeuroCube行为 |
| 151 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of motoneurons identifies regulators of synaptic wiring in Drosophila embryos
2022-03, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110255
PMID:35225419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、成像和遗传学方法，研究了果蝇胚胎中的运动神经元，揭示了同源域转录因子和下游免疫球蛋白域蛋白在细胞特异性连接中的重要作用 | 首次展示了细胞特异性组合的同源域转录因子和免疫球蛋白域蛋白在运动神经元与目标肌肉连接中的功能作用 | 研究主要集中在果蝇胚胎中的运动神经元，可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探究神经元电路结构的遗传决定机制 | 果蝇胚胎中的运动神经元及其与目标肌肉的连接 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个运动神经元细胞 |
| 152 | 2024-08-08 |
Corrigendum to 'single-cell transcriptomics of blood reveals a natural killer cell subset depletion in tuberculosis' [EBioMedicine 53 (2020) 102686]
2022-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.103905
PMID:35228015
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Identification of a discrete subpopulation of spinal cord ependymal cells with neural stem cell properties
2022-03-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110440
PMID:35235796
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research paper | 本文报道了脊髓室管膜细胞中存在一个具有神经干细胞特性的离散亚群，即室管膜A细胞（EpA细胞），并探讨了其在脊髓损伤后的自我更新和分化能力。 | 首次发现并鉴定了脊髓室管膜细胞中的一个功能异质性亚群EpA细胞，这些细胞在脊髓损伤后能转变为干细胞状态。 | NA | 研究脊髓室管膜细胞的异质性及其在脊髓损伤后的干细胞特性。 | 脊髓室管膜细胞及其亚群EpA细胞。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8%的室管膜细胞和0.1%的脊髓节段中所有细胞 |
| 154 | 2024-08-08 |
Bacteriocyte development is sexually differentiated in Bemesia tabaci
2022-03-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110455
PMID:35235797
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研究论文 | 研究揭示了白蝇Bemisia tabaci中细菌细胞发育的性别差异，发现母系遗传的细菌细胞在成年雌性中增殖而在成年雄性中退化 | 首次揭示了昆虫性别通过细胞和分子重塑影响细菌细胞发育的机制 | NA | 探究细菌细胞在白蝇中的性别特异性发育机制 | 白蝇Bemisia tabaci中的细菌细胞发育 | NA | NA | 单细胞转录组学和免疫组织化学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Molecular hallmarks of heterochronic parabiosis at single-cell resolution
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04461-2
PMID:35236985
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了异时共生对20个器官中不同细胞类型的影响，揭示了年轻和老年血液在异时共生中的细胞类型特异性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了异时共生中年轻血液如何通过调节线粒体功能等分子途径来逆转衰老模式 | NA | 探讨延缓或逆转生物衰老的可能性及其对疾病风险和维持活力的影响 | 异时共生中的不同细胞类型及其对年轻和老年血液的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20个器官 |
| 156 | 2024-08-08 |
Chromosome-scale and haplotype-resolved genome assembly of a tetraploid potato cultivar
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01015-0
PMID:35241824
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research paper | 本文报道了基于高质量长读长序列、717个花粉单细胞测序和Hi-C数据，对四倍体马铃薯品种'Otava'的3.1 Gb染色体级别和单体型解析基因组组装 | 首次成功重建了四倍体马铃薯的四条单体型基因组，揭示了近期近交导致的基因组中约50%的同源相同区域，以及约20%的基因组结构重排 | NA | 解析四倍体马铃薯的基因组结构和功能组织，为基因组辅助育种提供支持 | 四倍体马铃薯品种'Otava'的基因组 | 基因组学 | NA | 高质量长读长序列、单细胞测序、Hi-C | NA | 基因组数据 | 717个花粉单细胞 |
| 157 | 2024-08-08 |
Transcriptional kinetics and molecular functions of long noncoding RNAs
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01014-1
PMID:35241826
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研究论文 | 本文通过等位基因敏感的单细胞RNA测序技术，研究了长非编码RNA（lncRNA）的转录动力学及其分子功能 | 首次展示了lncRNA相比mRNA具有更长的转录爆发间隔，并观察到由于较低频率的爆发导致lncRNA表达的细胞间变异性增加 | NA | 探索lncRNA的转录动力学及其在细胞周期进展和凋亡中的细胞状态特异性功能 | 长非编码RNA（lncRNA）及其转录动力学和分子功能 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 异步生长的细胞 |
| 158 | 2024-08-08 |
The SpliZ generalizes 'percent spliced in' to reveal regulated splicing at single-cell resolution
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01400-x
PMID:35241832
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研究论文 | 本文介绍了一种名为splicing Z score（SpliZ）的无注释统计方法，用于检测单细胞RNA测序中的调控剪接 | SpliZ方法能够揭示单细胞分辨率下的调控剪接，为单细胞水平上的剪接调控研究提供了新的工具 | NA | 开发一种新的统计方法来检测单细胞水平上的调控剪接 | 人类肺细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | RNA测序数据 | 数百个具有细胞类型特异性剪接模式的基因 |
| 159 | 2024-08-08 |
Rod genesis driven by mafba in an nrl knockout zebrafish model with altered photoreceptor composition and progressive retinal degeneration
2022-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009841
PMID:35245286
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research paper | 本研究通过CRISPR-Cas9技术生成了nrl敲除斑马鱼模型，观察到杆状细胞数量减少和绿色锥状细胞过度生长的表型，并发现mafba基因在nrl非依赖的杆状细胞发育中的新作用。 | 首次揭示了mafba基因在斑马鱼杆状细胞发育中的新功能，并提出了关于杆状和绿色锥状光感受器发育和调控机制的工作模型。 | NA | 探究nrl基因在斑马鱼光感受器发育和维持中的确切作用。 | 斑马鱼的视网膜光感受器发育和退化。 | digital pathology | NA | CRISPR-Cas9, bulk and single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | 野生型和nrl敲除斑马鱼的视网膜细胞 |
| 160 | 2024-08-08 |
Intratumoral plasma cells predict outcomes to PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
2022-03-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.02.002
PMID:35216676
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序数据，探讨了B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的作用 | 发现B细胞和浆细胞的基因特征与PD-L1抑制剂治疗后的总生存期延长相关，且与CD8 T细胞信号独立 | NA | 研究B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的预测作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 891个非小细胞肺癌肿瘤样本 |