单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 247 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals MYC targeting gene MAD2L1 is associated with prostate cancer bone metastasis tumor dormancy
2022-Mar-19, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-022-00991-z
PMID:35305591
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了MYC靶向基因MAD2L1与前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制的关联 | 首次揭示了MYC靶向基因MAD2L1在前列腺癌骨转移肿瘤休眠机制中的潜在作用 | 研究仅基于小鼠模型和TCGA数据库中的数据，可能需要进一步的人体临床验证 | 研究前列腺癌骨转移中肿瘤细胞休眠的机制，以期为治疗和预防复发提供新策略 | 前列腺癌骨转移中的肿瘤细胞休眠机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq表达数据 | 378个差异表达基因，其中293个显著上调，85个显著下调 |
| 102 | 2024-08-08 |
Allergic airway recall responses require IL-9 from resident memory CD4+ T cells
2022-03-18, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abg9296
PMID:35302861
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研究论文 | 本研究使用慢性过敏原暴露后无过敏原休息期的鼠模型，探讨了分泌IL-9的CD4 T细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 首次明确指出IL-9分泌细胞具有驻留记忆T细胞表型，并且在过敏原回忆反应中起关键作用 | 研究仅限于鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨长期记忆细胞在过敏性气道回忆反应中的作用 | 分泌IL-9的CD4 T细胞及其在过敏性气道炎症中的作用 | NA | 哮喘 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 细胞 | 鼠模型 |
| 103 | 2024-08-08 |
Osteoclasts differential-related prognostic biomarker for osteosarcoma based on single cell, bulk cell and gene expression datasets
2022-Mar-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09380-z
PMID:35300639
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研究论文 | 本研究分析了骨肉瘤中破骨细胞的分化状态及其预后意义，基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，识别了与破骨细胞分化相关的预后生物标志物，并开发了风险评分模型和临床适用的诺模图。 | 首次综合利用单细胞和批量细胞RNA测序数据，识别了破骨细胞分化相关的预后基因，并开发了风险评分模型和诺模图，为骨肉瘤的预后预测提供了新的工具。 | NA | 研究骨肉瘤中破骨细胞分化的预后意义，并开发相关的预后生物标志物和预测模型。 | 骨肉瘤中的破骨细胞分化状态及其预后生物标志物。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 661个破骨细胞分化相关基因 |
| 104 | 2024-08-08 |
Homeostatic serum IgE is secreted by plasma cells in the thymus and enhances mast cell survival
2022-03-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29032-x
PMID:35301301
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研究论文 | 本文揭示了在稳态条件下，胸腺中的浆细胞分泌血清IgE并增强肥大细胞存活的现象 | 首次阐明了胸腺中浆细胞分泌IgE的来源及其发育过程，并展示了这些IgE如何调节肥大细胞的稳态 | NA | 研究稳态条件下IgE的来源及其对肥大细胞稳态的影响 | 胸腺中的浆细胞及其分泌的IgE | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
Circulating Immune Bioenergetic, Metabolic, and Genetic Signatures Predict Melanoma Patients' Response to Anti-PD-1 Immune Checkpoint Blockade
2022-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3114
PMID:35284940
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研究论文 | 本文研究了循环免疫细胞的生物能量学和代谢组学特征，以及单细胞RNA测序结果，以预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂的反应 | 首次揭示了响应者和非响应者在治疗前的代谢特征差异，并通过单细胞RNA测序技术发现了与代谢变化相关的转录调控基因 | NA | 寻找预测黑色素瘤患者对PD-1免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 黑色素瘤患者在接受PD-1免疫检查点抑制剂治疗前的循环免疫细胞和血浆代谢物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据 | 多个黑色素瘤患者样本 |
| 106 | 2024-08-08 |
Comprehensive evaluation of deconvolution methods for human brain gene expression
2022-03-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28655-4
PMID:35292647
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研究论文 | 本文对人类脑部基因表达数据的反卷积方法进行了全面评估 | 通过比较人类脑部、胰腺和心脏的数据，评估了八种反卷积方法和九种细胞类型标记的准确性 | NA | 评估人类脑部转录组数据的反卷积方法 | 人类脑部转录组数据的反卷积方法及其细胞组成估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 近2000个人类脑部样本 |
| 107 | 2024-08-08 |
Targeting CD96 overcomes PD-1 blockade resistance by enhancing CD8+ TIL function in cervical cancer
2022-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003667
PMID:35288463
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研究论文 | 本文研究通过靶向CD96克服宫颈癌中PD-1阻断抵抗，增强CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能 | 发现CD96和PD-1共同负向调控CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能，CD96阻断与PD-1阻断联合使用有望治疗宫颈癌 | NA | 探索通过靶向CD96增强PD-1阻断疗法在宫颈癌治疗中的效果 | 宫颈癌患者、CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、CD96表达 | 免疫学 | 宫颈癌 | 流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据 | 来自宫颈癌患者的血液样本、肿瘤标本及肿瘤周围组织 |
| 108 | 2024-08-08 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
|
研究论文 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，重建了小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | 构建了一个有向无环图（TOME），用于系统地提名转录因子作为每种细胞类型分化的候选调控因子，并识别跨脊椎动物进化的细胞类型同源性 | NA | 全面描绘哺乳动物体内发育的主要细胞轨迹 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞轨迹 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有向无环图（TOME） | RNA | 约150,000个核，来自胚胎第8.5天（E8.5）的胚胎 |
| 109 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01262-w
PMID:35296821
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
A multidimensional coding architecture of the vagal interoceptive system
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04515-5
PMID:35296859
|
研究论文 | 本文展示了迷走感觉神经元（VSNs）如何通过多维编码架构来编码内脏器官、组织层和刺激模式这三个内感受信号的关键特征 | 首次揭示了VSNs通过多维编码架构来编码内感受信号的多个关键特征，包括内脏器官、组织层和刺激模式 | NA | 探讨迷走感觉神经元如何编码内感受信号的关键特征 | 迷走感觉神经元（VSNs）及其在内感受信号编码中的作用 | NA | NA | 多重投影条形码、钙成像引导的空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 来自小鼠七个主要器官的VSNs |
| 111 | 2024-08-08 |
A single factor elicits multilineage reprogramming of astrocytes in the adult mouse striatum
2022-03-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2107339119
PMID:35254903
|
研究论文 | 本研究通过一系列体内筛选实验，揭示单一因子能够诱导成年小鼠纹状体中的星形胶质细胞转化为诱导性神经前体细胞（iNPCs），进而生成神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 发现了在非神经发生区域，单一因子能够诱导成年大脑中的星形胶质细胞转化为多能性前体细胞，这一发现对再生医学具有重要意义 | NA | 探索成年大脑中细胞的可塑性及再生能力 | 成年小鼠纹状体中的星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
FibROAD: a manually curated resource for multi-omics level evidence integration of fibrosis research
2022-03-12, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baac015
PMID:35277958
|
研究论文 | 本文介绍了FibROAD数据库的开发，该数据库整合了来自文献和多组学数据的纤维化相关疾病的证据 | FibROAD数据库整合了来自多种器官和物种的多组学数据，为纤维化研究提供了全面的证据 | NA | 开发一个开放访问的数据库，以帮助研究人员和临床医生更好地理解和治疗纤维化疾病 | 纤维化相关基因和多组学数据 | 数字病理学 | 纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, miRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, MeDIP-seq, MBD-seq | NA | 多组学数据 | 超过4000个样本，来自17种不同器官的5个物种 |
| 113 | 2024-08-08 |
Subcellular progression of mesenchymal transition identified by two discrete synchronous cell lines derived from the same glioblastoma
2022-Mar-12, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04188-3
PMID:35278143
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研究论文 | 本研究从同一胶质母细胞瘤组织样本中分离并建立了两种具有不同形态和生物学特性的癌细胞系，并通过基因组和转录组分析揭示了它们在间质转化过程中的差异 | 成功分离并建立了两种源自同一胶质母细胞瘤组织的不同癌细胞系，并通过转录组分析揭示了间质转化过程的差异 | NA | 研究胶质母细胞瘤中间质转化的亚细胞过程 | 胶质母细胞瘤的癌细胞系及其间质转化过程 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两种癌细胞系及四份肿瘤样本 |
| 114 | 2024-08-08 |
Recent advances in the developmental origin of neuroblastoma: an overview
2022-Mar-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02281-w
PMID:35277192
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综述 | 本文综述了神经母细胞瘤（NB）的发育起源及其复杂的表观遗传景观的最新进展 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了参与正常发育和NB癌变的神经嵴细胞后代，并发现了NB特异性调控回路，为设计针对NB遗传和表观遗传决定因素的创新疗法提供了新视角 | NA | 探讨神经母细胞瘤的发育起源及其表观遗传调控机制，以设计新的靶向治疗策略 | 神经母细胞瘤及其发育起源和表观遗传调控机制 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，染色质免疫沉淀测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Distinct outcomes, ABL1 mutation profile, and transcriptome features between p190 and p210 transcripts in adult Philadelphia-positive acute lymphoblastic leukemia in the TKI era
2022-Mar-11, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-022-00265-2
PMID:35277197
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研究论文 | 本研究探讨了在酪氨酸激酶抑制剂时代，费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病（Ph+ ALL）患者中p190和p210转录本的临床特征、治疗结果、ABL1突变谱和转录组特征的差异 | 首次系统研究了Ph+ ALL患者中p190和p210转录本的差异信号传导和治疗结果，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了两种转录本的转录组特征 | 研究样本量相对较小，且仅包括成人患者 | 探究Ph+ ALL患者中p190和p210转录本的临床特征、治疗结果、ABL1突变谱和转录组特征的差异 | 305名接受化疗加酪氨酸激酶抑制剂治疗的Ph+ ALL成年患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 305名患者 |
| 116 | 2024-08-08 |
Fully-automated and ultra-fast cell-type identification using specific marker combinations from single-cell transcriptomic data
2022-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28803-w
PMID:35273156
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研究论文 | 本文开发了一种名为ScType的计算平台，用于基于scRNA-seq数据和细胞标记数据库实现全自动和超快速的细胞类型识别 | ScType平台能够提供无偏见且准确的细胞类型注释，确保正负标记基因在细胞簇和细胞类型中的特异性，并能区分健康和恶性细胞群体 | NA | 开发一种全自动和超快速的细胞类型识别方法 | 人类和小鼠组织的scRNA-seq数据 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 六个scRNA-seq数据集 |
| 117 | 2024-08-08 |
A comprehensive temporal patterning gene network in Drosophila medulla neuroblasts revealed by single-cell RNA sequencing
2022-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28915-3
PMID:35273186
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了果蝇大脑神经母细胞中的全面时间模式基因网络 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了一系列先前未知的时间转录因子（TTFs），并实验验证了它们在时间模式和神经元特化中的作用 | NA | 揭示果蝇神经母细胞中时间模式基因网络的完整性和调控机制 | 果蝇大脑神经母细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 所有年龄段的果蝇大脑神经母细胞 |
| 118 | 2024-08-08 |
Myoepithelial progenitors as founder cells of hyperplastic human breast lesions upon PIK3CA transformation
2022-03-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03161-x
PMID:35273332
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研究论文 | 研究评估了人类乳腺中的肌上皮（MEP）前体细胞在PIK3CA致癌转化中的作用 | 通过单细胞RNA测序和多色成像技术，揭示了终端导管是具有导管MEP标记的细胞的最丰富来源，并提出了一个模型，其中空间分布的MEP前体细胞作为双相乳腺病变的发起细胞 | NA | 评估肌上皮前体细胞在PIK3CA致癌转化中的作用及其对乳腺病变的影响 | 人类乳腺中的肌上皮前体细胞及其在PIK3CA转化后的表现 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及多种标记的细胞样本 |
| 119 | 2024-08-08 |
Selective pressure of endocrine therapy activates the integrated stress response through NFκB signaling in a subpopulation of ER positive breast cancer cells
2022-03-09, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-022-01515-1
PMID:35264224
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研究论文 | 本文研究了内分泌治疗对ER阳性乳腺癌细胞中NFκB信号通路和整合应激反应的影响 | 首次揭示了内分泌治疗通过NFκB信号激活整合应激反应，促进ER阳性乳腺癌细胞中NFκB阳性细胞群的生存和扩展 | 需要进一步研究如何针对NFκB和ISR信号的细胞群进行有效治疗 | 探讨乳腺癌细胞在内分泌治疗压力下的生存机制，以改善患者预后 | ER阳性乳腺癌细胞中的NFκB信号通路和整合应激反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和生物信息学方法 | NA | RNA | 涉及乳腺癌细胞系和患者来源的模型 |
| 120 | 2024-08-08 |
Uncovering the molecular identity of cardiosphere-derived cells (CDCs) by single-cell RNA sequencing
2022-03-08, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-022-00913-y
PMID:35258704
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究心脏来源细胞（CDCs）的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了CDCs的分子身份，并发现CXCL6作为CDCs的新特异性标记物 | 研究主要集中在体外实验和分子层面，未涉及CDCs在体内的长期效果和临床应用 | 探索心脏来源细胞（CDCs）的分子身份及其在疾病治疗中的潜在作用 | 心脏来源细胞（CDCs）及其与心脏非肌细胞和非造血细胞的比较 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNAseq） | NA | RNA序列数据 | 包括婴儿和成人的CDCs样本 |