单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 248 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-05 |
A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration
2022-03-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj9949
PMID:35319981
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研究论文 | 本研究提出了一种转录组指导的药物靶标发现策略，识别了用于肺部再生的受体配体 | 开发了一种新方法来识别针对慢性阻塞性肺病(COPD)的再生药物靶标，强调了EP和IP前列腺素受体配体的疗效 | 研究可能未充分考虑其他可能影响慢性病修复机制的因素 | 探索治疗慢性疾病中的组织修复缺陷的新药物靶点 | 烟草相关的慢性阻塞性肺病患者及其小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 结合慢性阻塞性肺病的临床样本和吸烟小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-05 |
secDrug: a pipeline to discover novel drug combinations to kill drug-resistant multiple myeloma cells using a greedy set cover algorithm and single-cell multi-omics
2022-03-09, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-022-00636-2
PMID:35264575
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研究论文 | 本文介绍了一种计算管道，用于发现对抗耐药性多发性骨髓瘤细胞的新药组合 | 提出了一种结合药理基因组数据的优化算法来预测新药组合，并开发了可普遍应用的R软件包 | 实验主要在体外进行，临床应用效果尚未验证 | 研究针对耐药性多发性骨髓瘤的新药组合的发现 | 主要研究耐药性多发性骨髓瘤细胞及其药物组合 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，CyTOF单细胞蛋白组学，CRISPR基因编辑 | 贪婪集合覆盖算法 | 基因组数据，转录组数据，细胞系数据 | 使用了多个代表耐药性的人的多发性骨髓瘤细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Unveils the Role of the Tumor Immune Microenvironment and Notch Signaling in Dormant Minimal Residual Disease
2022-Mar-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-1230
PMID:34965936
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤免疫微环境和Notch信号通路在休眠微小残留疾病中的角色 | 首次利用新的免疫竞争转基因模型研究休眠微小残留疾病，并发现Jagged-1/Notch信号通路在肿瘤发生中的多重调控作用 | 尚未完全阐明肿瘤休眠的复杂生态系统及其影响因素 | 探讨休眠的分子通路和微环境的作用，提供新的策略延长癌症休眠 | 休眠微小残留疾病及其相关的肿瘤细胞和免疫细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-05 |
Isolation and Profiling of Human Primary Mesenteric Arterial Endothelial Cells at the Transcriptome Level
2022-03-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63307
PMID:35343966
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研究论文 | 本文展示了一种从供体肠系膜动脉分离人类原代内皮细胞的方法，以捕捉其原生状态 | 开发了隔离和初步分析内皮细胞转录组的新技术 | 研究依赖于供体的可用性，且可能受到细胞分离过程中外部变量的影响 | 揭示内皮细胞在发展、健康和疾病中的角色 | 人类原代内皮细胞，特定于肠系膜动脉 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-05 |
Precision analysis of mutant U2AF1 activity reveals deployment of stress granules in myeloid malignancies
2022-03-17, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.02.025
PMID:35303483
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研究论文 | 该文章研究了U2AF1突变在骨髓恶性肿瘤中的作用及其对应激颗粒的影响。 | 文章揭示了U2AF1突变带来的新3'剪接位点接触，以及这些突变如何通过影响应激颗粒成分促进癌症发展。 | 研究主要集中在特定突变，可能无法全面反映所有U2AF1突变的影响。 | 研究U2AF1突变对剪接和癌症的影响，特别是在骨髓恶性肿瘤中的作用。 | 研究对象包括U2AF1突变的细胞系和患者来源的骨髓增生异常综合症/急性髓性白血病细胞。 | 数字病理学 | 骨髓恶性肿瘤 | 交联免疫沉淀 | NA | RNA-seq | 涉及U2AF1突变细胞系和患者来源的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-05 |
Omega-3/Omega-6 Long-Chain Fatty Acid Imbalance in Phase I Retinopathy of Prematurity
2022-Mar-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu14071333
PMID:35405946
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研究论文 | 本研究探讨了ω-3和ω-6长链多不饱和脂肪酸在早产儿童第I期视网膜病变中的作用 | 研究首次揭示了ω-3和ω-6长链脂肪酸在保护视网膜神经血管功能中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理反应 | 探讨ω-3和ω-6长链脂肪酸对早产儿童第I期视网膜病变的影响 | 研究对象为糖尿病相关的早产小鼠模型 | 数字病理学 | 早产视网膜病变 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 生物学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-05 |
Culture shock: microglial heterogeneity, activation, and disrupted single-cell microglial networks in vitro
2022-03-28, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00531-1
PMID:35346293
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在离体培养条件下的异质性和激活情况 | 揭示了培养的微胶质细胞在转录上表现出显著的异质性，并且在激活的表型与其正常状态之间转变的关键驱动因素 | 离体培养的微胶质细胞不能完全代表体内的微胶质细胞特性 | 研究离体培养的微胶质细胞是否能够再现体内微胶质细胞的特征 | 基于单细胞RNA测序比较从大脑新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | CAUSAL PREDICTIVE NETWORK MODELS | 基因表达数据 | 比较了新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals expression profiles of Trypanosoma brucei sexual stages
2022-03, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010346
PMID:35255094
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研究论文 | 本研究揭示了植物瘤虫Trypanosoma brucei性阶段的表达谱。 | 使用单细胞RNA测序技术分析了感染了茧蝇的三种不同组织中的植物瘤虫，通过电子基因表达来识别组织特异性细胞类型 | 需要进一步实验以确定未知功能的蛋白质是否在配子形成和/或融合中起到作用 | 本研究旨在探索植物瘤虫的性生殖分子特征及其进化 | 研究对象为388个来自感染茧蝇的不同组织的单个植物瘤虫 | 生物信息学 | 非洲锥虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 388个植物瘤虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of the human surfactant air-liquid interface culture reveals alveolar type II cell-like transcriptome
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.11.006
PMID:34977273
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研究论文 | 该文章描述了一种基于H441细胞的空气-液体界面培养模型的转录组特征 | 提出了一种新的细胞培养平台SALI模型，能在长时间内维持多种生理特性，并与人类肺泡II型细胞相似 | 未提及研究模型的长期可持续性和实际应用中的局限性 | 旨在为研究和修正肺表面活性蛋白B缺乏症提供可靠的细胞培养模型 | 主要研究H441细胞在空气-液体界面培养下的转录组特征 | 数字病理学 | 间质性肺病 | RNA-seq | SALI培养模型 | 转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Chronic superphysiologic AMH promotes premature luteinization of antral follicles in human ovarian xenografts
2022-03-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi7315
PMID:35263130
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research paper | 研究探讨了超生理水平的抗穆勒氏管激素（AMH）对人类卵巢异种移植中卵泡黄素化的影响 | 首次通过共移植人卵巢皮质与表达AMH的血管内皮细胞，并进行单细胞RNA测序，揭示了超生理水平AMH对卵泡发育的影响 | 研究样本量较小，且仅限于免疫缺陷小鼠模型 | 探究AMH对卵泡发育的影响及其可能导致的排卵功能障碍 | 人卵巢皮质中的卵泡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共观察了38个卵泡（19个对照组和19个AMH组） | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Spatially resolved transcriptomics of high-grade serous ovarian carcinoma
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103923
PMID:35252817
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研究论文 | 本研究首次全面采用空间转录组学方法分析高级别浆液性卵巢癌，通过分析治疗前肿瘤组织样本，揭示了化疗反应者之间的肿瘤组成差异 | 首次采用空间转录组学方法全面分析高级别浆液性卵巢癌，揭示了细胞集群组织和定位对化疗反应的影响 | 研究样本量较小，仅包括少数经过详细注释的高级别浆液性卵巢癌患者 | 深入分析高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织，探讨细胞集群的空间交互作用对化疗反应的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者，特别是化疗反应不同的患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小样本量，具体数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
CEBPβ regulation of endogenous IGF-1 in adult sensory neurons can be mobilized to overcome diabetes-induced deficits in bioenergetics and axonal outgrowth
2022-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04201-9
PMID:35298717
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研究论文 | 本研究探讨了CEBPβ调控内源性IGF-1在成年感觉神经元中的作用，以及如何通过上调IGF-1来克服糖尿病引起的生物能量和轴突生长的缺陷 | 首次详细描述了CEBPβ在糖尿病模型中对内源性IGF-1表达的调控作用，并证明了CEBPβ过表达可以促进神经突生长和线粒体呼吸 | 研究主要基于体外细胞培养系统和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 研究内源性IGF-1在感觉神经元中的表达及其在糖尿病神经病变中的作用 | 感觉神经元、卫星胶质细胞（SGCs）和背根神经节（DRG） | 神经科学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、原位杂交 | NA | RNA | 包括STZ诱导的1型糖尿病大鼠、Zucker糖尿病肥胖（ZDF）大鼠、高脂/高糖饮食的小鼠和db/db 2型糖尿病小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
In vivo development and single-cell transcriptome profiling of human brain organoids
2022-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13201
PMID:35141969
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研究论文 | 本文通过将小型未成熟的人脑类器官注射到成年SCID小鼠的纹状体中，创新性地在体内开发了人脑类器官，并对其进行了单细胞转录组分析 | 本文创新性地在体内开发了人脑类器官，并发现这些类器官具有更多的支持细胞，如周细胞样细胞和脉络丛细胞，以及较低的细胞应激和凋亡水平 | 文中提到，由于移植手术引起的损伤等技术问题仍然限制了人脑类器官的应用 | 提供一种新方法来生成人脑类器官，以应用于疾病模型和治疗 | 人脑类器官及其在神经系统疾病中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 6131个GFP标记的人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
NGF-p75 signaling coordinates skeletal cell migration during bone repair
2022-03-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5716
PMID:35302859
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研究论文 | 本文研究了神经生长因子（NGF）通过p75信号通路在颅骨损伤后调节骨再生中的作用 | 首次揭示了NGF通过p75信号通路在骨修复过程中协调骨骼细胞迁移的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨骨损伤后神经信号与骨再生之间的关系 | 神经生长因子（NGF）及其p75受体在骨修复中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Clonal lineage tracing reveals shared origin of conventional and plasmacytoid dendritic cells
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.01.016
PMID:35180378
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研究论文 | 本研究使用诱导性谱系追踪结合克隆DNA条形码和单细胞转录组及表型分析（CITE-seq），在未经处理的成年小鼠中研究树突状细胞（DCs）的发育过程 | 揭示了常规DCs（cDCs）和浆细胞样DCs（pDCs）的共同起源，并提出了DC发育的新模式 | NA | 阐明树突状细胞的发育起源 | 树突状细胞（包括常规DCs和浆细胞样DCs）的发育过程 | NA | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组 | 成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Cell type-specific mechanism of Setd1a heterozygosity in schizophrenia pathogenesis
2022-03-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm1077
PMID:35245111
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研究论文 | 本研究通过生成Setd1a半合子不足的小鼠模型，探讨了这一与精神分裂症相关的表观遗传因子如何在高度相关的脑区影响基因表达 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Setd1a半合子不足在不同细胞类型中的高度可变的转录适应性，并发现这些变化与神经元形态发生和突触功能相关的基因失调有关 | NA | 理解Setd1a半合子不足在精神分裂症发病机制中的细胞特异性机制 | Setd1a半合子不足的小鼠模型及其在精神分裂症相关脑区的基因表达变化 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Widespread choroid plexus contamination in sampling and profiling of brain tissue
2022-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01416-3
PMID:34983929
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研究论文 | 本研究探讨了脑组织样本中脉络丛污染的问题，并提出了相应的解决方案 | 首次系统性地识别和分析了脑组织样本中的脉络丛污染，并提出了预防措施 | 无法完全确定某些差异表达的基因或蛋白质是否仅由脉络丛污染引起 | 揭示脑组织样本中脉络丛污染的问题及其对数据分析的影响 | 脑组织样本中的脉络丛污染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 基因表达谱分析, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 转录组数据 | 多个研究中的脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
Systems-based approaches to study immunometabolism
2022-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00783-9
PMID:35121805
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综述 | 本文综述了利用系统生物学方法研究免疫细胞代谢的现状和挑战 | 介绍了数学建模方法用于系统性分析免疫细胞代谢变化 | 讨论了代谢建模技术的应用和不足 | 定义免疫代谢的系统性质，总结细胞和系统层面的研究方法 | 免疫细胞的代谢 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Engineering a niche supporting hematopoietic stem cell development using integrated single-cell transcriptomics
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28781-z
PMID:35332125
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了从胚胎动脉血管中的造血内皮细胞向造血干细胞过渡的转录组特征，并识别了支持造血干细胞成熟和自我更新的信号分子。 | 本文通过伪时间排序揭示了造血内皮细胞向造血干细胞过渡过程中的基因表达动态，并识别了特定表达于发育中的造血干细胞的表面受体及其相应的配体。 | NA | 研究造血干细胞发育所需的信号交互作用，并推进造血干细胞在治疗应用中的工程化目标。 | 造血干细胞（HSCs）及其发育过程中的信号分子。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎动脉血管区域（AGM）来源的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell-type-specific diversification in human heart failure
2022-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00028-6
PMID:35959412
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序数据的整合分析，揭示了健康和心衰患者心脏的细胞组成及其转录特征 | 首次定义了健康和心衰患者心脏的细胞组成，并识别了与年龄和心衰相关的细胞特异性转录特征 | NA | 研究心衰患者心脏的细胞和转录组景观 | 健康和心衰患者的心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27名健康捐赠者和18名扩张型心肌病患者 | NA | NA | NA | NA |