单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 247 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
PTGES3 is a Putative Prognostic Marker in Breast Cancer
2022-03, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2021.08.033
PMID:34920330
|
研究论文 | 本研究分析了COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达模式，特别是PTGES3的表达与乳腺癌预后的关联 | 首次详细描述了PTGES3在乳腺癌中的表达模式及其作为预后标志物的潜力 | NA | 探讨COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达及其作为预后标志物的可能性 | 乳腺癌组织中COX/前列腺素通路酶的表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | Cox回归Kaplan-Meier生存分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了Cancer Genome Atlas数据和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium数据库中的样本 |
| 222 | 2024-08-08 |
Transcriptional differences between JAK2-V617F and wild-type bone marrow cells in patients with myeloproliferative neoplasms
2022-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2021.12.364
PMID:34921959
|
研究论文 | 研究JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录差异及其对骨髓增生性肿瘤患者的影响 | 首次联合单细胞RNA测序和JAK2基因分型，揭示了JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录效应 | NA | 探究JAK2-V617F突变对骨髓细胞转录组的影响 | 骨髓细胞中的JAK2-V617F突变 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名新诊断的原发性血小板增多症或真性红细胞增多症患者 |
| 223 | 2024-08-08 |
MEK inhibition suppresses metastatic progression of KRAS-mutated gastric cancer
2022-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15244
PMID:34931404
|
研究论文 | 本文通过开发基于胃癌的器官样模型，研究了MEK抑制剂trametinib在抑制KRAS突变胃癌转移进展中的作用 | 首次揭示了MEK抑制剂trametinib通过抑制肿瘤和微环境的MAPK信号传导，有效抑制KRAS突变胃癌的转移进展 | NA | 阐明致癌基因诱导的胃癌进展机制，并探索MEK抑制剂在抑制胃癌转移中的应用 | 胃癌细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学分析 | 器官样模型 | 基因表达数据 | 使用GAN小鼠来源的肿瘤细胞进行实验 |
| 224 | 2024-08-08 |
Skinny deeping: Uncovering immune cell behavior and function through imaging techniques
2022-03, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13049
PMID:34859448
|
综述 | 本文综述了通过活体成像技术揭示皮肤中中性粒细胞、树突状细胞和巨噬细胞行为及功能的关键研究 | 讨论了新兴成像技术如高含量蛋白质组筛选、空间转录组学和三维体积成像的集成应用 | NA | 深入理解皮肤中免疫细胞的行为和功能 | 皮肤中的中性粒细胞、树突状细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 活体成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 225 | 2024-08-08 |
Joint synovial macrophages as a potential target for intra-articular treatment of osteoarthritis-related pain
2022-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.11.014
PMID:34861384
|
综述 | 本文综述了滑膜巨噬细胞在骨关节炎相关疼痛中的作用及其作为关节内治疗潜在靶点的研究进展 | 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等先进技术，揭示了不同骨关节炎亚型中滑膜微环境内存在的多样性巨噬细胞亚群及其分子机制 | 目前缺乏针对单个细胞或分子的安全治疗方法 | 开发针对滑膜巨噬细胞的新型关节内治疗方案 | 滑膜巨噬细胞及其在骨关节炎疼痛中的作用 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing profiles of stem-differentiating xylem in poplar
2022-03, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13763
PMID:34882927
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-08 |
Deciphering the Dynamic Molecular Program of Radiation-Induced Endothelial Senescence
2022-03-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.11.019
PMID:34808254
|
研究论文 | 本研究通过系统生物学方法，解析了辐射诱导的内皮细胞衰老相关的动态转录程序。 | 首次揭示了辐射诱导内皮细胞早衰过程中白细胞介素-1信号通路的关键作用，以及内皮细胞向间充质细胞转化的过程。 | 研究主要集中在体外实验，辐射对内皮细胞衰老的影响还需体内实验进一步验证。 | 探究辐射诱导内皮细胞衰老的动态分子机制及其对正常组织损伤的影响。 | 辐射诱导的内皮细胞衰老及其相关分子程序。 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的内皮细胞样本 |
| 228 | 2024-08-08 |
Induced cell-autonomous neutropenia systemically perturbs hematopoiesis in Cebpa enhancer-null mice
2022-03-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005851
PMID:34814180
|
研究论文 | 研究Cebpa增强子缺失小鼠模型中，细胞自主性中性粒细胞减少如何系统性地干扰造血过程 | 首次揭示了Cebpa增强子缺失导致的细胞自主性中性粒细胞减少对造血干细胞的静止状态和造血过程的系统性影响 | NA | 探讨Cebpa增强子缺失对造血干细胞数量和造血过程的影响及其机制 | Cebpa增强子缺失小鼠的骨髓和造血干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 涉及Cebpa增强子缺失小鼠和野生型小鼠的骨髓移植实验 |
| 229 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了间充质基质细胞在三维羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观，以探索骨再生材料的生物活性 | 本文揭示了羟基磷灰石支架中类似于软骨内骨化的成骨过程，并阐明了成骨培养基介导的成骨机制，为改善成骨生物材料提供了新见解 | NA | 研究骨修复材料的成骨微环境，以加速骨再生 | 间充质基质细胞在羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 230 | 2024-08-08 |
Fibroblast-mediated intercellular crosstalk in the healthy and diseased heart
2022-03, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14234
PMID:34787896
|
综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞在健康和疾病心脏中的细胞间交流作用 | NA | NA | 探讨成纤维细胞在心脏稳态和疾病状态中的作用 | 心脏成纤维细胞与其他心脏细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-08 |
Co-varying neighborhood analysis identifies cell populations associated with phenotypes of interest from single-cell transcriptomics
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01066-4
PMID:34675423
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为共变邻域分析（CNA）的无偏方法，用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | CNA方法比基于聚类的方法更灵活，能够更敏感和准确地识别与疾病相关的细胞状态 | NA | 开发一种新的统计方法，用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | 单细胞转录组数据中的细胞群体及其与样本属性的关联 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Multiplexed droplet single-cell sequencing (Mux-Seq) of normal and transplant kidney
2022-03, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1111/ajt.16871
PMID:34687145
|
研究论文 | 本文介绍了多重液滴单细胞测序（Mux-Seq）在正常和移植肾脏组织中的应用 | Mux-Seq方法能够减少实验批次偏差和变异，即使在样本输入非常小的情况下 | NA | 研究移植排斥反应中免疫和实质细胞的特征，以及正常和移植肾脏的组织反应 | 正常和移植肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 六个正常肾脏和两个移植肾脏的组织样本 |
| 233 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of Lineage States, Tumor Microenvironment, and Subtype-Specific Expression Programs in Gastric Cancer
2022-03-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0683
PMID:34642171
|
研究论文 | 本文生成了一个全面的胃癌单细胞图谱，包含来自31名患者的48个样本，超过200,000个细胞，并识别了34种不同的细胞谱系状态，包括罕见的细胞群体。 | 首次生成了胃癌的全面单细胞图谱，并识别了新的罕见细胞群体，以及通过空间转录组学和独立批量RNA测序进行了正交验证。 | NA | 揭示胃癌的异质性，并为疾病管理提供高分辨率的分子资源。 | 胃癌的细胞谱系状态、肿瘤微环境和亚型特异性表达程序。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 超过200,000个细胞，来自31名患者的48个样本 |
| 234 | 2024-08-08 |
Cell segmentation in imaging-based spatial transcriptomics
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01044-w
PMID:34650268
|
research paper | 本文介绍了一种名为Baysor的细胞分割方法，该方法通过优化二维或三维细胞边界，结合转录组组成和细胞形态的联合似然性，用于基于成像的空间转录组学数据中的细胞分割。 | Baysor方法能够仅基于检测到的转录本进行分割，并且在某些情况下，与现有工具相比，可以将近乎翻倍的细胞数量进行分割，同时减少分割伪影。 | NA | 开发一种新的细胞分割方法，以提高基于成像的空间转录组学数据中细胞边界的识别准确性。 | 基于成像的空间转录组学数据中的细胞分割。 | digital pathology | NA | in situ sequencing, multiplexed RNA fluorescent hybridization | NA | image | 使用了五种不同的协议获取的数据进行评估。 |
| 235 | 2024-08-08 |
SH2 Domain-Containing Phosphatase 2 Inhibition Attenuates Osteoarthritis by Maintaining Homeostasis of Cartilage Metabolism via the Docking Protein 1/Uridine Phosphorylase 1/Uridine Cascade
2022-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41988
PMID:34569725
|
研究论文 | 本研究探讨了SH2域包含的磷酸酶2（SHP-2）在骨关节炎（OA）中的作用及其机制 | 首次揭示了SHP-2在骨关节炎中的作用，并阐明了其通过调节docking protein 1/uridine phosphorylase 1/uridine级联反应维持软骨代谢平衡的机制 | NA | 识别特定参与骨关节炎的蛋白酪氨酸磷酸酶（PTPs）并研究其作用机制 | 人骨关节炎软骨中的107个PTP基因表达，SHP-2酶活性，以及SHP-2抑制剂对骨关节炎进展的影响 | NA | 骨关节炎 | 单细胞测序，tandem mass tag labeling-based global proteomic analysis，稳定同位素标记氨基酸细胞培养标记的酪氨酸磷蛋白组分析 | NA | 基因表达数据，酶活性数据，蛋白质表达数据 | 人骨关节炎软骨样本，IL-1β处理后的原代软骨细胞，以及经过SHP-2抑制剂或celecoxib处理的DMM小鼠和IL-1β刺激的小鼠原代软骨细胞 |
| 236 | 2024-08-08 |
IL-37 regulates allergic inflammation by counterbalancing pro-inflammatory IL-1 and IL-33
2022-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15072
PMID:34460953
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-37通过平衡促炎性IL-1和IL-33的作用来调节过敏性炎症的机制 | 首次揭示了IL-37在过敏性哮喘中的抑制作用及其机制 | 研究主要集中在小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步的人体临床研究验证 | 旨在识别IL-37控制过敏性炎症的机制 | IL-37的目标细胞、基因表达变化以及在哮喘患者中的表达/生产比率 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序、激光捕获显微切割、微阵列基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 包括野生型、IL-1R1和IL-33缺陷的小鼠模型，以及哮喘患者的痰液和鼻分泌物样本 |
| 237 | 2024-08-08 |
Rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome shared megakaryocyte expansion in peripheral blood
2022-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220066
PMID:34462261
|
研究论文 | 本研究旨在识别类风湿关节炎（RA）、系统性红斑狼疮（SLE）和原发性干燥综合征（pSS）等自身免疫疾病在周围血中的共同转录谱和免疫细胞组成 | 发现了在这些自身免疫疾病中，巨核细胞（MK）的扩张是一个共同特征，这为理解这些疾病的病理机制提供了新的视角 | NA | 识别类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征等自身免疫疾病在周围血中的共同转录谱和免疫细胞组成 | 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、原发性干燥综合征和多重自身免疫疾病患者的周围血单个核细胞（PBMCs） | NA | 类风湿关节炎, 系统性红斑狼疮, 原发性干燥综合征 | RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA | 119名未经治疗的患者（41名RA，38名pSS，28名SLE和12名多重自身免疫）和20名健康对照 |
| 238 | 2024-08-08 |
Cancer biology deciphered by single-cell transcriptomic sequencing
2022-03, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-021-00868-1
PMID:34405376
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序在解析肿瘤生态系统及其在肿瘤发生、癌症干细胞模型、治疗抵抗和癌症转移中的应用 | 单细胞转录组测序技术使得能够详细剖析肿瘤生态系统，并在单细胞分辨率上促进对肿瘤发生的理解 | NA | 探讨单细胞RNA测序在近期癌症研究中的主要应用 | 癌症细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA |
| 239 | 2024-08-08 |
NMFLRR: Clustering scRNA-Seq Data by Integrating Nonnegative Matrix Factorization With Low Rank Representation
2022-03, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3099127
PMID:34310328
|
研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架NMFLRR，通过整合低秩表示（LRR）和非负矩阵分解（NMF）来识别细胞类型，并使用九个真实的scRNA-seq数据集测试了其性能 | NMFLRR框架通过引入局部约束图正则化项来捕获数据的局部几何信息，并使用交替方向乘子法（ADMM）算法同时获得数据的相似矩阵和低维特征 | NA | 开发一种新的计算方法，以准确识别单细胞类型 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF），低秩表示（LRR） | 基因表达数据 | 九个真实的scRNA-seq数据集 |
| 240 | 2024-08-08 |
Exploring the choroidal vascular labyrinth and its molecular and structural roles in health and disease
2022-03, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2021.100994
PMID:34280556
|
综述 | 本文综述了脉络膜在生理和病理生理机制中的作用，特别是脉络膜内皮细胞（CECs）的角色 | 讨论了CECs的表型特性、亚群以及从尸检眼中提取的原代CEC培养物中测量转录组学的价值 | 对于这些脉络膜视网膜疾病的临床特征和分子途径的理解仍然相对有限 | 深入了解脉络膜的特定临床和分子特性，以揭示广泛的脉络膜视网膜疾病的发病机制 | 脉络膜及其在健康和疾病中的分子和结构作用 | NA | 脉络膜视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据 | 从尸检眼中提取的原代CEC培养物 |