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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2024-08-08 |
Decoding the role of macrophages in periodontitis and type 2 diabetes using single-cell RNA-sequencing
2022-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101198R
PMID:35032412
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了巨噬细胞在牙周炎和2型糖尿病中的作用及其异质性 | 首次揭示了牙周炎中巨噬细胞的基因表达异质性,并展示了这些细胞在2型糖尿病患者中的转录和信号异质性 | 研究样本仅限于牙周炎和2型糖尿病患者,可能限制了结果的普遍性 | 探讨巨噬细胞在牙周炎和2型糖尿病中的作用及其异质性 | 牙周炎和2型糖尿病患者的牙龈组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自牙周炎和健康部位以及有无2型糖尿病的患者的牙龈组织样本 |
162 | 2024-08-08 |
Aging-related olfactory loss is associated with olfactory stem cell transcriptional alterations in humans
2022-02-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI155506
PMID:34990409
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研究论文 | 研究探讨了衰老相关嗅觉丧失与人类嗅觉干细胞转录改变之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序和培养模型研究了衰老嗅觉上皮干细胞的炎症相关变化 | NA | 探索衰老相关嗅觉丧失的细胞和分子机制 | 人类嗅觉上皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括老年嗅觉丧失患者的嗅觉黏膜活检样本 |
163 | 2024-08-08 |
To the bones: mapping the skeletal LEPR+ pool to component cell types
2022-02-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021110343
PMID:35005783
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了在稳态和多种病理条件下LEPR阳性骨骼细胞的组成和功能 | 首次详细解析了LEPR阳性骨骼前体细胞在不同生理和病理条件下的异质性 | NA | 揭示LEPR阳性骨骼前体细胞的异质性及其在不同条件下的功能 | LEPR阳性骨骼前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
164 | 2024-08-08 |
Human CD206+ macrophages associate with diabetes and adipose tissue lymphoid clusters
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146563
PMID:34990410
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研究论文 | 本文研究了肥胖和糖尿病患者脂肪组织中三种主要脂肪组织巨噬细胞(ATMs)亚型的特征及其与2型糖尿病的关系 | 首次详细描述了人类脂肪组织巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的基因表达特征 | 研究样本仅限于肥胖和糖尿病患者,可能限制了结果的普遍性 | 探讨脂肪组织巨噬细胞亚型与肥胖和糖尿病的关联 | 肥胖和糖尿病患者的脂肪组织巨噬细胞亚型 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 来自糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的内脏脂肪组织(VAT)和皮下脂肪组织(SAT)样本 |
165 | 2024-08-08 |
ID2 controls differentiation of enteroendocrine cells in mouse small intestine
2022-02, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.13773
PMID:34985199
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研究论文 | 本文研究了螺旋-环-螺旋转录因子ID2在小鼠小肠内分泌细胞分化中的作用 | 首次揭示了ID2在成年小肠中对内分泌细胞命运决定的重要作用,包括建立前后轴的内分泌细胞分化梯度和抑制向簇状细胞谱系的转化 | NA | 探究ID2在小鼠小肠内分泌细胞分化中的作用 | 小鼠小肠中的内分泌细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用遗传修饰的小鼠和类器官测定 |
166 | 2024-08-08 |
Ponesimod inhibits astrocyte-mediated neuroinflammation and protects against cingulum demyelination via S1P1 -selective modulation
2022-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101531R
PMID:34986275
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研究论文 | 本文研究了ponesimod通过选择性调节S1P1受体抑制星形胶质细胞介导的神经炎症并保护大脑扣带回免受脱髓鞘的作用 | ponesimod通过其对S1P受体的选择性作用,可能触及与现有S1PR调节剂不同的中枢神经系统机制 | NA | 探讨ponesimod在多发性硬化症治疗中的中枢神经系统作用机制 | ponesimod对S1PR的内吞和结合、人星形胶质细胞信号传导和单细胞RNA测序基因表达的影响,以及在体内对小鼠铜绿假单胞菌诱导的脱髓鞘的影响 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
167 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals altered NK cell subsets and reduced levels of cytotoxic molecules in patients with ankylosing spondylitis
2022-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17159
PMID:34994057
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了强直性脊柱炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞,揭示了NK细胞亚群和细胞毒性分子水平的改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示了强直性脊柱炎患者外周循环中NK细胞亚群和细胞毒性特征的改变 | 研究仅限于外周血单个核细胞,未涉及其他组织或器官 | 探究强直性脊柱炎发病机制中的NK细胞亚群和细胞毒性分子变化 | 强直性脊柱炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 强直性脊柱炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞样本 |
168 | 2024-08-08 |
Optical Cell Tagging for Spatially Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2022-02-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202113929
PMID:34970821
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研究论文 | 本文开发了一种名为OpTAG的新型化学平台,用于在空间解析的方式下将功能标签附着在细胞表面,从而实现空间解析的单细胞RNA测序(scRNA-seq)。 | OpTAG-seq方法的创新之处在于它能够提供细胞在多细胞样本中的位置信息,从而实现空间解析的scRNA-seq。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据中缺乏细胞位置信息的问题。 | 研究对象是迁移性癌细胞中的空间定义转录程序。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
169 | 2024-08-08 |
Immunotherapy of cancer in single-cell RNA sequencing era: A precision medicine perspective
2022-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112558
PMID:34953396
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 结合单细胞RNA测序技术,能够以单细胞分辨率评估肿瘤在免疫治疗药物作用下的机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗中的肿瘤异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录活性数据 | NA |
170 | 2024-08-08 |
Lipid-loaded tumor-associated macrophages sustain tumor growth and invasiveness in prostate cancer
2022-02-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210564
PMID:34919143
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的转录组图谱,发现了一类与脂质代谢失调相关的TAMs亚群,该亚群与前列腺癌进展和较短的无病生存期正相关 | 首次揭示了脂质积累的TAMs在前列腺癌进展中的作用机制,并提出了通过阻断Marco来减少脂质积累的治疗策略 | 研究主要基于模型动物和体外实验,需要在临床试验中进一步验证 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌进展中的作用机制及潜在治疗策略 | 前列腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其与脂质代谢的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类前列腺癌样本 |
171 | 2024-08-08 |
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.11.012
PMID:34936886
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术,深入分析了人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达,揭示了胚胎基因激活(EGA)在人类一细胞阶段的早期启动 | 本研究首次揭示了人类胚胎基因激活在一细胞阶段的早期启动,比之前认为的时间更早,并发现了数百个剪接转录本的低幅度上调 | NA | 探讨人类胚胎基因激活的确切时间和基因表达特征 | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达 | NA | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎 |
172 | 2024-08-08 |
Kidney-Targeted Renalase Agonist Prevents Cisplatin-Induced Chronic Kidney Disease by Inhibiting Regulated Necrosis and Inflammation
2022-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021040439
PMID:34921111
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研究论文 | 本研究通过特定递送肾调节素激动剂肽RP81至肾近端小管,探讨其对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 | 采用纳米粒子递送系统,实现了肾特异性递送肾调节素激动剂肽,有效减少了顺铂诱导的慢性肾脏病 | NA | 探讨肾特异性递送肾调节素激动剂肽对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 | 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序分析,Western blotting | NA | RNA | 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 |
173 | 2024-08-08 |
Novel insights into adipose tissue heterogeneity
2022-02, Reviews in endocrine & metabolic disorders
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s11154-021-09703-8
PMID:34935088
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综述 | 本文综述了脂肪组织的细胞组成及其通过单细胞RNA测序展现的异质性 | 探讨了脂肪组织中脂肪细胞和间质血管部分(SVF)细胞的深刻多样性及其对整体功能的影响 | 当前数据有限,对脂肪组织异质性和可塑性的生物学相关性理解尚不全面 | 旨在建立脂肪组织细胞异质性的图谱,以增进对其功能的理解 | 脂肪组织的细胞组成及其异质性 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞/核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
174 | 2024-08-08 |
Reversing T-cell Exhaustion in Cancer: Lessons Learned from PD-1/PD-L1 Immune Checkpoint Blockade
2022-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0515
PMID:34937730
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研究论文 | 本文讨论了通过PD-1/PD-L1免疫检查点阻断疗法逆转肿瘤中CD8 T细胞耗竭的机制及其对癌症免疫治疗发展的影响 | 通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析揭示了肿瘤微环境中CD8 T细胞的异质性及其在免疫检查点阻断后的不同反应能力 | NA | 重新评估免疫检查点阻断疗法的作用机制和作用位点 | CD8 T细胞在肿瘤微环境中的状态及其对免疫治疗的反应 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序,表观遗传学分析 | NA | RNA | NA |
175 | 2024-08-08 |
Cell type specificity of glucocorticoid signaling in the adult mouse hippocampus
2022-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13072
PMID:34939259
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研究论文 | 本文利用公开的单细胞RNA测序数据,研究了成年小鼠海马体中糖皮质激素信号的细胞类型特异性 | 首次在细胞类型水平上分析了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体的信号传导特异性 | NA | 探讨糖皮质激素在成年小鼠海马体中的细胞类型特异性信号传导 | 成年小鼠海马体中的糖皮质激素受体和盐皮质激素受体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
176 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing to Unveil the Mystery of Embryonic Development
2022-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202101151
PMID:34939365
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research paper | 本文综述了单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用及其技术原理 | 单细胞测序技术为理解胚胎发育的分子路线图提供了有力工具 | 单细胞测序是高度跨学科的,需要在特定生物学背景下对其多样性及其优缺点有全面的理解 | 探讨单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用 | 胚胎发育过程中的细胞命运决定 | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
177 | 2024-08-08 |
Stiffness is associated with hepatic stellate cell heterogeneity during liver fibrosis
2022-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00254.2021
PMID:34941452
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研究论文 | 本文研究了肝纤维化过程中肝脏硬度的分布及其对肝星状细胞(HSC)异质性的影响,并探讨了硬度如何通过特定的粘附分子途径放大纤维化反应。 | 首次揭示了硬度在整体器官、小叶和细胞水平上的异质性,并通过特定的粘附分子途径驱动纤维化反应的放大循环。 | NA | 理解肝纤维化中硬度的分布及其对肝星状细胞异质性的影响,并识别硬度放大纤维化反应的机制。 | 肝纤维化中的肝脏硬度分布、肝星状细胞异质性及纤维化反应的放大机制。 | 数字病理学 | 肝病 | 磁共振弹性成像、原子力显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 使用四氯化碳(CCl)诱导的肝纤维化小鼠模型与健康对照组进行比较,以及从健康和CCl处理的小鼠中提取的初级肝星状细胞进行单细胞RNA测序。 |
178 | 2024-08-08 |
Unravelling glioblastoma heterogeneity by means of single-cell RNA sequencing
2022-02-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2021.12.008
PMID:34902524
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了胶质母细胞瘤的异质性,并构建了一个更强大的统一知识库 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤的隐藏组成,包括患者间异质性、肿瘤内组织、癌症干细胞多样性、克隆马赛克现象和肿瘤微环境 | NA | 深入理解塑造胶质母细胞瘤病理生物学的多样性 | 胶质母细胞瘤的异质性 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及多个患者和肿瘤样本 |
179 | 2024-08-08 |
scShaper: an ensemble method for fast and accurate linear trajectory inference from single-cell RNA-seq data
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab831
PMID:34888622
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研究论文 | 本文介绍了scShaper,一种用于单细胞RNA测序数据快速准确线性轨迹推断的集成方法 | scShaper通过集成方法生成基于一组离散伪时间的连续平滑伪时间,能够推断多种三角函数轨迹,包括常用主曲线方法失败的轨迹 | NA | 开发更准确、更具泛化能力的细胞分化动态过程轨迹推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹推断 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成方法 | RNA测序数据 | 多种三角函数轨迹数据 |
180 | 2024-08-08 |
On the relation between input and output distributions of scRNA-seq experiments
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab841
PMID:34908126
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序实验中输入和输出分布之间的关系 | 提出了一个包含PCR扩增和测序的单细胞RNA测序模型,并推导了给定输入分布的输出分布的概率分布函数 | NA | 研究单细胞RNA测序中的技术噪声如何影响观察到的分布与细胞内分布之间的关系 | 单细胞RNA测序实验中的RNA拷贝数分布 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |