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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
A novel method for single-cell data imputation using subspace regression
2022-02-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-06500-4
PMID:35177662
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研究论文 | 本文开发了一种名为scISR的新型插补方法，用于恢复scRNA-seq数据中的缺失值（dropout） | scISR方法通过假设检验技术识别受dropout事件影响最大的零值条目，并使用子空间回归模型估计这些dropout值 | NA | 克服单细胞RNA测序数据中由于mRNA材料低捕获导致的表达值缺失问题 | scRNA-seq数据中的dropout值 | 生物化学 | NA | scRNA-seq | 子空间回归模型 | scRNA-seq数据 | 25个公开可用的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of dorsal root ganglia identifies molecular signatures of human nociceptors
2022-02-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj8186
PMID:35171654
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了人背根神经节中的伤害感受器分子特征 | 首次在人类伤害感受器中应用空间转录组学技术，识别了多种感觉神经元亚型及其转录组特征，并发现了性别差异 | 研究样本仅来自八名器官捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别人类伤害感受器的转录组特征，比较物种差异，并寻找潜在的药物靶点 | 人类背根神经节中的伤害感受器 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 八名器官捐赠者的背根神经节单个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
Erythropoietin directly remodels the clonal composition of murine hematopoietic multipotent progenitor cells
2022-02-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66922
PMID:35166672
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研究论文 | 研究探讨了促红细胞生成素（EPO）对小鼠造血多能祖细胞克隆组成的直接影响 | 首次通过细胞条形码技术追踪了EPO处理后的小鼠造血干细胞和祖细胞在不同造血细胞系中的分化情况，并发现EPO能直接作用于多能祖细胞，改变其克隆组成 | NA | 探究EPO对造血干细胞和祖细胞的直接影响及其对细胞命运的调控机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | 细胞条形码技术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 数百个单个小鼠造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Suspension culture promotes serosal mesothelial development in human intestinal organoids
2022-02-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110379
PMID:35172130
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研究论文 | 本文介绍了一种悬浮培养方法，用于促进人肠道类器官（HIOs）中浆膜间皮层的体外分化 | 悬浮培养方法简便且维护成本低，能促进HIOs中组织化的浆膜间皮层的分化，类似于初级人肠道浆膜间皮 | NA | 研究人肠道类器官中浆膜间皮层的发育 | 人肠道类器官（HIOs）中的浆膜间皮层 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
miR-137 and miR-122, two outer subventricular zone non-coding RNAs, regulate basal progenitor expansion and neuronal differentiation
2022-02-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110381
PMID:35172154
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研究论文 | 本文通过体内功能遗传学、单细胞RNA测序、活体成像和电生理学方法，研究了小鼠大脑中外侧室下带（oSVZ）表达的两种microRNAs（miR-137和miR-122）在皮质扩张中的作用。 | 首次揭示了miR-137和miR-122在调节皮质扩张中的细胞特异性作用，miR-137促进基底前体细胞自我复制和表层神经元命运，而miR-122减缓神经元分化速度。 | NA | 探讨外侧室下带（oSVZ）在皮质扩张中的作用及其分子机制。 | 小鼠大脑中的外侧室下带（oSVZ）表达的microRNAs（miR-137和miR-122）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像、电生理学 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Modeling iPSC-derived human neurofibroma-like tumors in mice uncovers the heterogeneity of Schwann cells within plexiform neurofibromas
2022-02-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110385
PMID:35172160
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研究论文 | 本文开发了一种基于诱导多能干细胞（iPSC）的神经嵴-施万细胞体外分化系统，并构建了用于分析不同2D和3D神经纤维瘤模型的谱系表达路线图 | 通过生成由iPSC衍生的NF1(-/-) SCs和NF1(+/-) pNF衍生的成纤维细胞组成的异型球体（神经纤维瘤球），成功在鼠体内生成了类似人类神经纤维瘤的肿瘤 | NA | 研究神经纤维瘤的异质性及其在鼠体内的模型构建 | 神经纤维瘤及其在鼠体内的模型 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | iPSC分化技术 | 异型球体模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Novel epigenetic network biomarkers for early detection of esophageal cancer
2022-02-14, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-022-01243-5
PMID:35164838
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研究论文 | 本文通过应用系统表观基因组学和细胞类型反卷积算法，分析了食管腺癌（EAC）患者和匹配的正常邻近组织的RNA-Seq和DNA甲基化数据，以识别不受细胞类型异质性影响的稳健生物标志物。 | 本文发现了12个在EAC中表观遗传失调的基因模块，并在4个独立的EAC队列中验证了所有这些模块。此外，通过单细胞RNA-Seq数据，展示了其中一个围绕CTNND2的原钙粘蛋白模块在EAC前驱病变Barrett's Esophagus中的失活状态。 | NA | 旨在早期检测食管癌并提高生存率 | 食管腺癌（EAC）及其前驱病变Barrett's Esophagus | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-Seq, DNA甲基化测序 | NA | RNA序列, DNA甲基化数据 | 包括EAC患者和匹配的正常邻近组织的样本，以及4个独立的EAC队列 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Uncovers Osteoblast Factor Growth Differentiation Factor 10 as Mediator of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypic Modulation Associated with Plaque Rupture in Human Carotid Artery Disease
2022-Feb-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031796
PMID:35163719
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了生长分化因子10（GDF10）在血管平滑肌细胞（VSMCs）表型转换中的作用，特别是在与颈动脉疾病相关的斑块破裂中的作用。 | 首次揭示了GDF10在VSMCs表型转换中的作用，特别是在颈动脉疾病中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨GDF10在VSMCs表型转换中的作用及其对颈动脉疾病的影响。 | 血管平滑肌细胞（VSMCs）和生长分化因子10（GDF10）。 | 数字病理学 | 颈动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自Apolipoprotein E-deficient（Apoe）小鼠的CD45细胞，分别来自正常胆固醇饮食（NCD）和高胆固醇饮食（HCD）的动脉粥样硬化主动脉。 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Regulatory network-based imputation of dropouts in single-cell RNA sequencing data
2022-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009849
PMID:35176023
|
研究论文 | 本文提出了一种基于转录调控网络的单细胞RNA测序数据中丢失值（'dropout imputation'）的计算预测方法 | 该方法利用外部独立的基因表达数据学习的转录调控网络，提高了dropout imputation的性能，并展示了不同基因对不同imputation方法的适应性 | 部分基因的细胞间变异无法通过测试的方法充分imputed，这些情况下基因表达水平最好由所有细胞的平均表达来预测 | 研究如何通过计算方法预测单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种人类单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogenic dysregulation of previously unrecognised chondral stem/progenitor cells in children with microtia
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.702
PMID:35184397
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Upregulation of CD14 in mesenchymal stromal cells accelerates lipopolysaccharide-induced response and enhances antibacterial properties
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103759
PMID:35141503
|
研究论文 | 研究通过系统方法比较不同遗传背景的间充质干细胞（MSCs）的抗菌活性，发现CD14的上调能加速MSCs对脂多糖（LPS）的反应并增强其抗菌特性 | 首次揭示了CD14在MSCs中的上调能显著增强其抗菌活性，并通过单细胞RNA测序展示了CD14上调后MSCs的转录状态变化 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的体内实验验证CD14上调的MSCs在实际感染治疗中的效果 | 探究调控间充质干细胞抗菌特性的遗传机制 | 间充质干细胞（MSCs）及其抗菌活性 | NA | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 蛋白质组 | 不同遗传背景的MSCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
SkewC: Identifying cells with skewed gene body coverage in single-cell RNA sequencing data
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103777
PMID:35146392
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SkewC的质量评估工具，用于识别单细胞RNA测序数据中基因体覆盖偏斜的细胞 | SkewC工具通过评估每个细胞的基因覆盖及其偏斜度作为质量指标，能够处理任何类型的scRNA-seq数据集，无论使用何种协议 | NA | 开发一种新的质量控制方法，以避免单细胞RNA测序数据中的错误聚类或虚假聚类 | 单细胞RNA测序数据中的质量较差的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
PD-L1+CD8+ T cells enrichment in lung cancer exerted regulatory function and tumor-promoting tolerance
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103785
PMID:35146396
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研究论文 | 本文通过CyTOF和IMC技术分析了原发性肺癌中的CD8 T细胞，发现PD-L1CD8 T细胞在肿瘤病变中富集，并通过PD-L1/PD-1轴抑制CD8 T细胞的增殖和细胞毒性能力。 | 首次揭示了PD-L1在CD8 T细胞中的图形模式和特征，并阐明了其在肺癌中的调节功能和促肿瘤耐受作用。 | NA | 研究PD-L1在CD8 T细胞中的作用及其在肺癌治疗中的潜在价值。 | PD-L1在CD8 T细胞中的表达模式及其在肺癌中的功能。 | 数字病理学 | 肺癌 | CyTOF, IMC, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 原发性肺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals time- and sex-specific responses of mouse spinal cord microglia to peripheral nerve injury and links ApoE to chronic pain
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28473-8
PMID:35149686
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓微胶质细胞在外周神经损伤后的时间性和性别特异性反应，并发现ApoE与慢性疼痛之间的关联。 | 首次展示了外周神经损伤后，小鼠脊髓微胶质细胞中性别特异性的炎症亚型生成，并揭示了ApoE在慢性疼痛中的作用。 | NA | 探究外周神经损伤后脊髓微胶质细胞的动态变化及其与慢性疼痛的关系。 | 小鼠和人类的脊髓微胶质细胞。 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的脊髓微胶质细胞样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Three-dimensional spatial transcriptomics uncovers cell type localizations in the human rheumatoid arthritis synovium
2022-02-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03050-3
PMID:35149753
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研究论文 | 本研究利用三维空间转录组学技术，探索了人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位 | 首次采用空间转录组学技术，对慢性滑膜炎症部位的局部组织相互作用进行研究，结合形态特征和高通量空间解析转录组学，提供更高的统计能力和更深入的疾病严重程度及治疗特定反应的监测 | NA | 研究类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位及其在组织中的相互作用 | 人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型及其定位 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | RNA-Seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Deciphering spatial genomic heterogeneity at a single cell resolution in multiple myeloma
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28266-z
PMID:35145077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤患者骨髓和溶骨性病变区域的恶性浆细胞，揭示了空间基因组异质性。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤中恶性浆细胞在溶骨性病变区域和骨髓中的基因表达差异。 | 研究样本仅来自10名患者，可能不足以全面代表所有多发性骨髓瘤患者的情况。 | 旨在深入理解多发性骨髓瘤导致的骨破坏疾病的机制。 | 研究对象为多发性骨髓瘤患者的恶性浆细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 148,630个浆细胞来自10名患者的24个不同位置 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
SM-Omics is an automated platform for high-throughput spatial multi-omics
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28445-y
PMID:35145087
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SM-Omics的全自动高通量空间多组学平台，该平台结合空间转录组学和基于抗体的蛋白质检测 | SM-Omics平台使用DNA条形码抗体、免疫荧光或其组合，实现了空间转录组学和空间抗体基多重蛋白质检测的规模化和结合 | NA | 推进空间转录组学在大规模应用中的应用 | 小鼠大脑、脾脏和结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 序列数据 | 最多可处理64个原位空间反应或96个测序准备库 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Homeostatic interferon-lambda response to bacterial microbiota stimulates preemptive antiviral defense within discrete pockets of intestinal epithelium
2022-02-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74072
PMID:35137688
|
研究论文 | 研究揭示了细菌微生物群如何通过刺激肠道上皮细胞中的干扰素-λ反应，促进肠道局部区域的抗病毒防御 | 首次发现细菌微生物群在稳态下刺激肠道上皮细胞中的干扰素刺激基因表达，并集中在成熟的上皮细胞中，从而预先激活抗病毒防御 | NA | 探讨细菌微生物群如何通过干扰素-λ反应在肠道上皮细胞中激活抗病毒防御 | 肠道上皮细胞和细菌微生物群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定病原体免费的小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
UINMF performs mosaic integration of single-cell multi-omic datasets using nonnegative matrix factorization
2022-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28431-4
PMID:35140223
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研究论文 | 本文提出了一种非负矩阵分解算法UINMF，用于整合包含共享和非共享特征的单细胞多组学数据集 | 引入了一个额外的元基因矩阵，使得非共享特征能够影响分解过程，从而提高了数据整合的准确性 | 先前的计算整合方法要求输入矩阵在基因或细胞数量上共享相同数量，因此只能使用共享特征 | 解决单细胞多组学数据集整合中的挑战，特别是包含共享和非共享特征的数据集 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、SNARE-seq和跨物种数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞多组学数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies an Il1rn+/Trem1+ macrophage subpopulation as a cellular target for mitigating the progression of thoracic aortic aneurysm and dissection
2022-Feb-08, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00362-2
PMID:35132073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胸主动脉瘤和夹层（TAAD）在小鼠模型中的细胞和分子变化，并识别出Il1rn+/Trem1+巨噬细胞亚群作为治疗TAAD的潜在靶点 | 首次在单细胞分辨率下全面分析TAAD发展过程中的细胞和分子变化，并发现抑制Il1rn/Trem1巨噬细胞亚群可以显著降低TAAD和主动脉破裂的发生率 | NA | 深入理解胸主动脉瘤和夹层（TAAD）发病过程中的调控变化，为医疗治疗开发提供依据 | 胸主动脉瘤和夹层（TAAD）的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的胸主动脉细胞，包括早期到晚期疾病阶段的三个时间点 | NA | NA | NA | NA |