单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 226 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Regulatory network-based imputation of dropouts in single-cell RNA sequencing data
2022-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009849
PMID:35176023
|
研究论文 | 本文提出了一种基于转录调控网络的单细胞RNA测序数据中丢失值（'dropout imputation'）的计算预测方法 | 该方法利用外部独立的基因表达数据学习的转录调控网络，提高了dropout imputation的性能，并展示了不同基因对不同imputation方法的适应性 | 部分基因的细胞间变异无法通过测试的方法充分imputed，这些情况下基因表达水平最好由所有细胞的平均表达来预测 | 研究如何通过计算方法预测单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 单细胞RNA测序数据中的丢失值 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种人类单细胞RNA测序数据集 |
| 102 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogenic dysregulation of previously unrecognised chondral stem/progenitor cells in children with microtia
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.702
PMID:35184397
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
Upregulation of CD14 in mesenchymal stromal cells accelerates lipopolysaccharide-induced response and enhances antibacterial properties
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103759
PMID:35141503
|
研究论文 | 研究通过系统方法比较不同遗传背景的间充质干细胞（MSCs）的抗菌活性，发现CD14的上调能加速MSCs对脂多糖（LPS）的反应并增强其抗菌特性 | 首次揭示了CD14在MSCs中的上调能显著增强其抗菌活性，并通过单细胞RNA测序展示了CD14上调后MSCs的转录状态变化 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的体内实验验证CD14上调的MSCs在实际感染治疗中的效果 | 探究调控间充质干细胞抗菌特性的遗传机制 | 间充质干细胞（MSCs）及其抗菌活性 | NA | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 蛋白质组 | 不同遗传背景的MSCs样本 |
| 104 | 2024-08-08 |
SkewC: Identifying cells with skewed gene body coverage in single-cell RNA sequencing data
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103777
PMID:35146392
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SkewC的质量评估工具，用于识别单细胞RNA测序数据中基因体覆盖偏斜的细胞 | SkewC工具通过评估每个细胞的基因覆盖及其偏斜度作为质量指标，能够处理任何类型的scRNA-seq数据集，无论使用何种协议 | NA | 开发一种新的质量控制方法，以避免单细胞RNA测序数据中的错误聚类或虚假聚类 | 单细胞RNA测序数据中的质量较差的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
PD-L1+CD8+ T cells enrichment in lung cancer exerted regulatory function and tumor-promoting tolerance
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103785
PMID:35146396
|
研究论文 | 本文通过CyTOF和IMC技术分析了原发性肺癌中的CD8 T细胞，发现PD-L1CD8 T细胞在肿瘤病变中富集，并通过PD-L1/PD-1轴抑制CD8 T细胞的增殖和细胞毒性能力。 | 首次揭示了PD-L1在CD8 T细胞中的图形模式和特征，并阐明了其在肺癌中的调节功能和促肿瘤耐受作用。 | NA | 研究PD-L1在CD8 T细胞中的作用及其在肺癌治疗中的潜在价值。 | PD-L1在CD8 T细胞中的表达模式及其在肺癌中的功能。 | 数字病理学 | 肺癌 | CyTOF, IMC, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 原发性肺癌样本 |
| 106 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals time- and sex-specific responses of mouse spinal cord microglia to peripheral nerve injury and links ApoE to chronic pain
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28473-8
PMID:35149686
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠脊髓微胶质细胞在外周神经损伤后的时间性和性别特异性反应，并发现ApoE与慢性疼痛之间的关联。 | 首次展示了外周神经损伤后，小鼠脊髓微胶质细胞中性别特异性的炎症亚型生成，并揭示了ApoE在慢性疼痛中的作用。 | NA | 探究外周神经损伤后脊髓微胶质细胞的动态变化及其与慢性疼痛的关系。 | 小鼠和人类的脊髓微胶质细胞。 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的脊髓微胶质细胞样本。 |
| 107 | 2024-08-08 |
Three-dimensional spatial transcriptomics uncovers cell type localizations in the human rheumatoid arthritis synovium
2022-02-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03050-3
PMID:35149753
|
研究论文 | 本研究利用三维空间转录组学技术，探索了人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位 | 首次采用空间转录组学技术，对慢性滑膜炎症部位的局部组织相互作用进行研究，结合形态特征和高通量空间解析转录组学，提供更高的统计能力和更深入的疾病严重程度及治疗特定反应的监测 | NA | 研究类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位及其在组织中的相互作用 | 人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型及其定位 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Deciphering spatial genomic heterogeneity at a single cell resolution in multiple myeloma
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28266-z
PMID:35145077
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤患者骨髓和溶骨性病变区域的恶性浆细胞，揭示了空间基因组异质性。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤中恶性浆细胞在溶骨性病变区域和骨髓中的基因表达差异。 | 研究样本仅来自10名患者，可能不足以全面代表所有多发性骨髓瘤患者的情况。 | 旨在深入理解多发性骨髓瘤导致的骨破坏疾病的机制。 | 研究对象为多发性骨髓瘤患者的恶性浆细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 148,630个浆细胞来自10名患者的24个不同位置 |
| 109 | 2024-08-08 |
SM-Omics is an automated platform for high-throughput spatial multi-omics
2022-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28445-y
PMID:35145087
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SM-Omics的全自动高通量空间多组学平台，该平台结合空间转录组学和基于抗体的蛋白质检测 | SM-Omics平台使用DNA条形码抗体、免疫荧光或其组合，实现了空间转录组学和空间抗体基多重蛋白质检测的规模化和结合 | NA | 推进空间转录组学在大规模应用中的应用 | 小鼠大脑、脾脏和结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 序列数据 | 最多可处理64个原位空间反应或96个测序准备库 |
| 110 | 2024-08-08 |
Homeostatic interferon-lambda response to bacterial microbiota stimulates preemptive antiviral defense within discrete pockets of intestinal epithelium
2022-02-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74072
PMID:35137688
|
研究论文 | 研究揭示了细菌微生物群如何通过刺激肠道上皮细胞中的干扰素-λ反应，促进肠道局部区域的抗病毒防御 | 首次发现细菌微生物群在稳态下刺激肠道上皮细胞中的干扰素刺激基因表达，并集中在成熟的上皮细胞中，从而预先激活抗病毒防御 | NA | 探讨细菌微生物群如何通过干扰素-λ反应在肠道上皮细胞中激活抗病毒防御 | 肠道上皮细胞和细菌微生物群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定病原体免费的小鼠和人类样本 |
| 111 | 2024-08-08 |
UINMF performs mosaic integration of single-cell multi-omic datasets using nonnegative matrix factorization
2022-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28431-4
PMID:35140223
|
研究论文 | 本文提出了一种非负矩阵分解算法UINMF，用于整合包含共享和非共享特征的单细胞多组学数据集 | 引入了一个额外的元基因矩阵，使得非共享特征能够影响分解过程，从而提高了数据整合的准确性 | 先前的计算整合方法要求输入矩阵在基因或细胞数量上共享相同数量，因此只能使用共享特征 | 解决单细胞多组学数据集整合中的挑战，特别是包含共享和非共享特征的数据集 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、SNARE-seq和跨物种数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞多组学数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集 |
| 112 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies an Il1rn+/Trem1+ macrophage subpopulation as a cellular target for mitigating the progression of thoracic aortic aneurysm and dissection
2022-Feb-08, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00362-2
PMID:35132073
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胸主动脉瘤和夹层（TAAD）在小鼠模型中的细胞和分子变化，并识别出Il1rn+/Trem1+巨噬细胞亚群作为治疗TAAD的潜在靶点 | 首次在单细胞分辨率下全面分析TAAD发展过程中的细胞和分子变化，并发现抑制Il1rn/Trem1巨噬细胞亚群可以显著降低TAAD和主动脉破裂的发生率 | NA | 深入理解胸主动脉瘤和夹层（TAAD）发病过程中的调控变化，为医疗治疗开发提供依据 | 胸主动脉瘤和夹层（TAAD）的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的胸主动脉细胞，包括早期到晚期疾病阶段的三个时间点 |
| 113 | 2024-08-08 |
Cardiac macrophages regulate isoproterenol-induced Takotsubo-like cardiomyopathy
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156236
PMID:35132957
|
研究论文 | 本文研究了心脏巨噬细胞在异丙肾上腺素诱导的类似Tako-Tsubo心肌病中的调节作用 | 首次揭示了巨噬细胞在Tako-Tsubo综合征发病机制中的关键作用，并提出了针对巨噬细胞的治疗策略 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探索Tako-Tsubo综合征的分子基础及其潜在的治疗方法 | 心脏巨噬细胞在Tako-Tsubo心肌病中的功能和作用机制 | 心血管疾病 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 114 | 2024-08-08 |
Elucidating minimal residual disease of paediatric B-cell acute lymphoblastic leukaemia by single-cell analysis
2022-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00814-7
PMID:35145224
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）在诊断、残留和复发阶段的动力学变化 | 结合单细胞RNA测序和B细胞受体测序，揭示了残留疾病中白血病细胞的复杂变化和耐药机制 | NA | 探究儿童B-ALL在化疗后残留疾病的生物学特性和耐药机制 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病的残留疾病 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 161,986个单细胞 |
| 115 | 2024-08-08 |
The threat of programmed DNA damage to neuronal genome integrity and plasticity
2022-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-01001-y
PMID:35145299
|
研究论文 | 本文探讨了程序性DNA损伤对神经元基因组完整性和可塑性的威胁 | 本文提出了神经元中存在高水平的程序性DNA断裂，这些断裂可能源于神经元发育、分化和维持过程中的生理性DNA代谢过程 | 程序性DNA断裂在正常神经生理和疾病中的作用仍相对未被探索 | 探索神经元中DNA修复的范式，保护基因组免受程序性基因断裂的错误影响 | 神经元基因组的完整性和可塑性 | NA | 神经退行性疾病 | bulk和单细胞测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis-Hope for the Future
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.12.002
PMID:35155850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Correlation between circulating innate lymphoid cell precursors and thymic function
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103732
PMID:35118353
|
研究论文 | 本文探讨了循环中的先天淋巴细胞前体与胸腺功能之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序分析显示野生型而非无胸腺裸鼠血液中存在大量ILC前体，并发现这些前体细胞在不同组织环境中分化为多种ILC亚群 | NA | 研究胸腺在维持不同外周组织中ILC池平衡中的作用 | 先天淋巴细胞前体及其在不同组织环境中的分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the individual alteration of intestinal mucosal immunocytes in Dusp6 knockout mice
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103738
PMID:35128351
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Dusp6敲除小鼠肠道黏膜免疫细胞的个体变化 | 首次通过scRNA-seq技术详细解析了Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | NA | 探索Dusp6敲除小鼠肠道白细胞的个体组成和转录变化 | Dusp6敲除小鼠的肠道白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为dynamo的分析框架，用于推断绝对RNA速度，重建连续向量场以预测细胞命运，并利用微分几何提取潜在的调控机制 | dynamo框架能够克服传统剪接型RNA速度分析的基本限制，实现对代谢标记的人类造血scRNA-seq数据准确的速度估计，并能预测基因扰动引起的细胞命运变化 | NA | 开发一种新的分析框架，以充分利用单细胞RNA测序数据，揭示细胞状态和转换的调控功能 | 单细胞RNA测序数据，特别是代谢标记的人类造血系统数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, RNA速度分析, 代谢标记 | 微分几何模型 | scRNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 120 | 2024-08-08 |
Highly Sensitive and Specific Responses of Oyster Hemocytes to Copper Exposure: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Different Cell Populations
2022-02-15, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.1c07510
PMID:35107992
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）分析了牡蛎血细胞在铜暴露下的不同细胞群体的响应 | 首次揭示了牡蛎血细胞在铜暴露下的异质性响应，并提供了1900个群体特异性的铜响应基因 | NA | 研究牡蛎血细胞在铜暴露下的响应机制 | 牡蛎血细胞的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12个血细胞集群 |