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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of LepR-positive skeletal cells reveals heterogeneous stress-dependent stem and progenitor pools
2022-02-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108415
PMID:34957577
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研究论文 | 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，分析了LepR阳性骨骼细胞在稳态和应激条件下的异质性和谱系层次结构 | 发现了一个与血管紧密相关的Notch3骨髓亚群，以及促进骨软骨分化的关键转录网络，并识别出一个具有高克隆活性的Sca-1骨膜亚群 | NA | 揭示LepR阳性骨骼干细胞和前体细胞的维护和谱系特化的细胞和分子机制 | LepR阳性骨骼细胞的异质性和谱系层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年长骨中的骨髓间质细胞和成骨谱系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Identification of kidney injury released circulating osteopontin as causal agent of respiratory failure
2022-02-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm5900
PMID:35213222
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配体-受体分析，识别了急性肾损伤（AKI）引起的急性肺损伤（ALI）中，肾脏释放的循环骨桥蛋白（OPN）作为关键介质的作用 | 首次揭示了肾脏释放的OPN在AKI-ALI中的因果作用，并证明了OPN抑制剂在预防AKI-ALI中的有效性 | 研究主要在动物模型中进行，需要在人类中进一步验证 | 识别并验证介导组织损伤间相互作用的分子 | 急性肾损伤和急性肺损伤 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型和人类患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
4D imaging analysis of the aging mouse neural stem cell niche reveals a dramatic loss of progenitor cell dynamism regulated by the RHO-ROCK pathway
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.007
PMID:35030320
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research paper | 研究通过4D成像分析老龄小鼠神经干细胞微环境，揭示了由RHO-ROCK通路调控的前体细胞动态活性的显著丧失 | 首次使用活体时间流逝成像结合计算机图像分析，探讨了年轻和老龄小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为，并发现RHO-ROCK信号通路在调控这些细胞运动和相互作用中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为及其与年龄相关的变化 | 神经干细胞（NSCs）和过渡放大前体（TAP）细胞的动态行为 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 图像 | 年轻和老龄的转基因小鼠V-SVZ全装片 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法，用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询，相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤（TBI）和脊髓损伤（SCI）中编码和长非编码基因表达变化的研究进展 | 强调了长非编码RNA（lncRNAs）在CNS损伤中的重要作用及其作为诊断、治疗和预后潜在靶点的可能性 | NA | 探讨TBI和SCI中基因表达变化及其分子机制 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的基因表达变化 | NA | 神经系统损伤 | RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例，并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后，疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性，需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human pancreatic islets reveals novel cellular states in type 1 diabetes
2022-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00531-x
PMID:35228745
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，研究了人类胰腺胰岛在1型糖尿病中的细胞状态 | 开发了一种先进的综合分析策略，用于评估胰腺胰岛并识别典型细胞类型 | NA | 揭示1型糖尿病中胰腺胰岛的新细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学、飞行时间流式细胞术、原位成像质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 24名1型糖尿病、自身抗体阳性和非糖尿病器官捐赠者的胰腺胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
The effects of H22 tumor on the quality of oocytes and the development of early embryos from host mice: A single-cell RNA sequencing approach
2022-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究探讨了H22肿瘤对宿主小鼠卵母细胞质量和早期胚胎发育的影响，通过单细胞RNA测序方法进行分析 | 首次揭示了H22肿瘤通过改变与生殖相关基因的表达模式，影响卵母细胞质量和早期胚胎发育 | NA | 研究癌症与女性生殖之间的关联 | H22肿瘤携带小鼠的卵母细胞和合子发育潜力 | NA | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 202个差异表达基因中，45个与卵母细胞质量密切相关 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Expansion of Fcγ Receptor IIIa-Positive Macrophages, Ficolin 1-Positive Monocyte-Derived Dendritic Cells, and Plasmacytoid Dendritic Cells Associated With Severe Skin Disease in Systemic Sclerosis
2022-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41813
PMID:34042322
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2465个来自12名弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者和10名健康对照者的皮肤活检样本中的髓系细胞转录组，以全面理解驱动dcSSc皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了dcSSc特异性的髓系细胞集群，并发现与正常对照相比，dcSSc中存在高度表达Fcγ受体IIIA的巨噬细胞集群和高度表达FCN-1等单核细胞标志物的mo-DCs，这些细胞与更严重的皮肤疾病相关。 | 本研究仅分析了12名dcSSc患者和10名健康对照者的皮肤样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。此外，髓系细胞的活化在不同患者间存在差异，表明潜在的病理机制和/或疾病活动的时间差异，但具体机制未深入探讨。 | 旨在全面理解驱动弥漫性皮肤系统性硬化症皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤活检样本中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2465个髓系细胞样本，来自12名dcSSc患者和10名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscape identifies the expansion of peripheral blood monocytes as an indicator of HIV-1-TB co-infection
2022-Feb, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2022.100005
PMID:37192986
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了HIV-1和结核病（TB）共感染患者的外周血单核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 首次揭示了HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的比例变化，并发现炎症性CD14CD16单核细胞亚群可作为诊断HIV-1-TB共感染的生物标志物 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定治疗阶段的病人 | 探究HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的转录组特征及其在疾病诊断中的应用 | HIV-1感染者、HIV-1-TB共感染者及其治疗前后的外周血单核细胞 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过60,000个细胞，包括80名患者的额外队列 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
Integration of multiple lineage measurements from the same cell reconstructs parallel tumor evolution
2022-Feb-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100096
PMID:36778661
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞全基因组测序技术和病毒谱系追踪，模拟结直肠癌肿瘤进化过程，构建高分辨率的克隆进化树 | 首次使用单细胞全基因组测序结合病毒谱系追踪技术，在结直肠癌肿瘤模型中重建肿瘤进化过程 | 研究仅限于结直肠癌肿瘤模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 研究肿瘤内部异质性（ITH）和肿瘤进化过程 | 结直肠癌肿瘤模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全基因组测序（WGS） | NA | 基因组数据 | 1,641个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γδ T cells
2022-02-26, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.11.013
PMID:36546093
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研究论文 | 本文通过结合转录组和染色质分析，构建了小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的单细胞转录组和染色质可及性图谱 | 首次揭示了γδ T1和γδ T17细胞在这些组织中的异质性，并推断了其潜在的调控机制，同时发现了具有未成熟特性的新型Gzma γδ T细胞亚群 | NA | 解析小鼠γδ T细胞的异质性及其在不同组织中的功能 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell transcriptome analysis reveals changes in gene expression in response to drug perturbation in rat kidney
2022-Feb-27, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsac007
PMID:35325072
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析，揭示了药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化，并构建了包含空间信息的大鼠肾细胞图谱 | 本研究首次结合空间和单细胞转录组分析，详细揭示了药物处理后大鼠肾脏中不同细胞类型的基因表达变化及其空间异质性 | NA | 探索药物干扰下大鼠肾脏基因表达的变化及其细胞和空间层面的机制 | 大鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
CBX3 is associated with metastasis and glutathione/glycosphingolipid metabolism in colon adenocarcinoma
2022-Feb, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-22-97
PMID:35284119
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研究论文 | 本研究探讨了CBX3在结肠腺癌转移中的作用及其与谷胱甘肽/糖神经鞘脂代谢的关系 | 揭示了CBX3在结肠腺癌转移中的高表达及其通过调节CCT6A、LSM5和GGCT等基因参与谷胱甘肽代谢的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序和TCGA数据库中的数据，可能需要更多临床样本验证 | 识别与结肠腺癌转移相关的关键基因失调，为发现潜在治疗靶点提供新策略 | 结肠腺癌的转移机制及CBX3的作用 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 17,469个肿瘤细胞来自23个样本，以及TCGA数据库中的326个结肠腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Metastatic Tumor Cell-Specific FABP7 Promotes NSCLC Metastasis via Inhibiting β-Catenin Degradation
2022-02-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11050805
PMID:35269427
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，发现脂肪酸结合蛋白7（FABP7）在转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤细胞中特异性上调，并可能作为不良预后的标志物。实验研究表明，FABP7促进了NSCLC细胞的转移能力，并通过抑制β-catenin的降解来激活Wnt信号通路。 | 本研究首次揭示了FABP7作为转移性肿瘤细胞特异性的促转移基因，并通过FABP7介导的细胞质β-catenin降解障碍，揭示了Wnt信号过度激活的新调控机制。 | NA | 探讨非小细胞肺癌转移的细胞特异性机制和关键分子。 | 非小细胞肺癌（NSCLC）细胞中的脂肪酸结合蛋白7（FABP7）及其对转移能力的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 转移性非小细胞肺癌患者的肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Quantifying the Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) from Bench to Bedside
2022-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051138
PMID:35267444
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综述 | 本文综述了上皮-间质转化（EMT）及其逆转过程在乳腺癌和其他实体瘤转移中的重要性，并讨论了将EMT生物学知识从实验室转移到临床的进展 | 文章介绍了多种检测和量化肿瘤中EMT状态的方法，包括免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞测序和多重肿瘤映射 | 目前尚未常规进行EMT状态的定义，以确定患者预后或指导临床治疗决策 | 探讨如何将EMT生物学知识从实验室转移到临床，并开发用于检测和测量患者肿瘤中EMT状态的诊断工具 | 上皮-间质转化（EMT）及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling unravels the adenoma-initiation role of protein tyrosine kinases during colorectal tumorigenesis
2022-02-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00881-8
PMID:35221332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了54,788个来自匹配组织样本的细胞，揭示了蛋白酪氨酸激酶在结直肠肿瘤发生中的腺瘤起始作用。 | 首次在单细胞水平上定义了正常、良性及恶性阶段的上皮细胞分子特征，并验证了蛋白酪氨酸激酶BMX和HCK在腺瘤起始中的潜在作用。 | NA | 研究结直肠肿瘤发生过程中的腺瘤起始机制。 | 结直肠肿瘤发生过程中的细胞类型、转录特征及差异表达基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 54,788个细胞样本，包括血液、正常组织、癌旁组织、息肉及结直肠癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
[Quantifying the state of cell differentiation based on the gene networks entropy]
2022-Feb-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.210140
PMID:35234401
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研究论文 | 本文提出了一种名为基因交互网络熵（GINE）的方法，用于量化细胞分化状态，以研究细胞动力学 | GINE方法通过构建基于基因关联的细胞特异性网络并定义GINE，将不稳定的基因表达数据转换为相对稳定的GINE，避免了额外复杂性和不确定性，并一定程度上规避了掉落事件的影响 | NA | 探索单细胞无序化水平的动态信息，从而研究生物系统过程的动力学 | 头颈鳞状细胞癌和慢性髓性白血病的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 基因交互网络熵（GINE） | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Organoids from human tooth showing epithelial stemness phenotype and differentiation potential
2022-Feb-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04183-8
PMID:35217915
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研究论文 | 本文首次从人类牙齿中开发出一种上皮类器官模型，展示了牙齿上皮干细胞特性及分化潜力 | 开发了首个从人类牙齿中提取的上皮类器官模型，揭示了与小鼠相似的新型干细胞特征，并展示了与牙髓干细胞的相互作用 | NA | 探索人类牙齿上皮干细胞的生物学特性和功能及其与牙髓的相互作用 | 人类牙齿上皮干细胞及其生物学特性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 细胞 | 从未萌出的智齿中分离的牙囊组织 | NA | NA | NA | NA |