单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Advancing root developmental research through single-cell technologies
2022-02, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102113
PMID:34562694
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研究论文 | 本文探讨了通过单细胞技术推进根发育研究的可能性 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学提高分辨率和特异性，加速根发育调控因子的发现 | 目前仅触及单细胞RNA测序潜力的表面，仍存在技术挑战 | 通过单细胞技术深入研究根发育的分子机制 | 主要研究对象是拟南芥的根分生组织 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 42 | 2024-08-07 |
Antimicrobial production by perifollicular dermal preadipocytes is essential to the pathophysiology of acne
2022-02-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abh1478
PMID:35171653
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨了皮肤成纤维细胞向脂肪细胞分化在痤疮发病机制中的作用 | 首次揭示了成纤维细胞向脂肪细胞分化过程中产生的抗菌肽cathelicidin在非感染性皮肤病痤疮中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和痤疮患者样本，可能存在种属差异 | 探究成纤维细胞向脂肪细胞分化在痤疮发病机制中的作用 | 人痤疮病灶和受挑战的小鼠皮肤 | NA | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人痤疮病灶和小鼠皮肤样本 |
| 43 | 2024-08-07 |
Cellular architecture of human brain metastases
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.043
PMID:35063085
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、质谱流式细胞术以及结合小鼠模型和计算机模拟方法，对15个人类脑转移瘤中的超过10万个恶性与非恶性细胞进行了综合分析 | 揭示了脑转移瘤微环境的组成，分子层面定义了血瘤界面，并发现了富含浸润性T细胞和巨噬细胞的基质免疫抑制状态 | NA | 旨在深入理解人类脑转移瘤的生物学基础及其与肿瘤细胞内在特性和宿主环境的关系 | 人类脑转移瘤中的恶性与非恶性细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学，质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 超过10万个细胞来自15个人类脑转移瘤 |
| 44 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of antibody- and lipid-based multiplexing methods for single-cell RNA-seq
2022-02-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02628-8
PMID:35172874
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研究论文 | 本文比较了基于抗体和脂质的多种复用方法在单细胞RNA测序中的应用效果 | 首次全面比较了不同复用策略在单细胞和单核RNA测序中的性能，并评估了其在临床样本中的应用潜力 | 研究主要集中在特定的细胞系和组织类型，可能需要进一步验证在更广泛的样本类型中的适用性 | 评估和比较不同复用技术在单细胞RNA测序中的效率和适用性 | 四种细胞系、人外周血单个核细胞（PBMCs）和初级小鼠组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括健康和SARS-CoV-2感染患者的PBMCs，以及多种小鼠组织 |
| 45 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of LepR-positive skeletal cells reveals heterogeneous stress-dependent stem and progenitor pools
2022-02-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108415
PMID:34957577
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研究论文 | 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，分析了LepR阳性骨骼细胞在稳态和应激条件下的异质性和谱系层次结构 | 发现了一个与血管紧密相关的Notch3骨髓亚群，以及促进骨软骨分化的关键转录网络，并识别出一个具有高克隆活性的Sca-1骨膜亚群 | NA | 揭示LepR阳性骨骼干细胞和前体细胞的维护和谱系特化的细胞和分子机制 | LepR阳性骨骼细胞的异质性和谱系层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年长骨中的骨髓间质细胞和成骨谱系细胞 |
| 46 | 2024-08-07 |
Identification of kidney injury released circulating osteopontin as causal agent of respiratory failure
2022-02-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm5900
PMID:35213222
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配体-受体分析，识别了急性肾损伤（AKI）引起的急性肺损伤（ALI）中，肾脏释放的循环骨桥蛋白（OPN）作为关键介质的作用 | 首次揭示了肾脏释放的OPN在AKI-ALI中的因果作用，并证明了OPN抑制剂在预防AKI-ALI中的有效性 | 研究主要在动物模型中进行，需要在人类中进一步验证 | 识别并验证介导组织损伤间相互作用的分子 | 急性肾损伤和急性肺损伤 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型和人类患者样本 |
| 47 | 2024-08-07 |
4D imaging analysis of the aging mouse neural stem cell niche reveals a dramatic loss of progenitor cell dynamism regulated by the RHO-ROCK pathway
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.007
PMID:35030320
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research paper | 研究通过4D成像分析老龄小鼠神经干细胞微环境，揭示了由RHO-ROCK通路调控的前体细胞动态活性的显著丧失 | 首次使用活体时间流逝成像结合计算机图像分析，探讨了年轻和老龄小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为，并发现RHO-ROCK信号通路在调控这些细胞运动和相互作用中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为及其与年龄相关的变化 | 神经干细胞（NSCs）和过渡放大前体（TAP）细胞的动态行为 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 图像 | 年轻和老龄的转基因小鼠V-SVZ全装片 |
| 48 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法，用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询，相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 |
| 49 | 2024-08-07 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤（TBI）和脊髓损伤（SCI）中编码和长非编码基因表达变化的研究进展 | 强调了长非编码RNA（lncRNAs）在CNS损伤中的重要作用及其作为诊断、治疗和预后潜在靶点的可能性 | NA | 探讨TBI和SCI中基因表达变化及其分子机制 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的基因表达变化 | NA | 神经系统损伤 | RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 |
| 51 | 2024-08-07 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和单细胞蛋白质组学结合机制研究，评估了严重COVID-19中病理性T细胞功能及其诱导信号 | 发现了在严重COVID-19中高度激活的CD16 T细胞，其具有增强的细胞毒性功能，并通过免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性脱颗粒和细胞毒性作用，这在其他疾病中未见 | NA | 研究严重COVID-19中T细胞是否参与疾病病理过程 | 严重COVID-19患者的T细胞功能及诱导信号 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞数据 | COVID-19患者的CD16 T细胞 |
| 52 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例，并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后，疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性，需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 |
| 53 | 2024-08-07 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本文通过多模态高维度策略分析了口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了与长期生存相关的免疫微聚集物的形成机制。 | 首次揭示了肿瘤特异性T细胞通过产生趋化因子支持免疫微聚集物的形成，从而形成正反馈循环，维持DC-T细胞微聚集物的形成。 | NA | 研究肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境与长期生存之间的关系。 | 口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤特异性T细胞及其免疫微环境。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | NanoString、Hyperion成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 组织样本 | 包括免疫响应阳性（IR+）和免疫响应阴性（IR-）的口腔鳞状细胞癌组织样本 |
| 54 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Conserved Metaplasia Program in Pancreatic Injury
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.027
PMID:34695382
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胰腺损伤后腺泡向导管化生（ADM）的保守程序 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺损伤后ADM的转录变化，并发现了与疾病进展相关的标记物 | 研究主要集中在小鼠模型和慢性胰腺炎患者的样本上，可能不完全代表所有胰腺疾病的情况 | 定义ADM产生的细胞群、相关的转录变化以及疾病进展的标记物 | 胰腺损伤后的腺泡细胞及其化生过程 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 超过13,000个EYFP+细胞，15例慢性胰腺炎患者的手术样本 |
| 55 | 2024-08-07 |
[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils]
2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文简要回顾了近年来中性粒细胞的生物行为及其在多种疾病中的作用 | 近年来对中性粒细胞异质性和与其他免疫细胞相互作用机制的研究推动了对中性粒细胞生理和病理生理角色的重新理解 | NA | 重新理解中性粒细胞的生理和病理生理角色 | 中性粒细胞及其在疾病中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术，空间转录组测序技术，多组学联合测序技术 | NA | 转录组 | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human pancreatic islets reveals novel cellular states in type 1 diabetes
2022-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00531-x
PMID:35228745
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，研究了人类胰腺胰岛在1型糖尿病中的细胞状态 | 开发了一种先进的综合分析策略，用于评估胰腺胰岛并识别典型细胞类型 | NA | 揭示1型糖尿病中胰腺胰岛的新细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学、飞行时间流式细胞术、原位成像质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 24名1型糖尿病、自身抗体阳性和非糖尿病器官捐赠者的胰腺胰岛 |
| 57 | 2024-08-07 |
The effects of H22 tumor on the quality of oocytes and the development of early embryos from host mice: A single-cell RNA sequencing approach
2022-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究探讨了H22肿瘤对宿主小鼠卵母细胞质量和早期胚胎发育的影响，通过单细胞RNA测序方法进行分析 | 首次揭示了H22肿瘤通过改变与生殖相关基因的表达模式，影响卵母细胞质量和早期胚胎发育 | NA | 研究癌症与女性生殖之间的关联 | H22肿瘤携带小鼠的卵母细胞和合子发育潜力 | NA | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 202个差异表达基因中，45个与卵母细胞质量密切相关 |
| 58 | 2024-08-07 |
Mapping the biogenesis of forward programmed megakaryocytes from induced pluripotent stem cells
2022-02-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj8618
PMID:35171685
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研究论文 | 本文开发了一种从多能干细胞生产血小板前体细胞巨核细胞的系统，并通过单细胞RNA测序技术映射了体外分化过程中的每个状态与其在体内的等效状态 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了五个表面标记，这些标记可重复纯化巨核细胞前体细胞，并优化了培养条件以增加巨核细胞前体细胞的生产 | 目前尚不清楚体外巨核细胞前体细胞状态是否与体内状态一致 | 研究旨在映射体外和体内巨核细胞前体细胞状态的平行关系，并优化体外衍生输血产品的生产 | 研究对象为从诱导多能干细胞衍生的巨核细胞及其前体细胞 | NA | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Expansion of Fcγ Receptor IIIa-Positive Macrophages, Ficolin 1-Positive Monocyte-Derived Dendritic Cells, and Plasmacytoid Dendritic Cells Associated With Severe Skin Disease in Systemic Sclerosis
2022-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41813
PMID:34042322
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2465个来自12名弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者和10名健康对照者的皮肤活检样本中的髓系细胞转录组，以全面理解驱动dcSSc皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了dcSSc特异性的髓系细胞集群，并发现与正常对照相比，dcSSc中存在高度表达Fcγ受体IIIA的巨噬细胞集群和高度表达FCN-1等单核细胞标志物的mo-DCs，这些细胞与更严重的皮肤疾病相关。 | 本研究仅分析了12名dcSSc患者和10名健康对照者的皮肤样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。此外，髓系细胞的活化在不同患者间存在差异，表明潜在的病理机制和/或疾病活动的时间差异，但具体机制未深入探讨。 | 旨在全面理解驱动弥漫性皮肤系统性硬化症皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤活检样本中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2465个髓系细胞样本，来自12名dcSSc患者和10名健康对照者 |
| 60 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscape identifies the expansion of peripheral blood monocytes as an indicator of HIV-1-TB co-infection
2022-Feb, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2022.100005
PMID:37192986
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了HIV-1和结核病（TB）共感染患者的外周血单核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 首次揭示了HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的比例变化，并发现炎症性CD14CD16单核细胞亚群可作为诊断HIV-1-TB共感染的生物标志物 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定治疗阶段的病人 | 探究HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的转录组特征及其在疾病诊断中的应用 | HIV-1感染者、HIV-1-TB共感染者及其治疗前后的外周血单核细胞 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过60,000个细胞，包括80名患者的额外队列 |