单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Emerging Single-cell Approaches to Understand HIV in the Central Nervous System
2022-02, Current HIV/AIDS reports
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11904-021-00586-7
PMID:34822063
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综述 | 本综述重点介绍了与HIV在中枢神经系统（CNS）转化研究相关的新兴单细胞测序方法，总结了CNS中HIV的有限单细胞研究，并讨论了未来HIV转化CNS研究的机会 | 利用单细胞技术的新方法在基因组、蛋白质组、转录组和表观基因组研究中提高了分辨率和深度。单细胞分析可以揭示HIV感染者CNS的扰动，并有助于揭示CNS中隐藏的HIV库的分子身份 | NA | 探讨HIV在中枢神经系统中的研究进展和未来研究方向 | HIV在中枢神经系统中的单细胞研究 | NA | HIV | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 202 | 2024-08-08 |
Gain-of-function mutations in RPA1 cause a syndrome with short telomeres and somatic genetic rescue
2022-02-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021011980
PMID:34767620
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研究论文 | 本文报道了RPA1基因的获得性功能突变导致一种综合征，该综合征表现为端粒缩短和体细胞遗传拯救现象 | 首次描述了由RPA1基因的获得性功能突变引起的人类疾病，并发现了体细胞遗传拯救现象 | NA | 研究RPA1基因突变对端粒生物学和临床症状的影响 | RPA1基因突变在4个无关联的短端粒综合征患者中的表现和机制 | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞测序数据 | 4个无关联的短端粒综合征患者 |
| 203 | 2024-08-08 |
An in situ sequencing approach maps PLASTOCHRON1 at the boundary between indeterminate and determinate cells
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab533
PMID:34791481
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研究论文 | 本文优化了空间转录组学方法——原位测序（ISS），以在同一组织切片上同时共定位90个基因的转录本，并展示了其在玉米（Zea mays）茎尖顶端的应用。 | 本文首次将空间转录组学应用于植物茎尖顶端，提供了转录事件的时空序列，并展示了PLASTOCHRON1（PLA1）在不定细胞和定型细胞边界处的特异性表达。 | 本文提到的技术在分辨率和灵敏度上仍有改进空间，这可能会影响其在植物发育生物学研究中的应用。 | 研究植物茎尖顶端的分生组织中分子信号如何在离散细胞中决定叶片何时何地开始发育。 | 玉米（Zea mays）茎尖顶端的组织切片中的90个基因的转录本。 | 植物生物学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 转录本 | 同一组织切片上的90个基因 |
| 204 | 2024-08-08 |
Hif-1a suppresses ROS-induced proliferation of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.10.009
PMID:34762860
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研究论文 | 研究报告了心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞在心肌梗死后表现出更高的缺氧状态，表达更多的缺氧诱导因子1α（HIF-1α），并具有增强的糖酵解代谢。 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）展示了CF特异性删除Hif-1a后的影响，并发现线粒体靶向抗氧化剂MitoTEMPO能挽救Hif-1a突变体的表型。 | NA | 探讨HIF-1α在心肌梗死后心脏成纤维细胞中的作用及其对线粒体活性氧（ROS）的调控机制。 | 心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及心肌梗死后的心脏成纤维细胞和间充质前体细胞，具体样本数量未详细说明。 |
| 205 | 2024-08-08 |
NKG2A is a late immune checkpoint on CD8 T cells and marks repeated stimulation and cell division
2022-02-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33859
PMID:34716584
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研究论文 | 研究探讨了NKG2A作为CD8 T细胞上的晚期免疫检查点，及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 揭示了NKG2A作为晚期抑制受体的表达动力学，及其与TIM-3和CD39的共同表达模式 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据，未涵盖所有可能的体内环境 | 阐明NKG2A在CD8 T细胞中的表达模式及其在肿瘤免疫治疗中的潜在作用 | NKG2A在CD8 T细胞上的表达及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及人类肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的单细胞转录组数据 |
| 206 | 2024-08-08 |
Paligenosis: Cellular Remodeling During Tissue Repair
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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研究论文 | 本文讨论了在组织修复过程中，新兴技术如何挑战了组织更新是由驻留干细胞单向分化的概念，并强调了细胞可塑性在组织更新中的核心作用。 | 提出了细胞可塑性作为组织更新的中心机制，并介绍了进化上保守的程序——paligenosis，成熟细胞通过这一程序重新进入细胞周期并再生受损组织。 | 文章指出，细胞可塑性虽然有益，但也带来了风险，如长期存活的细胞在周期性增殖和再分化过程中可能积累并传播获得性突变，增加癌症风险。 | 探讨细胞在组织修复过程中的重塑机制，并提出新的细胞增殖模式分类框架。 | 多细胞生物在稳态和修复过程中的细胞更新机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 207 | 2024-08-08 |
Mapping the genomic diaspora of gastric cancer
2022-02, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-021-00412-7
PMID:34702982
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综述 | 本文综述了胃癌基因组学的最新进展，包括非编码变异、表观遗传异常和转录组改变，并探讨了这些改变如何与环境影响、遗传因素和肿瘤微环境相互作用 | 介绍了单细胞测序和液体活检等技术在胃癌治疗抵抗机制和临床前靶点识别中的应用 | 需要设计特定的胃癌队列，将多模态基因组数据与治疗挑战和患者结果的纵向数据相结合 | 提高对胃癌发展生物学机制的理解，并推动胃癌精准肿瘤学和预防的临床举措 | 胃癌的基因组学特征及其与环境、遗传因素和肿瘤微环境的相互作用 | NA | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 208 | 2024-08-08 |
Profiling the specificity of clonally expanded plasma cells during chronic viral infection by single-cell analysis
2022-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149331
PMID:34727578
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和抗体谱测序研究了慢性病毒感染后小鼠骨髓浆细胞的克隆扩增特异性 | 首次通过单细胞测序技术全面描述了浆细胞的基因型、表型和抗体谱特征，并揭示了慢性病毒感染诱导的浆细胞克隆扩增和交叉反应性抗体的产生 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨慢性病毒感染期间浆细胞的克隆扩增特异性及其对抗体反应的影响 | 小鼠骨髓浆细胞及其在慢性淋巴细胞性脉络膜脑膜炎病毒感染后的抗体谱 | NA | NA | 单细胞转录组测序，抗体谱测序 | NA | 基因表达数据，抗体序列数据 | 数千个浆细胞 |
| 209 | 2024-08-08 |
Systems biological assessment of altered cytokine responses to bacteria and fungi reveals impaired immune functionality in schizophrenia
2022-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01362-0
PMID:34728799
|
研究论文 | 本研究通过系统生物学方法评估了精神分裂症患者对细菌和真菌的细胞因子反应变化，揭示了其免疫功能障碍的分子和细胞基础。 | 首次系统比较了精神分裂症患者与对照组的外周血单个核细胞对不同病原体的细胞因子反应，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞亚群中的广泛抑制和受损的趋化因子/细胞因子受体相互作用网络。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未涉及更广泛的临床症状或治疗效果的评估。 | 旨在深入理解精神分裂症中的免疫变化和分子通路。 | 精神分裂症患者和对照组的外周血单个核细胞对细菌、真菌及纯化微生物配体的细胞因子反应。 | 免疫学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 210 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of T lymphocytes in deficiency of adenosine deaminase 2
2022-02, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5A0621-314R
PMID:34730257
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞TCR测序技术，分析了10名腺苷脱氨酶2缺乏症（DADA2）患者的T淋巴细胞特征 | 首次详细描述了DADA2患者中T淋巴细胞的活化和细胞间相互作用，揭示了先前未被充分表征的细胞特征 | 研究样本量较小，仅包括10名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺苷脱氨酶2缺乏症中T淋巴细胞的特征及其在疾病中的作用 | 腺苷脱氨酶2缺乏症患者的T淋巴细胞 | 数字病理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 10名DADA2患者 |
| 211 | 2024-08-08 |
Pericyte Control of Blood Flow Across Microvascular Zones in the Central Nervous System
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
|
综述 | 本文综述了大脑微血管区域血流控制的当前知识，涉及命名问题和基于活体光学成像及单细胞转录组学的新进展 | 强调了壁细胞形态、基因表达和收缩动力学的重要区别，这些区别解释了动脉、过渡和毛细血管区域对血管活性介质反应的观察差异 | 仍有许多未解决问题，包括活体内激活不同周细胞类型的血管活性介质、周细胞-内皮细胞通讯在从毛细血管向动脉传递信号中的作用，以及神经系统疾病如何影响这些机制 | 探讨大脑微血管区域血流控制机制 | 大脑血管中的周细胞及其对血流控制的影响 | NA | NA | 活体光学成像、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics sheds light on the identity and metabolism of developing leaf cells
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab489
PMID:34687312
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了在两种不同环境条件下生长的拟南芥幼叶细胞的转录组，揭示了发育中的叶片中不同细胞群的特征和代谢活动 | 本研究首次揭示了拟南芥幼叶中14种细胞群的单细胞转录组图谱，并提出了细胞类型特异性标记 | NA | 探索发育中的叶片中不同细胞群的转录组特征和代谢活动 | 拟南芥幼叶细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,800个高质量叶片细胞 |
| 213 | 2024-08-08 |
Specialized Mechanosensory Epithelial Cells in Mouse Gut Intrinsic Tactile Sensitivity
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.026
PMID:34688712
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研究论文 | 本文研究了小鼠肠道中特化的机械感觉上皮细胞，探讨了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用。 | 首次揭示了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用，并展示了其在调节肠道生理功能中的重要性。 | NA | 探究Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用及其对肠道生理功能的调节。 | 小鼠肠道中的特化感觉肠内分泌细胞（EECs）及其表达的Piezo2机械门控离子通道。 | NA | NA | 单细胞RNA测序、光遗传学、光-电生理学、器官浴槽和体内研究。 | NA | 单细胞RNA测序数据、光遗传学激活数据、电生理数据。 | 使用了转基因小鼠模型，具体样本数量未详细说明。 |
| 214 | 2024-08-08 |
Dopamine receptor D2 antagonism normalizes profibrotic macrophage-endothelial crosstalk in non-alcoholic steatohepatitis
2022-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.09.032
PMID:34648896
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研究论文 | 本研究探讨了多巴胺受体D2拮抗剂在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中调节促纤维化巨噬细胞与内皮细胞相互作用的作用 | 首次发现多巴胺受体D2拮抗剂能特异性地阻断巨噬细胞中的YAP，从而减少肝脏纤维化 | NA | 研究YAP在肝脏修复中的特定作用，并寻找能选择性绕过纤维化并保留YAP促再生功能的药物 | 肝脏纤维化、NASH模型中的巨噬细胞和内皮细胞 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠、迷你猪和人类患者的肝脏样本 |
| 215 | 2024-08-08 |
Integrating genetic and epigenetic factors in chronic myeloid leukemia risk assessment: toward gene expression-based biomarkers
2022-02-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2021.279317
PMID:34615339
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综述 | 本文综述了基因表达（GE）分析在慢性髓性白血病（CML）中的应用，探讨其作为个性化治疗风险评估工具的潜力 | 提出了一个四阶段方法来开发基于GE的CML生物标志物，并探讨了遗传和表观遗传因素在耐药性和急性转化中的作用 | 不同细胞类型、技术使用和基因组数据解释的复杂性对将GE数据转化为具有临床实用性的生物标志物提出了挑战 | 评估GE分析在CML中的临床信息价值，并探索其作为个性化CML治疗风险评估工具的潜力 | 慢性髓性白血病（CML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种来源的患者材料 |
| 216 | 2024-08-08 |
Resident vascular endothelial progenitor definition and function: the age of reckoning
2022-02, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09817-2
PMID:34499264
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综述 | 本文综述了近年来对血管内皮祖细胞在体内的定义和功能的研究进展 | 利用单细胞测序技术深入理解内皮细胞在稳态和病理状态下的特性 | 对体内能够产生ECFC的内皮细胞群体的了解仍然有限 | 描述和分析体内祖细胞群体的研究，特别是通过小鼠研究反映ECFC的自更新和干细胞能力 | 血管内皮祖细胞的定义和功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 217 | 2024-08-08 |
Comparative description of the mRNA expression profile of Na+ /K+ -ATPase isoforms in adult mouse nervous system
2022-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25234
PMID:34415061
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研究论文 | 研究分析了成年小鼠神经系统中Na+/K+-ATPase异构体的mRNA表达谱 | 首次在单细胞水平上分析了不同脑区和神经元群体中Na+/K+-ATPase异构体的表达模式 | NA | 为了更好地理解这些疾病的病理机制，确定不同Na+/K+-ATPase亚基在大脑和特定细胞类型中的表达模式 | 成年小鼠神经系统中的Na+/K+-ATPase异构体的mRNA表达 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | scRNA-Seq | NA | mRNA | 使用了两个来自成年小鼠神经系统的scRNA-Seq数据库 |
| 218 | 2024-08-08 |
Heat-inactivated Escherichia coli promotes hematopoietic regeneration after irradiation with IL-1β
2022-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2021.07.003
PMID:34426082
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研究论文 | 本文研究了热灭活的大肠杆菌（HIEC）与IL-1β联合使用对辐射后造血再生的促进作用及其潜在机制 | 首次探讨了HIEC与IL-1β联合使用对辐射后造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的再生促进作用 | NA | 研究HIEC与IL-1β联合使用对辐射后造血再生的促进作用及其潜在机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 蛋白质印迹 | NA | 细胞 | 辐射致死的小鼠 |
| 219 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals innate lymphoid cell lineage infidelity in atopic dermatitis
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.07.025
PMID:34363841
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了特应性皮炎中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | 首次通过单细胞RNA测序展示了特应性皮炎病变皮肤中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | NA | 更好地理解皮肤先天淋巴细胞（ILCs）在生理和病理条件下的表型和分子特征 | 皮肤先天淋巴细胞（ILCs） | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 来自特应性皮炎患者和健康个体的皮肤穿刺活检、减薄片和血液样本 |
| 220 | 2024-08-08 |
Generation of functional human thymic cells from induced pluripotent stem cells
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.07.021
PMID:34331993
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研究论文 | 本文研究了从诱导多能干细胞（iPSCs）生成功能性人类胸腺细胞的方法 | 开发了一种直接分化协议，能够从多个iPSC系生成患者来源的胸腺上皮祖细胞，并在移植到无胸腺裸鼠后进一步分化为功能性胸腺上皮细胞 | NA | 系统评估信号通路，开发一种精炼的直接分化协议，生成患者来源的胸腺上皮祖细胞 | 诱导多能干细胞（iPSCs）生成的胸腺上皮祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 流式细胞术，定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个iPSC系生成的胸腺上皮祖细胞 |