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当前共找到 226 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
|
研究论文 | 提出一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，可将疾病信息从患者层面迁移到细胞层面 | 引入'印象'概念作为可迁移信息，将个体细胞与疾病属性关联 | 仅使用模拟数据和有限的实际数据集进行验证 | 开发能够将疾病信息从患者迁移到细胞的深度学习框架 | 单细胞和患者批量组织转录组数据 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤,阿尔茨海默病,多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度迁移学习 | 转录组数据 | 十个不同的单细胞和患者批量组织转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
T cell characteristics associated with toxicity to immune checkpoint blockade in patients with melanoma
2022-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01623-z
PMID:35027754
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析黑色素瘤患者外周血样本，发现与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 首次发现循环中活化的CD4记忆T细胞丰度和TCR多样性这两个治疗前因素与严重免疫相关不良事件的发生相关 | 样本量相对有限（共3个队列，n=27、26和18），需要更大规模研究验证 | 探索与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 接受抗PD-1单药或抗PD-1联合抗CTLA-4治疗的黑色素瘤患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序 | NA | 单细胞测序数据，质谱流式数据，RNA测序数据 | 93份治疗前和早期治疗血液样本，3个患者队列（n=27、26和18） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Network inference with Granger causality ensembles on single-cell transcriptomics
2022-02-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110333
PMID:35139376
|
研究论文 | 提出一种基于Granger因果关系集成学习的单细胞转录组基因调控网络推断算法SINGE | 使用基于核的Granger因果关系回归处理不规则伪时间序列，并通过集成回归分析聚合预测结果 | 对个别调控因子表现不佳，且对无信息量的伪时间序列敏感 | 从有序单细胞基因表达数据推断基因调控网络 | 小鼠胚胎干细胞分化过程中的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Granger因果关系回归，集成学习 | 单细胞基因表达数据 | 两个小鼠胚胎干细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
PLCG2 is associated with the inflammatory response and is induced by amyloid plaques in Alzheimer's disease
2022-02-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01022-0
PMID:35180881
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研究论文 | 本研究探讨了PLCG2在阿尔茨海默病炎症反应中的作用及其与淀粉样斑块的关联 | 首次在人类AD患者和5xFAD小鼠模型中系统验证PLCG2表达与淀粉样斑块密度的正相关性，并通过单细胞RNA测序揭示其与炎症反应信号通路的关联 | 研究主要基于相关性分析，PLCG2在AD中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明PLCG2在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 晚发性阿尔茨海默病患者、5xFAD小鼠模型、野生型和Plcg2失活小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | 差异表达分析, 共表达网络分析 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 1249例人类脑组织样本，小鼠模型若干 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Diversification of multipotential postmitotic mouse retinal ganglion cell precursors into discrete types
2022-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73809
PMID:35191836
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜神经节细胞前体细胞从多能状态分化为约45种离散类型的分子机制 | 首次证明视网膜神经节细胞的转录组类型身份不是在细胞分裂退出时确定的，而是通过有丝分裂后多能前体细胞的逐渐、异步限制获得的 | 研究仅限于小鼠模型，人类视网膜神经节细胞分化机制可能有所不同 | 探究单个神经元类别如何分化为多种类型的分子机制 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优输运推断 | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Mapping the biogenesis of forward programmed megakaryocytes from induced pluripotent stem cells
2022-02-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj8618
PMID:35171685
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研究论文 | 本研究开发了从多能干细胞生产巨核细胞的系统，并通过单细胞RNA测序绘制了体外与体内巨核细胞祖细胞状态的对应关系 | 首次识别出五个能够重复纯化巨核细胞祖细胞的表面标志物，并揭示了其转录和表观遗传特征 | 研究中使用的表面标志物在传统方法中无法识别巨核细胞祖细胞，且体外状态与体内状态的对应关系先前不明确 | 开发血小板前体细胞的生产系统并阐明巨核细胞祖细胞的生物学特性 | 诱导多能干细胞分化的巨核细胞和巨核细胞祖细胞 | 单细胞生物学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
|
研究论文 | 开发了dynamo分析框架，可从单细胞RNA测序数据推断RNA绝对速度、重建细胞命运向量场并预测基因扰动效果 | 克服传统基于剪接的RNA速度分析的基本限制，引入微分几何分析揭示调控机制，利用最小作用路径方法预测细胞命运转变驱动因子 | NA | 开发能够揭示调控功能的动力学模型，推进细胞状态转变的定量和预测理论 | 人类造血系统单细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA速度分析，代谢标记 | 微分几何模型，最小作用路径方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Discordant Genome Assemblies Drastically Alter the Interpretation of Single-Cell RNA Sequencing Data Which Can Be Mitigated by a Novel Integration Method
2022-02-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11040608
PMID:35203259
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研究论文 | 本研究揭示了不同基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的显著影响，并提出了一种新的整合方法以缓解此问题 | 首次系统评估不同基因组组装对scRNAseq数据解读的影响，并提出多基因组组装对齐与数据集成的创新方法 | 研究主要关注非模式生物，在模式生物中的适用性需要进一步验证 | 解决多基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的一致性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术发现严重COVID-19中补体激活诱导CD16 T细胞产生过度细胞毒性 | 首次发现CD16 T细胞在COVID-19中具有免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性细胞毒性功能 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 探究严重COVID-19中T细胞的致病机制 | COVID-19患者的T细胞和微血管内皮细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | COVID-19患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.11.012
PMID:34936886
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序揭示了人类胚胎基因组激活在一细胞阶段即已开始 | 发现人类胚胎转录在一细胞阶段就开始启动，比传统认为的八细胞阶段更早 | 研究样本类型有限，主要关注正常和异常原核形态的胚胎 | 确定人类胚胎基因组激活的确切时间和表达特征 | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类卵母细胞和一细胞胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
|
研究论文 | 通过尿液单细胞RNA测序分析局灶节段性肾小球硬化症患者的炎症特征 | 首次在FSGS患者尿液中鉴定出单细胞亚型和足细胞上皮-间质转化特征基因 | 样本量较小（12名患者，17份尿液样本），缺乏纵向随访数据 | 探索尿液细胞分子特征作为肾病综合征诊断和预后工具的潜力 | 局灶节段性肾小球硬化症患者的尿液细胞 | 单细胞组学 | 肾病综合征/局灶节段性肾小球硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名FSGS患者的17份尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了肿瘤特异性T细胞通过分泌趋化因子驱动肿瘤内免疫微聚集体的空间组织，从而促进长期生存的机制 | 首次在头颈鳞癌中系统解析了免疫应答阳性患者肿瘤微环境的空间组织结构特征，发现肿瘤特异性T细胞通过分泌CCL4和LTB等趋化因子形成正反馈环路 | 研究样本量相对有限，主要聚焦于口咽鳞状细胞癌，结论在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 解析与肿瘤特异性T细胞应答相关的肿瘤免疫微环境蓝图特征 | 口咽鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理 | 头颈癌 | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | 空间相互作用分析 | 基因表达数据,空间表型数据,单细胞转录组数据 | 前瞻性口咽鳞癌队列患者 | NanoString,Fluidigm,10x Genomics | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NanoString nCounter,Hyperion,10x Chromium | NanoString基因表达分析,Hyperion组织成像系统,10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 13 | 2025-10-06 |
The threat of programmed DNA damage to neuronal genome integrity and plasticity
2022-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-01001-y
PMID:35145299
|
综述 | 探讨神经元中程序性DNA损伤对基因组完整性和可塑性的威胁及其修复机制 | 提出神经元程序性DNA断裂的新范式，揭示其与生理代谢过程及神经退行性疾病的关联 | 程序性DNA断裂在神经元生理和疾病中的作用尚未充分探索 | 研究神经元DNA修复机制以保护基因组免受程序性断裂的错误影响 | 神经元基因组 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, bulk测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Diversity of satellite glia in sympathetic and sensory ganglia
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110328
PMID:35108545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了外周神经系统交感神经节和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性 | 首次系统识别了交感神经节和感觉神经节中五种不同的卫星胶质细胞亚群，并发现感觉特异性胶质细胞富含谷氨酸代谢相关基因 | 研究主要基于转录组分析，功能验证实验相对有限 | 探索外周神经系统中卫星胶质细胞的分子多样性 | 交感神经节和感觉神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Advancing root developmental research through single-cell technologies
2022-02, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102113
PMID:34562694
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综述 | 探讨单细胞技术在植物根系发育研究中的应用与前景 | 提出通过整合多组学数据和空间转录组学提升根系发育研究的时空分辨率 | 当前技术仍处于初步阶段，尚未充分发挥单细胞技术的全部潜力 | 推动单细胞技术在植物根系发育研究领域的应用发展 | 拟南芥根分生组织及其他植物物种的根系发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, 轨迹分析 | 单细胞基因调控网络 | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Conserved Metaplasia Program in Pancreatic Injury
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.027
PMID:34695382
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)的保守化生程序及其与肿瘤发生的关系 | 首次在单细胞水平系统描绘胰腺损伤诱导的ADM细胞群体及其发育轨迹，发现与胃幽门化生相似的转录表型，并证明KrasG12D靶向ADM群体可驱动肿瘤形成 | 样本量相对有限，人类样本仅来自15例慢性胰腺炎患者 | 定义胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)产生的细胞群体、转录变化及疾病进展标志物 | 小鼠胰腺腺泡细胞、人类慢性胰腺炎手术标本 | 单细胞生物学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、免疫染色、电子显微镜 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 超过13,000个EYFP+细胞进行scRNA-seq，15例人类慢性胰腺炎患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Differential abundance testing on single-cell data using k-nearest neighbor graphs
2022-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01033-z
PMID:34594043
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研究论文 | 提出基于k近邻图的单细胞数据差异丰度测试新方法Milo | 使用部分重叠的k近邻图邻域替代传统离散聚类，能识别连续轨迹变化和聚类方法无法检测的扰动 | 基于细胞间相似性结构，可能不适用于所有单细胞数据类型 | 开发单细胞数据差异丰度测试的统计框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | k近邻图 | 单细胞基因表达数据 | 模拟数据和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Comparative description of the mRNA expression profile of Na+ /K+ -ATPase isoforms in adult mouse nervous system
2022-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25234
PMID:34415061
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据库分析成年小鼠神经系统中Na+/K+-ATPase不同亚型的mRNA表达模式 | 首次在单细胞水平系统描述Na+/K+-ATPase各亚型在成年小鼠神经系统中的表达谱，并鉴定出α1和α3亚型富集的特定神经元类型 | 研究基于现有数据库，缺乏实验验证；仅关注mRNA水平，未涉及蛋白质表达和功能验证 | 阐明不同Na+/K+-ATPase亚型在神经系统中的表达模式，为相关神经系统疾病的发病机制提供见解 | 成年小鼠神经系统中的不同脑区和各种神经元群体 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个成年小鼠神经系统scRNA-Seq数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of MET- and EMT-like programs in osteoblasts during zebrafish fin regeneration
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103784
PMID:35169687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究斑马鱼尾鳍再生过程中成骨细胞的MET和EMT样程序 | 首次在单细胞分辨率下揭示成骨祖细胞中EMT和MET相关程序的共存，并发现剪接调控因子在骨再生过程中的表达 | 研究仅限于斑马鱼模型，需要进一步验证在哺乳动物系统中的普适性 | 阐明斑马鱼鳍再生过程中成骨细胞的转录程序 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞和成骨祖细胞 | 单细胞生物学 | 组织再生 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-07 |
[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils]
2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了中性粒细胞的生物学行为及其在多种疾病中的作用，重新评估其生理和病理生理功能 | 重新评估中性粒细胞的异质性及其与其他免疫细胞的相互作用机制，挑战传统认为中性粒细胞是短寿命同质细胞的观点 | NA | 重新理解中性粒细胞的生理和病理生理作用 | 中性粒细胞 | 免疫学 | 多种疾病 | 单细胞测序技术、空间转录组测序技术、多组学联合测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学测序 | NA | NA |