单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of the adaptive immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.964976
PMID:36119105
|
综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在分析SARS-CoV-2感染和疫苗接种后适应性免疫反应中的应用 | 利用单细胞多组学技术深入研究SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的免疫反应机制 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应，为疫苗和治疗策略的开发提供支持 | SARS-CoV-2感染和疫苗接种后的适应性免疫反应，包括T细胞和B细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞多组学技术，包括流式细胞术、单细胞转录组学、单细胞TCR和BCR分析 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1942 | 2024-08-08 |
Identification of a novel histone phosphorylation prognostic signature in hepatocellular carcinoma based on bulk and single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.965445
PMID:36120466
|
研究论文 | 本研究构建了与肝细胞癌（HCC）预后相关的组蛋白磷酸化调控（HPR）基因签名，并探讨了HPR基因是否能预测HCC患者的总体生存 | 首次构建了与HCC预后相关的组蛋白磷酸化调控基因签名，并验证了其在预测HCC患者生存中的作用 | NA | 探讨组蛋白磷酸化调控基因在肝细胞癌中的预后价值 | 肝细胞癌患者及其组蛋白磷酸化调控基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox回归分析，Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用TCGA、ICGC和GEO数据库中的差异表达基因数据，以及从Gene Expression Omnibus（GEO）下载的HCC单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1943 | 2024-08-08 |
Systematic Characterization of Expression Patterns and Immunocorrelations of Formin-Like Genes in Breast Cancer
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/8577821
PMID:36124068
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研究论文 | 本文系统分析了乳腺癌中formin-like基因（FMNL）的表达模式及其与免疫相关性 | 首次全面阐述了FMNL基因在乳腺癌中的表达模式及其在临床应用中的可变预后意义 | NA | 研究FMNL基因在乳腺癌中的表达及其与免疫浸润的关系 | 乳腺癌组织中的FMNL基因表达及其与免疫细胞浸润的相关性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学（IHC） | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1944 | 2024-08-08 |
RAB20 deficiency promotes the development of silicosis via NLRP3 inflammasome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.967299
PMID:36131930
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析硅肺病患者的支气管肺泡灌洗液，发现RAB20缺乏与硅肺病的发展密切相关，并通过小鼠模型验证了RAB20缺失加剧硅晶体诱导的肺间质纤维化和呼吸功能障碍，主要通过NLRP3炎症小体的激活和IL-1β的释放。 | 首次揭示了RAB20在硅肺病发病机制中的关键作用，为理解环境刺激介导的先天免疫提供了新的分子见解。 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在人体中进一步验证。 | 探究RAB20在硅肺病发病机制中的作用及其分子机制。 | 硅肺病患者和小鼠模型的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 包括硅肺病患者和未发病矿工的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1945 | 2024-08-08 |
The role of goblet cells and mucus in intestinal homeostasis
2022-12, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-022-00675-x
PMID:36097076
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综述 | 本文综述了杯状细胞和黏液层在维持肠道稳态中的作用及其在炎症和感染性疾病中的变化 | 通过单细胞RNA测序识别出新的杯状细胞亚群，加深了对它们在肠道稳态中多种贡献的理解 | NA | 探讨杯状细胞和黏液层在维持肠道健康中的作用及其在疾病中的变化 | 杯状细胞和黏液层 | NA | 炎症和感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1946 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA analysis of chemokine expression in heterogeneous CD14+ monocytes with lipopolysaccharide-induced bone resorption
2022-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2022.113343
PMID:36088998
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研究论文 | 研究探讨了脂多糖（LPS）诱导的骨吸收中，CD14+单核细胞的异质性及其在表达趋化因子中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了LPS处理后CD14+单核细胞的异质性及其在骨吸收过程中的趋化因子表达模式 | 研究主要基于体外实验和动物模型，可能与人体内实际情况存在差异 | 探究LPS诱导的骨吸收过程中CD14+单核细胞的响应机制 | CD14+单核细胞及其在LPS处理后的反应 | 数字病理学 | 炎症性骨疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从人外周血单个核细胞（PBMCs）中分离的CD14+单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1947 | 2024-08-08 |
The druggable transcription factor Fli-1 regulates T cell immunity and tolerance in graft-versus-host disease
2022-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI143950
PMID:36074578
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研究论文 | 研究了转录因子Fli-1在移植物抗宿主病（GVHD）发病机制中的作用，并验证了Fli-1作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了Fli-1在调节T细胞免疫和耐受中的作用，并发现低剂量的喜树碱类药物可以作为有效的Fli-1抑制剂，减轻GVHD的严重程度 | NA | 探讨Fli-1在GVHD中的作用及作为治疗靶点的可能性 | Fli-1在GVHD中的作用及治疗潜力 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1948 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome study in forensic medicine: prospective applications
2022-Nov, International journal of legal medicine
IF:2.2Q1
DOI:10.1007/s00414-022-02889-9
PMID:36083564
|
review | 本文综述了单细胞转录组学在法医学中的应用前景 | 探讨了单细胞转录组学在法医学领域的潜在应用，为法医学研究提供了新的视角 | 目前该技术在法医学相关研究中尚未得到充分关注 | 旨在通过审查和回顾单细胞转录组学的最新发展和应用，探讨其在法医学研究中的未来方向 | 单细胞转录组学技术及其在法医学中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1949 | 2024-08-08 |
Decoding the associations between cell functional states in head and neck cancer based on single-cell transcriptome
2022-11, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序技术，系统识别了头颈鳞状细胞癌中的六种癌症相关状态及其关联模式 | 首次定义了头颈鳞状细胞癌中功能状态之间的关联模式，并发现这些模式与状态活性相关 | NA | 旨在理解癌症发病机制中癌细胞功能状态及其关联 | 头颈鳞状细胞癌中的癌细胞功能状态及其关联 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括免疫细胞和四个独立头颈鳞状细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1950 | 2024-08-08 |
MSR1 characterized by chromatin accessibility mediates M2 macrophage polarization to promote gastric cancer progression
2022-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109217
PMID:36095948
|
研究论文 | 本文通过分析TCIA数据库和综合ATAC-seq、RNA-seq及单细胞RNA测序数据，研究了M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及机制 | 首次揭示了MSR1基因通过染色质可及性介导M2巨噬细胞极化，从而促进胃癌进展的机制 | NA | 探究M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及其潜在的肿瘤促进机制 | 胃癌样本中的M2巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | CIBERSORTx算法 | 基因表达数据 | 17,334个具有染色质可及性的基因，2,714个同时具有染色质可及性和差异表达的基因，171个与生存相关的差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1951 | 2024-08-08 |
Developmental regulation of epithelial cell cuboidal-to-squamous transition in Drosophila follicle cells
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.09.001
PMID:36100084
|
研究论文 | 本研究探讨了果蝇卵泡细胞中上皮细胞从立方形到扁平形的转变过程及其调控机制 | 揭示了蜕皮激素和JAK/STAT信号通路在调控上皮细胞形态变化中的重要作用，并首次报道了蜕皮激素信号在上皮细胞重塑中的抑制作用 | NA | 研究上皮细胞形态转变的调控机制 | 果蝇卵泡细胞中的上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1952 | 2024-08-08 |
A machine learning-based method for automatically identifying novel cells in annotating single-cell RNA-seq data
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac617
PMID:36083008
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研究论文 | 本文开发了一种基于自动编码器和迭代特征选择的方法，用于自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 该方法通过迭代选择显示双峰模式的特征并使用所选特征重新聚类细胞，能够准确识别训练数据中不存在的新型细胞 | NA | 开发一种新的方法来自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | 五个真实的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1953 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals skewed cellular communication and phenotypic shift in pulmonary artery remodeling
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153471
PMID:36099047
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肺动脉重塑过程中细胞组成的改变及其对细胞间通信网络的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肺动脉重塑过程中的细胞和分子变化，特别是平滑肌细胞的异质性和表型转变 | NA | 探究肺动脉重塑过程中不同细胞群体的贡献及其分子机制 | 肺动脉重塑过程中的细胞组成和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肺动脉高压和捐赠肺的肺动脉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1954 | 2024-08-08 |
Probabilistic boolean networks predict transcription factor targets to induce transdifferentiation
2022-Sep-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104951
PMID:36093045
|
研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于找到实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 本文采用概率布尔网络（PBNs）从单细胞RNA测序数据中构建模型，以模拟造血转录因子的相互作用，并使用“采样网络”方法构建大型网络 | NA | 寻找实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 转录因子和细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（PBNs） | RNA测序数据 | 两种不同细胞状态的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1955 | 2024-08-08 |
Cell lineage specification and signalling pathway use during development of the lateral plate mesoderm and forelimb mesenchyme
2022-09-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200702
PMID:36093878
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，定义了鸡胚胎中侧板中胚层（LPM）的细胞命运决定及其在发育过程中的信号通路 | 本研究揭示了TWIST1在早期肢芽上皮-间充质转化中的潜在驱动作用，并定义了BMP信号在早期肢发育中的新角色 | NA | 探讨侧板中胚层（LPM）早期分化和发育的分子机制 | 鸡胚胎中的侧板中胚层（LPM）及其在肢芽发育中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 鸡胚胎中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1956 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals molecular basis of malignant phenotypes and tumor microenvironments in small bowel adenocarcinomas
2022-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00434-x
PMID:36104333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了12例小肠腺癌（SBA）患者的肿瘤样本，揭示了恶性细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并预测了针对SBA的潜在药物候选物 | 首次揭示了小肠腺癌中四种主要恶性细胞亚型的分子特征及其进展关系，并发现了EMT特征的癌细胞亚群与高度耗竭的CD8 T细胞之间的配体-受体相互作用 | NA | 揭示小肠腺癌的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并寻找潜在的治疗靶点和药物候选物 | 小肠腺癌患者的肿瘤样本及其分子特征 | 数字病理学 | 小肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例小肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1957 | 2024-08-08 |
A LILRB1 variant with a decreased ability to phosphorylate SHP-1 leads to autoimmune diseases
2022-09-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-19334-x
PMID:36104364
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研究论文 | 本研究通过全基因组连锁研究和全外显子测序，发现并验证了一个LILRB1基因的错义变异（c.479G>A，p.G160E），该变异导致SHP-1磷酸化能力下降，与家族性自身免疫疾病相关。 | 首次将LILRB1基因与自身免疫疾病联系起来，并揭示了其通过影响SHP-1磷酸化在免疫调节中的作用。 | 研究仅基于一个家族的样本，需要更多样本验证该变异的普遍性和致病性。 | 识别导致家族性自身免疫疾病的遗传变异。 | LILRB1基因变异及其在自身免疫疾病中的作用。 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 全基因组连锁研究，全外显子测序，流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，RNA数据 | 一个三代家族中的9名受影响成员 | NA | NA | NA | NA |
| 1958 | 2024-08-08 |
Adipocyte mesenchymal transition contributes to mammary tumor progression
2022-09-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111362
PMID:36103820
|
研究论文 | 本文研究了肥胖与癌症进展之间的关系，特别是脂肪细胞在肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的间充质转变及其对肿瘤微环境的影响 | 首次报道了肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的脂肪细胞在肿瘤进展期间去分化为成纤维细胞样前体细胞，并揭示了这些去分化脂肪细胞的多能性及其在免疫反应、炎症和细胞外基质重塑中的作用 | NA | 探讨肥胖与癌症进展之间的机制联系，特别是脂肪细胞的间充质转变对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的脂肪细胞及其在肿瘤进展中的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1959 | 2024-08-08 |
Biology of lung macrophages in health and disease
2022-09-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.08.010
PMID:36103853
|
综述 | 本文综述了组织驻留型和招募型肺泡及间质巨噬细胞在肺部稳态和疾病中的作用，并介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学技术如何区分这些亚群，揭示巨噬细胞生物学的复杂性。 | 介绍了使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术区分组织驻留型和招募型巨噬细胞的新方法。 | NA | 探讨肺部巨噬细胞在健康和疾病状态下的功能及其区分方法。 | 肺部巨噬细胞及其在不同组织状态下的功能。 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1960 | 2024-08-08 |
sciCAN: single-cell chromatin accessibility and gene expression data integration via cycle-consistent adversarial network
2022-09-12, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00245-6
PMID:36089620
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为sciCAN的对抗方法，用于在无监督方式下整合单细胞染色质可及性和基因表达数据 | sciCAN方法在跨模态数据整合中表现出一致的性能，并且在模态间相互转换的平衡性上优于其他五种现有方法 | NA | 解决单细胞技术中跨模态数据整合的计算挑战 | 单细胞染色质可及性和基因表达数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | GAN | 单细胞数据 | 5个scATAC-seq/scRNA-seq数据集和10X Multiome数据 | NA | NA | NA | NA |