单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2024-08-08 |
A statistical method to uncover gene expression changes in spatial transcriptomics
2022-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01576-2
PMID:36050491
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1942 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomic analyses reveal that GPNMB-high macrophages promote PN-MES transition and impede T cell activation in GBM
2022-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104239
PMID:36054938
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞转录组数据，揭示了GPNMB高表达的巨噬细胞在胶质母细胞瘤中促进PN-MES转变并阻碍T细胞活化的作用 | 发现GPNMB高表达的巨噬细胞通过免疫细胞与肿瘤相互作用，在胶质母细胞瘤中起到关键作用，并阻碍T细胞的活化 | NA | 深入理解肿瘤微环境中的细胞间通信，以识别有潜力的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤中的单细胞转录组、批量转录组和空间单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及多种人类和小鼠研究的数据 |
| 1943 | 2024-08-08 |
Novel skewed usage of B-cell receptors in COVID-19 patients with various clinical presentations
2022-09, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2022.08.006
PMID:36055412
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研究论文 | 本研究通过单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）分析了来自健康对照组、无症状患者和有症状COVID-19患者的PBMC样本，揭示了不同临床表现患者中B细胞受体的偏倚使用情况 | 发现了IGHV、IGLV和IGKV基因的偏倚使用，并识别了各组中特定的VDJ基因对和组合偏好，如IGKV3-7和IGKV2-24在无症状患者中富集，而IGHV3-13等在重症恢复患者中富集 | NA | 深入理解COVID-19患者的体液免疫反应，并开发针对SARS-CoV-2感染的新疫苗候选物和治疗性抗体 | COVID-19患者的B细胞受体使用情况 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 11名健康对照者，5名无症状患者和33名有症状COVID-19患者 |
| 1944 | 2024-08-08 |
Zebrafish Danio rerio myotomal muscle structure and growth from a spatial transcriptomics perspective
2022-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110477
PMID:36058475
|
研究论文 | 本研究采用空间转录组学方法，分析了斑马鱼肌肉的结构和生长特征 | 首次将空间转录组学应用于鱼类肌节肌肉结构和生长的研究 | NA | 探讨鱼类与哺乳动物在肌肉结构和生长特性上的差异 | 斑马鱼的肌节肌肉 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年和幼体斑马鱼的肌节肌肉样本 |
| 1945 | 2024-08-08 |
Cutting edge technologies in chronic inflammation research
2022-09, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14648
PMID:36059185
|
综述 | 本文是一篇关于炎症研究前沿技术的综述，特别关注皮肤和神经系统疾病 | 讨论了体外皮肤移植模型的价值，创新地使用动物模型，强调抗原经验和“野生”微生物群的作用，以及单细胞测序和原位转录组学（空间分析）提供的功能性细胞亚群、相互作用和可塑性的详细信息 | NA | 介绍和讨论炎症研究中的最新技术 | 皮肤和神经系统疾病 | NA | NA | 单细胞测序，原位转录组学，光谱流式细胞术，多重技术 | NA | 细胞 | NA |
| 1946 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrated activated B cells suppress liver metastasis of colorectal cancers
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111295
PMID:36044847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了B细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 首次发现激活的B细胞及其亚型iMPA在结直肠癌肝转移中的显著减少，并揭示了Wnt和TGF-β信号通路在促进B细胞迁移中的作用 | NA | 探讨结直肠癌肝转移中免疫细胞的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其肝转移情况 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1947 | 2024-08-08 |
Spatial molecular anatomy of germ layers in the gastrulating cynomolgus monkey embryo
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111285
PMID:36044859
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研究论文 | 本文研究了猕猴胚胎在原肠胚形成期间的空间分子结构，通过重建三维数字模型和空间转录组学分析，揭示了不同胚层特有的基因表达谱及其在物种间的发育协调性 | 首次对猕猴胚胎原肠胚形成期间的空间分子动态进行了时空调查，并发现了鼠和灵长类动物在胚层分离上的发育协调性及物种特异的转录程序 | NA | 探究哺乳动物胚胎发育过程中基因表达和细胞信号的空间调控与谱系指定、组织前体模式化和胚层形态发生之间的关系 | 猕猴胚胎在原肠胚形成期间的空间分子结构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 三维数字模型 | 从E17到E21的猕猴原肠胚形成胚胎，每日时间分辨率 |
| 1948 | 2024-08-08 |
A bifurcation concept for B-lymphoid/plasmacytoid dendritic cells with largely fluctuating transcriptome dynamics
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111260
PMID:36044861
|
研究论文 | 本文通过干湿结合的方法，研究了人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）在B/NK前体区域的转录组动态波动，并提出了一种基于波动的分化模型。 | 本文首次揭示了B/pDC分叉点在IL-7Rα区域的强烈波动，并通过计算方法将剪接动力学转化为扩散动力学，验证了这些预期。 | NA | 研究树突状细胞在淋巴细胞环境中的分化路径及其转录组动态波动。 | 人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）及其前体细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1949 | 2024-08-08 |
Time-resolved transcriptomes reveal diverse B cell fate trajectories in the early response to Epstein-Barr virus infection
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111286
PMID:36044865
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组学构建了EB病毒感染后B细胞命运的多状态模型 | 首次通过单细胞转录组学揭示了EB病毒感染后B细胞的多种命运轨迹 | NA | 探索EB病毒感染后B细胞的基本过程和命运决策 | EB病毒感染的B淋巴细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞转录组学 | 多状态模型 | 转录组数据 | NA |
| 1950 | 2024-08-08 |
Meso-seq for in-depth transcriptomics in ultra-low amounts of FACS-purified neuronal nuclei
2022-08-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100259
PMID:36046622
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Meso-seq的中尺度转录组测序方法，能够在极少量的FACS纯化神经元核中鉴定超过10,000个稳健表达的基因 | Meso-seq方法简化了技术流程，降低了成本，并适用于多种神经科学应用，包括在小鼠和非人灵长类动物的抗体标记皮质神经元中的转录组学研究 | NA | 开发一种适用于稀疏神经元群体的转录组测序方法，以深入研究神经回路的发育和可塑性的分子机制 | FACS纯化的神经元核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 最少50个FACS排序的神经元核 |
| 1951 | 2024-08-08 |
[Modern research on Chinese medicine based on single-cell omics: technologies and strategies]
2022-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本文介绍了基于单细胞组学技术在现代中医药研究中的应用，包括单细胞转录组测序、空间转录组学和单细胞多模态组学等技术及其应用模式 | 单细胞组学技术为解析中医药复杂性及阐明传统中医药理论的现代科学内涵提供了新的机遇 | NA | 探讨单细胞组学技术在现代中医药研究中的策略和应用 | 中医药的复杂性和传统中医药理论的科学内涵 | NA | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组学、单细胞多模态组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1952 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals shared immunosuppressive landscapes of mouse and human neuroblastoma
2022-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004807
PMID:36054452
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了小鼠和人类神经母细胞瘤共享的免疫抑制微环境 | 首次展示了小鼠和人类神经母细胞瘤中免疫微环境的复杂性和相似性，并发现了具有免疫抑制功能的细胞亚群 | NA | 深入理解神经母细胞瘤的肿瘤微环境，为开发新的治疗策略提供数据支持 | 小鼠神经母细胞瘤模型和人类神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 10例人类神经母细胞瘤患者活检样本 |
| 1953 | 2024-08-08 |
B7H3-dependent myeloid-derived suppressor cell recruitment and activation in pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901349
PMID:36045668
|
研究论文 | 本研究探讨了特发性肺纤维化（IPF）中髓源性抑制细胞（MDSCs）的作用及其通过B7H3的潜在介导机制 | 首次揭示了B7H3依赖的MDSC招募和激活在肺纤维化中的作用，以及MDSCs在肺纤维化进展中的旁分泌作用 | NA | 研究MDSCs在特发性肺纤维化中的作用及其通过B7H3的潜在介导机制 | 特发性肺纤维化患者的循环MDSCs和B7H3表达 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 特发性肺纤维化患者的血液样本 |
| 1954 | 2024-08-08 |
Identification of novel tumor microenvironment-associated genes in gastric cancer based on single-cell RNA-sequencing datasets
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.896064
PMID:36046240
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别胃癌中与肿瘤微环境相关的新基因 | 通过分析受体-配体对和细胞间相互作用，获得了MIF信号通路网络，并识别了64个在肠上皮化生和早期胃癌中差异表达的基因 | NA | 研究胃癌肿瘤微环境与异质性的关系，并探索其对患者预后的影响 | 胃癌中的肿瘤微环境相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO风险评分模型 | RNA测序数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE134520数据集，识别了25个细胞亚群 |
| 1955 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular changes that contribute to the progression of lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.927300
PMID:36046337
|
研究论文 | 本研究通过分析76,762个细胞的单细胞转录组数据，揭示了肺腺癌从纯磨玻璃结节（GGN）到实性结节（SN）进展过程中的细胞和分子变化 | 首次全面阐明了纯GGN和SN的细胞和分子特征，并揭示了肺腺癌进展的机制 | NA | 揭示肺腺癌进展过程中的细胞和分子变化，并发现新的治疗靶点 | 肺腺癌的纯磨玻璃结节和实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 76,762个细胞，来自四个纯GGN、四个SN和四个正常组织 |
| 1956 | 2024-08-08 |
Heterogeneity in NK Cell Subpopulations May Be Involved in Kidney Cancer Metastasis
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/6378567
PMID:36046723
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分离出自然杀伤（NK）细胞亚群，并探讨其在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）转移中的作用 | 首次揭示了NK细胞亚群NK(EGR1)和NK(CAPG)与肾癌转移的密切关系 | NA | 研究肾癌免疫微环境和免疫细胞异质性，以改善肾癌治疗效果 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的NK细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1957 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of neuroblastoma identifies chemoresistance-associated genes and pathways
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.031
PMID:36051886
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了神经母细胞瘤中与化疗耐药相关的基因和通路 | 首次揭示了化疗耐药神经母细胞瘤细胞的双向能力，即肾上腺素能向间充质转化 | NA | 探讨神经母细胞瘤中肿瘤内异质性与治疗耐药性的关联 | 神经母细胞瘤细胞及其对依托泊苷和顺铂的耐药性 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 498个肿瘤样本 |
| 1958 | 2024-08-08 |
Bioinformatics analysis of potential pathogenesis and risk genes of immunoinflammation-promoted renal injury in severe COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950076
PMID:36052061
|
研究论文 | 本研究通过整合166个COVID-19患者的外周血转录组数据，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和短时序表达挖掘（STEM）分析，识别与严重COVID-19相关的肾损伤关键基因，并探讨其潜在的免疫炎症机制。 | 本研究首次在严重COVID-19患者中识别出一组与肾损伤进展相关的关键基因，并通过蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和单细胞测序分析，深入探讨了这些基因在免疫细胞中的分布及其在肾损伤中的作用机制。 | 本研究主要基于转录组数据进行分析，未来需要更多的实验验证来支持这些发现，并进一步探讨这些基因在COVID-19肾损伤中的具体作用机制。 | 探讨严重COVID-19中免疫炎症促进肾损伤的病理机制，并识别相关的风险基因。 | 严重COVID-19患者的肾损伤及其相关的免疫炎症机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），短时序表达挖掘（STEM）分析，蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析，单细胞测序 | 随机森林，Nomogram模型 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 166个COVID-19患者的外周血样本 |
| 1959 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals the potential risk of anti-mesothelin CAR T Cell therapy toxicity to different organs in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.807915
PMID:36059490
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了来自人类主要生理系统的数据，评估了抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 首次利用scRNA-seq数据对不同器官在抗间皮素CAR-T细胞疗法中的毒性风险进行分级 | NA | 评估抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 人类主要生理系统的器官，包括呼吸、心血管、消化和泌尿系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个器官的细胞样本 |
| 1960 | 2024-08-08 |
Research progress on application of single-cell TCR/BCR sequencing technology to the tumor immune microenvironment, autoimmune diseases, and infectious diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969808
PMID:36059506
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研究论文 | 本文总结了单细胞TCR/BCR测序技术在肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病中的应用进展 | 单细胞TCR/BCR测序技术能够克服细胞异质性问题，提供新的方法和视角，深入分析细胞群体中个体细胞的行为和机制及其与机体的关系 | 讨论了该技术的不足和未来应用的前景 | 探讨单细胞TCR/BCR测序技术在多种疾病中的应用及其未来发展 | 肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病 | 生物技术 | NA | 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 基因表达和免疫组学数据 | 大量单细胞 |