单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2024-08-08 |
The impact of single-cell genomics on the field of mycobacterial infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.989464
PMID:36246265
|
综述 | 本文综述了单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究领域的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其变体提供了大量个体细胞的无偏转录组测序，超越了传统的“批量”方法，深化了对细胞异质性和动态转录状态的理解 | 尽管单细胞基因组学在生命科学和生物医学研究中应用广泛，但在分枝杆菌感染领域的进展相对有限 | 旨在总结单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究中的重要发现，强调不同和最新的单细胞方法，并探讨当前的研究空白和未来的发展潜力 | 研究对象为感染分枝杆菌的宿主细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 大量个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1782 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Active Involvement of Macrophage Polarizations in Pulmonary Hypertension
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5398157
PMID:36246557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 首次揭示了在肺动脉高压早期阶段，巨噬细胞向M2型极化的现象，并验证了其在患者中的存在 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要更多临床数据支持 | 探究肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 肺动脉高压中的巨噬细胞极化 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及肺动脉高压患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1783 | 2024-08-08 |
A novel risk score model based on fourteen chromatin regulators-based genes for predicting overall survival of patients with lower-grade gliomas
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.957059
PMID:36246611
|
研究论文 | 本文构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的总体生存率 | 首次构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的预后 | NA | 揭示染色质调控因子在低级别胶质瘤患者中的功能和价值 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 870个染色质调控因子 | NA | NA | NA | NA |
| 1784 | 2024-08-08 |
Critical role of guanylate binding protein 5 in tumor immune microenvironment and predictive value of immunotherapy response
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984615
PMID:36246628
|
研究论文 | 本研究探讨了鸟苷酸结合蛋白5（GBP5）在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次详细分析了GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境（TME）的关系，并构建了基于GBP5表达的预后模型 | 研究主要基于公开的基因表达数据，可能存在样本选择偏倚；预后模型的外部验证有限 | 探索GBP5在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的33种癌症的RNA测序数据，以及来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1785 | 2024-08-08 |
The soldiers needed to be awakened: Tumor-infiltrating immune cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.988703
PMID:36246629
|
研究论文 | 本文综述了肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）在肿瘤微环境中的作用及其在不同肿瘤中的免疫治疗策略 | 介绍了基于TIICs功能开发的各种抗肿瘤策略，如免疫检查点阻断（ICB）、过继细胞疗法（ACT）等，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究肿瘤特异性免疫细胞特征中的应用 | NA | 探讨肿瘤浸润性免疫细胞的功能、预后价值及针对不同肿瘤的免疫治疗策略 | 肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1786 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of immune ferroptosis gene in renal clear cell carcinoma: prognosis and influence of tumor microenvironment
2022, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36247256
|
研究论文 | 本研究深入探讨了免疫系统与铁死亡在肾透明细胞癌中的作用，识别了预测性生物标志物和治疗靶点。 | 构建了一个新的与免疫铁死亡相关基因的预测模型，该模型在免疫浸润、微环境和免疫逃逸中起重要作用。 | NA | 识别肾透明细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点。 | 肾透明细胞癌患者的预后和肿瘤微环境影响。 | 数字病理学 | 肾癌 | lasso-Cox风险评分模型 | lasso-Cox | 基因表达数据 | 103个免疫铁死亡相关差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1787 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of AIM2 inflammasomes with potential implications for immunotherapy in human cancer: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.998266
PMID:36248785
|
研究论文 | 本研究通过大规模组学研究和单细胞测序验证，分析了AIM2炎症小体在泛癌中的作用，并探讨了其对人类癌症免疫治疗的潜在影响。 | 首次在泛癌背景下全面分析AIM2炎症小体，并通过单细胞转录组测序技术验证其在肿瘤微环境中的激活状态。 | 研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚和数据解释的局限性。 | 探讨AIM2炎症小体在泛癌中的表达模式、预后意义及其与免疫治疗的相关性。 | AIM2炎症小体及其相关基因在不同癌症中的表达和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA)和The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库中的数据，具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 1788 | 2024-08-08 |
Single cell meta-analysis of EndMT and EMT state in COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.976512
PMID:36248845
|
meta-分析 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组，以探究COVID-19中的间质过渡状态 | 首次通过分析公共数据库的单细胞测序数据，识别了早期和晚期的内皮间质过渡（EndMT）和上皮-间质过渡（EMT） | NA | 探究COVID-19患者肺部间质过渡状态及其与纤维化的关系 | 健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体45例，COVID-19患者58例，特发性肺纤维化患者64例 | NA | NA | NA | NA |
| 1789 | 2024-08-08 |
Transcriptional states of CAR-T infusion relate to neurotoxicity - lessons from high-resolution single-cell SOM expression portraying
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994885
PMID:36248848
|
研究论文 | 本文通过重新分析24名患者的单细胞RNA测序数据，探讨了CAR-T细胞免疫疗法中细胞状态与神经毒性的关系 | 开发了一种单细胞数据描绘工作流程，用于解析单细胞分辨率的转录状态空间，并通过直观的可视化、功能挖掘、分子细胞分层和变异性分析展示了单细胞数据描绘的能力 | NA | 研究CAR-T细胞免疫疗法中的细胞状态与神经毒性的关系 | 24名患者的单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 24名患者，超过130,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1790 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.985187
PMID:36248860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了化疗对复发性卵巢癌患者免疫景观及TCR/BCR克隆扩增的影响 | 首次在单细胞分辨率下，全面描述了化疗耐药患者在不同治疗阶段肿瘤、腹水和外周血中的多维细胞和免疫学图谱 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探讨化疗对复发性卵巢癌患者免疫环境的具体影响，并提出改善化疗引起的免疫损伤的策略 | 复发性化疗耐药的卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 单一患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1791 | 2024-08-08 |
Evaluating the role of IDO1 macrophages in immunotherapy using scRNA-seq and bulk-seq in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1006501
PMID:36248886
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq）分析结直肠癌（CRC）患者，以评估IDO1巨噬细胞在免疫治疗中的作用 | 首次详细分类了结直肠癌中的巨噬细胞亚群，并揭示了IDO1巨噬细胞在不同亚群中的浸润程度差异 | NA | 研究IDO1巨噬细胞在结直肠癌免疫治疗中的作用 | 结直肠癌患者及其巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个结直肠癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1792 | 2024-08-08 |
Metabolic-related gene pairs signature analysis identifies ABCA1 expression levels on tumor-associated macrophages as a prognostic biomarker in primary IDHWT glioblastoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869061
PMID:36248907
|
研究论文 | 本研究通过分析代谢相关基因对签名，确定了肿瘤相关巨噬细胞中ABCA1表达水平作为原发性IDHWT胶质母细胞瘤的预后生物标志物。 | 开发了一种基于代谢相关基因对的预后签名，用于原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的个性化管理。 | NA | 开发一种针对IDHWT胶质母细胞瘤患者的稳健预后签名。 | 原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和临床数据。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了377个样本，包括204个训练集样本和173个验证集样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 1793 | 2024-08-08 |
Expression Analysis of Ligand-Receptor Pairs Identifies Cell-to-Cell Crosstalk between Macrophages and Tumor Cells in Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/9589895
PMID:36249427
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了肺腺癌中的配体-受体对表达，揭示了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间对话。 | 首次在肺腺癌中详细分析了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的自分泌和旁分泌网络，并构建了基于细胞间相互作用的机器学习预测模型。 | 研究依赖于已发表文献和公开数据库中的样本，可能存在数据来源的局限性。 | 探索肺腺癌中巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间通信，并识别与患者预后相关的关键基因对。 | 肺腺癌患者的单细胞和批量RNA测序样本，以及巨噬细胞和肿瘤细胞的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 159,219个单细胞（包括18,248个肿瘤细胞和29,520个巨噬细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 1794 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and immunogenicity of chondrocytes via single-cell RNA sequencing technique in human osteoarthritis
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1004766
PMID:36249797
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中软骨细胞的异质性和免疫原性 | 首次定义了八种具有不同生物学功能的软骨细胞亚型，并发现效应软骨细胞和纤维软骨细胞可能促进骨关节炎的发展 | NA | 探索软骨细胞的生物学功能和标志物，以促进骨关节炎的准确诊断和靶向治疗 | 人骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1795 | 2024-08-08 |
Subcapsular Sinus Macrophages Promote Melanoma Metastasis to the Sentinel Lymph Nodes via an IL1α-STAT3 Axis
2022-12-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0225
PMID:36206577
|
研究论文 | 研究了皮肤来源的肿瘤细胞通过淋巴管迁移至前哨淋巴结（sLN）的过程，并探讨了亚被膜窦（SS）中的巨噬细胞通过IL1α-STAT3轴促进黑色素瘤转移的机制 | 发现了亚被膜窦中的巨噬细胞在识别肿瘤抗原后产生促肿瘤的IL1α，并通过单细胞RNA测序揭示了IL1α信号在转移性肿瘤细胞中的STAT3为主要靶点 | NA | 探讨黑色素瘤转移至前哨淋巴结的机制及潜在的免疫治疗策略 | 亚被膜窦中的巨噬细胞、IL1α、STAT3信号通路 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受IL1α特异性阻断抗体治疗的动物中获取的微切割转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1796 | 2024-08-08 |
Cellular Landscapes of Nondiseased Human Cardiac Valves From End-Stage Heart Failure-Explanted Heart
2022-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318314
PMID:36200446
|
研究论文 | 探索来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜的细胞景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面分析非病变人类心脏瓣膜叶片的细胞景观，并结合生物信息学方法识别细胞类型、描述细胞功能及研究细胞发育轨迹和相互作用 | 研究仅限于非病变心脏瓣膜，未涉及病变瓣膜的情况 | 探索心脏瓣膜疾病的细胞层面机制，以识别新的治疗靶点 | 来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜叶片 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5个主动脉瓣、5个肺动脉瓣、5个三尖瓣和3个二尖瓣，共128,412个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1797 | 2024-08-08 |
Review: Challenges and perspectives in applying single nuclei RNA-seq technology in plant biology
2022-Dec, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2022.111486
PMID:36202294
|
综述 | 本文综述了单核RNA测序技术在植物生物学中的应用挑战与前景 | 探讨了单细胞转录组在植物细胞发育和环境应激响应中的动态调控 | 讨论了使用植物原生质体与核进行单细胞RNA测序实验的优缺点 | 支持基因功能研究，建立精确的转录程序，预测更准确的基因调控网络，并长期设计新基因途径以增强选定作物性状 | 植物细胞的转录组及其在细胞发育和环境应激中的调控 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种植物物种和器官的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1798 | 2024-08-08 |
Thyroid hormone regulators in human cerebral cortex development
2022-12-01, The Journal of endocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1530/JOE-22-0189
PMID:36219489
|
review | 本文综述了甲状腺激素在人类大脑皮层发育中的调控作用 | 利用单细胞转录组学方法分析了发育中的人类大脑皮层的单细胞RNA-Seq数据，提供了甲状腺激素转运蛋白、脱碘酶和受体在特定细胞中表达的新见解 | 由于小鼠和人类大脑之间的根本差异，小鼠疾病模型并不完全令人满意 | 探讨甲状腺激素在人类新皮层发育中的病理生理学背景 | 人类大脑皮层发育中的甲状腺激素调控 | NA | NA | 单细胞RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1799 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics shows moxibustion promotes hippocampus astrocyte and neuron interaction
2022-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.121052
PMID:36220370
|
研究论文 | 本研究探讨了艾灸通过促进海马体星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，从而改善阿尔茨海默病小鼠的认知功能 | 本研究首次采用空间转录组学技术评估艾灸对阿尔茨海默病小鼠星形胶质细胞与神经元相互作用的影响 | NA | 研究艾灸是否能通过促进星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，增强突触可塑性，从而缓解阿尔茨海默病的认知障碍 | 阿尔茨海默病小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | APP/PS1小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1800 | 2024-08-08 |
scHiCPTR: unsupervised pseudotime inference through dual graph refinement for single-cell Hi-C data
2022-11-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac670
PMID:36205615
|
研究论文 | 本文介绍了scHiCPTR，一种基于图的无监督流程，用于从单细胞Hi-C接触矩阵中推断伪时间 | scHiCPTR通过双图优化过程优化图结构，有助于减少噪声导致的虚假细胞连接，并确定全局发育方向性 | NA | 研究如何利用单细胞Hi-C接触矩阵构建伪时间路径，以沿着发育轨迹对细胞进行排序 | 单细胞Hi-C接触矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C技术 | 图模型 | 矩阵数据 | NA | NA | NA | NA | NA |