单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1741 - 1760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2024-08-08 |
Identification of key monocytes/macrophages related gene set of the early-stage abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.950961
PMID:36186997
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和实验验证，识别了早期腹主动脉瘤中与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因集。 | 本研究首次通过scRNA-seq数据和WGCNA分析，识别了与早期腹主动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因模块，并构建了基于这些基因集的逻辑回归诊断模型。 | 本研究主要基于生物信息学分析和有限的实验验证，未来需要更多的临床样本和实验来进一步验证这些发现。 | 探讨早期腹主动脉瘤中免疫细胞浸润的分子机制，并寻找有效的腹主动脉瘤标志物。 | 早期腹主动脉瘤中的单核细胞/巨噬细胞及其相关基因集。 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | scRNA-seq, WGCNA, Limma-Voom, RT-qPCR, ELISA | 逻辑回归模型 | mRNA表达数据, scRNA-seq数据 | 多个早期腹主动脉瘤模型数据集，以及人类腹主动脉瘤和健康捐赠者的样本 |
| 1742 | 2024-08-08 |
Identification of Monocyte-Associated Genes Related to the Instability of Atherosclerosis Plaque
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3972272
PMID:36187340
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞测序数据分析，识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 本研究首次识别了239个与单核细胞相关的基因，并通过WGCNA分析确定了与不稳定斑块高度相关的模块基因 | NA | 识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因，并探讨其潜在的生物学机制 | 动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组测序，单细胞测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GSE159677, GSE41571, GSE120521, 和 GSE118481的数据 |
| 1743 | 2024-08-08 |
Association of glioma CD44 expression with glial dynamics in the tumour microenvironment and patient prognosis
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.09.003
PMID:36187921
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研究论文 | 本文研究了胶质瘤CD44表达与肿瘤微环境中胶质细胞动态变化及患者预后的关联 | 首次揭示了星形胶质细胞通过上调CD44表达增强胶质瘤细胞活性和迁移能力，并通过骨桥蛋白-CD44信号促进M1巨噬细胞的招募，从而可能促进胶质瘤干细胞特性 | NA | 探索胶质瘤微环境中免疫和基质成分的动态调节及其与患者预后的关系 | 胶质瘤细胞、星形胶质细胞、M1巨噬细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | RT-qPCR、细胞活力和伤口愈合实验、CIBERSORT分析、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 使用The Cancer Genome Atlas数据库和中国胶质瘤基因组图谱数据库的数据 |
| 1744 | 2024-08-08 |
A combined analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals that depleted extracellular matrix and enhanced immune processes co-contribute to fluorouracil beneficial responses in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.999551
PMID:36189263
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研究论文 | 本研究通过结合TCGA数据库的批量测序数据和GEO数据库的单细胞RNA测序数据，探讨了肿瘤微环境特征与胃癌患者氟尿嘧啶反应之间的关系 | 首次揭示了胃癌肿瘤微环境与氟尿嘧啶耐药性的关系，并提供了潜在的治疗靶点和预测原理 | NA | 探讨肿瘤微环境特征与胃癌患者氟尿嘧啶反应之间的关系 | 胃癌患者的肿瘤微环境特征及氟尿嘧啶反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 涉及TCGA数据库和GEO数据库的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 1745 | 2024-08-08 |
T cell receptor repertoire analysis in HTLV-1-associated diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.984274
PMID:36189294
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综述 | 本文综述了在HTLV-1相关疾病中T细胞受体（TCR）谱的研究现状，并讨论了TCR克隆扩展对HTLV-1相关疾病进程和治疗的影响 | 利用单细胞RNA测序等突破性技术提高了T细胞克隆的特异性，并加深了对病毒感染、癌症及关联治疗中TCR特征的理解 | 从无症状携带者到疾病状态的转变因素仍不完全清楚 | 识别和追踪可用于监测从初次感染到免疫功能障碍和疾病进展的HTLV-1特异性T细胞生物标志物 | HTLV-1相关疾病中的T细胞受体（TCR）谱 | NA | 白血病/淋巴瘤、神经炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 涉及HTLV-1感染的CD4 T细胞和HTLV-1特异性CD8 T细胞 |
| 1746 | 2024-08-08 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 本文通过建立结直肠癌患者来源的类器官模型，研究了奥沙利铂耐药的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术解析了奥沙利铂耐药的细胞群体及相关信号通路 | NA | 研究结直肠癌中奥沙利铂耐药的机制 | 结直肠癌患者来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两株患者来源的类器官 |
| 1747 | 2024-08-08 |
Investigate the stemness of adult adipose-derived stromal cells based on single-cell RNA-sequencing
2022-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11898
PMID:36150081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性及其基因组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脂肪来源间充质干细胞的细胞异质性和干细胞基因特征 | 研究样本仅来自一名健康成年志愿者，可能影响结果的普遍性 | 探究脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5325个脂肪来源间充质干细胞样本 |
| 1748 | 2024-08-08 |
Decoding brain memory formation by single-cell RNA sequencing
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac412
PMID:36156112
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术解码大脑记忆形成的研究进展 | 介绍了单细胞RNA测序和单核RNA测序技术在揭示记忆特异性基因表达动态变化及其调控网络中的应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在理解记忆形成分子机制中的应用及面临的计算挑战 | 大脑中记忆形成的分子机制 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1749 | 2024-08-08 |
SARA suppresses myofibroblast precursor transdifferentiation in fibrogenesis in a mouse model of scleroderma
2022-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160977
PMID:36136606
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研究论文 | 本文研究了SARA在硬皮病小鼠模型中抑制肌成纤维细胞前体转分化的作用 | 首次揭示了SARA在硬皮病发病机制中与肌成纤维细胞前体和免疫细胞之间的新型交叉对话中的关键作用 | NA | 探讨SARA在硬皮病小鼠模型中抑制肌成纤维细胞前体转分化的机制 | SARA在PDGFR-β+周细胞和泛白细胞中的过表达对硬皮病皮肤纤维化的影响 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1750 | 2024-08-08 |
Human Plasma Proteome During Normal Pregnancy
2022-11-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.2c00391
PMID:36154181
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研究论文 | 本研究利用基于适配体的新平台，在91例正常妊娠的528份血浆样本中分析了7288种蛋白质 | 首次在正常妊娠期间对人类血浆蛋白质组进行了大规模分析，并展示了其对监测健康和疾病的潜在价值 | NA | 探索正常妊娠期间人类血浆蛋白质组的变化及其在监测健康和疾病中的应用 | 正常妊娠期间的人类血浆蛋白质组 | NA | NA | 适配体技术 | 机器学习 | 蛋白质组数据 | 528份血浆样本来自91例正常妊娠 |
| 1751 | 2024-08-08 |
Identification of the OA-related metabolism-related genes, corresponding transcription factors, relevant pathways, and specific bioactive small molecules
2022-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109096
PMID:36152536
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研究论文 | 本研究旨在通过RNA测序数据分析，识别与骨关节炎（OA）相关的代谢相关基因、转录因子、相关通路及特定生物活性小分子 | 本研究通过综合分析RNA测序数据、基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析和基因集变异分析（GSVA），构建了转录因子、代谢相关基因和标志物的综合网络，并利用ChIP-seq和单细胞测序技术进一步验证了转录因子的调控作用 | NA | 识别与骨关节炎相关的代谢相关基因、转录因子、相关通路及特定生物活性小分子 | 关节软骨的代谢变化 | NA | 骨关节炎 | RNA测序, ChIP-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | 74个差异表达的代谢相关基因和38个转录因子 |
| 1752 | 2024-08-08 |
Acute kidney injury biomarkers in the single-cell transcriptomic era
2022-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00079.2022
PMID:36154695
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学技术在急性肾损伤（AKI）生物标志物研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术，能够详细分析尿液、血液或肾活检中的细胞，揭示传统生物标志物的细胞来源，捕捉患者异质性，定义与不同AKI亚型相关的细胞状态，并可能有助于预测治疗反应 | NA | 探索单细胞技术如何改变AKI的诊断方法，从单一生物标志物转向细胞特异性分子特征 | 急性肾损伤（AKI）的生物标志物 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 1753 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape analysis reveals distinct regression trajectories and novel prognostic biomarkers in primary neuroblastoma
2022-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.12.020
PMID:36157484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了17个神经母细胞瘤临床样本和3个肾上腺周围组织，揭示了神经母细胞瘤的独特退化轨迹和新的预后生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了神经母细胞瘤的退化机制，并识别出新的预后标志物和潜在的治疗靶点。 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 揭示神经母细胞瘤的退化机制，并寻找新的预后生物标志物和治疗靶点。 | 神经母细胞瘤的细胞组成、退化机制和预后标志物。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17个神经母细胞瘤临床样本和3个肾上腺周围组织 |
| 1754 | 2024-08-08 |
DNA sensor-associated type I interferon signaling is increased in ulcerative colitis and induces JAK-dependent inflammatory cell death in colonic organoids
2022-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00104.2022
PMID:36165492
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研究论文 | 本研究探讨了DNA传感器途径在溃疡性结肠炎（UC）发病机制中的作用，通过分析结肠黏膜活检组织中DNA传感器、炎症小体和I型干扰素（IFN）生物标志物基因的表达，并研究了I型IFN、IFN-γ和TNF-α对人类结肠类器官中基因表达、细胞因子产生和细胞死亡的影响。 | 本研究发现活动性UC患者结肠基因表达的细胞质DNA传感器、炎症小体、STING和I型IFN信号通路显著增加，I型IFN与TNF-α联合诱导了JAK依赖但NLRP3和炎症小体独立的结肠类器官炎症细胞死亡，这是一种与UC免疫病理相关的新型炎症细胞死亡表型。 | NA | 探讨DNA传感器途径在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其对结肠类器官的影响。 | 结肠黏膜活检组织、人类结肠类器官。 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 控制组31例，非活动性UC 31例，活动性UC 33例，以及一个UC单细胞RNA-Seq数据集。 |
| 1755 | 2024-08-08 |
Single-cell mapping of regenerative and fibrotic healing responses after musculoskeletal injury
2022-10-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.08.011
PMID:36150381
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术比较了再生性和纤维化愈合反应在肌肉骨骼损伤后的差异 | 研究发现纤维化的P2 DTA模型与异位骨化（HO）的转录相似度高于再生性的P3 DTA模型，表明基因表达与愈合结果的相关性大于与损伤类型或细胞来源的相关性 | NA | 指导未来伤口再生策略 | 肌肉骨骼损伤后的再生性和纤维化愈合反应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及第三指节元素（P3）和第二指节元素（P2）的指尖截肢（DTA）模型以及异位骨化（HO）模型 |
| 1756 | 2024-08-08 |
Highly sensitive single-cell chromatin accessibility assay and transcriptome coassay with METATAC
2022-10-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206450119
PMID:36161934
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研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的单细胞染色质可及性检测方法METATAC及其与转录组共检测技术 | METATAC方法能够检测大量单细胞中的可及位点，并与自动化兼容，同时与高灵敏度单细胞RNA测序方法MALBAC-DT结合，开发了联合ATAC-RNA检测技术M2C-seq | NA | 提高单细胞染色质可及性和转录组检测的灵敏度和效率 | 单细胞染色质可及性和基因表达的关系 | 单细胞组学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞, 早期小鼠胚胎细胞 |
| 1757 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104258
PMID:36137413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出铁死亡性软骨细胞簇，并揭示TRPV1作为抗铁死亡靶点在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出骨关节炎中铁死亡性软骨细胞簇，并发现TRPV1作为抗铁死亡的新靶点 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨软骨细胞铁死亡在骨关节炎发病机制中的作用及其分子特征和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17,638个软骨细胞 |
| 1758 | 2024-08-08 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals tissue architecture in esophageal squamous cell carcinoma
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104281
PMID:36162205
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研究论文 | 本研究通过整合基于微阵列的空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了食管鳞状细胞癌中的组织结构 | 首次通过多模态交叉分析整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，精确注释了肿瘤和间质区域的细胞组成 | 研究样本仅来自三位食管鳞状细胞癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中不同细胞亚群的空间景观及其潜在的细胞间交流 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三位食管鳞状细胞癌患者的组织样本 |
| 1759 | 2024-08-08 |
Unique Cell Subpopulations and Disease Progression Markers in Canines with Atopic Dermatitis
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200304
PMID:36165204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在犬类特应性皮炎模型中探索健康皮肤与特应性皮炎皮肤之间的分子和细胞差异 | 首次在犬类特应性皮炎模型中发现γδ T细胞的富集，以及特应性皮炎中显著的-阳性成纤维细胞亚群，这些可能与皮肤炎症有关 | NA | 揭示特应性皮炎在分子和细胞层面的差异，并寻找可能的疾病进展标志物 | 犬类特应性皮炎的皮肤细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 1760 | 2024-08-08 |
Loss of apelin blocks the emergence of sprouting angiogenesis in experimental tumors
2022-10, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200616RR
PMID:36165236
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研究论文 | 研究探讨了apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用，特别是在VEGF信号抑制后的影响 | 发现apelin的缺失可以延缓肿瘤生长并减少血管密度，为抗血管生成治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别VEGF途径抑制后的替代促血管生成途径，以开发更有效的抗血管生成疗法 | apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺腺癌1和B16F10黑色素瘤 |