单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1741 - 1760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2024-08-08 |
Integration of single-cell and bulk RNA-seq to establish a predictive signature based on the differentiation trajectory of M2 macrophages in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1010440
PMID:36171876
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，建立了基于M2巨噬细胞分化轨迹的肺腺癌预测标志物 | 首次在单细胞水平上研究M2巨噬细胞的异质性及其与肺腺癌分化相关的基因，以指导临床治疗 | NA | 建立基于M2巨噬细胞分化轨迹的肺腺癌预测模型，以提高精准治疗的效果 | M2巨噬细胞在肺腺癌中的异质性和分化相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Lasso-Cox, 多元逐步回归 | RNA序列 | 12个肺腺癌样本 |
| 1742 | 2024-08-08 |
Integrative bioinformatics analysis to identify the effects of circadian rhythm on Crohn's disease
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.961481
PMID:36172047
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，探讨了昼夜节律对克罗恩病发病机制的影响 | 首次揭示了昼夜节律相关基因在克罗恩病中的异常表达及其与疾病严重程度的关系 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需要更多的临床样本验证 | 探究昼夜节律在克罗恩病发病机制中的作用 | 克罗恩病患者的多组学数据和临床信息 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的克罗恩病患者样本 |
| 1743 | 2024-08-08 |
Fibroblasts mediate the angiogenesis of pheochromocytoma by increasing COX4I2 expression
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.938123
PMID:36172142
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研究论文 | 本研究探讨了COX4I2在调节嗜铬细胞瘤血管生成中的作用 | 发现成纤维细胞通过增加COX4I2表达来介导嗜铬细胞瘤的血管生成 | NA | 探索COX4I2在嗜铬细胞瘤血管生成中的作用 | COX4I2在嗜铬细胞瘤中的表达及其对血管生成的影响 | NA | 嗜铬细胞瘤 | scRNA-seq, 免疫染色, qPCR | NA | mRNA | 一个嗜铬细胞瘤病例及NIH3T3细胞系 |
| 1744 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals T-cell exhaustion in denosumab-treated giant cell tumor of bone
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.934078
PMID:36172351
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫染色实验，探讨了地诺单抗治疗后骨巨细胞瘤中的免疫景观，特别是CD8 T细胞的耗竭情况。 | 首次揭示了地诺单抗治疗后骨巨细胞瘤中CD8 T细胞的耗竭现象，并发现肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的M2型偏斜以及POSTN表达的增加与肿瘤复发相关。 | NA | 研究地诺单抗治疗骨巨细胞瘤后，肿瘤浸润淋巴细胞的分子和功能特性。 | 骨巨细胞瘤中的CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1745 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis identifies immune heterogeneity associated with KRAS/TP53 mutation status and tumor-sideness in colorectal cancers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.961350
PMID:36172359
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，分析了KRAS/TP53突变状态和肿瘤侧性对结直肠癌免疫微环境的影响 | 发现了结直肠癌中两种耗竭的CD8+ T细胞亚型和预示不良预后的FOLR2+ LYVE1+巨噬细胞，并揭示了KRAS/TP53双突变通过影响免疫细胞的能量代谢和细胞间通讯，促进免疫抑制 | NA | 分析KRAS/TP53突变状态和肿瘤侧性对结直肠癌免疫微环境的影响 | 结直肠癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 共包括78个单细胞RNA测序数据集，涵盖42个未经治疗的结直肠肿瘤、13个肿瘤邻近组织和23个正常黏膜组织 |
| 1746 | 2024-08-08 |
Case report: Understanding the impact of persistent tissue-localization of SARS-CoV-2 on immune response activity via spatial transcriptomic analysis of two cancer patients with COVID-19 co-morbidity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.978760
PMID:36172383
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病例报告 | 本报告通过空间转录组学分析，研究了两位患有COVID-19合并症的癌症患者的组织定位免疫反应 | 首次展示了空间转录组学分析在肿瘤和邻近正常组织中与淋巴细胞相关的SARS-CoV-2反应的一致性，并揭示了患者特异性SARS-CoV-2记忆B细胞的主要贡献 | 研究样本量较小，仅包括两位患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SARS-CoV-2在长期免疫记忆和癌症治疗中的影响 | 患有COVID-19合并症的癌症患者的免疫反应 | 数字病理学 | 肝细胞癌，结直肠癌 | 空间转录组学分析，RNAscope，多重免疫组织化学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两位患者（一位肝细胞癌患者和一位结直肠癌患者） |
| 1747 | 2024-08-08 |
L36G is associated with cutaneous antiviral competence in psoriasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.971071
PMID:36172384
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研究论文 | 本文研究了L36G与银屑病皮肤抗病毒能力的关系，通过基因表达谱分析、GO和KEGG通路富集分析、蛋白质相互作用网络构建等方法，发现IL36G与抗病毒蛋白在银屑病发病机制中的潜在关联。 | 首次揭示了IL36G与抗病毒蛋白在银屑病发病机制中的关联，并提出它们可能是银屑病发生和严重程度的新候选分子标记。 | 研究主要基于基因表达数据和蛋白质相互作用网络分析，未涉及临床试验验证。 | 探讨银屑病发病机制中IL36G与抗病毒蛋白的关系。 | 银屑病患者的皮肤样本和健康对照皮肤样本。 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | 银屑病样本和健康对照样本 |
| 1748 | 2024-08-08 |
Proteomics Combined with RNA Sequencing to Screen Biomarkers of Sepsis
2022, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S380137
PMID:36172619
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学结合RNA测序技术筛选脓毒症患者血清中的生物标志物，并寻找新的诊断和治疗靶点 | 采用数据非依赖采集（DIA）方法进行蛋白质谱分析，结合RNA测序技术，通过九象限分析和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）及基因本体（GO）功能富集分析，筛选出在蛋白质组和转录组中表达趋势一致的差异因子 | NA | 筛选脓毒症的生物标志物和新的诊断及治疗靶点 | 脓毒症患者和健康志愿者的血样 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | 蛋白质和基因数据 | 22名脓毒症患者和10名健康志愿者的血样 |
| 1749 | 2024-08-08 |
Corrigendum: The role of NR4A1 in the pathophysiology of osteosarcoma: A comprehensive bioinformatics analysis of the single-cell RNA sequencing dataset
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1027056
PMID:36176386
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1750 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of brain tissues reveal the central nervous system's susceptibility to SARS-CoV-2 and the drug
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.971017
PMID:36176453
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析大脑组织，探讨了SARS-CoV-2感染对人类中枢神经系统的脆弱性，并预测了药物(-)-儿茶素对神经系统的影响。 | 首次通过单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2入侵大脑的机制，并发现了(-)-儿茶素可能减轻COVID-19对神经系统的影响。 | NA | 探讨SARS-CoV-2对中枢神经系统的感染机制及可能的治疗药物。 | 人类大脑组织及SARS-CoV-2病毒。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及不同年龄段的大鼠及人类大脑组织样本。 |
| 1751 | 2024-08-08 |
M2-like tumor-associated macrophage-related biomarkers to construct a novel prognostic signature, reveal the immune landscape, and screen drugs in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994019
PMID:36177006
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，鉴定与M2样肿瘤相关巨噬细胞（M2-like TAMs）相关的生物标志物，构建新的预后标志物，揭示肝细胞癌（HCC）的免疫景观，并筛选潜在的治疗药物。 | 本研究通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据，首次构建了基于M2样TAM相关基因的预后标志物，并揭示了HCC的免疫景观。 | NA | 旨在通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据，鉴定与M2样TAM相关的生物标志物，构建新的预后标志物，揭示HCC的免疫景观，并筛选潜在的治疗药物。 | M2样肿瘤相关巨噬细胞（M2-like TAMs）相关的生物标志物及其在肝细胞癌（HCC）中的作用。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA-seq数据 | 127个M2样TAM相关基因 |
| 1752 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq uncovered hemocyte functional subtypes and their differentiational characteristics and connectivity with morphological subpopulations in Litopenaeus vannamei
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.980021
PMID:36177045
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合RNA-FISH和流式细胞分选技术，揭示了南美白对虾血细胞的功能亚型及其分化特征和与形态亚群的联系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细定义了南美白对虾血细胞的功能亚型，并揭示了其潜在的分化轨迹和与形态亚群的对应关系 | NA | 旨在揭示南美白对虾血细胞的多样性，并为血细胞分类提供新的理论依据 | 南美白对虾的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1753 | 2024-08-08 |
Astrocyte development in the cerebral cortex: Complexity of their origin, genesis, and maturation
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.916055
PMID:36177355
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研究论文 | 本文综述了大脑皮层中星形胶质细胞的起源、生成和成熟过程，以及这些过程中的关键调控因素 | 利用大量和单细胞转录组学技术，逐步解开星形胶质细胞多样性的秘密，并更好地理解其复杂性 | 尽管取得了进展，但星形胶质细胞多样性的起源仍未完全解决，且缺乏针对每个星形胶质细胞亚型的特定标记 | 深入理解大脑皮层中星形胶质细胞的多样性及其发展机制 | 星形胶质细胞的起源、生成和成熟过程及其在大脑皮层中的多样性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1754 | 2024-08-08 |
Preparation of Single Pineal Cells
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2593-4_13
PMID:36180682
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研究论文 | 本文描述了一种从松果体中分离单个细胞的简单程序 | 介绍了单细胞RNA测序技术在松果体细胞生理学研究中的应用 | NA | 理解松果体中分化、代谢和细胞间通讯等复杂过程 | 松果体中的单个细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量松果体组织 |
| 1755 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with recurrent implantation failure
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.74053
PMID:36185612
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，对反复植入失败（RIF）患者和健康对照组的人类子宫内膜细胞在植入窗口期（WOI）的转录组进行了详细分析 | 首次提供了健康和RIF子宫内膜在WOI时期的详细分子和细胞图谱，并发现了RIF患者子宫内膜细胞中与接受性相关的基因表达显著差异 | 样本量较小，可能影响研究结果的普遍性和可靠性 | 深入了解RIF患者子宫内膜微环境紊乱，以改善不明原因RIF的病因诊断和治疗 | 反复植入失败患者和健康对照组的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | RIF患者6例，健康对照组3例 |
| 1756 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses of Heterotopic Ossification: Characteristics of Injury-Related Senescent Fibroblasts
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S369376
PMID:36185637
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术分析异位骨化样本中与损伤相关的衰老成纤维细胞的特征 | 首次研究损伤相关细胞衰老在异位骨化中的作用，并发现损伤相关衰老与年龄相关衰老在SASP表型上存在显著差异 | 研究仅限于特定时间点的样本分析，未涵盖更广泛的时间范围和样本类型 | 探讨损伤相关细胞衰老在异位骨化中的作用及其分子机制 | 异位骨化样本中的衰老成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 特定时间点的异位骨化样本 |
| 1757 | 2024-08-08 |
Identification of differentially expressed genes at the single-cell level and prognosis prediction through bulk RNA sequencing data in breast cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.979829
PMID:36186437
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研究论文 | 本研究通过单细胞水平分析和批量RNA测序数据，识别乳腺癌中正常细胞与肿瘤细胞之间的差异表达基因，并构建预后标志物 | 利用单细胞技术识别细胞类型特异性差异表达基因，并结合批量RNA测序数据构建预后标志物，有效区分患者风险组 | NA | 探讨单细胞水平上正常细胞与肿瘤细胞的差异表达基因，并探索这些基因在乳腺癌中的临床应用 | 乳腺癌中的正常细胞与肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23,909个正常乳腺细胞和33,138个乳腺癌肿瘤细胞 |
| 1758 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals potential novel combination of biomarkers for antibody-based cancer therapeutics in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.928256
PMID:36186483
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人肝细胞癌（HCC）的肿瘤异质性，并鉴定出一种新的三基因标志物组合，可能作为基于抗体的癌症治疗的新型生物标志物。 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中潜在的新型生物标志物组合，为基于抗体的癌症治疗提供了新的靶点。 | 研究主要集中在肝细胞癌的肿瘤细胞表面抗原的鉴定，未涉及其他类型的癌症或更广泛的治疗应用。 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肝细胞癌中的肿瘤异质性，并寻找新的生物标志物以促进基于抗体的癌症治疗。 | 研究对象包括肝细胞癌的肿瘤组织、癌旁组织和远端正常肝组织中的单细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及28个细胞集群，并在多个独立患者队列中进行了验证。 |
| 1759 | 2024-08-08 |
Identification of key monocytes/macrophages related gene set of the early-stage abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.950961
PMID:36186997
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和实验验证，识别了早期腹主动脉瘤中与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因集。 | 本研究首次通过scRNA-seq数据和WGCNA分析，识别了与早期腹主动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因模块，并构建了基于这些基因集的逻辑回归诊断模型。 | 本研究主要基于生物信息学分析和有限的实验验证，未来需要更多的临床样本和实验来进一步验证这些发现。 | 探讨早期腹主动脉瘤中免疫细胞浸润的分子机制，并寻找有效的腹主动脉瘤标志物。 | 早期腹主动脉瘤中的单核细胞/巨噬细胞及其相关基因集。 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | scRNA-seq, WGCNA, Limma-Voom, RT-qPCR, ELISA | 逻辑回归模型 | mRNA表达数据, scRNA-seq数据 | 多个早期腹主动脉瘤模型数据集，以及人类腹主动脉瘤和健康捐赠者的样本 |
| 1760 | 2024-08-08 |
Identification of Monocyte-Associated Genes Related to the Instability of Atherosclerosis Plaque
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3972272
PMID:36187340
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞测序数据分析，识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 本研究首次识别了239个与单核细胞相关的基因，并通过WGCNA分析确定了与不稳定斑块高度相关的模块基因 | NA | 识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因，并探讨其潜在的生物学机制 | 动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组测序，单细胞测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GSE159677, GSE41571, GSE120521, 和 GSE118481的数据 |