单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2024-08-08 |
Conservation at the uterine-placental interface
2022-10-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210633119
PMID:36191208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了早期和晚期妊娠阶段大鼠子宫-胎盘界面入侵滋养层细胞及其他细胞群体的转录组特征 | 发现大鼠入侵滋养层细胞的转录本在人类胎盘的入侵绒毛外滋养层细胞中具有保守性 | NA | 探究子宫-胎盘界面中滋养层细胞与母体细胞的相互作用及其对胎儿生长的影响 | 大鼠子宫-胎盘界面中的入侵滋养层细胞及其他细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早期（妊娠第15.5天）和晚期（妊娠第19.5天）的大鼠子宫-胎盘界面细胞样本 |
| 1702 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing resolves the landscape of immune cells and regulatory mechanisms in HIV-infected immune non-responders
2022-10-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05225-6
PMID:36195585
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）分析了来自HIV-1感染的免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了INR中黏膜相关不变T细胞（MAIT）低表达及其与受损线粒体功能和凋亡信号相关的转录特征。 | 首次通过单细胞测序技术详细解析了HIV感染后免疫非应答者的免疫细胞图谱及其调控机制，特别是发现了MAIT细胞在INR中的功能障碍及其与线粒体功能的关系。 | 研究样本仅限于外周血单个核细胞，未涉及其他组织或器官的细胞，可能限制了对HIV感染后免疫重建失败机制的全面理解。 | 探究HIV感染后免疫非应答者免疫重建失败的机制。 | HIV-1感染的免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 细胞 | 来自免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的多个样本 |
| 1703 | 2024-08-08 |
Multicellular immune dynamics implicate PIM1 as a potential therapeutic target for uveitis
2022-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33502-7
PMID:36195600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU），揭示了疾病进展中的细胞组成和转录调控变化，并发现PIM1分子与疾病相关 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了葡萄膜炎中细胞动态变化，并识别出PIM1作为潜在治疗靶点 | NA | 探究葡萄膜炎的细胞动态和发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）和人类葡萄膜炎（VKH） | NA | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1704 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics tools allow for regional exploration of heterogeneous muscle pathology in the pre-clinical rabbit model of rotator cuff tear
2022-Oct-04, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-022-03326-8
PMID:36195913
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研究论文 | 本文评估了空间转录组技术在兔肩袖撕裂模型中探索异质性骨骼肌组织区域细胞活动的潜力和挑战 | 使用3' Visium空间转录组技术，能够在先前获取的组织中探索空间转录模式，并与底层组织学相关联 | 肌肉纤维过长，难以被单细胞液滴包围，且单核转录组学受肌肉纤维多核化的影响 | 评估空间转录组技术在理解异质性骨骼肌组织区域细胞活动中的潜力和挑战 | 兔肩袖撕裂模型的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 3' Visium空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 健康对照组和手术后2周及16周的组织样本，以及储存超过6年的组织样本 |
| 1705 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of mammalian utricular cells over the course of development
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1052
PMID:36178017
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了从新生期到成年期小鼠椭圆囊细胞的异质性，并追踪了新毛细胞的来源 | 发现新毛细胞主要通过Sox9+前体细胞分化产生，而非有丝分裂增殖 | NA | 探究哺乳动物椭圆囊细胞在发育过程中的命运及其特征 | 小鼠椭圆囊中的毛细胞和支持细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 包括新生期和成年期的小鼠椭圆囊样本，具体为P2、P7和P30的小鼠 |
| 1706 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing Offers Potential Therapeutic Targets for Ischemic Stroke
2022-Oct-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0212
PMID:36186129
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示缺血性中风中细胞异质性和潜在治疗靶点方面的应用 | 利用单细胞RNA测序技术无偏倚地确定高分辨率的细胞异质性，并识别细胞标记，揭示了细胞类型特异性基因表达模式中的主要脑簇以及细胞特异性亚簇及其在不同通路中的功能 | NA | 旨在启发新的研究，并为探索单细胞水平上缺血性中风的潜在病理机制和新型治疗策略提供方向 | 缺血性中风中的脑细胞和外周免疫细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1707 | 2024-08-08 |
Fast and interpretable consensus clustering via minipatch learning
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010577
PMID:36191044
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研究论文 | 本文提出了一种快速且可解释的共识聚类方法IMPACC，通过使用微小块（minipatches）学习来提高聚类的准确性、稳定性和计算效率 | IMPACC方法通过从观测和特征的微小子集中集成聚类共现，显著减少了计算时间，并开发了自适应采样方案以提高可靠性和解释性 | NA | 解决共识聚类在处理大规模生物信息学数据时的计算效率低下和缺乏解释性的问题 | 大规模生物信息学数据，如单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 共识聚类 | NA | 数据集 | 多种真实大规模生物信息学数据集 |
| 1708 | 2024-08-08 |
CaSee: A lightning transfer-learning model directly used to discriminate cancer/normal cells from scRNA-seq
2022-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02478-5
PMID:36192479
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研究论文 | 本研究开发了一种名为pan-Cancer Seeker（CaSee）的转移学习模型，用于直接从scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞 | CaSee是首个直接用于scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞的工具，相较于需要相应参考细胞的拷贝数变异（CNV）方法，具有更广泛的应用领域和更高的效率 | NA | 开发一种基于深度学习的泛癌细胞鉴别模型，以区分癌细胞和正常细胞 | scRNA-seq表达矩阵中的癌细胞和正常细胞 | 基因组学 | 癌症 | scRNA-seq | 转移学习模型 | 表达矩阵 | 在11个回顾性队列和1个独立数据集的多中心数据评估中展示了优异的性能 |
| 1709 | 2024-08-08 |
Therapeutic implications of mitochondrial stress-induced proteasome inhibitor resistance in multiple myeloma
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq5575
PMID:36170375
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研究论文 | 本文探讨了线粒体应激诱导的蛋白酶体抑制剂抗性在多发性骨髓瘤中的治疗意义 | 首次揭示了电子传递链抑制促进蛋白酶体抑制剂抗性的机制，并提出了针对线粒体代谢状态的联合治疗方案 | NA | 研究多发性骨髓瘤中代谢状态与治疗抗性的关联 | 多发性骨髓瘤患者及细胞模型 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CoMMpass试验中的患者样本 |
| 1710 | 2024-08-08 |
Rapid and sensitive single-cell RNA sequencing with SHERRY2
2022-09-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01416-x
PMID:36175891
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SHERRY2的单细胞RNA测序优化协议，无需第二链cDNA合成，具有高灵敏度和准确性 | SHERRY2利用Tn5转座酶直接切割和标记DNA/RNA异源双链，避免了预扩增和序列依赖性偏差 | NA | 开发一种新型单细胞RNA测序方法，提高测序的灵敏度和准确性 | 单细胞RNA测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个细胞 |
| 1711 | 2024-08-08 |
In vivo generation of bone marrow from embryonic stem cells in interspecies chimeras
2022-Sep-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74018
PMID:36178184
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研究论文 | 本文通过胚胎互补技术，在鼠-鼠嵌合体中从胚胎干细胞生成骨髓细胞系，并分析了其基因表达特征和细胞表面标记 | 首次在鼠-鼠嵌合体中成功生成功能性骨髓，并展示了胚胎干细胞衍生的造血干细胞的长期重建潜力 | 该方法目前仅在鼠-鼠嵌合体中验证，尚未在其他物种中进行测试 | 加速未来针对致命疾病的细胞疗法的开发 | 胚胎干细胞衍生的骨髓细胞系及其在嵌合体中的功能 | 干细胞研究 | NA | 荧光激活细胞分选分析，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了鼠胚胎干细胞和鼠-鼠嵌合体 |
| 1712 | 2024-08-08 |
CAR density influences antitumoral efficacy of BCMA CAR T cells and correlates with clinical outcome
2022-Sep-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo0514
PMID:36179026
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研究论文 | 本研究探讨了CAR密度对BCMA CAR T细胞功能的影响及其与临床结果的相关性 | 首次揭示了CAR密度对CAR T细胞功能的影响，并提供了基因调控网络的机制洞察 | 研究主要集中在体外和转录水平，需要进一步的临床试验验证 | 识别与CAR T细胞长期疗效相关的新标志物 | BCMA CAR T细胞的功能及其在多发性骨髓瘤治疗中的应用 | NA | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多个血液恶性肿瘤患者 |
| 1713 | 2024-08-08 |
Single cell and spatial transcriptomic analyses reveal microglia-plasma cell crosstalk in the brain during Trypanosoma brucei infection
2022-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33542-z
PMID:36180478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了在布氏锥虫感染期间大脑中微胶质细胞与浆细胞之间的相互作用 | 发现了微胶质细胞与Cd138浆细胞之间通过IL-10和B细胞激活因子（BAFF）信号传导的先前未知的相互作用 | NA | 旨在深入了解非洲锥虫感染期间大脑的分子和细胞反应 | 布氏锥虫感染期间大脑中的微胶质细胞和浆细胞 | 数字病理学 | 睡眠病 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑样本 |
| 1714 | 2024-08-08 |
LAG3 blockade coordinates with microwave ablation to promote CD8+ T cell-mediated anti-tumor immunity
2022-09-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03646-7
PMID:36180876
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研究论文 | 本文研究了LAG3阻断与微波消融（MWA）联合治疗在促进CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫中的作用。 | 首次报道了LAG3在肿瘤微环境中的上调表达，并提出MWA与LAG3阻断的联合治疗策略。 | 研究仅在预临床小鼠模型中进行，需要进一步的临床试验验证。 | 探讨LAG3阻断与MWA联合治疗在某些实体瘤中的疗效及其对肿瘤微环境的影响。 | 研究对象包括肿瘤微环境中的免疫细胞和CD8+ T细胞。 | 数字病理学 | 实体瘤 | 微波消融（MWA） | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 研究使用了预临床小鼠模型，具体样本数量未详细说明。 |
| 1715 | 2024-08-08 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
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research paper | 本研究利用荧光激活细胞分选、单细胞转录组学以及组织学和超微结构分析，揭示了在妊娠中期人脑中，多种内皮细胞和壁细胞亚型共同构成脑部血管网络，并探讨了它们在神经发生中的作用。 | 本研究首次全面展示了妊娠中期人脑中血管细胞的成熟过程，并揭示了这些细胞如何通过特定的信号机制促进细胞间通讯和成熟。 | NA | 探讨血管生成与神经生成在胚胎脑发育中的相互作用，并深入理解人脑发育关键时期血管细胞的成熟机制。 | 妊娠中期人脑中的内皮细胞和壁细胞亚型及其在血管生成和神经生成中的作用。 | digital pathology | NA | 荧光激活细胞分选、单细胞转录组学 | NA | 细胞、组织 | NA |
| 1716 | 2024-08-08 |
Bone marrow-derived naïve B lymphocytes improve heart function after myocardial infarction: a novel cardioprotective mechanism for empagliflozin
2022-09-28, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-022-00956-1
PMID:36171393
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研究论文 | 研究探讨了骨髓来源的初始B淋巴细胞在心肌梗死后改善心脏功能的作用，以及SGLT2抑制剂empagliflozin在此过程中的保护机制 | 首次建立了双次心肌梗死模型来评估empagliflozin的剂量依赖性心脏保护作用，并揭示了empagliflozin恢复骨髓初始B细胞数量和功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型和少量急性心肌梗死患者，需要更多临床试验验证 | 探究心肌梗死后适应性免疫反应的作用机制，特别是B淋巴细胞的作用，并评估empagliflozin的心脏保护效果 | 骨髓来源的初始B淋巴细胞、心肌梗死模型小鼠、急性心肌梗死患者 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14名急性心肌梗死患者和18名对照组 |
| 1717 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals heterogeneity of juvenile idiopathic arthritis fibroblast-like synoviocytes with implications for disease subtype
2022-09-27, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-022-02913-8
PMID:36167601
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了幼年特发性关节炎中的成纤维样滑膜细胞的异质性及其与疾病亚型的关系 | 首次揭示了幼年特发性关节炎中成纤维样滑膜细胞的异质性，并发现特定的基因表达模式可以区分不同的疾病亚型 | NA | 探究幼年特发性关节炎中成纤维样滑膜细胞的异质性及其与疾病亚型的关系 | 幼年特发性关节炎中的成纤维样滑膜细胞 | 数字病理学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自三种持续性寡关节炎、三种扩展前寡关节炎和三种多关节炎亚型的成纤维样滑膜细胞系 |
| 1718 | 2024-08-08 |
Polyclonal evolution of Fanconi anemia to MDS and AML revealed at single cell resolution
2022-Sep-27, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-022-00319-5
PMID:36167633
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率揭示了范可尼贫血向骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的多克隆演化过程 | 首次在单细胞水平上展示了范可尼贫血向骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病演化的多克隆模式 | 研究仅基于少数患者样本，可能无法完全代表所有范可尼贫血患者的演化模式 | 探究范可尼贫血向骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的分子克隆演化过程 | 范可尼贫血患者及其向骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的演化过程 | NA | 骨髓增生异常综合征，急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 包括一个从范可尼贫血演化为骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的患者样本（P1001）及其他三个处于骨髓增生异常综合征阶段的范可尼贫血患者样本 |
| 1719 | 2024-08-08 |
TGF-β generates a population of cancer cells residing in G1 phase with high motility and metastatic potential via KRTAP2-3
2022-09-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111411
PMID:36170816
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研究论文 | 本文研究了TGF-β通过KRTAP2-3调控G1期口腔癌细胞的迁移和转移能力 | 首次揭示了TGF-β通过KRTAP2-3在G1期诱导口腔癌细胞高迁移和转移能力的机制 | NA | 探讨TGF-β在口腔癌细胞中的促肿瘤和抑制肿瘤效应的相关性 | 口腔癌细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1720 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies pathogenic T-helper 17.1 cells and pro-inflammatory monocytes in immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005323
PMID:36171010
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，识别了免疫检查点抑制剂相关性肺炎中的致病性T辅助17.1细胞和促炎性单核细胞，并探讨了其潜在的治疗靶点。 | 首次在免疫检查点抑制剂相关性肺炎中识别出致病性T辅助17.1细胞和促炎性单核细胞，并揭示了它们之间的有害交叉对话，为治疗提供了新的潜在靶点。 | NA | 旨在深入了解免疫检查点抑制剂相关性肺炎的发病机制，并识别潜在的治疗靶点。 | 免疫检查点抑制剂相关性肺炎患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞RNA和T细胞受体。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11名免疫检查点抑制剂相关性肺炎患者和6名无此病症的癌症患者 |