单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2024-08-08 |
Analysis of antitumor immunity in mouse glioma microenvironment through intercellular communication
2022-Sep, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_852_22
PMID:36204889
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研究论文 | 本研究通过分析细胞间通讯，描绘了小鼠胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 描述了之前被低估的浸润性T细胞与脑细胞群之间的复杂通讯 | NA | 旨在通过分析细胞间通讯，描绘胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 小鼠胶质瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因组数据 | 新鲜的小鼠胶质瘤样本 |
| 1662 | 2024-08-08 |
Spotlight on liver macrophages for halting injury and progression in nonalcoholic fatty liver disease
2022-08, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2132145
PMID:36205054
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中巨噬细胞的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 探讨了未来研究可能涉及的领域，如肠道微生物组、损伤相关分子模式（DAMPS）及其相关分子和通路，以及单细胞测序等高级分子生物学研究 | NA | 更新关于直接或间接影响NAFLD中巨噬细胞的药物研究，并讨论巨噬细胞生物标志物在监测疾病阶段和进展/逆转中的意义 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及其相关药物和生物标志物 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1663 | 2024-08-08 |
[scRNA-sequencing uncovers metabolism and CD52 as new targets in ibrutinib-surviving mantle cell lymphoma cells]
2022-Aug, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-022-01136-7
PMID:36222922
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后存活的外套细胞淋巴瘤细胞中的代谢变化和新靶点CD52 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后外套细胞淋巴瘤细胞的基因表达趋势和新的治疗靶点 | 研究仅使用了REC-1细胞系，可能无法完全代表所有外套细胞淋巴瘤细胞的反应 | 探索伊布替尼治疗外套细胞淋巴瘤后的细胞适应性和新的治疗靶点 | 外套细胞淋巴瘤细胞及其对伊布替尼治疗的反应 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用REC-1细胞系进行实验 |
| 1664 | 2024-08-08 |
[New insights into the bone marrow niche in multiple myeloma revealed by single-cell profiling technologies]
2022, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.63.1188
PMID:36198544
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术揭示的多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术深入研究了多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | NA | 探讨多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 多发性骨髓瘤骨髓微环境中的非造血细胞和成熟造血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1665 | 2024-08-08 |
Identification of Diagnostic Genes and Effective Drugs Associated with Osteoporosis Treatment by Single-Cell RNA-Seq Analysis and Network Pharmacology
2022, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2022/6830635
PMID:36199280
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析和网络药理学方法，识别与骨质疏松治疗相关的诊断基因和有效药物 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别出与骨质疏松特定细胞亚群相关的关键基因和潜在药物 | 研究仅基于特定数据集和计算方法，实际临床应用的有效性和安全性需进一步验证 | 探索骨质疏松的诊断和治疗方法 | 骨质疏松相关的诊断基因和有效药物 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,577个细胞，识别出12个细胞亚群 |
| 1666 | 2024-08-08 |
Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Revealed That the Pyroptosis of Glioma-Associated Macrophages Participates in Tumor Progression and Immunosuppression
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1803544
PMID:36199426
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡参与肿瘤进展和免疫抑制 | 首次阐明了胶质瘤中细胞焦亡与临床预后及免疫细胞浸润的关系，并发现了潜在的治疗靶点，如细胞焦亡抑制剂 | NA | 探索胶质瘤中细胞焦亡的作用及其对预后和免疫环境的影响 | 胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡及其在肿瘤进展和免疫抑制中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集，包括TCGA和CGGA队列，以及三个独立的单细胞RNA测序数据集 |
| 1667 | 2024-08-08 |
Stability of scRNA-Seq Analysis Workflows is Susceptible to Preprocessing and is Mitigated by Regularized or Supervised Approaches
2022, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.1177/11769343221123050
PMID:36199555
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析工作流程的稳定性，特别是预处理步骤对其的影响，并探讨了正则化或监督方法如何缓解这一问题。 | 本文首次全面评估了scRNA-Seq分析工作流程在降维、聚类和轨迹推断中的稳健性，并引入了神经网络方法来评估模型复杂度对偏差/方差权衡的影响。 | 研究主要集中在公共数据库中的时间序列单细胞转录组数据，可能无法完全代表所有scRNA-Seq数据的情况。 | 旨在全面审查scRNA-Seq分析工作流程的稳健性，特别是在降维、聚类和轨迹推断方面。 | 单细胞RNA测序数据分析工作流程的稳定性及其对预处理步骤的敏感性。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | 超过6000次分析 |
| 1668 | 2024-08-08 |
Regulatory pattern of abnormal promoter CpG island methylation in the glioblastoma multiforme classification
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.989985
PMID:36199581
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研究论文 | 本研究探讨了启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的调控模式 | 首次构建了基于启动子CpG岛甲基化驱动基因的胶质母细胞瘤样本集群的多组学尺度图，并开发了胶质母细胞瘤的诊断图和预测模型 | NA | 研究启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的作用 | 胶质母细胞瘤的分类和诊断 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CpG岛甲基化测序 | NA | 甲基化谱、表达谱和单细胞测序数据 | 多个高注释公共临床队列的数据 |
| 1669 | 2024-08-08 |
Transcriptional programming of immunoregulatory responses in human Langerhans cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.892254
PMID:36203560
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人类表皮朗格汉斯细胞（LCs）在迁移前后的转录组变化，并评估了其调节性T细胞启动能力 | 揭示了LCs在迁移过程中基因表达的连续成熟状态变化，并识别了关键的迁移诱导转录因子 | NA | 研究人类LCs在免疫稳态中的转录调控 | 人类表皮朗格汉斯细胞（LCs） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 迁移前后的LCs样本 |
| 1670 | 2024-08-08 |
Versican enrichment predicts poor prognosis and response to adjuvant therapy and immunotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.960570
PMID:36203562
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研究论文 | 本文评估了胃癌（GC）患者中VCAN表达对预后及辅助治疗和免疫治疗反应的影响 | VCAN可作为预测胃癌患者对辅助化疗、辅助放化疗及免疫治疗反应的潜在指标 | NA | 研究VCAN表达在胃癌中的作用及其对治疗反应的预测价值 | 胃癌患者的VCAN表达及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1353名胃癌患者 |
| 1671 | 2024-08-08 |
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011132
PMID:36203588
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研究论文 | 本研究通过流感与耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）共感染及每日抗生素治疗的实验模型，探讨了IFN-γ受体信号在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的作用 | 首次展示了IFN-γ信号通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）诱导气道免疫细胞转录组变化，特别是上调与炎症疾病相关的巨噬细胞和单核细胞基因表达 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨IFN-γ在ARDS发病机制中的作用及其对肺损伤的影响 | 小鼠模型中的IFN-γ受体信号及肺部炎症反应 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 1672 | 2024-08-08 |
Mechanism investigation and experiment validation of capsaicin on uterine corpus endometrial carcinoma
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.953874
PMID:36210802
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验操作，探讨辣椒素目标基因GATA1在子宫内膜癌治疗中的潜在机制，并开发疾病预后模型以验证该模型 | 本研究首次筛选出与预后相关的高风险基因GATA1，并通过Kaplan-Meier分析和ROC曲线验证了其作为独立预后因子的有效性 | NA | 探讨辣椒素在子宫内膜癌治疗中的作用机制并开发预后模型 | 辣椒素、GATA1基因、子宫内膜癌 | NA | 子宫内膜癌 | 生物信息学分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1673 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immune-related autophagy in spinal cord injury in rats
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.987344
PMID:36211348
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了大鼠脊髓损伤后免疫相关自噬的作用 | 首次全面评估了脊髓损伤部位的细胞类型，并筛选了免疫自噬相关因子的表达及信号通路 | NA | 探究脊髓损伤后的细胞组成变化、细胞发展轨迹及细胞间通讯 | 大鼠脊髓损伤部位的细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 几乎涵盖了所有脊髓损伤部位的细胞类型 |
| 1674 | 2024-08-08 |
A novel T-cell proliferation-associated regulator signature pre-operatively predicted the prognostic of bladder cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970949
PMID:36211359
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研究论文 | 本研究通过收集膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息，利用LASSO Cox回归模型建立了一个多基因签名，用于预测膀胱癌的预后和分期 | 本研究首次建立了一个与T细胞增殖相关调节因子签名，用于膀胱癌的预后预测 | NA | 研究T细胞增殖及其免疫微环境，以改善膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息 | 数字病理学 | 膀胱癌 | LASSO Cox回归模型 | LASSO Cox回归模型 | mRNA表达谱 | TCGA队列和验证队列 |
| 1675 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of CSF reveals neuroprotective RAC1+ NK cells in Parkinson's disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992505
PMID:36211372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者的脑脊液，揭示了神经保护性的RAC1+ NK细胞在帕金森病中的作用 | 首次在帕金森病患者中发现RAC1在NK细胞中显著上调，并探讨了RAC1 NK细胞在神经保护中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和公开的单细胞RNA测序数据，需要进一步的人体临床研究验证 | 探究NK细胞在帕金森病中的分子机制及其神经保护作用 | 帕金森病患者的脑脊液中的NK细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了公开的单细胞RNA测序数据（GSE141578），涉及帕金森病患者的脑脊液样本 |
| 1676 | 2024-08-08 |
Identification of immune cell infiltration and diagnostic biomarkers in unstable atherosclerotic plaques by integrated bioinformatics analysis and machine learning
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.956078
PMID:36211422
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和机器学习方法，识别了不稳定动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞浸润和诊断生物标志物。 | 本研究首次详细分析了不稳定斑块中免疫细胞的浸润情况，并发现了与斑块稳定性相关的关键基因和潜在治疗药物。 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，需要进一步的临床样本验证。 | 旨在探讨免疫细胞在不稳定斑块形成中的作用，并探索相关的诊断生物标志物。 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和相关基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 22种免疫细胞类型，来自公共GEO数据库的RNA测序和微阵列数据。 |
| 1677 | 2024-08-08 |
The emerging roles of interstitial macrophages in pulmonary fibrosis: A perspective from scRNA-seq analyses
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923235
PMID:36211428
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综述 | 本文综述了间质巨噬细胞在肺纤维化中的新兴作用，并通过单细胞RNA测序分析提供了新的视角 | 利用单细胞RNA测序技术结合生物信息学方法，重新认识间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用 | NA | 探讨间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其分类和功能 | 间质巨噬细胞及其在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 1678 | 2024-08-08 |
Impaired expression of serine/arginine protein kinase 2 (SRPK2) affects melanoma progression
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.979735
PMID:36212152
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研究论文 | 本文研究了丝氨酸/精氨酸蛋白激酶2（SRPK2）在黑色素瘤进展中的作用 | 发现SRPK2在黑色素瘤细胞中的表达与不良预后相关，并通过CRISPR-Cas9基因编辑技术验证了SRPK2在抑制黑色素瘤细胞增殖和侵袭能力中的特定作用 | NA | 探讨SRPK1和SRPK2在黑色素瘤进展中的不同功能角色 | 黑色素瘤细胞中的SRPK2表达 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | RNA | 多个黑色素瘤患者样本 |
| 1679 | 2024-08-08 |
A necroptosis-related prognostic model for predicting prognosis, immune landscape, and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis and weighted co-expression network
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984297
PMID:36212155
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析和加权共表达网络，构建了一个与坏死性凋亡相关的预后模型，用于预测肝细胞癌的预后、免疫景观和药物敏感性 | 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型，并探讨了高和低坏死性凋亡组与肝细胞癌中免疫细胞浸润的关系 | NA | 研究坏死性凋亡相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者及其坏死性凋亡相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 加权共表达网络 | 单细胞数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE125449和GSE151530数据集，以及TCGA和ICGC队列中的肝细胞癌患者数据 |
| 1680 | 2024-08-08 |
Fibronectin-1 is a dominant mechanism for rheumatoid arthritis via the mediation of synovial fibroblasts activity
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1010114
PMID:36225320
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研究论文 | 本研究使用scRNA-seq技术评估与类风湿性关节炎（RA）相关的分子机制，并识别出纤维连接蛋白-1（FN-1）作为关键基因，可能成为RA治疗的新靶点 | 首次通过scRNA-seq技术识别出FN-1在RA发展中的关键作用，并提出其作为潜在的治疗靶点 | 研究仅基于GEO数据库中的scRNA-seq数据，可能需要进一步的实验验证 | 评估类风湿性关节炎的分子机制并识别关键基因 | 类风湿性关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自类风湿性关节炎患者的滑膜成纤维细胞的scRNA-seq数据集 |