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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of potential cellular communication networks in advanced osteosarcoma using single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1013737
PMID:36303551
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据对高级骨肉瘤中的潜在细胞通信网络进行了综合分析 | 揭示了11种细胞类型和17种潜在的细胞通信网络,为骨肉瘤的分子机制提供了新的见解 | NA | 深入理解肿瘤微环境,以开发有效的骨肉瘤治疗方法 | 骨肉瘤中的细胞类型和细胞通信网络 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个骨肉瘤组织,包含25个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 1662 | 2024-08-08 |
SingleCAnalyzer: Interactive Analysis of Single Cell RNA-Seq Data on the Cloud
2022, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2022.793309
PMID:36304292
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研究论文 | 本文介绍了SingleCAnalyzer,一个云平台,用于通过易于使用的自探索网页界面进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据的完整分析 | 开发了SingleCAnalyzer平台,提供了一个完整的scRNA-Seq分析流程,并通过交互式图形界面增强了探索和分析功能 | 需要生物信息学专业知识以正确应用这些计算方法,否则难以获得可靠和可重复的结果 | 开发一个用户友好的云平台,用于单细胞RNA测序数据的交互式分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1663 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the cell map and transcriptional network of sporadic vestibular schwannoma
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.984529
PMID:36304995
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研究论文 | 本研究基于来自散发性前庭神经鞘瘤患者的三个肿瘤样本,通过单细胞转录组测序获得32,011个细胞,质量控制和双细胞去除后得到22,309个高质量细胞。随后,通过聚类分析得到18个细胞簇,并将其注释为六种类型的细胞。基于这六种细胞簇进行了深入分析,包括描述每个细胞亚型的功能特征、细胞发育和分化途径、细胞间相互作用以及簇内的转录调控网络。 | 首次详细描述了散发性前庭神经鞘瘤肿瘤组织中各种类型细胞的单细胞图谱,揭示了不同细胞类型的功能状态和发展轨迹,并探索了Schwann细胞在周围神经系统中的功能状态,这在以往研究中未被报道。 | NA | 描述散发性前庭神经鞘瘤的单细胞图谱,揭示不同细胞类型的功能状态和发展轨迹。 | 散发性前庭神经鞘瘤患者的肿瘤样本中的细胞。 | 数字病理学 | 神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 3个肿瘤样本,32,011个细胞,质量控制后22,309个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1664 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct transcriptional features of the purinergic signaling in mouse trigeminal ganglion
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1038539
PMID:36311028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠三叉神经节中嘌呤能信号传导的转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了三叉神经节中不同细胞类型的嘌呤能信号相关基因的表达模式 | NA | 深入理解嘌呤能信号在三叉神经节中的细胞特异性作用 | 小鼠三叉神经节中的细胞类型及其嘌呤能信号相关基因的转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22,969个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1665 | 2024-08-08 |
Dysregulation of B7 family and its association with tumor microenvironment in uveal melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1026076
PMID:36311731
|
研究论文 | 本文研究了B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其对肿瘤微环境的影响,并发现了CABP4和RORB作为潜在的治疗靶点 | NA | 探讨B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其与肿瘤微环境的关系 | 葡萄膜黑色素瘤中的B7家族及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库,具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1666 | 2024-08-08 |
Immune-infiltrating signature-based classification reveals CD103+CD39+ T cells associate with colorectal cancer prognosis and response to immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011590
PMID:36311750
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研究论文 | 本文开发了一种基于免疫相关特征的评分系统,用于结直肠癌患者的预后预测和免疫治疗效果评估 | 构建了基于54个无复发生存期相关免疫特征的免疫相关特征评分(IRScore),并发现CD103+CD39+ T细胞在CRC患者中的富集与良好的预后和免疫检查点阻断治疗反应相关 | NA | 构建一个基于详细免疫特征的评分系统,以对结直肠癌患者进行分层 | 结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | CRC患者的CD45+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1667 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and therapeutic response in lung squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992990
PMID:36311764
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,识别出基于T细胞标记基因的签名,用于预测肺鳞状细胞癌的预后和治疗反应 | 首次在肺鳞状细胞癌中利用T细胞标记基因构建预后签名,并验证其在不同队列中的有效性 | NA | 探索肺鳞状细胞癌中T细胞标记基因的预后价值和治疗反应 | 肺鳞状细胞癌患者的预后和治疗反应 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练队列、测试队列和GEO队列中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1668 | 2024-08-08 |
Significance of macrophage infiltration in the prognosis of lung adenocarcinoma patients evaluated by scRNA and bulkRNA analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1028440
PMID:36311801
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA分析技术,探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别肺腺癌组织中巨噬细胞亚型的标记基因,并构建了基于这些基因的风险评分模型 | NA | 探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 肺腺癌患者的巨噬细胞浸润及其对预后的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA (加权基因共表达网络分析) | 风险评分模型 | RNA | 多个数据队列(TCGA-LUAD, GSE11969, GSE31210, GSE50081, GSE72094, GSE8894, GSE19188, GSE26939, GSE42127)和临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1669 | 2024-08-08 |
Insights into the roles and driving forces of CCT3 in human tumors
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1005855
PMID:36313331
|
研究论文 | 本研究从泛癌角度探讨CCT3的特征及其在肿瘤中的驱动作用 | 首次构建了lncRNA/circRNA-miRNA-CCT3调控网络,并预测了CCT3的敏感药物 | NA | 探索CCT3在多种肿瘤中的作用及其驱动因素 | CCT3在肿瘤中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | 生物信息学分析,单细胞测序 | NA | mRNA,蛋白质,单细胞测序数据 | 多种肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1670 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1051707
PMID:36313561
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1671 | 2024-08-08 |
Single-nuclei analysis reveals depot-specific transcriptional heterogeneity and depot-specific cell types in adipose tissue of dairy cows
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1025240
PMID:36313560
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析,揭示了奶牛内脏和皮下脂肪组织中细胞类型的差异性和特定亚型 | 首次在奶牛脂肪组织中展示了细胞类型和库特异性异质性,为针对脂肪组织的策略开发提供了新见解 | NA | 阐明奶牛内脏和皮下脂肪组织在单核水平上的细胞多样性差异 | 奶牛的内脏和皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从三头奶牛收集的匹配的皮下和内脏脂肪组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1672 | 2024-08-08 |
Cellular milieu in clear cell renal cell carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.943583
PMID:36313721
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综述 | 本文综述了最近关于透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的单细胞转录组学研究,旨在阐明PTEC在ccRCC发展中的转变以及可能限制靶向免疫治疗反应的免疫细胞类型、状态和相互作用 | 提出基质细胞可能是ccRCC复发和局部侵袭的关键驱动因素 | 对于ccRCC恶性转变和免疫检查点治疗抵抗的机制仍不完全清楚 | 阐明ccRCC微环境中的细胞环境,从而定义ccRCC的临床、治疗和预后特征 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其发展过程中的细胞转变和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1673 | 2024-08-08 |
Applications of Transcriptomics in the Research of Antibody-Mediated Rejection in Kidney Transplantation: Progress and Perspectives
2022-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2022.2131357
PMID:36259540
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研究论文 | 本文探讨了转录组学方法在肾移植中抗体介导排斥反应研究中的应用及其进展和展望 | 引入单细胞RNA测序技术,提供高分辨率的免疫细胞转录组图谱,以揭示抗体介导排斥反应的发病机制 | 传统的批量转录组方法仅反映平均基因表达,忽略了单个细胞间的转录组异质性 | 改进抗体介导排斥反应的临床诊断标准,并探索新的治疗策略 | 肾移植中的抗体介导排斥反应 | 转录组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及移植肾活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1674 | 2024-08-08 |
IL-13/IL-4 signaling contributes to fibrotic progression of the myeloproliferative neoplasms
2022-12-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017326
PMID:36283106
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研究论文 | 本文研究了IL-13/IL-4信号通路在骨髓增生性肿瘤纤维化进展中的作用 | 首次揭示了IL-13在骨髓纤维化中的作用,并提出抑制IL-13/IL-4信号通路可能是一种新的治疗策略 | NA | 探讨IL-13/IL-4信号通路在骨髓纤维化进展中的作用及潜在的治疗策略 | 骨髓纤维化小鼠模型及患者样本 | NA | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 骨髓纤维化小鼠及患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1675 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing unveils the communications between malignant T and myeloid cells contributing to tumor growth and immunosuppression in cutaneous T-cell lymphoma
2022-12-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215972
PMID:36265653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞间的相互作用,这些作用促进了肿瘤生长和免疫抑制。 | 首次展示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用及其对肿瘤微环境的影响,并提出了新的治疗策略。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞共培养实验,未来需要更多的临床试验来验证这些发现。 | 揭示皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用,并探索新的治疗策略。 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1676 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of ferroptosis and establish a risk signature in cholangiocarcinoma
2022-Dec-15, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2022.09.008
PMID:36284715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序技术,揭示了胆管癌中铁死亡的特征,并建立了一个风险标志物 | 首次通过scRNA-seq技术分析胆管癌中的免疫微环境和细胞异质性,并发现了与铁死亡相关的细胞间通信 | 研究依赖于公共数据库中的scRNA-seq数据,可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索胆管癌中铁死亡的特征及其与免疫细胞的关系,并建立一个预测胆管癌预后的风险标志物 | 胆管癌中的铁死亡特征及免疫细胞的浸润情况 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 21个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 1677 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal microglia types associated with proliferative retinopathy
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160940
PMID:36264636
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其特征 | 首次全面绘制了正常和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠视网膜中所有微胶质细胞群体的图谱,并揭示了几种独特的与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其相关标记物、信号通路和调控元件 | 研究仅限于小鼠模型,未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类 | 探究与新生血管化相关的微胶质细胞的异质性,并描述其转录组特征和代谢途径 | 微胶质细胞及其在增生性视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 正常空气和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1678 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis dissected the osteo-immunology microenvironment and revealed key regulators in osteoporosis
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109302
PMID:36257255
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松症中的骨免疫微环境,并揭示了关键的调控因子 | 发现了新的巨噬细胞亚型和差异表达基因,并识别了与骨代谢相关的新基因ZFP36L1和DEFA3,以及RETN-CAP1在骨免疫细胞相互作用中的新作用 | NA | 揭示骨质疏松症中骨免疫微环境的关键调控因子和可能的基因靶点及信号通路 | 骨质疏松症中的骨免疫微环境 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 19,102个细胞和4097个动态基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1679 | 2024-08-08 |
The role of lung macrophages in acute respiratory distress syndrome
2022-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-022-01645-4
PMID:36264361
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综述 | 本文综述了肺泡巨噬细胞在急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中的作用,从解剖位置和细胞起源两个维度进行探讨 | 利用单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学等新技术,更深入地理解肺部巨噬细胞的发展过程、分类和功能 | 不同研究组对治疗反应的差异性和单核/巨噬细胞基因表达的巨大动态变化 | 探讨肺泡巨噬细胞在ARDS中的功能及治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞及其在ARDS中的作用 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1680 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes from turtle livers reveal sensitivity of hepatic immune cells to bacteria-infection
2022-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2022.10.033
PMID:36273515
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了中国软壳龟肝脏的细胞组成,并探讨了细菌感染对肝脏免疫细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下全面展示了软壳龟肝脏的免疫景观,并揭示了细菌感染对肝脏免疫细胞数量的影响 | NA | 研究肝脏免疫细胞对细菌感染的响应 | 中国软壳龟的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9938个细胞,来自两个个体(未感染和细菌感染)的肝脏组织 | NA | NA | NA | NA |