单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2024-08-08 |
Transcriptional states of CAR-T infusion relate to neurotoxicity - lessons from high-resolution single-cell SOM expression portraying
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994885
PMID:36248848
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研究论文 | 本文通过重新分析24名患者的单细胞RNA测序数据，探讨了CAR-T细胞免疫疗法中细胞状态与神经毒性的关系 | 开发了一种单细胞数据描绘工作流程，用于解析单细胞分辨率的转录状态空间，并通过直观的可视化、功能挖掘、分子细胞分层和变异性分析展示了单细胞数据描绘的能力 | NA | 研究CAR-T细胞免疫疗法中的细胞状态与神经毒性的关系 | 24名患者的单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 24名患者，超过130,000个细胞 |
| 1622 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.985187
PMID:36248860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了化疗对复发性卵巢癌患者免疫景观及TCR/BCR克隆扩增的影响 | 首次在单细胞分辨率下，全面描述了化疗耐药患者在不同治疗阶段肿瘤、腹水和外周血中的多维细胞和免疫学图谱 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探讨化疗对复发性卵巢癌患者免疫环境的具体影响，并提出改善化疗引起的免疫损伤的策略 | 复发性化疗耐药的卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 单一患者 |
| 1623 | 2024-08-08 |
Evaluating the role of IDO1 macrophages in immunotherapy using scRNA-seq and bulk-seq in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1006501
PMID:36248886
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq）分析结直肠癌（CRC）患者，以评估IDO1巨噬细胞在免疫治疗中的作用 | 首次详细分类了结直肠癌中的巨噬细胞亚群，并揭示了IDO1巨噬细胞在不同亚群中的浸润程度差异 | NA | 研究IDO1巨噬细胞在结直肠癌免疫治疗中的作用 | 结直肠癌患者及其巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个结直肠癌患者样本 |
| 1624 | 2024-08-08 |
Metabolic-related gene pairs signature analysis identifies ABCA1 expression levels on tumor-associated macrophages as a prognostic biomarker in primary IDHWT glioblastoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869061
PMID:36248907
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研究论文 | 本研究通过分析代谢相关基因对签名，确定了肿瘤相关巨噬细胞中ABCA1表达水平作为原发性IDHWT胶质母细胞瘤的预后生物标志物。 | 开发了一种基于代谢相关基因对的预后签名，用于原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的个性化管理。 | NA | 开发一种针对IDHWT胶质母细胞瘤患者的稳健预后签名。 | 原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和临床数据。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了377个样本，包括204个训练集样本和173个验证集样本。 |
| 1625 | 2024-08-08 |
Targeting the TREM1-positive myeloid microenvironment in glioblastoma
2022 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdac149
PMID:36249290
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中由髓系细胞衍生的微环境作为胶质母细胞瘤异质性的驱动因素，并提供了抑制其的药理途径 | 本研究首次证实了TREM1+髓系衍生的微环境在胶质母细胞瘤异质性中的作用，并展示了通过药理抑制HuR二聚化来抑制该微环境和肿瘤/宿主细胞融合网络的能力 | NA | 研究胶质母细胞瘤中髓系细胞衍生的微环境的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 胶质母细胞瘤中的髓系细胞衍生的微环境及其与肿瘤异质性的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个PDX细胞系和两个免疫健全的小鼠胶质母细胞瘤模型 |
| 1626 | 2024-08-08 |
Expression Analysis of Ligand-Receptor Pairs Identifies Cell-to-Cell Crosstalk between Macrophages and Tumor Cells in Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/9589895
PMID:36249427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了肺腺癌中的配体-受体对表达，揭示了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间对话。 | 首次在肺腺癌中详细分析了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的自分泌和旁分泌网络，并构建了基于细胞间相互作用的机器学习预测模型。 | 研究依赖于已发表文献和公开数据库中的样本，可能存在数据来源的局限性。 | 探索肺腺癌中巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间通信，并识别与患者预后相关的关键基因对。 | 肺腺癌患者的单细胞和批量RNA测序样本，以及巨噬细胞和肿瘤细胞的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 159,219个单细胞（包括18,248个肿瘤细胞和29,520个巨噬细胞） |
| 1627 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and immunogenicity of chondrocytes via single-cell RNA sequencing technique in human osteoarthritis
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1004766
PMID:36249797
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中软骨细胞的异质性和免疫原性 | 首次定义了八种具有不同生物学功能的软骨细胞亚型，并发现效应软骨细胞和纤维软骨细胞可能促进骨关节炎的发展 | NA | 探索软骨细胞的生物学功能和标志物，以促进骨关节炎的准确诊断和靶向治疗 | 人骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1628 | 2024-08-08 |
Subcapsular Sinus Macrophages Promote Melanoma Metastasis to the Sentinel Lymph Nodes via an IL1α-STAT3 Axis
2022-12-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0225
PMID:36206577
|
研究论文 | 研究了皮肤来源的肿瘤细胞通过淋巴管迁移至前哨淋巴结（sLN）的过程，并探讨了亚被膜窦（SS）中的巨噬细胞通过IL1α-STAT3轴促进黑色素瘤转移的机制 | 发现了亚被膜窦中的巨噬细胞在识别肿瘤抗原后产生促肿瘤的IL1α，并通过单细胞RNA测序揭示了IL1α信号在转移性肿瘤细胞中的STAT3为主要靶点 | NA | 探讨黑色素瘤转移至前哨淋巴结的机制及潜在的免疫治疗策略 | 亚被膜窦中的巨噬细胞、IL1α、STAT3信号通路 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受IL1α特异性阻断抗体治疗的动物中获取的微切割转移样本 |
| 1629 | 2024-08-08 |
Cellular Landscapes of Nondiseased Human Cardiac Valves From End-Stage Heart Failure-Explanted Heart
2022-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318314
PMID:36200446
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研究论文 | 探索来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜的细胞景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面分析非病变人类心脏瓣膜叶片的细胞景观，并结合生物信息学方法识别细胞类型、描述细胞功能及研究细胞发育轨迹和相互作用 | 研究仅限于非病变心脏瓣膜，未涉及病变瓣膜的情况 | 探索心脏瓣膜疾病的细胞层面机制，以识别新的治疗靶点 | 来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜叶片 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5个主动脉瓣、5个肺动脉瓣、5个三尖瓣和3个二尖瓣，共128,412个细胞 |
| 1630 | 2024-08-08 |
Review: Challenges and perspectives in applying single nuclei RNA-seq technology in plant biology
2022-Dec, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2022.111486
PMID:36202294
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综述 | 本文综述了单核RNA测序技术在植物生物学中的应用挑战与前景 | 探讨了单细胞转录组在植物细胞发育和环境应激响应中的动态调控 | 讨论了使用植物原生质体与核进行单细胞RNA测序实验的优缺点 | 支持基因功能研究，建立精确的转录程序，预测更准确的基因调控网络，并长期设计新基因途径以增强选定作物性状 | 植物细胞的转录组及其在细胞发育和环境应激中的调控 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种植物物种和器官的细胞 |
| 1631 | 2024-08-08 |
Thyroid hormone regulators in human cerebral cortex development
2022-12-01, The Journal of endocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1530/JOE-22-0189
PMID:36219489
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review | 本文综述了甲状腺激素在人类大脑皮层发育中的调控作用 | 利用单细胞转录组学方法分析了发育中的人类大脑皮层的单细胞RNA-Seq数据，提供了甲状腺激素转运蛋白、脱碘酶和受体在特定细胞中表达的新见解 | 由于小鼠和人类大脑之间的根本差异，小鼠疾病模型并不完全令人满意 | 探讨甲状腺激素在人类新皮层发育中的病理生理学背景 | 人类大脑皮层发育中的甲状腺激素调控 | NA | NA | 单细胞RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1632 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics shows moxibustion promotes hippocampus astrocyte and neuron interaction
2022-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.121052
PMID:36220370
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研究论文 | 本研究探讨了艾灸通过促进海马体星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，从而改善阿尔茨海默病小鼠的认知功能 | 本研究首次采用空间转录组学技术评估艾灸对阿尔茨海默病小鼠星形胶质细胞与神经元相互作用的影响 | NA | 研究艾灸是否能通过促进星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，增强突触可塑性，从而缓解阿尔茨海默病的认知障碍 | 阿尔茨海默病小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | APP/PS1小鼠 |
| 1633 | 2024-08-08 |
scHiCPTR: unsupervised pseudotime inference through dual graph refinement for single-cell Hi-C data
2022-11-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac670
PMID:36205615
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研究论文 | 本文介绍了scHiCPTR，一种基于图的无监督流程，用于从单细胞Hi-C接触矩阵中推断伪时间 | scHiCPTR通过双图优化过程优化图结构，有助于减少噪声导致的虚假细胞连接，并确定全局发育方向性 | NA | 研究如何利用单细胞Hi-C接触矩阵构建伪时间路径，以沿着发育轨迹对细胞进行排序 | 单细胞Hi-C接触矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C技术 | 图模型 | 矩阵数据 | NA |
| 1634 | 2024-08-08 |
PPMS: A framework to Profile Primary MicroRNAs from Single-cell RNA-sequencing datasets
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac419
PMID:36209413
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PPMS的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中分析初级微小RNA（pri-miRNA） | PPMS框架能够以细胞类型分辨率对pri-miRNA进行分析和定量，这是目前其他计算方法所不具备的 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞水平上分析和定量pri-miRNA | pri-miRNA在不同细胞类型和细胞状态中的分布及其与细胞/读取序列数量的关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA序列数据 | 包括人类心脏的不同腔室、人类多能干细胞分化为心肌细胞以及感染了严重急性呼吸综合征冠状病毒2的hiPSCs衍生心肌细胞的公开单细胞RNA测序数据 |
| 1635 | 2024-08-08 |
Subclones of bone marrow CD34+ cells in acute myeloid leukemia at diagnosis confer responses of patients to induction chemotherapy
2022-11-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.34481
PMID:36197314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了新诊断急性髓系白血病（AML）患者骨髓CD34+细胞的异质性，并根据患者对诱导化疗的反应将其分为敏感组和耐药组 | 本研究首次揭示了CD34+细胞亚群与AML患者对诱导化疗反应的关系，并提供了预测患者反应的生物标志物 | NA | 研究AML患者骨髓CD34+细胞的异质性与对诱导化疗反应的关系 | 急性髓系白血病患者的骨髓CD34+细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新诊断的AML患者骨髓CD34+细胞样本 |
| 1636 | 2024-08-08 |
Angiotensin-converting Enzyme-2 (ACE2) Expression in Pediatric Liver Disease
2022 Nov-Dec 01, Applied immunohistochemistry & molecular morphology : AIMM
IF:1.3Q3
DOI:10.1097/PAI.0000000000001068
PMID:36222506
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研究论文 | 本文研究了儿童免疫介导性肝病中血管紧张素转换酶2（ACE2）的表达情况 | 采用了新的方法学来评估ACE2在儿童肝病中的表达，并使用计算深度学习分割模型和空间转录组学进行分析 | 需要进一步研究ACE2在慢性疾病和急性感染中的作用 | 更好地理解ACE2在肝病中的存在及其在感染如COVID-19中的作用 | 儿童免疫介导性肝病中的ACE2表达 | NA | 肝病 | 免疫荧光染色、共聚焦显微镜、酶联免疫吸附试验、空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织、血液 | 儿童和成人肝病及对照组织样本 |
| 1637 | 2024-08-08 |
BATF epigenetically and transcriptionally controls the activation program of regulatory T cells in human tumors
2022-10-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk0957
PMID:36206353
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研究论文 | 本文研究了BATF在人肺肿瘤微环境中对调节性T细胞的表观遗传和转录调控作用 | 首次揭示了BATF通过表观遗传调控激活相关基因表达，从而影响T细胞在肿瘤微环境中的分化和功能 | NA | 探讨BATF在肿瘤微环境中对调节性T细胞分化和功能的调控机制 | 人肺肿瘤中的调节性T细胞及其表观遗传和转录调控 | 数字病理学 | 肺癌 | ATAC测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1638 | 2024-08-08 |
Upper cortical layer-driven network impairment in schizophrenia
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn8367
PMID:36223459
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了精神分裂症患者大脑皮质上层的神经网络损伤 | 首次通过单核RNA测序和空间转录组学技术，详细分析了精神分裂症患者大脑皮质上层神经元的转录组变化 | 研究样本仅限于精神分裂症患者和匹配的控制组，可能需要更多样化的样本以验证结果的普遍性 | 揭示精神分裂症对大脑皮质上层神经网络的影响 | 精神分裂症患者和匹配的控制组的大脑皮质上层神经元 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 超过220,000个神经元样本 |
| 1639 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory megakaryocyte gene expression in murine models of breast cancer
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo5224
PMID:36223471
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research paper | 本研究使用自发性的乳腺癌小鼠模型，发现肿瘤负荷减少了巨核细胞的数量和大小，并干扰了多倍体化。单细胞RNA测序显示，肿瘤小鼠的巨核细胞表现出促炎性表型，蛋白质S100A8/A9和脂质运载蛋白-2水平在血小板中也增加，表明肿瘤诱导的巨核细胞改变传递给了血小板后代，促进了体外肿瘤细胞侵袭和肿瘤细胞肺部定植。 | 首次证明乳腺癌诱导的巨核细胞改变，导致血小板成分的质变，可能反馈促进肿瘤转移。 | NA | 研究乳腺癌对血小板产生巨核细胞的影响。 | 乳腺癌小鼠模型的巨核细胞和血小板。 | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 肿瘤小鼠和野生型小鼠的巨核细胞和血小板。 |
| 1640 | 2024-08-08 |
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04056-7
PMID:36224302
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和系统生物学方法分析了钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组特征 | 揭示了动脉粥样硬化斑块中细胞表达的炎症介质和基质分泌基因的解剖学区分，并识别了可能驱动细胞转分化的新候选基因 | NA | 探索动脉粥样硬化斑块的病理生理机制，并建立针对疾病进展的特定部位干预策略 | 钙化动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化斑块和匹配的近端邻近颈动脉组织 |