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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1601 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Associations between Genes and Cellular Topology in Breast and Prostate Cancers
2022-Oct-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194856
PMID:36230778
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研究论文 | 本文通过空间转录组学分析,揭示了乳腺癌和前列腺癌中基因与细胞拓扑结构之间的关联 | 首次通过空间转录组学技术,探讨了细胞基因表达与其空间关系之间的联系 | NA | 研究乳腺癌和前列腺癌中基因表达与细胞空间关系之间的关联 | 乳腺癌和前列腺癌中的基因与细胞拓扑结构 | 数字病理学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 700个图像拓扑特征在乳腺癌和前列腺癌空间转录组样本中 |
1602 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal distinct gene expression signatures of severe COVID-19 in the presence of clonal hematopoiesis
2022-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00866-1
PMID:36229591
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了克隆性造血(CHIP)在严重COVID-19患者中通过特定的基因表达程序影响免疫反应的机制 | 首次揭示了CHIP突变通过改变染色质结构,增强IFN-γ介导的炎症反应,从而增加严重COVID-19的风险 | NA | 探究CHIP在严重COVID-19中的免疫学特征及基因表达调控机制 | 严重COVID-19患者的单细胞转录组及CHIP相关的基因表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 外周血单个核细胞样本 |
1603 | 2024-08-08 |
Plap-1 lineage tracing and single-cell transcriptomics reveal cellular dynamics in the periodontal ligament
2022-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201203
PMID:36245218
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研究论文 | 本研究通过Plap-1谱系追踪和单细胞转录组学揭示了牙周韧带中的细胞动态 | 首次鉴定了牙周韧带特异性细胞外基质蛋白Plap-1,并通过遗传谱系追踪和单细胞图谱定义了牙周韧带中的多种细胞群体及其在组织稳态和修复中的作用 | NA | 阐明牙周韧带中各种细胞类型的特征及其谱系层次 | 牙周韧带中的细胞类型及其在组织稳态和修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
1604 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the key role of ZNF683 in natural killer cell exhaustion in multiple myeloma
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1065
PMID:36245253
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和体外实验,揭示了ZNF683在多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验验证了ZNF683在多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的分子机制 | 研究样本仅包括10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和三名健康志愿者,可能影响结果的普遍性 | 旨在揭示和验证多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的分子调控因子,并为新的免疫疗法提供潜在目标 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓和外周血样本中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者的骨髓和外周血样本 |
1605 | 2024-08-08 |
IgE type multiple myeloma exhibits hypermutated phenotype and tumor reactive T cells
2022-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005815
PMID:36252999
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研究论文 | 本文通过综合分析DNA和单细胞RNA测序数据,全面剖析了IgE型kappa多发性骨髓瘤的基因组和免疫组库特征,并与非IgE型多发性骨髓瘤样本进行比较 | 揭示了IgE型多发性骨髓瘤独特的病理生理机制,并提出了针对高肿瘤突变负荷多发性骨髓瘤的个性化新表位靶向细胞治疗的新机会 | NA | 研究IgE型多发性骨髓瘤的遗传和免疫学特征,探索其治疗新策略 | IgE型kappa多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 免疫组库数据 | NA |
1606 | 2024-08-08 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了由诱导多能干细胞(iPSC)衍生的微胶质细胞(iPSC-microglia)在不同刺激下的转录反应,特别是与阿尔茨海默病(AD)相关的反应 | 首次揭示了脂多糖(LPS)在iPSC-microglia中诱导的转录反应与AD小鼠模型中微胶质细胞的转录变化相似 | 研究仅限于体外iPSC-microglia模型,未涉及体内环境及临床应用 | 探讨iPSC-microglia在不同免疫刺激下的转录反应及其与AD病理机制的相关性 | iPSC-microglia在前列腺素E2(PGE2)、脂多糖(LPS)+干扰素γ(IFN-γ)及ATPγS刺激下的转录反应 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
1607 | 2024-08-08 |
Exploring Precise Medication Strategies for OSCC Based on Single-Cell Transcriptome Analysis from a Dynamic Perspective
2022-Sep-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194801
PMID:36230722
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-Seq数据的静态和动态分析方法,全面剖析口腔鳞状细胞癌(OSCC)的复杂异质性和进化过程,并提出精确治疗策略。 | 首次引入患者伪时间评分概念,量化动态发展过程中的异质性水平,评估其与生存状态的关系,并据此调整药物治疗策略。 | NA | 从动态角度理解癌症发展,制定精确治疗措施。 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者及其治疗策略。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
1608 | 2024-08-08 |
An Integrative Analysis of Identified Schizophrenia-Associated Brain Cell Types and Gene Expression Changes
2022-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231911581
PMID:36232882
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研究论文 | 本研究利用人类背外侧前额叶皮层的大量RNA-seq数据,通过RNA-seq反卷积算法CIBERSORTx生成精神分裂症(SCZ)大脑单细胞RNA-seq数据,全面分析了SCZ相关的大脑细胞类型和基因表达变化。 | 本研究首次通过RNA-seq反卷积算法CIBERSORTx生成SCZ大脑单细胞RNA-seq数据,揭示了SCZ相关的大脑细胞类型和基因表达变化的细胞异质性和分子机制。 | NA | 理解精神分裂症(SCZ)相关的大脑细胞类型和基因表达变化 | 精神分裂症(SCZ)患者的大脑细胞类型和基因表达 | 数字病理学 | 精神分裂症 | RNA-seq | CIBERSORTx | RNA-seq数据 | NA |
1609 | 2024-08-08 |
Single-Cell Gene Expression Analysis Revealed Immune Cell Signatures of Delta COVID-19
2022-09-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11192950
PMID:36230912
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因表达分析揭示了Delta COVID-19的免疫细胞特征 | 本研究首次揭示了Delta变异株特有的免疫相关分子因子,特别是大量具有特定基因表达特征的单核细胞 | NA | 理解与COVID-19变异株相关的免疫反应,以辅助开发治疗和诊断策略 | COVID-19患者的血液单核细胞及不同严重程度的病毒变异株 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 不同严重程度的COVID-19患者血液单核细胞样本 |
1610 | 2024-08-08 |
Mechanistic target of rapamycin signaling in human nervous system development and disease
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1005631
PMID:36226315
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综述 | 本文综述了mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的关键作用 | 利用单细胞转录组学和大脑类器官技术揭示了mTOR信号在人类皮质发育中的特定作用 | NA | 探讨mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的作用 | mTOR信号通路及其在神经系统发育和疾病中的影响 | NA | 神经发育疾病 | 单细胞转录组学,大脑类器官技术 | NA | 转录组数据 | NA |
1611 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and establishment of an 8-gene prognostic model for pancreatic cancer patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1000447
PMID:36237305
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析胰腺癌中的基因结构和表达数据,并建立了一个包含8个基因的胰腺癌预后模型 | 首次在胰腺癌中应用单细胞测序技术进行深入分析,并成功建立了一个新的胰腺癌预后模型 | 需要进一步的临床验证来确认该模型的准确性和广泛适用性 | 通过单细胞测序技术分析胰腺癌的基因表达,并建立预后模型以预测患者的预后和治疗反应 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据和基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序(SCS) | LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及多个数据库的胰腺癌单细胞测序数据,包括15个细胞亚群和10种细胞类型 |
1612 | 2024-08-08 |
CEP192 is a novel prognostic marker and correlates with the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950884
PMID:36238304
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验方法评估CEP192蛋白在肝细胞癌中的预后和治疗潜力 | 发现CEP192与免疫微环境密切相关,可能作为免疫检查点抑制剂反应的预测因子 | NA | 探索CEP192作为肝细胞癌的新治疗靶点和预后标志物 | CEP192蛋白在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
1613 | 2024-08-08 |
The impact of single-cell genomics on the field of mycobacterial infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.989464
PMID:36246265
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究领域的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其变体提供了大量个体细胞的无偏转录组测序,超越了传统的“批量”方法,深化了对细胞异质性和动态转录状态的理解 | 尽管单细胞基因组学在生命科学和生物医学研究中应用广泛,但在分枝杆菌感染领域的进展相对有限 | 旨在总结单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究中的重要发现,强调不同和最新的单细胞方法,并探讨当前的研究空白和未来的发展潜力 | 研究对象为感染分枝杆菌的宿主细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 大量个体细胞 |
1614 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Active Involvement of Macrophage Polarizations in Pulmonary Hypertension
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5398157
PMID:36246557
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 首次揭示了在肺动脉高压早期阶段,巨噬细胞向M2型极化的现象,并验证了其在患者中的存在 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本,需要更多临床数据支持 | 探究肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 肺动脉高压中的巨噬细胞极化 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及肺动脉高压患者的肺组织样本 |
1615 | 2024-08-08 |
A novel risk score model based on fourteen chromatin regulators-based genes for predicting overall survival of patients with lower-grade gliomas
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.957059
PMID:36246611
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研究论文 | 本文构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型,用于预测低级别胶质瘤患者的总体生存率 | 首次构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型,用于预测低级别胶质瘤患者的预后 | NA | 揭示染色质调控因子在低级别胶质瘤患者中的功能和价值 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 870个染色质调控因子 |
1616 | 2024-08-08 |
Critical role of guanylate binding protein 5 in tumor immune microenvironment and predictive value of immunotherapy response
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984615
PMID:36246628
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研究论文 | 本研究探讨了鸟苷酸结合蛋白5(GBP5)在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次详细分析了GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境(TME)的关系,并构建了基于GBP5表达的预后模型 | 研究主要基于公开的基因表达数据,可能存在样本选择偏倚;预后模型的外部验证有限 | 探索GBP5在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的33种癌症的RNA测序数据,以及来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞转录组数据 |
1617 | 2024-08-08 |
The soldiers needed to be awakened: Tumor-infiltrating immune cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.988703
PMID:36246629
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研究论文 | 本文综述了肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)在肿瘤微环境中的作用及其在不同肿瘤中的免疫治疗策略 | 介绍了基于TIICs功能开发的各种抗肿瘤策略,如免疫检查点阻断(ICB)、过继细胞疗法(ACT)等,并探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在研究肿瘤特异性免疫细胞特征中的应用 | NA | 探讨肿瘤浸润性免疫细胞的功能、预后价值及针对不同肿瘤的免疫治疗策略 | 肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
1618 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of immune ferroptosis gene in renal clear cell carcinoma: prognosis and influence of tumor microenvironment
2022, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36247256
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研究论文 | 本研究深入探讨了免疫系统与铁死亡在肾透明细胞癌中的作用,识别了预测性生物标志物和治疗靶点。 | 构建了一个新的与免疫铁死亡相关基因的预测模型,该模型在免疫浸润、微环境和免疫逃逸中起重要作用。 | NA | 识别肾透明细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点。 | 肾透明细胞癌患者的预后和肿瘤微环境影响。 | 数字病理学 | 肾癌 | lasso-Cox风险评分模型 | lasso-Cox | 基因表达数据 | 103个免疫铁死亡相关差异表达基因 |
1619 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of AIM2 inflammasomes with potential implications for immunotherapy in human cancer: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.998266
PMID:36248785
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研究论文 | 本研究通过大规模组学研究和单细胞测序验证,分析了AIM2炎症小体在泛癌中的作用,并探讨了其对人类癌症免疫治疗的潜在影响。 | 首次在泛癌背景下全面分析AIM2炎症小体,并通过单细胞转录组测序技术验证其在肿瘤微环境中的激活状态。 | 研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据,可能存在样本选择偏倚和数据解释的局限性。 | 探讨AIM2炎症小体在泛癌中的表达模式、预后意义及其与免疫治疗的相关性。 | AIM2炎症小体及其相关基因在不同癌症中的表达和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA)和The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库中的数据,具体样本数量未详细说明。 |
1620 | 2024-08-08 |
Single cell meta-analysis of EndMT and EMT state in COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.976512
PMID:36248845
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meta-分析 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组,以探究COVID-19中的间质过渡状态 | 首次通过分析公共数据库的单细胞测序数据,识别了早期和晚期的内皮间质过渡(EndMT)和上皮-间质过渡(EMT) | NA | 探究COVID-19患者肺部间质过渡状态及其与纤维化的关系 | 健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体45例,COVID-19患者58例,特发性肺纤维化患者64例 |